data_1JWH # _model_server_result.job_id JY9d6XNxYBviylLCBL-BSQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-28 03:30:27' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1jwh # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"L","auth_seq_id":355}' # _entry.id 1JWH # _exptl.entry_id 1JWH _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 94.971 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'PHOSPHATE ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 7 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 1JWH _cell.length_a 175.99 _cell.length_b 175.99 _cell.length_c 93.666 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1JWH _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 173 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 63' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 E N N ? 3 G N N ? 3 H N N ? 3 I N N ? 3 K N N ? 3 L N N ? 3 M N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 C SG CYS 109 C CYS 109 1_555 J ZN ZN . C ZN 357 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.163 ? metalc ? metalc2 C SG CYS 114 C CYS 114 1_555 J ZN ZN . C ZN 357 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.215 ? metalc ? metalc3 C SG CYS 137 C CYS 137 1_555 J ZN ZN . C ZN 357 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc4 C SG CYS 140 C CYS 140 1_555 J ZN ZN . C ZN 357 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.867 ? metalc ? metalc5 D SG CYS 109 D CYS 109 1_555 N ZN ZN . D ZN 358 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.407 ? metalc ? metalc6 D SG CYS 114 D CYS 114 1_555 N ZN ZN . D ZN 358 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.002 ? metalc ? metalc7 D SG CYS 137 D CYS 137 1_555 N ZN ZN . D ZN 358 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.619 ? metalc ? metalc8 D SG CYS 140 D CYS 140 1_555 N ZN ZN . D ZN 358 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.671 ? # _chem_comp.formula 'O4 P -3' _chem_comp.formula_weight 94.971 _chem_comp.id PO4 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'PHOSPHATE ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag P O1 PO4 doub 310 n n P O2 PO4 sing 311 n n P O3 PO4 sing 312 n n P O4 PO4 sing 313 n n # _atom_sites.entry_id 1JWH _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.005682 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.003281 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006561 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.010676 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 3 PO4 A 1 350 350 PO4 PO4 . F 4 ANP A 1 340 340 ANP ANP . G 3 PO4 B 1 351 351 PO4 PO4 . H 3 PO4 B 1 352 352 PO4 PO4 . I 3 PO4 C 1 353 353 PO4 PO4 . J 5 ZN C 1 357 357 ZN ZN2 . K 3 PO4 D 1 354 354 PO4 PO4 . L 3 PO4 D 1 355 355 PO4 PO4 . M 3 PO4 D 1 356 356 PO4 PO4 . N 5 ZN D 1 358 358 ZN ZN2 . O 6 HOH A 1 351 2 HOH WAT . O 6 HOH A 2 352 3 HOH WAT . O 6 HOH A 3 353 4 HOH WAT . O 6 HOH A 4 354 5 HOH WAT . O 6 HOH A 5 355 6 HOH WAT . O 6 HOH A 6 356 7 HOH WAT . O 6 HOH A 7 357 8 HOH WAT . O 6 HOH A 8 358 9 HOH WAT . O 6 HOH A 9 359 10 HOH WAT . O 6 HOH A 10 360 11 HOH WAT . O 6 HOH A 11 361 12 HOH WAT . O 6 HOH A 12 362 13 HOH WAT . O 6 HOH A 13 363 19 HOH WAT . O 6 HOH A 14 364 32 HOH WAT . O 6 HOH A 15 365 35 HOH WAT . O 6 HOH A 16 366 36 HOH WAT . O 6 HOH A 17 367 43 HOH WAT . O 6 HOH A 18 368 44 HOH WAT . O 6 HOH A 19 369 49 HOH WAT . O 6 HOH A 20 370 51 HOH WAT . O 6 HOH A 21 371 60 HOH WAT . O 6 HOH A 22 372 62 HOH WAT . O 6 HOH A 23 373 66 HOH WAT . O 6 HOH A 24 374 67 HOH WAT . O 6 HOH A 25 375 72 HOH WAT . O 6 HOH A 26 376 74 HOH WAT . O 6 HOH A 27 377 81 HOH WAT . O 6 HOH A 28 378 83 HOH WAT . O 6 HOH A 29 379 85 HOH WAT . O 6 HOH A 30 380 88 HOH WAT . O 6 HOH A 31 381 91 HOH WAT . O 6 HOH A 32 382 94 HOH WAT . O 6 HOH A 33 383 103 HOH WAT . O 6 HOH A 34 384 108 HOH WAT . O 6 HOH A 35 385 110 HOH WAT . O 6 HOH A 36 386 112 HOH WAT . O 6 HOH A 37 387 114 HOH WAT . O 6 HOH A 38 388 117 HOH WAT . O 6 HOH A 39 389 118 HOH WAT . O 6 HOH A 40 390 119 HOH WAT . O 6 HOH A 41 391 120 HOH WAT . O 6 HOH A 42 392 121 HOH WAT . O 6 HOH A 43 393 122 HOH WAT . O 6 HOH A 44 394 123 HOH WAT . O 6 HOH A 45 395 124 HOH WAT . O 6 HOH A 46 396 125 HOH WAT . O 6 HOH A 47 397 126 HOH WAT . O 6 HOH A 48 398 133 HOH WAT . O 6 HOH A 49 399 134 HOH WAT . O 6 HOH A 50 400 136 HOH WAT . O 6 HOH A 51 401 137 HOH WAT . O 6 HOH A 52 402 138 HOH WAT . O 6 HOH A 53 403 139 HOH WAT . O 6 HOH A 54 404 140 HOH WAT . O 6 HOH A 55 405 141 HOH WAT . O 6 HOH A 56 406 142 HOH WAT . O 6 HOH A 57 407 143 HOH WAT . O 6 HOH A 58 408 144 HOH WAT . O 6 HOH A 59 409 145 HOH WAT . O 6 HOH A 60 410 146 HOH WAT . O 6 HOH A 61 411 147 HOH WAT . O 6 HOH A 62 412 148 HOH WAT . O 6 HOH A 63 413 149 HOH WAT . O 6 HOH A 64 414 150 HOH WAT . O 6 HOH A 65 415 151 HOH WAT . O 6 HOH A 66 416 152 HOH WAT . O 6 HOH A 67 417 153 HOH WAT . O 6 HOH A 68 418 158 HOH WAT . O 6 HOH A 69 419 159 HOH WAT . O 6 HOH A 70 420 161 HOH WAT . O 6 HOH A 71 421 173 HOH WAT . O 6 HOH A 72 422 175 HOH WAT . O 6 HOH A 73 423 177 HOH WAT . O 6 HOH A 74 424 183 HOH WAT . O 6 HOH A 75 425 184 HOH WAT . O 6 HOH A 76 426 188 HOH WAT . O 6 HOH A 77 427 190 HOH WAT . O 6 HOH A 78 428 193 HOH WAT . O 6 HOH A 79 429 196 HOH WAT . O 6 HOH A 80 430 200 HOH WAT . O 6 HOH A 81 431 207 HOH WAT . P 6 HOH B 1 353 1 HOH WAT . P 6 HOH B 2 354 14 HOH WAT . P 6 HOH B 3 355 15 HOH WAT . P 6 HOH B 4 356 16 HOH WAT . P 6 HOH B 5 357 17 HOH WAT . P 6 HOH B 6 358 18 HOH WAT . P 6 HOH B 7 359 20 HOH WAT . P 6 HOH B 8 360 21 HOH WAT . P 6 HOH B 9 361 30 HOH WAT . P 6 HOH B 10 362 31 HOH WAT . P 6 HOH B 11 363 33 HOH WAT . P 6 HOH B 12 364 34 HOH WAT . P 6 HOH B 13 365 38 HOH WAT . P 6 HOH B 14 366 39 HOH WAT . P 6 HOH B 15 367 40 HOH WAT . P 6 HOH B 16 368 42 HOH WAT . P 6 HOH B 17 369 46 HOH WAT . P 6 HOH B 18 370 47 HOH WAT . P 6 HOH B 19 371 52 HOH WAT . P 6 HOH B 20 372 53 HOH WAT . P 6 HOH B 21 373 54 HOH WAT . P 6 HOH B 22 374 56 HOH WAT . P 6 HOH B 23 375 58 HOH WAT . P 6 HOH B 24 376 59 HOH WAT . P 6 HOH B 25 377 61 HOH WAT . P 6 HOH B 26 378 65 HOH WAT . P 6 HOH B 27 379 69 HOH WAT . P 6 HOH B 28 380 70 HOH WAT . P 6 HOH B 29 381 71 HOH WAT . P 6 HOH B 30 382 75 HOH WAT . P 6 HOH B 31 383 76 HOH WAT . P 6 HOH B 32 384 78 HOH WAT . P 6 HOH B 33 385 79 HOH WAT . P 6 HOH B 34 386 80 HOH WAT . P 6 HOH B 35 387 82 HOH WAT . P 6 HOH B 36 388 87 HOH WAT . P 6 HOH B 37 389 89 HOH WAT . P 6 HOH B 38 390 92 HOH WAT . P 6 HOH B 39 391 95 HOH WAT . P 6 HOH B 40 392 99 HOH WAT . P 6 HOH B 41 393 100 HOH WAT . P 6 HOH B 42 394 104 HOH WAT . P 6 HOH B 43 395 105 HOH WAT . P 6 HOH B 44 396 106 HOH WAT . P 6 HOH B 45 397 113 HOH WAT . P 6 HOH B 46 398 127 HOH WAT . P 6 HOH B 47 399 128 HOH WAT . P 6 HOH B 48 400 129 HOH WAT . P 6 HOH B 49 401 130 HOH WAT . P 6 HOH B 50 402 131 HOH WAT . P 6 HOH B 51 403 132 HOH WAT . P 6 HOH B 52 404 135 HOH WAT . P 6 HOH B 53 405 160 HOH WAT . P 6 HOH B 54 406 162 HOH WAT . P 6 HOH B 55 407 163 HOH WAT . P 6 HOH B 56 408 164 HOH WAT . P 6 HOH B 57 409 165 HOH WAT . P 6 HOH B 58 410 166 HOH WAT . P 6 HOH B 59 411 167 HOH WAT . P 6 HOH B 60 412 168 HOH WAT . P 6 HOH B 61 413 169 HOH WAT . P 6 HOH B 62 414 170 HOH WAT . P 6 HOH B 63 415 171 HOH WAT . P 6 HOH B 64 416 172 HOH WAT . P 6 HOH B 65 417 176 HOH WAT . P 6 HOH B 66 418 180 HOH WAT . P 6 HOH B 67 419 187 HOH WAT . P 6 HOH B 68 420 192 HOH WAT . P 6 HOH B 69 421 197 HOH WAT . P 6 HOH B 70 422 202 HOH WAT . P 6 HOH B 71 423 203 HOH WAT . P 6 HOH B 72 424 205 HOH WAT . P 6 HOH B 73 425 206 HOH WAT . P 6 HOH B 74 426 211 HOH WAT . Q 6 HOH C 1 358 22 HOH WAT . Q 6 HOH C 2 359 24 HOH WAT . Q 6 HOH C 3 360 25 HOH WAT . Q 6 HOH C 4 361 26 HOH WAT . Q 6 HOH C 5 362 48 HOH WAT . Q 6 HOH C 6 363 55 HOH WAT . Q 6 HOH C 7 364 68 HOH WAT . Q 6 HOH C 8 365 77 HOH WAT . Q 6 HOH C 9 366 84 HOH WAT . Q 6 HOH C 10 367 93 HOH WAT . Q 6 HOH C 11 368 98 HOH WAT . Q 6 HOH C 12 369 101 HOH WAT . Q 6 HOH C 13 370 109 HOH WAT . Q 6 HOH C 14 371 111 HOH WAT . Q 6 HOH C 15 372 154 HOH WAT . Q 6 HOH C 16 373 155 HOH WAT . Q 6 HOH C 17 374 156 HOH WAT . Q 6 HOH C 18 375 157 HOH WAT . Q 6 HOH C 19 376 178 HOH WAT . Q 6 HOH C 20 377 179 HOH WAT . Q 6 HOH C 21 378 181 HOH WAT . Q 6 HOH C 22 379 182 HOH WAT . Q 6 HOH C 23 380 194 HOH WAT . Q 6 HOH C 24 381 198 HOH WAT . Q 6 HOH C 25 382 199 HOH WAT . Q 6 HOH C 26 383 201 HOH WAT . Q 6 HOH C 27 384 204 HOH WAT . R 6 HOH D 1 359 23 HOH WAT . R 6 HOH D 2 360 27 HOH WAT . R 6 HOH D 3 361 28 HOH WAT . R 6 HOH D 4 362 29 HOH WAT . R 6 HOH D 5 363 37 HOH WAT . R 6 HOH D 6 364 41 HOH WAT . R 6 HOH D 7 365 45 HOH WAT . R 6 HOH D 8 366 50 HOH WAT . R 6 HOH D 9 367 57 HOH WAT . R 6 HOH D 10 368 63 HOH WAT . R 6 HOH D 11 369 64 HOH WAT . R 6 HOH D 12 370 73 HOH WAT . R 6 HOH D 13 371 86 HOH WAT . R 6 HOH D 14 372 90 HOH WAT . R 6 HOH D 15 373 96 HOH WAT . R 6 HOH D 16 374 102 HOH WAT . R 6 HOH D 17 375 107 HOH WAT . R 6 HOH D 18 376 115 HOH WAT . R 6 HOH D 19 377 116 HOH WAT . R 6 HOH D 20 378 185 HOH WAT . R 6 HOH D 21 379 186 HOH WAT . R 6 HOH D 22 380 189 HOH WAT . R 6 HOH D 23 381 191 HOH WAT . R 6 HOH D 24 382 195 HOH WAT . R 6 HOH D 25 383 208 HOH WAT . R 6 HOH D 26 384 209 HOH WAT . R 6 HOH D 27 385 210 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P P PO4 . . . L 3 24.281 11.173 -66.061 1 143.08 ? P PO4 355 D 1 HETATM 2 O O1 PO4 . . . L 3 23.084 10.462 -66.583 1 118.47 ? O1 PO4 355 D 1 HETATM 3 O O2 PO4 . . . L 3 23.892 12.521 -65.565 1 127.07 ? O2 PO4 355 D 1 HETATM 4 O O3 PO4 . . . L 3 25.281 11.317 -67.15 1 132.5 ? O3 PO4 355 D 1 HETATM 5 O O4 PO4 . . . L 3 24.871 10.38 -64.954 1 115 ? O4 PO4 355 D 1 # _model_server_stats.io_time_ms 10 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 10 _model_server_stats.query_time_ms 304 _model_server_stats.encode_time_ms 8 _model_server_stats.element_count 5 #