data_1JTW # _model_server_result.job_id YHyIql5Ki1NrfE7WFLW8Ug _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 19:16:28' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1jtw # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"N","auth_seq_id":29}' # _entry.id 1JTW # _exptl.entry_id 1JTW _exptl.method 'SOLUTION NMR' # _entity.details ? _entity.formula_weight 22.99 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'SODIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 15 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha ? _cell.angle_beta ? _cell.angle_gamma ? _cell.entry_id 1JTW _cell.length_a ? _cell.length_b ? _cell.length_c ? _cell.Z_PDB 1 _cell.pdbx_unique_axis ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 H N N ? 2 I N N ? 2 J N N ? 2 K N N ? 2 L N N ? 2 M N N ? 2 N N N ? 2 O N N ? 2 P N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OP1 G 2 A G 2 1_555 B NA NA . A NA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.486 ? metalc ? metalc2 A OP2 G 2 A G 2 1_555 L NA NA . A NA 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.729 ? metalc ? metalc3 A O6 G 3 A G 3 1_555 C NA NA . A NA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.617 ? metalc ? metalc4 A OP1 G 3 A G 3 1_555 D NA NA . A NA 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.627 ? metalc ? metalc5 A OP2 G 3 A G 3 1_555 L NA NA . A NA 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.621 ? metalc ? metalc6 A O4 U 4 A U 4 1_555 C NA NA . A NA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.744 ? metalc ? metalc7 A OP2 U 4 A U 4 1_555 D NA NA . A NA 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.536 ? metalc ? metalc8 A OP1 U 4 A U 4 1_555 E NA NA . A NA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.626 ? metalc ? metalc9 A O5' U 4 A U 4 1_555 E NA NA . A NA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.969 ? metalc ? metalc10 A OP2 G 5 A G 5 1_555 E NA NA . A NA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.679 ? metalc ? metalc11 A OP1 C 6 A C 6 1_555 H NA NA . A NA 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.497 ? metalc ? metalc12 A OP1 G 7 A G 7 1_555 G NA NA . A NA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.953 ? metalc ? metalc13 A OP2 G 7 A G 7 1_555 G NA NA . A NA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.845 ? metalc ? metalc14 A OP1 A 8 A A 8 1_555 G NA NA . A NA 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.696 ? metalc ? metalc15 A OP2 A 8 A A 8 1_555 I NA NA . A NA 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? metalc ? metalc16 A OP2 G 9 A G 9 1_555 I NA NA . A NA 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.559 ? metalc ? metalc17 A OP1 G 9 A G 9 1_555 J NA NA . A NA 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.853 ? metalc ? metalc18 A O5' G 9 A G 9 1_555 J NA NA . A NA 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.943 ? metalc ? metalc19 A OP2 A 10 A A 10 1_555 J NA NA . A NA 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.62 ? metalc ? metalc20 A OP1 G 11 A G 11 1_555 K NA NA . A NA 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.722 ? metalc ? metalc21 A OP2 G 11 A G 11 1_555 K NA NA . A NA 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.613 ? metalc ? metalc22 A O3' G 11 A G 11 1_555 N NA NA . A NA 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.619 ? metalc ? metalc23 A OP2 C 12 A C 12 1_555 M NA NA . A NA 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.689 ? metalc ? metalc24 A OP1 C 12 A C 12 1_555 N NA NA . A NA 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.66 ? metalc ? metalc25 A O6 G 13 A G 13 1_555 C NA NA . A NA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.592 ? metalc ? metalc26 A OP2 G 13 A G 13 1_555 M NA NA . A NA 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.556 ? metalc ? metalc27 A O4 U 14 A U 14 1_555 C NA NA . A NA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.901 ? metalc ? metalc28 A OP1 U 14 A U 14 1_555 F NA NA . A NA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.575 ? metalc ? metalc29 A OP2 U 14 A U 14 1_555 O NA NA . A NA 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.664 ? metalc ? metalc30 A O5' U 14 A U 14 1_555 O NA NA . A NA 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.99 ? metalc ? metalc31 A OP2 C 15 A C 15 1_555 O NA NA . A NA 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.535 ? metalc ? metalc32 A O5' C 15 A C 15 1_555 P NA NA . A NA 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.893 ? metalc ? metalc33 A OP2 A 16 A A 16 1_555 P NA NA . A NA 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.594 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N1 G 2 A G 2 1_555 A N3 C 15 A C 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N2 G 2 A G 2 1_555 A O2 C 15 A C 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O6 G 2 A G 2 1_555 A N4 C 15 A C 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog4 A N1 G 3 A G 3 1_555 A O2 U 14 A U 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog5 A O6 G 3 A G 3 1_555 A N3 U 14 A U 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog6 A N3 U 4 A U 4 1_555 A O6 G 13 A G 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog7 A O2 U 4 A U 4 1_555 A N1 G 13 A G 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A N1 G 5 A G 5 1_555 A N3 C 12 A C 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A N2 G 5 A G 5 1_555 A O2 C 12 A C 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A O6 G 5 A G 5 1_555 A N4 C 12 A C 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A N3 C 6 A C 6 1_555 A N1 G 11 A G 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A N4 C 6 A C 6 1_555 A O6 G 11 A G 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A O2 C 6 A C 6 1_555 A N2 G 11 A G 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog14 A N2 G 7 A G 7 1_555 A N7 A 10 A A 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Na 1' _chem_comp.formula_weight 22.99 _chem_comp.id NA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'SODIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1JTW _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 NA A 1 17 17 NA NA . C 2 NA A 1 18 18 NA NA . D 2 NA A 1 19 19 NA NA . E 2 NA A 1 20 20 NA NA . F 2 NA A 1 21 21 NA NA . G 2 NA A 1 22 22 NA NA . H 2 NA A 1 23 23 NA NA . I 2 NA A 1 24 24 NA NA . J 2 NA A 1 25 25 NA NA . K 2 NA A 1 26 26 NA NA . L 2 NA A 1 27 27 NA NA . M 2 NA A 1 28 28 NA NA . N 2 NA A 1 29 29 NA NA . O 2 NA A 1 30 30 NA NA . P 2 NA A 1 31 31 NA NA . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol NA _atom_site.label_atom_id NA _atom_site.label_comp_id NA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id N _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 28.067 _atom_site.Cartn_y 9.255 _atom_site.Cartn_z 1.399 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 0 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id NA _atom_site.auth_comp_id NA _atom_site.auth_seq_id 29 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 6 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 34 _model_server_stats.query_time_ms 3080 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 1 #