data_1JZF
#
_model_server_result.job_id            6wBiyLTGAUWT6FYrvpr09A 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-03-06 08:39:37' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1jzf 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":902}' 
#
_entry.id    1JZF 
#
_exptl.entry_id    1JZF 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              367.854 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'TETRA(IMIDAZOLE)DIAQUACOPPER (II)' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            1JZF 
_cell.length_a            52.776 
_cell.length_b            61.441 
_cell.length_c            75.956 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1JZF 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        23 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'I 2 2 2' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    monomeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      1 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      4 
_struct_asym.id                             D 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 3 A CYS 3 1_555 A SG CYS 26 A CYS 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
metalc ? metalc1 A O GLY 45 A GLY 45 1_555 B CU CU . A CU 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.597 ? 
metalc ? metalc2 A ND1 HIS 46 A HIS 46 1_555 B CU CU . A CU 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? 
metalc ? metalc3 A NE2 HIS 83 A HIS 83 1_555 C RU RTB . A RTB 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? 
metalc ? metalc4 A SG CYS 112 A CYS 112 1_555 B CU CU . A CU 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? 
metalc ? metalc5 A ND1 HIS 117 A HIS 117 1_555 B CU CU . A CU 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? 
metalc ? metalc6 A SD MET 121 A MET 121 1_555 B CU CU . A CU 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.317 ? 
#
_chem_comp.formula           'C12 H16 Cu N8 O2 2' 
_chem_comp.formula_weight    367.854 
_chem_comp.id                IME 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'TETRA(IMIDAZOLE)DIAQUACOPPER (II)' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
CU O1 IME sing 173 n n 
CU O2 IME sing 174 n n 
CU NEC IME sing 175 n n 
CU NEM IME sing 176 n n 
CU NEW IME sing 177 n n 
CU NE6 IME sing 178 n n 
O1 HO1 IME sing 179 n n 
O2 HO2 IME sing 180 n n 
CG1 CDC IME doub 181 n y 
CG1 NDB IME sing 182 n y 
CG1 HG1 IME sing 183 n n 
CDC NEC IME sing 184 n y 
CDC HD21 IME sing 185 n n 
NDB CEB IME doub 186 n y 
CEB NEC IME sing 187 n y 
CEB HE11 IME sing 188 n n 
CG2 CDM IME doub 189 n y 
CG2 NDL IME sing 190 n y 
CG2 HG2 IME sing 191 n n 
CDM NEM IME sing 192 n y 
CDM HD22 IME sing 193 n n 
NDL CEL IME doub 194 n y 
CEL NEM IME sing 195 n y 
CEL HE12 IME sing 196 n n 
CG3 CDW IME doub 197 n y 
CG3 NDV IME sing 198 n y 
CG3 HG3 IME sing 199 n n 
CDW NEW IME sing 200 n y 
CDW HD23 IME sing 201 n n 
NDV CEV IME doub 202 n y 
CEV NEW IME sing 203 n y 
CEV HE13 IME sing 204 n n 
CG4 CD6 IME doub 205 n y 
CG4 ND5 IME sing 206 n y 
CG4 HG4 IME sing 207 n n 
CD6 NE6 IME sing 208 n y 
CD6 HD24 IME sing 209 n n 
ND5 CE5 IME doub 210 n y 
CE5 NE6 IME sing 211 n y 
CE5 HE14 IME sing 212 n n 
O1 H15 IME sing 213 n n 
O2 H16 IME sing 214 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     1JZF 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.018948 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.016276 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.013166 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 CU A 1 901 901 CU CU . 
C 3 RTB A 1 903 903 RTB RTB . 
D 4 IME A 1 902 902 IME CU . 
E 5 HOH A 1 1000 1000 HOH WAT . 
E 5 HOH A 2 1001 1001 HOH WAT . 
E 5 HOH A 3 1002 1002 HOH WAT . 
E 5 HOH A 4 1003 1003 HOH WAT . 
E 5 HOH A 5 1004 1004 HOH WAT . 
E 5 HOH A 6 1005 1005 HOH WAT . 
E 5 HOH A 7 1006 1006 HOH WAT . 
E 5 HOH A 8 1007 1007 HOH WAT . 
E 5 HOH A 9 1008 1008 HOH WAT . 
E 5 HOH A 10 1009 1009 HOH WAT . 
E 5 HOH A 11 1010 1010 HOH WAT . 
E 5 HOH A 12 1011 1011 HOH WAT . 
E 5 HOH A 13 1012 1012 HOH WAT . 
E 5 HOH A 14 1013 1013 HOH WAT . 
E 5 HOH A 15 1014 1014 HOH WAT . 
E 5 HOH A 16 1015 1015 HOH WAT . 
E 5 HOH A 17 1016 1016 HOH WAT . 
E 5 HOH A 18 1017 1017 HOH WAT . 
E 5 HOH A 19 1018 1018 HOH WAT . 
E 5 HOH A 20 1019 1019 HOH WAT . 
E 5 HOH A 21 1020 1020 HOH WAT . 
E 5 HOH A 22 1021 1021 HOH WAT . 
E 5 HOH A 23 1022 1022 HOH WAT . 
E 5 HOH A 24 1023 1023 HOH WAT . 
E 5 HOH A 25 1024 1024 HOH WAT . 
E 5 HOH A 26 1025 1025 HOH WAT . 
E 5 HOH A 27 1026 1026 HOH WAT . 
E 5 HOH A 28 1027 1027 HOH WAT . 
E 5 HOH A 29 1028 1028 HOH WAT . 
E 5 HOH A 30 1029 1029 HOH WAT . 
E 5 HOH A 31 1030 1030 HOH WAT . 
E 5 HOH A 32 1031 1031 HOH WAT . 
E 5 HOH A 33 1032 1032 HOH WAT . 
E 5 HOH A 34 1033 1033 HOH WAT . 
E 5 HOH A 35 1034 1034 HOH WAT . 
E 5 HOH A 36 1035 1035 HOH WAT . 
E 5 HOH A 37 1036 1036 HOH WAT . 
E 5 HOH A 38 1037 1037 HOH WAT . 
E 5 HOH A 39 1038 1038 HOH WAT . 
E 5 HOH A 40 1039 1039 HOH WAT . 
E 5 HOH A 41 1040 1040 HOH WAT . 
E 5 HOH A 42 1041 1041 HOH WAT . 
E 5 HOH A 43 1042 1042 HOH WAT . 
E 5 HOH A 44 1043 1043 HOH WAT . 
E 5 HOH A 45 1044 1044 HOH WAT . 
E 5 HOH A 46 1045 1045 HOH WAT . 
E 5 HOH A 47 1046 1046 HOH WAT . 
E 5 HOH A 48 1047 1047 HOH WAT . 
E 5 HOH A 49 1048 1048 HOH WAT . 
E 5 HOH A 50 1049 1049 HOH WAT . 
E 5 HOH A 51 1050 1050 HOH WAT . 
E 5 HOH A 52 1051 1051 HOH WAT . 
E 5 HOH A 53 1052 1052 HOH WAT . 
E 5 HOH A 54 1053 1053 HOH WAT . 
E 5 HOH A 55 1054 1054 HOH WAT . 
E 5 HOH A 56 1055 1055 HOH WAT . 
E 5 HOH A 57 1056 1056 HOH WAT . 
E 5 HOH A 58 1057 1057 HOH WAT . 
E 5 HOH A 59 1058 1058 HOH WAT . 
E 5 HOH A 60 1059 1059 HOH WAT . 
E 5 HOH A 61 1060 1060 HOH WAT . 
E 5 HOH A 62 1061 1061 HOH WAT . 
E 5 HOH A 63 1062 1062 HOH WAT . 
E 5 HOH A 64 1063 1063 HOH WAT . 
E 5 HOH A 65 1064 1064 HOH WAT . 
E 5 HOH A 66 1065 1065 HOH WAT . 
E 5 HOH A 67 1066 1066 HOH WAT . 
E 5 HOH A 68 1067 1067 HOH WAT . 
E 5 HOH A 69 1068 1068 HOH WAT . 
E 5 HOH A 70 1069 1069 HOH WAT . 
E 5 HOH A 71 1070 1070 HOH WAT . 
E 5 HOH A 72 1071 1071 HOH WAT . 
E 5 HOH A 73 1072 1072 HOH WAT . 
E 5 HOH A 74 1073 1073 HOH WAT . 
E 5 HOH A 75 1074 1074 HOH WAT . 
E 5 HOH A 76 1075 1075 HOH WAT . 
E 5 HOH A 77 1076 1076 HOH WAT . 
E 5 HOH A 78 1077 1077 HOH WAT . 
E 5 HOH A 79 1078 1078 HOH WAT . 
E 5 HOH A 80 1079 1079 HOH WAT . 
E 5 HOH A 81 1080 1080 HOH WAT . 
E 5 HOH A 82 1081 1081 HOH WAT . 
E 5 HOH A 83 1082 1082 HOH WAT . 
E 5 HOH A 84 1083 1083 HOH WAT . 
E 5 HOH A 85 1084 1084 HOH WAT . 
E 5 HOH A 86 1085 1085 HOH WAT . 
E 5 HOH A 87 1086 1086 HOH WAT . 
E 5 HOH A 88 1087 1087 HOH WAT . 
E 5 HOH A 89 1088 1088 HOH WAT . 
E 5 HOH A 90 1089 1089 HOH WAT . 
E 5 HOH A 91 1090 1090 HOH WAT . 
E 5 HOH A 92 1091 1091 HOH WAT . 
E 5 HOH A 93 1092 1092 HOH WAT . 
E 5 HOH A 94 1093 1093 HOH WAT . 
E 5 HOH A 95 1094 1094 HOH WAT . 
E 5 HOH A 96 1095 1095 HOH WAT . 
E 5 HOH A 97 1096 1096 HOH WAT . 
E 5 HOH A 98 1097 1097 HOH WAT . 
E 5 HOH A 99 1098 1098 HOH WAT . 
E 5 HOH A 100 1099 1099 HOH WAT . 
E 5 HOH A 101 1100 1100 HOH WAT . 
E 5 HOH A 102 1101 1101 HOH WAT . 
E 5 HOH A 103 1102 1102 HOH WAT . 
E 5 HOH A 104 1103 1103 HOH WAT . 
E 5 HOH A 105 1104 1104 HOH WAT . 
E 5 HOH A 106 1105 1105 HOH WAT . 
E 5 HOH A 107 1106 1106 HOH WAT . 
E 5 HOH A 108 1107 1107 HOH WAT . 
E 5 HOH A 109 1108 1108 HOH WAT . 
E 5 HOH A 110 1109 1109 HOH WAT . 
E 5 HOH A 111 1111 1111 HOH WAT . 
E 5 HOH A 112 1112 1112 HOH WAT . 
E 5 HOH A 113 1113 1113 HOH WAT . 
E 5 HOH A 114 1114 1114 HOH WAT . 
E 5 HOH A 115 1115 1115 HOH WAT . 
E 5 HOH A 116 1116 1116 HOH WAT . 
E 5 HOH A 117 1117 1117 HOH WAT . 
E 5 HOH A 118 1118 1118 HOH WAT . 
E 5 HOH A 119 1119 1119 HOH WAT . 
E 5 HOH A 120 1120 1120 HOH WAT . 
E 5 HOH A 121 1121 1121 HOH WAT . 
E 5 HOH A 122 1122 1122 HOH WAT . 
E 5 HOH A 123 1123 1123 HOH WAT . 
E 5 HOH A 124 1124 1124 HOH WAT . 
E 5 HOH A 125 1125 1125 HOH WAT . 
E 5 HOH A 126 1126 1126 HOH WAT . 
E 5 HOH A 127 1127 1127 HOH WAT . 
E 5 HOH A 128 1128 1128 HOH WAT . 
E 5 HOH A 129 1129 1129 HOH WAT . 
E 5 HOH A 130 1130 1130 HOH WAT . 
E 5 HOH A 131 1131 1131 HOH WAT . 
E 5 HOH A 132 1132 1132 HOH WAT . 
E 5 HOH A 133 1133 1133 HOH WAT . 
E 5 HOH A 134 1134 1134 HOH WAT . 
E 5 HOH A 135 1135 1135 HOH WAT . 
E 5 HOH A 136 1136 1136 HOH WAT . 
E 5 HOH A 137 1137 1137 HOH WAT . 
E 5 HOH A 138 1138 1138 HOH WAT . 
E 5 HOH A 139 1139 1139 HOH WAT . 
E 5 HOH A 140 1140 1140 HOH WAT . 
E 5 HOH A 141 1141 1141 HOH WAT . 
E 5 HOH A 142 1142 1142 HOH WAT . 
E 5 HOH A 143 1143 1143 HOH WAT . 
E 5 HOH A 144 1144 1144 HOH WAT . 
E 5 HOH A 145 1145 1145 HOH WAT . 
E 5 HOH A 146 1146 1146 HOH WAT . 
E 5 HOH A 147 1147 1147 HOH WAT . 
E 5 HOH A 148 1148 1148 HOH WAT . 
E 5 HOH A 149 1149 1149 HOH WAT . 
E 5 HOH A 150 1150 1150 HOH WAT . 
E 5 HOH A 151 1151 1151 HOH WAT . 
E 5 HOH A 152 1152 1152 HOH WAT . 
E 5 HOH A 153 1153 1153 HOH WAT . 
E 5 HOH A 154 1154 1154 HOH WAT . 
E 5 HOH A 155 1155 1155 HOH WAT . 
E 5 HOH A 156 1156 1156 HOH WAT . 
E 5 HOH A 157 1157 1157 HOH WAT . 
E 5 HOH A 158 1158 1158 HOH WAT . 
E 5 HOH A 159 1159 1159 HOH WAT . 
E 5 HOH A 160 1160 1160 HOH WAT . 
E 5 HOH A 161 1161 1161 HOH WAT . 
E 5 HOH A 162 1162 1162 HOH WAT . 
E 5 HOH A 163 1163 1163 HOH WAT . 
E 5 HOH A 164 1164 1164 HOH WAT . 
E 5 HOH A 165 1165 1165 HOH WAT . 
E 5 HOH A 166 1166 1166 HOH WAT . 
E 5 HOH A 167 1167 1167 HOH WAT . 
E 5 HOH A 168 1168 1168 HOH WAT . 
E 5 HOH A 169 1169 1169 HOH WAT . 
E 5 HOH A 170 1170 1170 HOH WAT . 
E 5 HOH A 171 1171 1171 HOH WAT . 
E 5 HOH A 172 1172 1172 HOH WAT . 
E 5 HOH A 173 1173 1173 HOH WAT . 
E 5 HOH A 174 1174 1174 HOH WAT . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 CU CU IME . . . D 4 26.382 23.073 -0.026 0.5 22.11 ? CU IME 902 A 1 
HETATM 2 O O1 IME . . . D 4 23.606 23.038 0.469 0.5 31.39 ? O1 IME 902 A 1 
HETATM 3 C CG1 IME . . . D 4 27.091 18.637 -0.035 0.5 16.08 ? CG1 IME 902 A 1 
HETATM 4 C CDC IME . . . D 4 27.518 19.919 -0.112 0.5 16.09 ? CDC IME 902 A 1 
HETATM 5 N NDB IME . . . D 4 25.718 18.698 0.065 0.5 16.06 ? NDB IME 902 A 1 
HETATM 6 C CEB IME . . . D 4 25.33 19.959 0.051 0.5 16.08 ? CEB IME 902 A 1 
HETATM 7 N NEC IME . . . D 4 26.404 20.723 -0.055 0.5 15.99 ? NEC IME 902 A 1 
HETATM 8 C CG2 IME . . . D 4 26.951 23.632 4.081 1 24.2 ? CG2 IME 902 A 1 
HETATM 9 C CDM IME . . . D 4 27.375 23.721 2.797 1 24.25 ? CDM IME 902 A 1 
HETATM 10 N NDL IME . . . D 4 25.702 23.05 4.031 1 24.45 ? NDL IME 902 A 1 
HETATM 11 C CEL IME . . . D 4 25.382 22.8 2.775 1 23.99 ? CEL IME 902 A 1 
HETATM 12 N NEM IME . . . D 4 26.38 23.198 2.004 1 24.32 ? NEM IME 902 A 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              5 
_model_server_stats.parse_time_ms           18 
_model_server_stats.create_model_time_ms    1 
_model_server_stats.query_time_ms           251 
_model_server_stats.encode_time_ms          1 
_model_server_stats.element_count           12 
#