data_1JBW
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_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_params.name     atom_site 
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#
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_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
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_entity.details                     ? 
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_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
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_entity.pdbx_description            'DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
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#
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_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
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_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    monomeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      1 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
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_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F 
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_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
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_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      3 
_struct_asym.id                             D 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A C HIS 184 A HIS 184 1_555 A N KCX 185 A KCX 185 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale2 A C KCX 185 A KCX 185 1_555 A N ALA 186 A ALA 186 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale3 A NH1 ARG 300 A ARG 300 1_555 D O1A ACQ . A ACQ 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.165 ? 
metalc ? metalc1 A O SER 73 A SER 73 1_555 C MG MG . A MG 998 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? 
metalc ? metalc2 A OE2 GLU 143 A GLU 143 1_555 C MG MG . A MG 998 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.23 ? 
metalc ? metalc3 F O HOH . A HOH 430 1_555 C MG MG . A MG 998 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? 
metalc ? metalc4 F O HOH . A HOH 431 1_555 C MG MG . A MG 998 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.99 ? 
metalc ? metalc5 F O HOH . A HOH 432 1_555 B MG MG . A MG 997 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.881 ? 
metalc ? metalc6 F O HOH . A HOH 433 1_555 B MG MG . A MG 997 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? 
metalc ? metalc7 F O HOH . A HOH 434 1_555 B MG MG . A MG 997 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? 
metalc ? metalc8 F O HOH . A HOH 435 1_555 B MG MG . A MG 997 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? 
metalc ? metalc9 F O HOH . A HOH 795 1_555 B MG MG . A MG 997 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.097 ? 
metalc ? metalc10 B MG MG . A MG 997 1_555 D O1D ACQ . A ACQ 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.22 ? 
metalc ? metalc11 B MG MG . A MG 997 1_555 D O1G ACQ . A ACQ 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? 
metalc ? metalc12 C MG MG . A MG 998 1_555 D O1B ACQ . A ACQ 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? 
metalc ? metalc13 C MG MG . A MG 998 1_555 D O2G ACQ . A ACQ 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.14 ? 
#
_chem_comp.formula           'C11 H19 N5 O15 P4' 
_chem_comp.formula_weight    585.188 
_chem_comp.id                ACQ 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     "ADENOSINE-5'-[BETA, GAMMA-METHYLENE]TETRAPHOSPHATE" 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PG O1G ACQ doub 1 n n 
PG O2G ACQ sing 2 n n 
PG O3G ACQ sing 3 n n 
PG C3B ACQ sing 4 n n 
O2G HOG2 ACQ sing 5 n n 
O3G PD ACQ sing 6 n n 
PB O1B ACQ doub 7 n n 
PB O2B ACQ sing 8 n n 
PB C3B ACQ sing 9 n n 
PB O3A ACQ sing 10 n n 
O2B HOB2 ACQ sing 11 n n 
C3B H3B1 ACQ sing 12 n n 
C3B H3B2 ACQ sing 13 n n 
PA O1A ACQ doub 14 n n 
PA O2A ACQ sing 15 n n 
PA O3A ACQ sing 16 n n 
PA O5' ACQ sing 17 n n 
O2A HOA2 ACQ sing 18 n n 
O5' C5' ACQ sing 19 n n 
C5' C4' ACQ sing 20 n n 
C5' "H5'1" ACQ sing 21 n n 
C5' "H5'2" ACQ sing 22 n n 
C4' O4' ACQ sing 23 n n 
C4' C3' ACQ sing 24 n n 
C4' H4' ACQ sing 25 n n 
O4' C1' ACQ sing 26 n n 
C3' O3' ACQ sing 27 n n 
C3' C2' ACQ sing 28 n n 
C3' H3' ACQ sing 29 n n 
O3' HO3' ACQ sing 30 n n 
C2' O2' ACQ sing 31 n n 
C2' C1' ACQ sing 32 n n 
C2' H2' ACQ sing 33 n n 
O2' HO2' ACQ sing 34 n n 
C1' N9 ACQ sing 35 n n 
C1' H1' ACQ sing 36 n n 
N9 C8 ACQ sing 37 n y 
N9 C4 ACQ sing 38 n y 
C8 N7 ACQ doub 39 n y 
C8 H8 ACQ sing 40 n n 
N7 C5 ACQ sing 41 n y 
C5 C6 ACQ sing 42 n y 
C5 C4 ACQ doub 43 n y 
C6 N6 ACQ sing 44 n n 
C6 N1 ACQ doub 45 n y 
N6 HN61 ACQ sing 46 n n 
N6 HN62 ACQ sing 47 n n 
N1 C2 ACQ sing 48 n y 
C2 N3 ACQ doub 49 n y 
C2 H2 ACQ sing 50 n n 
N3 C4 ACQ sing 51 n y 
PD O1D ACQ doub 52 n n 
PD O2D ACQ sing 53 n n 
PD O3D ACQ sing 54 n n 
O2D HOD2 ACQ sing 55 n n 
O3D HOD3 ACQ sing 56 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     1JBW 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.018832 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.004905 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.02193 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.012495 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 MG A 1 997 997 MG MTL . 
C 2 MG A 1 998 998 MG MTL . 
D 3 ACQ A 1 999 999 ACQ ACP . 
E 4 TMF A 1 996 996 TMF TMF . 
F 5 HOH A 1 430 430 HOH WAT . 
F 5 HOH A 2 431 431 HOH WAT . 
F 5 HOH A 3 432 432 HOH WAT . 
F 5 HOH A 4 433 433 HOH WAT . 
F 5 HOH A 5 434 434 HOH WAT . 
F 5 HOH A 6 435 435 HOH WAT . 
F 5 HOH A 7 436 436 HOH WAT . 
F 5 HOH A 8 437 437 HOH WAT . 
F 5 HOH A 9 438 438 HOH WAT . 
F 5 HOH A 10 439 439 HOH WAT . 
F 5 HOH A 11 440 440 HOH WAT . 
F 5 HOH A 12 441 441 HOH WAT . 
F 5 HOH A 13 442 442 HOH WAT . 
F 5 HOH A 14 443 443 HOH WAT . 
F 5 HOH A 15 444 444 HOH WAT . 
F 5 HOH A 16 445 445 HOH WAT . 
F 5 HOH A 17 446 446 HOH WAT . 
F 5 HOH A 18 447 447 HOH WAT . 
F 5 HOH A 19 448 448 HOH WAT . 
F 5 HOH A 20 449 449 HOH WAT . 
F 5 HOH A 21 450 450 HOH WAT . 
F 5 HOH A 22 451 451 HOH WAT . 
F 5 HOH A 23 452 452 HOH WAT . 
F 5 HOH A 24 453 453 HOH WAT . 
F 5 HOH A 25 454 454 HOH WAT . 
F 5 HOH A 26 455 455 HOH WAT . 
F 5 HOH A 27 456 456 HOH WAT . 
F 5 HOH A 28 457 457 HOH WAT . 
F 5 HOH A 29 458 458 HOH WAT . 
F 5 HOH A 30 459 459 HOH WAT . 
F 5 HOH A 31 460 460 HOH WAT . 
F 5 HOH A 32 461 461 HOH WAT . 
F 5 HOH A 33 462 462 HOH WAT . 
F 5 HOH A 34 463 463 HOH WAT . 
F 5 HOH A 35 464 464 HOH WAT . 
F 5 HOH A 36 465 465 HOH WAT . 
F 5 HOH A 37 466 466 HOH WAT . 
F 5 HOH A 38 467 467 HOH WAT . 
F 5 HOH A 39 468 468 HOH WAT . 
F 5 HOH A 40 469 469 HOH WAT . 
F 5 HOH A 41 470 470 HOH WAT . 
F 5 HOH A 42 471 471 HOH WAT . 
F 5 HOH A 43 472 472 HOH WAT . 
F 5 HOH A 44 473 473 HOH WAT . 
F 5 HOH A 45 474 474 HOH WAT . 
F 5 HOH A 46 475 475 HOH WAT . 
F 5 HOH A 47 476 476 HOH WAT . 
F 5 HOH A 48 477 477 HOH WAT . 
F 5 HOH A 49 478 478 HOH WAT . 
F 5 HOH A 50 479 479 HOH WAT . 
F 5 HOH A 51 480 480 HOH WAT . 
F 5 HOH A 52 481 481 HOH WAT . 
F 5 HOH A 53 482 482 HOH WAT . 
F 5 HOH A 54 483 483 HOH WAT . 
F 5 HOH A 55 484 484 HOH WAT . 
F 5 HOH A 56 485 485 HOH WAT . 
F 5 HOH A 57 486 486 HOH WAT . 
F 5 HOH A 58 487 487 HOH WAT . 
F 5 HOH A 59 488 488 HOH WAT . 
F 5 HOH A 60 489 489 HOH WAT . 
F 5 HOH A 61 490 490 HOH WAT . 
F 5 HOH A 62 491 491 HOH WAT . 
F 5 HOH A 63 492 492 HOH WAT . 
F 5 HOH A 64 493 493 HOH WAT . 
F 5 HOH A 65 494 494 HOH WAT . 
F 5 HOH A 66 495 495 HOH WAT . 
F 5 HOH A 67 496 496 HOH WAT . 
F 5 HOH A 68 497 497 HOH WAT . 
F 5 HOH A 69 498 498 HOH WAT . 
F 5 HOH A 70 499 499 HOH WAT . 
F 5 HOH A 71 500 500 HOH WAT . 
F 5 HOH A 72 501 501 HOH WAT . 
F 5 HOH A 73 502 502 HOH WAT . 
F 5 HOH A 74 503 503 HOH WAT . 
F 5 HOH A 75 504 504 HOH WAT . 
F 5 HOH A 76 505 505 HOH WAT . 
F 5 HOH A 77 506 506 HOH WAT . 
F 5 HOH A 78 507 507 HOH WAT . 
F 5 HOH A 79 508 508 HOH WAT . 
F 5 HOH A 80 509 509 HOH WAT . 
F 5 HOH A 81 510 510 HOH WAT . 
F 5 HOH A 82 511 511 HOH WAT . 
F 5 HOH A 83 512 512 HOH WAT . 
F 5 HOH A 84 513 513 HOH WAT . 
F 5 HOH A 85 514 514 HOH WAT . 
F 5 HOH A 86 515 515 HOH WAT . 
F 5 HOH A 87 516 516 HOH WAT . 
F 5 HOH A 88 517 517 HOH WAT . 
F 5 HOH A 89 518 518 HOH WAT . 
F 5 HOH A 90 519 519 HOH WAT . 
F 5 HOH A 91 520 520 HOH WAT . 
F 5 HOH A 92 521 521 HOH WAT . 
F 5 HOH A 93 522 522 HOH WAT . 
F 5 HOH A 94 523 523 HOH WAT . 
F 5 HOH A 95 524 524 HOH WAT . 
F 5 HOH A 96 525 525 HOH WAT . 
F 5 HOH A 97 526 526 HOH WAT . 
F 5 HOH A 98 527 527 HOH WAT . 
F 5 HOH A 99 528 528 HOH WAT . 
F 5 HOH A 100 529 529 HOH WAT . 
F 5 HOH A 101 530 530 HOH WAT . 
F 5 HOH A 102 531 531 HOH WAT . 
F 5 HOH A 103 532 532 HOH WAT . 
F 5 HOH A 104 533 533 HOH WAT . 
F 5 HOH A 105 534 534 HOH WAT . 
F 5 HOH A 106 535 535 HOH WAT . 
F 5 HOH A 107 536 536 HOH WAT . 
F 5 HOH A 108 537 537 HOH WAT . 
F 5 HOH A 109 538 538 HOH WAT . 
F 5 HOH A 110 539 539 HOH WAT . 
F 5 HOH A 111 540 540 HOH WAT . 
F 5 HOH A 112 541 541 HOH WAT . 
F 5 HOH A 113 542 542 HOH WAT . 
F 5 HOH A 114 543 543 HOH WAT . 
F 5 HOH A 115 544 544 HOH WAT . 
F 5 HOH A 116 545 545 HOH WAT . 
F 5 HOH A 117 546 546 HOH WAT . 
F 5 HOH A 118 547 547 HOH WAT . 
F 5 HOH A 119 548 548 HOH WAT . 
F 5 HOH A 120 549 549 HOH WAT . 
F 5 HOH A 121 550 550 HOH WAT . 
F 5 HOH A 122 551 551 HOH WAT . 
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HETATM 22 N N9 ACQ . . . D 3 21.129 1.334 11.812 1 20.78 ? N9 ACQ 999 A 1 
HETATM 23 C C8 ACQ . . . D 3 21.523 1.042 13.098 1 21.98 ? C8 ACQ 999 A 1 
HETATM 24 N N7 ACQ . . . D 3 22.593 1.673 13.529 1 19.57 ? N7 ACQ 999 A 1 
HETATM 25 C C5 ACQ . . . D 3 22.937 2.433 12.454 1 18.93 ? C5 ACQ 999 A 1 
HETATM 26 C C6 ACQ . . . D 3 23.994 3.365 12.244 1 21.63 ? C6 ACQ 999 A 1 
HETATM 27 N N6 ACQ . . . D 3 24.889 3.638 13.218 1 19.51 ? N6 ACQ 999 A 1 
HETATM 28 N N1 ACQ . . . D 3 24.078 3.986 11.024 1 20.67 ? N1 ACQ 999 A 1 
HETATM 29 C C2 ACQ . . . D 3 23.178 3.711 10.058 1 21.47 ? C2 ACQ 999 A 1 
HETATM 30 N N3 ACQ . . . D 3 22.129 2.854 10.133 1 21.61 ? N3 ACQ 999 A 1 
HETATM 31 C C4 ACQ . . . D 3 22.062 2.241 11.379 1 21.28 ? C4 ACQ 999 A 1 
HETATM 32 P PD ACQ . . . D 3 12.081 1.337 13.908 1 31.24 ? PD ACQ 999 A 1 
HETATM 33 O O1D ACQ . . . D 3 12.624 2.612 13.306 1 28.2 ? O1D ACQ 999 A 1 
HETATM 34 O O2D ACQ . . . D 3 12.353 0.11 13.05 1 30.98 ? O2D ACQ 999 A 1 
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