data_1JQN # _model_server_result.job_id MLMSaluZzSxPdnSvLb9sVw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-06 12:29:13' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1jqn # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":884}' # _entry.id 1JQN # _exptl.entry_id 1JQN _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 133.103 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ASPARTIC ACID' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1JQN _cell.length_a 117.95 _cell.length_b 249.06 _cell.length_c 83.12 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1JQN _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 23 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'I 2 2 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E 1 1 A,B,C,D,E 1 2 A,B,C,D,E 1 3 A,B,C,D,E 1 4 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 2_655 -x+1,-y,z -1 0 0 0 -1 0 0 0 1 117.95 0 0 3 'crystal symmetry operation' 3_655 -x+1,y,-z -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 117.95 0 0 4 'crystal symmetry operation' 4_555 x,-y,-z 1 0 0 0 -1 0 0 0 -1 0 0 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 3 _struct_asym.id C _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OE1 GLU 506 A GLU 506 1_555 B MN MN . A MN 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 543 A ASP 543 1_555 B MN MN . A MN 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.16 ? metalc ? metalc3 D O2 DCO . A DCO 901 1_555 B MN MN . A MN 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.934 ? metalc ? metalc4 D O3 DCO . A DCO 901 1_555 B MN MN . A MN 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? metalc ? metalc5 B MN MN . A MN 902 1_555 E O HOH . A HOH 1095 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? metalc ? metalc6 B MN MN . A MN 902 1_555 E O HOH . A HOH 1096 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? # _chem_comp.formula 'C4 H7 N O4' _chem_comp.formula_weight 133.103 _chem_comp.id ASP _chem_comp.mon_nstd_flag y _chem_comp.name 'ASPARTIC ACID' _chem_comp.type 'l-peptide linking' _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag N CA ASP sing 55 n n N H ASP sing 56 n n N H2 ASP sing 57 n n CA C ASP sing 58 n n CA CB ASP sing 59 n n CA HA ASP sing 60 n n C O ASP doub 61 n n C OXT ASP sing 62 n n CB CG ASP sing 63 n n CB HB2 ASP sing 64 n n CB HB3 ASP sing 65 n n CG OD1 ASP doub 66 n n CG OD2 ASP sing 67 n n OD2 HD2 ASP sing 68 n n OXT HXT ASP sing 69 n n # _atom_sites.entry_id 1JQN _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.008478 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.004015 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.012031 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 MN A 1 902 2 MN MN2 . C 3 ASP A 1 884 884 ASP ASP . D 4 DCO A 1 901 1 DCO DCP . E 5 HOH A 1 903 1 HOH WAT . E 5 HOH A 2 904 2 HOH WAT . E 5 HOH A 3 905 3 HOH WAT . E 5 HOH A 4 906 4 HOH WAT . E 5 HOH A 5 907 5 HOH WAT . E 5 HOH A 6 908 6 HOH WAT . E 5 HOH A 7 909 8 HOH WAT . E 5 HOH A 8 910 9 HOH WAT . E 5 HOH A 9 911 11 HOH WAT . E 5 HOH A 10 912 12 HOH WAT . E 5 HOH A 11 913 13 HOH WAT . E 5 HOH A 12 914 14 HOH WAT . E 5 HOH A 13 915 15 HOH WAT . E 5 HOH A 14 916 16 HOH WAT . E 5 HOH A 15 917 17 HOH WAT . E 5 HOH A 16 918 18 HOH WAT . E 5 HOH A 17 919 19 HOH WAT . E 5 HOH A 18 920 20 HOH WAT . E 5 HOH A 19 921 21 HOH WAT . E 5 HOH A 20 922 22 HOH WAT . E 5 HOH A 21 923 23 HOH WAT . E 5 HOH A 22 924 24 HOH WAT . E 5 HOH A 23 925 25 HOH WAT . E 5 HOH A 24 926 26 HOH WAT . E 5 HOH A 25 927 27 HOH WAT . E 5 HOH A 26 928 28 HOH WAT . E 5 HOH A 27 929 29 HOH WAT . E 5 HOH A 28 930 30 HOH WAT . E 5 HOH A 29 931 31 HOH WAT . E 5 HOH A 30 932 32 HOH WAT . E 5 HOH A 31 933 33 HOH WAT . E 5 HOH A 32 934 34 HOH WAT . E 5 HOH A 33 935 35 HOH WAT . E 5 HOH A 34 936 36 HOH WAT . E 5 HOH A 35 937 37 HOH WAT . E 5 HOH A 36 938 38 HOH WAT . E 5 HOH A 37 939 39 HOH WAT . E 5 HOH A 38 940 40 HOH WAT . E 5 HOH A 39 941 41 HOH WAT . E 5 HOH A 40 942 42 HOH WAT . E 5 HOH A 41 943 43 HOH WAT . E 5 HOH A 42 944 44 HOH WAT . E 5 HOH A 43 945 45 HOH WAT . E 5 HOH A 44 946 47 HOH WAT . E 5 HOH A 45 947 48 HOH WAT . E 5 HOH A 46 948 49 HOH WAT . E 5 HOH A 47 949 50 HOH WAT . E 5 HOH A 48 950 51 HOH WAT . E 5 HOH A 49 951 52 HOH WAT . E 5 HOH A 50 952 53 HOH WAT . E 5 HOH A 51 953 54 HOH WAT . E 5 HOH A 52 954 55 HOH WAT . E 5 HOH A 53 955 57 HOH WAT . E 5 HOH A 54 956 58 HOH WAT . E 5 HOH A 55 957 59 HOH WAT . E 5 HOH A 56 958 60 HOH WAT . E 5 HOH A 57 959 61 HOH WAT . E 5 HOH A 58 960 62 HOH WAT . E 5 HOH A 59 961 63 HOH WAT . E 5 HOH A 60 962 64 HOH WAT . E 5 HOH A 61 963 65 HOH WAT . E 5 HOH A 62 964 67 HOH WAT . E 5 HOH A 63 965 68 HOH WAT . E 5 HOH A 64 966 69 HOH WAT . E 5 HOH A 65 967 70 HOH WAT . E 5 HOH A 66 968 71 HOH WAT . E 5 HOH A 67 969 72 HOH WAT . E 5 HOH A 68 970 73 HOH WAT . E 5 HOH A 69 971 74 HOH WAT . E 5 HOH A 70 972 75 HOH WAT . E 5 HOH A 71 973 76 HOH WAT . E 5 HOH A 72 974 77 HOH WAT . E 5 HOH A 73 975 78 HOH WAT . E 5 HOH A 74 976 79 HOH WAT . E 5 HOH A 75 977 80 HOH WAT . E 5 HOH A 76 978 81 HOH WAT . E 5 HOH A 77 979 82 HOH WAT . E 5 HOH A 78 980 85 HOH WAT . E 5 HOH A 79 981 88 HOH WAT . E 5 HOH A 80 982 89 HOH WAT . E 5 HOH A 81 983 90 HOH WAT . E 5 HOH A 82 984 91 HOH WAT . E 5 HOH A 83 985 92 HOH WAT . E 5 HOH A 84 986 96 HOH WAT . E 5 HOH A 85 987 97 HOH WAT . E 5 HOH A 86 988 101 HOH WAT . E 5 HOH A 87 989 106 HOH WAT . E 5 HOH A 88 990 107 HOH WAT . E 5 HOH A 89 991 109 HOH WAT . E 5 HOH A 90 992 111 HOH WAT . E 5 HOH A 91 993 112 HOH WAT . E 5 HOH A 92 994 116 HOH WAT . E 5 HOH A 93 995 118 HOH WAT . E 5 HOH A 94 996 120 HOH WAT . E 5 HOH A 95 997 122 HOH WAT . E 5 HOH A 96 998 123 HOH WAT . E 5 HOH A 97 999 124 HOH WAT . E 5 HOH A 98 1000 125 HOH WAT . E 5 HOH A 99 1001 126 HOH WAT . E 5 HOH A 100 1002 128 HOH WAT . E 5 HOH A 101 1003 129 HOH WAT . E 5 HOH A 102 1004 130 HOH WAT . E 5 HOH A 103 1005 131 HOH WAT . E 5 HOH A 104 1006 132 HOH WAT . E 5 HOH A 105 1007 136 HOH WAT . E 5 HOH A 106 1008 139 HOH WAT . E 5 HOH A 107 1009 147 HOH WAT . E 5 HOH A 108 1010 149 HOH WAT . E 5 HOH A 109 1011 150 HOH WAT . E 5 HOH A 110 1012 151 HOH WAT . E 5 HOH A 111 1013 152 HOH WAT . E 5 HOH A 112 1014 153 HOH WAT . E 5 HOH A 113 1015 155 HOH WAT . E 5 HOH A 114 1016 156 HOH WAT . E 5 HOH A 115 1017 157 HOH WAT . E 5 HOH A 116 1018 158 HOH WAT . E 5 HOH A 117 1019 161 HOH WAT . E 5 HOH A 118 1020 164 HOH WAT . E 5 HOH A 119 1021 166 HOH WAT . E 5 HOH A 120 1022 171 HOH WAT . E 5 HOH A 121 1023 172 HOH WAT . E 5 HOH A 122 1024 173 HOH WAT . E 5 HOH A 123 1025 175 HOH WAT . E 5 HOH A 124 1026 176 HOH WAT . E 5 HOH A 125 1027 177 HOH WAT . E 5 HOH A 126 1028 178 HOH WAT . E 5 HOH A 127 1029 179 HOH WAT . E 5 HOH A 128 1030 180 HOH WAT . E 5 HOH A 129 1031 181 HOH WAT . E 5 HOH A 130 1032 185 HOH WAT . E 5 HOH A 131 1033 186 HOH WAT . E 5 HOH A 132 1034 187 HOH WAT . E 5 HOH A 133 1035 188 HOH WAT . E 5 HOH A 134 1036 191 HOH WAT . E 5 HOH A 135 1037 193 HOH WAT . E 5 HOH A 136 1038 195 HOH WAT . E 5 HOH A 137 1039 196 HOH WAT . E 5 HOH A 138 1040 198 HOH WAT . E 5 HOH A 139 1041 201 HOH WAT . E 5 HOH A 140 1042 203 HOH WAT . E 5 HOH A 141 1043 206 HOH WAT . E 5 HOH A 142 1044 207 HOH WAT . E 5 HOH A 143 1045 209 HOH WAT . E 5 HOH A 144 1046 237 HOH WAT . E 5 HOH A 145 1047 240 HOH WAT . E 5 HOH A 146 1048 243 HOH WAT . E 5 HOH A 147 1049 247 HOH WAT . E 5 HOH A 148 1050 248 HOH WAT . E 5 HOH A 149 1051 249 HOH WAT . E 5 HOH A 150 1052 251 HOH WAT . E 5 HOH A 151 1053 255 HOH WAT . E 5 HOH A 152 1054 257 HOH WAT . E 5 HOH A 153 1055 261 HOH WAT . E 5 HOH A 154 1056 262 HOH WAT . E 5 HOH A 155 1057 263 HOH WAT . E 5 HOH A 156 1058 264 HOH WAT . E 5 HOH A 157 1059 266 HOH WAT . E 5 HOH A 158 1060 267 HOH WAT . E 5 HOH A 159 1061 268 HOH WAT . E 5 HOH A 160 1062 270 HOH WAT . E 5 HOH A 161 1063 273 HOH WAT . E 5 HOH A 162 1064 279 HOH WAT . E 5 HOH A 163 1065 281 HOH WAT . E 5 HOH A 164 1066 282 HOH WAT . E 5 HOH A 165 1067 284 HOH WAT . E 5 HOH A 166 1068 288 HOH WAT . E 5 HOH A 167 1069 289 HOH WAT . E 5 HOH A 168 1070 291 HOH WAT . E 5 HOH A 169 1071 292 HOH WAT . E 5 HOH A 170 1072 293 HOH WAT . E 5 HOH A 171 1073 295 HOH WAT . E 5 HOH A 172 1074 299 HOH WAT . E 5 HOH A 173 1075 301 HOH WAT . E 5 HOH A 174 1076 302 HOH WAT . E 5 HOH A 175 1077 303 HOH WAT . E 5 HOH A 176 1078 304 HOH WAT . E 5 HOH A 177 1079 307 HOH WAT . E 5 HOH A 178 1080 309 HOH WAT . E 5 HOH A 179 1081 314 HOH WAT . E 5 HOH A 180 1082 317 HOH WAT . E 5 HOH A 181 1083 318 HOH WAT . E 5 HOH A 182 1084 320 HOH WAT . E 5 HOH A 183 1085 322 HOH WAT . E 5 HOH A 184 1086 326 HOH WAT . E 5 HOH A 185 1087 328 HOH WAT . E 5 HOH A 186 1088 330 HOH WAT . E 5 HOH A 187 1089 332 HOH WAT . E 5 HOH A 188 1090 334 HOH WAT . E 5 HOH A 189 1091 335 HOH WAT . E 5 HOH A 190 1092 336 HOH WAT . E 5 HOH A 191 1093 337 HOH WAT . E 5 HOH A 192 1094 341 HOH WAT . E 5 HOH A 193 1095 342 HOH WAT . E 5 HOH A 194 1096 343 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 N N ASP . . . C 3 32.707 49.046 -11.52 1 38.25 ? N ASP 884 A 1 HETATM 2 C CA ASP . . . C 3 32.177 50.355 -11.994 1 38.81 ? CA ASP 884 A 1 HETATM 3 C C ASP . . . C 3 30.716 50.467 -11.605 1 39.72 ? C ASP 884 A 1 HETATM 4 O O ASP . . . C 3 30.222 51.601 -11.469 1 40.13 ? O ASP 884 A 1 HETATM 5 C CB ASP . . . C 3 32.309 50.465 -13.515 1 37.31 ? CB ASP 884 A 1 HETATM 6 C CG ASP . . . C 3 33.693 50.139 -13.995 1 35.46 ? CG ASP 884 A 1 HETATM 7 O OD1 ASP . . . C 3 34.663 50.54 -13.331 1 38.18 ? OD1 ASP 884 A 1 HETATM 8 O OD2 ASP . . . C 3 33.82 49.484 -15.04 1 36.26 ? OD2 ASP 884 A 1 HETATM 9 O OXT ASP . . . C 3 30.085 49.406 -11.444 1 41.91 ? OXT ASP 884 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 0 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 6 _model_server_stats.query_time_ms 269 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 9 #