data_1JYE # _model_server_result.job_id h2fxzSNOQGMlcWs9dplI2w _model_server_result.datetime_utc '2024-12-26 11:07:41' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1jye # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":350}' # _entry.id 1JYE # _exptl.entry_id 1JYE _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 92.094 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description GLYCEROL _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1JYE _cell.length_a 87.007 _cell.length_b 87.007 _cell.length_c 224.098 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1JYE _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 98 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'I 41 2 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 5_655 -x+3/2,y,-z+3/4 -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 130.5105 0 168.0735 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id B _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # _chem_comp.formula 'C3 H8 O3' _chem_comp.formula_weight 92.094 _chem_comp.id GOL _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name GLYCEROL _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms GLYCERIN;PROPANE-1,2,3-TRIOL # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 O1 GOL sing 129 n n C1 C2 GOL sing 130 n n C1 H11 GOL sing 131 n n C1 H12 GOL sing 132 n n O1 HO1 GOL sing 133 n n C2 O2 GOL sing 134 n n C2 C3 GOL sing 135 n n C2 H2 GOL sing 136 n n O2 HO2 GOL sing 137 n n C3 O3 GOL sing 138 n n C3 H31 GOL sing 139 n n C3 H32 GOL sing 140 n n O3 HO3 GOL sing 141 n n # _atom_sites.entry_id 1JYE _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.011493 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.011493 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.004462 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 GOL A 1 350 1 GOL GLL . C 3 HOH A 1 351 1 HOH WAT . C 3 HOH A 2 352 2 HOH WAT . C 3 HOH A 3 353 3 HOH WAT . C 3 HOH A 4 354 4 HOH WAT . C 3 HOH A 5 355 5 HOH WAT . C 3 HOH A 6 356 6 HOH WAT . C 3 HOH A 7 357 7 HOH WAT . C 3 HOH A 8 358 8 HOH WAT . C 3 HOH A 9 359 9 HOH WAT . C 3 HOH A 10 360 10 HOH WAT . C 3 HOH A 11 361 11 HOH WAT . C 3 HOH A 12 362 12 HOH WAT . C 3 HOH A 13 363 13 HOH WAT . C 3 HOH A 14 364 14 HOH WAT . C 3 HOH A 15 365 15 HOH WAT . C 3 HOH A 16 366 16 HOH WAT . C 3 HOH A 17 367 17 HOH WAT . C 3 HOH A 18 368 18 HOH WAT . C 3 HOH A 19 369 19 HOH WAT . C 3 HOH A 20 370 20 HOH WAT . C 3 HOH A 21 371 21 HOH WAT . C 3 HOH A 22 372 22 HOH WAT . C 3 HOH A 23 373 23 HOH WAT . C 3 HOH A 24 374 24 HOH WAT . C 3 HOH A 25 375 25 HOH WAT . C 3 HOH A 26 376 26 HOH WAT . C 3 HOH A 27 377 27 HOH WAT . C 3 HOH A 28 378 28 HOH WAT . C 3 HOH A 29 379 29 HOH WAT . C 3 HOH A 30 380 30 HOH WAT . C 3 HOH A 31 381 31 HOH WAT . C 3 HOH A 32 382 32 HOH WAT . C 3 HOH A 33 383 33 HOH WAT . C 3 HOH A 34 384 34 HOH WAT . C 3 HOH A 35 385 35 HOH WAT . C 3 HOH A 36 386 36 HOH WAT . C 3 HOH A 37 387 37 HOH WAT . C 3 HOH A 38 388 38 HOH WAT . C 3 HOH A 39 389 39 HOH WAT . C 3 HOH A 40 390 40 HOH WAT . C 3 HOH A 41 391 41 HOH WAT . C 3 HOH A 42 392 42 HOH WAT . C 3 HOH A 43 393 43 HOH WAT . C 3 HOH A 44 394 44 HOH WAT . C 3 HOH A 45 395 45 HOH WAT . C 3 HOH A 46 396 46 HOH WAT . C 3 HOH A 47 397 47 HOH WAT . C 3 HOH A 48 398 48 HOH WAT . C 3 HOH A 49 399 49 HOH WAT . C 3 HOH A 50 400 50 HOH WAT . C 3 HOH A 51 401 51 HOH WAT . C 3 HOH A 52 402 52 HOH WAT . C 3 HOH A 53 403 53 HOH WAT . C 3 HOH A 54 404 54 HOH WAT . C 3 HOH A 55 405 55 HOH WAT . C 3 HOH A 56 406 56 HOH WAT . C 3 HOH A 57 407 57 HOH WAT . C 3 HOH A 58 408 58 HOH WAT . C 3 HOH A 59 409 59 HOH WAT . C 3 HOH A 60 410 60 HOH WAT . C 3 HOH A 61 411 61 HOH WAT . C 3 HOH A 62 412 62 HOH WAT . C 3 HOH A 63 413 63 HOH WAT . C 3 HOH A 64 414 64 HOH WAT . C 3 HOH A 65 415 65 HOH WAT . C 3 HOH A 66 416 66 HOH WAT . C 3 HOH A 67 417 67 HOH WAT . C 3 HOH A 68 418 68 HOH WAT . C 3 HOH A 69 419 69 HOH WAT . C 3 HOH A 70 420 70 HOH WAT . C 3 HOH A 71 421 71 HOH WAT . C 3 HOH A 72 422 72 HOH WAT . C 3 HOH A 73 423 73 HOH WAT . C 3 HOH A 74 424 74 HOH WAT . C 3 HOH A 75 425 75 HOH WAT . C 3 HOH A 76 426 76 HOH WAT . C 3 HOH A 77 427 77 HOH WAT . C 3 HOH A 78 428 78 HOH WAT . C 3 HOH A 79 429 79 HOH WAT . C 3 HOH A 80 430 80 HOH WAT . C 3 HOH A 81 431 81 HOH WAT . C 3 HOH A 82 432 82 HOH WAT . C 3 HOH A 83 433 83 HOH WAT . C 3 HOH A 84 434 84 HOH WAT . C 3 HOH A 85 435 85 HOH WAT . C 3 HOH A 86 436 86 HOH WAT . C 3 HOH A 87 437 87 HOH WAT . C 3 HOH A 88 438 88 HOH WAT . C 3 HOH A 89 439 89 HOH WAT . C 3 HOH A 90 440 90 HOH WAT . C 3 HOH A 91 441 91 HOH WAT . C 3 HOH A 92 442 92 HOH WAT . C 3 HOH A 93 443 93 HOH WAT . C 3 HOH A 94 444 94 HOH WAT . C 3 HOH A 95 445 95 HOH WAT . C 3 HOH A 96 446 96 HOH WAT . C 3 HOH A 97 447 97 HOH WAT . C 3 HOH A 98 448 98 HOH WAT . C 3 HOH A 99 449 99 HOH WAT . C 3 HOH A 100 450 100 HOH WAT . C 3 HOH A 101 451 101 HOH WAT . C 3 HOH A 102 452 102 HOH WAT . C 3 HOH A 103 453 103 HOH WAT . C 3 HOH A 104 454 104 HOH WAT . C 3 HOH A 105 455 105 HOH WAT . C 3 HOH A 106 456 106 HOH WAT . C 3 HOH A 107 457 107 HOH WAT . C 3 HOH A 108 458 108 HOH WAT . C 3 HOH A 109 459 109 HOH WAT . C 3 HOH A 110 460 110 HOH WAT . C 3 HOH A 111 461 111 HOH WAT . C 3 HOH A 112 462 112 HOH WAT . C 3 HOH A 113 463 113 HOH WAT . C 3 HOH A 114 464 114 HOH WAT . C 3 HOH A 115 465 115 HOH WAT . C 3 HOH A 116 466 116 HOH WAT . C 3 HOH A 117 467 117 HOH WAT . C 3 HOH A 118 468 118 HOH WAT . C 3 HOH A 119 469 119 HOH WAT . C 3 HOH A 120 470 120 HOH WAT . C 3 HOH A 121 471 121 HOH WAT . C 3 HOH A 122 472 122 HOH WAT . C 3 HOH A 123 473 123 HOH WAT . C 3 HOH A 124 474 124 HOH WAT . C 3 HOH A 125 475 125 HOH WAT . C 3 HOH A 126 476 126 HOH WAT . C 3 HOH A 127 477 127 HOH WAT . C 3 HOH A 128 478 128 HOH WAT . C 3 HOH A 129 479 129 HOH WAT . C 3 HOH A 130 480 130 HOH WAT . C 3 HOH A 131 481 131 HOH WAT . C 3 HOH A 132 482 132 HOH WAT . C 3 HOH A 133 483 133 HOH WAT . C 3 HOH A 134 484 134 HOH WAT . C 3 HOH A 135 485 135 HOH WAT . C 3 HOH A 136 486 136 HOH WAT . C 3 HOH A 137 487 137 HOH WAT . C 3 HOH A 138 488 138 HOH WAT . C 3 HOH A 139 489 139 HOH WAT . C 3 HOH A 140 490 140 HOH WAT . C 3 HOH A 141 491 141 HOH WAT . C 3 HOH A 142 492 142 HOH WAT . C 3 HOH A 143 493 143 HOH WAT . C 3 HOH A 144 494 144 HOH WAT . C 3 HOH A 145 495 145 HOH WAT . C 3 HOH A 146 496 146 HOH WAT . C 3 HOH A 147 497 147 HOH WAT . C 3 HOH A 148 498 148 HOH WAT . C 3 HOH A 149 499 149 HOH WAT . C 3 HOH A 150 500 150 HOH WAT . C 3 HOH A 151 501 151 HOH WAT . C 3 HOH A 152 502 152 HOH WAT . C 3 HOH A 153 503 153 HOH WAT . C 3 HOH A 154 504 154 HOH WAT . C 3 HOH A 155 505 155 HOH WAT . C 3 HOH A 156 506 156 HOH WAT . C 3 HOH A 157 507 157 HOH WAT . C 3 HOH A 158 508 158 HOH WAT . C 3 HOH A 159 509 159 HOH WAT . C 3 HOH A 160 510 160 HOH WAT . C 3 HOH A 161 511 161 HOH WAT . C 3 HOH A 162 512 162 HOH WAT . C 3 HOH A 163 513 163 HOH WAT . C 3 HOH A 164 514 164 HOH WAT . C 3 HOH A 165 515 165 HOH WAT . C 3 HOH A 166 516 166 HOH WAT . C 3 HOH A 167 517 167 HOH WAT . C 3 HOH A 168 518 168 HOH WAT . C 3 HOH A 169 519 169 HOH WAT . C 3 HOH A 170 520 170 HOH WAT . C 3 HOH A 171 521 171 HOH WAT . C 3 HOH A 172 522 172 HOH WAT . C 3 HOH A 173 523 173 HOH WAT . C 3 HOH A 174 524 174 HOH WAT . C 3 HOH A 175 525 175 HOH WAT . C 3 HOH A 176 526 176 HOH WAT . C 3 HOH A 177 527 177 HOH WAT . C 3 HOH A 178 528 178 HOH WAT . C 3 HOH A 179 529 179 HOH WAT . C 3 HOH A 180 530 180 HOH WAT . C 3 HOH A 181 531 181 HOH WAT . C 3 HOH A 182 532 182 HOH WAT . C 3 HOH A 183 533 183 HOH WAT . C 3 HOH A 184 534 184 HOH WAT . C 3 HOH A 185 535 185 HOH WAT . C 3 HOH A 186 536 186 HOH WAT . C 3 HOH A 187 537 187 HOH WAT . C 3 HOH A 188 538 188 HOH WAT . C 3 HOH A 189 539 189 HOH WAT . C 3 HOH A 190 540 190 HOH WAT . C 3 HOH A 191 541 191 HOH WAT . C 3 HOH A 192 542 192 HOH WAT . C 3 HOH A 193 543 193 HOH WAT . C 3 HOH A 194 544 194 HOH WAT . C 3 HOH A 195 545 195 HOH WAT . C 3 HOH A 196 546 196 HOH WAT . C 3 HOH A 197 547 197 HOH WAT . C 3 HOH A 198 548 198 HOH WAT . C 3 HOH A 199 549 199 HOH WAT . C 3 HOH A 200 550 200 HOH WAT . C 3 HOH A 201 551 201 HOH WAT . C 3 HOH A 202 552 202 HOH WAT . C 3 HOH A 203 553 203 HOH WAT . C 3 HOH A 204 554 204 HOH WAT . C 3 HOH A 205 555 205 HOH WAT . C 3 HOH A 206 556 206 HOH WAT . C 3 HOH A 207 557 207 HOH WAT . C 3 HOH A 208 558 208 HOH WAT . C 3 HOH A 209 559 209 HOH WAT . C 3 HOH A 210 560 210 HOH WAT . C 3 HOH A 211 561 211 HOH WAT . C 3 HOH A 212 562 212 HOH WAT . C 3 HOH A 213 563 213 HOH WAT . C 3 HOH A 214 564 214 HOH WAT . C 3 HOH A 215 565 215 HOH WAT . C 3 HOH A 216 566 216 HOH WAT . C 3 HOH A 217 567 217 HOH WAT . C 3 HOH A 218 568 218 HOH WAT . C 3 HOH A 219 569 219 HOH WAT . C 3 HOH A 220 570 220 HOH WAT . C 3 HOH A 221 571 221 HOH WAT . C 3 HOH A 222 572 222 HOH WAT . C 3 HOH A 223 573 223 HOH WAT . C 3 HOH A 224 574 224 HOH WAT . C 3 HOH A 225 575 225 HOH WAT . C 3 HOH A 226 576 226 HOH WAT . C 3 HOH A 227 577 227 HOH WAT . C 3 HOH A 228 578 228 HOH WAT . C 3 HOH A 229 579 229 HOH WAT . C 3 HOH A 230 580 230 HOH WAT . C 3 HOH A 231 581 231 HOH WAT . C 3 HOH A 232 582 232 HOH WAT . C 3 HOH A 233 583 233 HOH WAT . C 3 HOH A 234 584 234 HOH WAT . C 3 HOH A 235 585 235 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 GOL . . . B 2 61.993 35.821 94.205 1 21.6 ? C1 GOL 350 A 1 HETATM 2 O O1 GOL . . . B 2 62.127 34.999 93.053 1 19.12 ? O1 GOL 350 A 1 HETATM 3 C C2 GOL . . . B 2 60.513 36.036 94.52 1 23.55 ? C2 GOL 350 A 1 HETATM 4 O O2 GOL . . . B 2 59.913 34.801 94.878 1 22.1 ? O2 GOL 350 A 1 HETATM 5 C C3 GOL . . . B 2 60.344 37.036 95.659 1 26.84 ? C3 GOL 350 A 1 HETATM 6 O O3 GOL . . . B 2 58.964 37.183 95.96 1 27.81 ? O3 GOL 350 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 51 _model_server_stats.parse_time_ms 6 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 262 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 6 #