data_1JW9 # _model_server_result.job_id Wm5q3tf9fSvkgYhD_Ibu6w _model_server_result.datetime_utc '2024-10-17 05:39:58' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1jw9 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":250}' # _entry.id 1JW9 # _exptl.entry_id 1JW9 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1JW9 _cell.length_a 77.832 _cell.length_b 77.832 _cell.length_c 102.139 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1JW9 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 92 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 41 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA,PQS _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 8_665 -y+1,-x+1,-z+1/2 0 -1 0 -1 0 0 0 0 -1 77.832 77.832 51.0695 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 3 _struct_asym.id C _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A SG CYS 172 B CYS 172 1_555 C ZN ZN . B ZN 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 175 B CYS 175 1_555 C ZN ZN . B ZN 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 244 B CYS 244 1_555 C ZN ZN . B ZN 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 247 B CYS 247 1_555 C ZN ZN . B ZN 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1JW9 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.012848 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.012848 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.009791 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 3 ZN B 1 250 1 ZN ZN . D 4 SO4 B 1 251 227 SO4 SUL . E 4 SO4 B 1 252 230 SO4 SUL . F 4 SO4 D 1 82 2 SO4 SUL . G 5 HOH B 1 253 3 HOH WAT . G 5 HOH B 2 254 4 HOH WAT . G 5 HOH B 3 255 5 HOH WAT . G 5 HOH B 4 256 6 HOH WAT . G 5 HOH B 5 257 7 HOH WAT . G 5 HOH B 6 258 8 HOH WAT . G 5 HOH B 7 259 9 HOH WAT . G 5 HOH B 8 260 10 HOH WAT . G 5 HOH B 9 261 11 HOH WAT . G 5 HOH B 10 262 12 HOH WAT . G 5 HOH B 11 263 14 HOH WAT . G 5 HOH B 12 264 15 HOH WAT . G 5 HOH B 13 265 17 HOH WAT . G 5 HOH B 14 266 18 HOH WAT . G 5 HOH B 15 267 19 HOH WAT . G 5 HOH B 16 268 20 HOH WAT . G 5 HOH B 17 269 21 HOH WAT . G 5 HOH B 18 270 22 HOH WAT . G 5 HOH B 19 271 23 HOH WAT . G 5 HOH B 20 272 24 HOH WAT . G 5 HOH B 21 273 26 HOH WAT . G 5 HOH B 22 274 27 HOH WAT . G 5 HOH B 23 275 29 HOH WAT . G 5 HOH B 24 276 30 HOH WAT . G 5 HOH B 25 277 31 HOH WAT . G 5 HOH B 26 278 32 HOH WAT . G 5 HOH B 27 279 33 HOH WAT . G 5 HOH B 28 280 34 HOH WAT . G 5 HOH B 29 281 35 HOH WAT . G 5 HOH B 30 282 36 HOH WAT . G 5 HOH B 31 283 37 HOH WAT . G 5 HOH B 32 284 38 HOH WAT . G 5 HOH B 33 285 39 HOH WAT . G 5 HOH B 34 286 40 HOH WAT . G 5 HOH B 35 287 42 HOH WAT . G 5 HOH B 36 288 43 HOH WAT . G 5 HOH B 37 289 44 HOH WAT . G 5 HOH B 38 290 45 HOH WAT . G 5 HOH B 39 291 46 HOH WAT . G 5 HOH B 40 292 47 HOH WAT . G 5 HOH B 41 293 49 HOH WAT . G 5 HOH B 42 294 51 HOH WAT . G 5 HOH B 43 295 52 HOH WAT . G 5 HOH B 44 296 53 HOH WAT . G 5 HOH B 45 297 54 HOH WAT . G 5 HOH B 46 298 55 HOH WAT . G 5 HOH B 47 299 56 HOH WAT . G 5 HOH B 48 300 57 HOH WAT . G 5 HOH B 49 301 58 HOH WAT . G 5 HOH B 50 302 59 HOH WAT . G 5 HOH B 51 303 60 HOH WAT . G 5 HOH B 52 304 61 HOH WAT . G 5 HOH B 53 305 62 HOH WAT . G 5 HOH B 54 306 65 HOH WAT . G 5 HOH B 55 307 66 HOH WAT . G 5 HOH B 56 308 67 HOH WAT . G 5 HOH B 57 309 68 HOH WAT . G 5 HOH B 58 310 69 HOH WAT . G 5 HOH B 59 311 70 HOH WAT . G 5 HOH B 60 312 71 HOH WAT . G 5 HOH B 61 313 72 HOH WAT . G 5 HOH B 62 314 73 HOH WAT . G 5 HOH B 63 315 74 HOH WAT . G 5 HOH B 64 316 75 HOH WAT . G 5 HOH B 65 317 76 HOH WAT . G 5 HOH B 66 318 77 HOH WAT . G 5 HOH B 67 319 78 HOH WAT . G 5 HOH B 68 320 79 HOH WAT . G 5 HOH B 69 321 80 HOH WAT . G 5 HOH B 70 322 82 HOH WAT . G 5 HOH B 71 323 83 HOH WAT . G 5 HOH B 72 324 85 HOH WAT . G 5 HOH B 73 325 87 HOH WAT . G 5 HOH B 74 326 88 HOH WAT . G 5 HOH B 75 327 89 HOH WAT . G 5 HOH B 76 328 90 HOH WAT . G 5 HOH B 77 329 92 HOH WAT . G 5 HOH B 78 330 93 HOH WAT . G 5 HOH B 79 331 94 HOH WAT . G 5 HOH B 80 332 95 HOH WAT . G 5 HOH B 81 333 96 HOH WAT . G 5 HOH B 82 334 98 HOH WAT . G 5 HOH B 83 335 99 HOH WAT . G 5 HOH B 84 336 100 HOH WAT . G 5 HOH B 85 337 101 HOH WAT . G 5 HOH B 86 338 102 HOH WAT . G 5 HOH B 87 339 103 HOH WAT . G 5 HOH B 88 340 104 HOH WAT . G 5 HOH B 89 341 105 HOH WAT . G 5 HOH B 90 342 106 HOH WAT . G 5 HOH B 91 343 107 HOH WAT . G 5 HOH B 92 344 108 HOH WAT . G 5 HOH B 93 345 109 HOH WAT . G 5 HOH B 94 346 110 HOH WAT . G 5 HOH B 95 347 112 HOH WAT . G 5 HOH B 96 348 113 HOH WAT . G 5 HOH B 97 349 115 HOH WAT . G 5 HOH B 98 350 120 HOH WAT . G 5 HOH B 99 351 124 HOH WAT . G 5 HOH B 100 352 125 HOH WAT . G 5 HOH B 101 353 126 HOH WAT . G 5 HOH B 102 354 127 HOH WAT . G 5 HOH B 103 355 128 HOH WAT . G 5 HOH B 104 356 129 HOH WAT . G 5 HOH B 105 357 130 HOH WAT . G 5 HOH B 106 358 131 HOH WAT . G 5 HOH B 107 359 132 HOH WAT . G 5 HOH B 108 360 135 HOH WAT . G 5 HOH B 109 361 136 HOH WAT . G 5 HOH B 110 362 137 HOH WAT . G 5 HOH B 111 363 138 HOH WAT . G 5 HOH B 112 364 139 HOH WAT . G 5 HOH B 113 365 141 HOH WAT . G 5 HOH B 114 366 142 HOH WAT . G 5 HOH B 115 367 144 HOH WAT . G 5 HOH B 116 368 145 HOH WAT . G 5 HOH B 117 369 146 HOH WAT . G 5 HOH B 118 370 147 HOH WAT . G 5 HOH B 119 371 148 HOH WAT . G 5 HOH B 120 372 149 HOH WAT . G 5 HOH B 121 373 150 HOH WAT . G 5 HOH B 122 374 151 HOH WAT . G 5 HOH B 123 375 153 HOH WAT . G 5 HOH B 124 376 154 HOH WAT . G 5 HOH B 125 377 157 HOH WAT . G 5 HOH B 126 378 158 HOH WAT . G 5 HOH B 127 379 160 HOH WAT . G 5 HOH B 128 380 161 HOH WAT . G 5 HOH B 129 381 162 HOH WAT . G 5 HOH B 130 382 164 HOH WAT . G 5 HOH B 131 383 168 HOH WAT . G 5 HOH B 132 384 169 HOH WAT . G 5 HOH B 133 385 170 HOH WAT . G 5 HOH B 134 386 171 HOH WAT . G 5 HOH B 135 387 172 HOH WAT . G 5 HOH B 136 388 173 HOH WAT . G 5 HOH B 137 389 177 HOH WAT . G 5 HOH B 138 390 178 HOH WAT . G 5 HOH B 139 391 181 HOH WAT . G 5 HOH B 140 392 182 HOH WAT . G 5 HOH B 141 393 187 HOH WAT . G 5 HOH B 142 394 189 HOH WAT . G 5 HOH B 143 395 190 HOH WAT . G 5 HOH B 144 396 194 HOH WAT . G 5 HOH B 145 397 196 HOH WAT . G 5 HOH B 146 398 197 HOH WAT . G 5 HOH B 147 399 198 HOH WAT . G 5 HOH B 148 400 201 HOH WAT . G 5 HOH B 149 401 203 HOH WAT . G 5 HOH B 150 402 205 HOH WAT . G 5 HOH B 151 403 207 HOH WAT . G 5 HOH B 152 404 208 HOH WAT . G 5 HOH B 153 405 210 HOH WAT . G 5 HOH B 154 406 214 HOH WAT . G 5 HOH B 155 407 215 HOH WAT . G 5 HOH B 156 408 216 HOH WAT . G 5 HOH B 157 409 217 HOH WAT . G 5 HOH B 158 410 219 HOH WAT . G 5 HOH B 159 411 220 HOH WAT . G 5 HOH B 160 412 223 HOH WAT . G 5 HOH B 161 413 226 HOH WAT . G 5 HOH B 162 414 228 HOH WAT . G 5 HOH B 163 415 229 HOH WAT . G 5 HOH B 164 416 231 HOH WAT . G 5 HOH B 165 417 232 HOH WAT . H 5 HOH D 1 83 13 HOH WAT . H 5 HOH D 2 84 16 HOH WAT . H 5 HOH D 3 85 25 HOH WAT . H 5 HOH D 4 86 28 HOH WAT . H 5 HOH D 5 87 41 HOH WAT . H 5 HOH D 6 88 48 HOH WAT . H 5 HOH D 7 89 64 HOH WAT . H 5 HOH D 8 90 81 HOH WAT . H 5 HOH D 9 91 84 HOH WAT . H 5 HOH D 10 92 86 HOH WAT . H 5 HOH D 11 93 91 HOH WAT . H 5 HOH D 12 94 97 HOH WAT . H 5 HOH D 13 95 111 HOH WAT . H 5 HOH D 14 96 114 HOH WAT . H 5 HOH D 15 97 116 HOH WAT . H 5 HOH D 16 98 117 HOH WAT . H 5 HOH D 17 99 118 HOH WAT . H 5 HOH D 18 100 119 HOH WAT . H 5 HOH D 19 101 121 HOH WAT . H 5 HOH D 20 102 123 HOH WAT . H 5 HOH D 21 103 134 HOH WAT . H 5 HOH D 22 104 140 HOH WAT . H 5 HOH D 23 105 143 HOH WAT . H 5 HOH D 24 106 155 HOH WAT . H 5 HOH D 25 107 156 HOH WAT . H 5 HOH D 26 108 159 HOH WAT . H 5 HOH D 27 109 165 HOH WAT . H 5 HOH D 28 110 166 HOH WAT . H 5 HOH D 29 111 167 HOH WAT . H 5 HOH D 30 112 174 HOH WAT . H 5 HOH D 31 113 175 HOH WAT . H 5 HOH D 32 114 176 HOH WAT . H 5 HOH D 33 115 179 HOH WAT . H 5 HOH D 34 116 180 HOH WAT . H 5 HOH D 35 117 183 HOH WAT . H 5 HOH D 36 118 184 HOH WAT . H 5 HOH D 37 119 185 HOH WAT . H 5 HOH D 38 120 186 HOH WAT . H 5 HOH D 39 121 188 HOH WAT . H 5 HOH D 40 122 192 HOH WAT . H 5 HOH D 41 123 193 HOH WAT . H 5 HOH D 42 124 195 HOH WAT . H 5 HOH D 43 125 199 HOH WAT . H 5 HOH D 44 126 200 HOH WAT . H 5 HOH D 45 127 202 HOH WAT . H 5 HOH D 46 128 213 HOH WAT . H 5 HOH D 47 129 218 HOH WAT . H 5 HOH D 48 130 222 HOH WAT . H 5 HOH D 49 131 224 HOH WAT . H 5 HOH D 50 132 225 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id C _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 15.939 _atom_site.Cartn_y 27.351 _atom_site.Cartn_z 29.688 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 28.93 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 250 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 42 _model_server_stats.parse_time_ms 100 _model_server_stats.create_model_time_ms 38 _model_server_stats.query_time_ms 328 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 1 #