data_1KGU # _model_server_result.job_id c_Ragq1K9luoZm6BOsp1Yg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-22 19:34:34' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1kgu # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":497}' # _entry.id 1KGU # _exptl.entry_id 1KGU _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1KGU _cell.length_a 53.062 _cell.length_b 74.984 _cell.length_c 137.108 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1KGU _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id B _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 28 A CYS 28 1_555 A SG CYS 86 A CYS 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 70 A CYS 70 1_555 A SG CYS 115 A CYS 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 141 A CYS 141 1_555 A SG CYS 160 A CYS 160 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 378 A CYS 378 1_555 A SG CYS 384 A CYS 384 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 450 A CYS 450 1_555 A SG CYS 462 A CYS 462 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? covale ? covale1 A C PCA 1 A PCA 1 1_555 A N TYR 2 A TYR 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.267 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASN 100 A ASN 100 1_555 B CA CA . A CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.509 ? metalc ? metalc2 A O ARG 158 A ARG 158 1_555 B CA CA . A CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.51 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 167 A ASP 167 1_555 B CA CA . A CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.684 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 167 A ASP 167 1_555 B CA CA . A CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.594 ? metalc ? metalc5 A O HIS 201 A HIS 201 1_555 B CA CA . A CA 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.497 ? metalc ? metalc6 B CA CA . A CA 497 1_555 C O HOH . A HOH 541 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.631 ? metalc ? metalc7 B CA CA . A CA 497 1_555 C O HOH . A HOH 547 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.679 ? metalc ? metalc8 B CA CA . A CA 497 1_555 C O HOH . A HOH 598 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.667 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1KGU _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.018846 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.013336 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007294 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 CA A 1 497 497 CA CAL . C 3 HOH A 1 500 500 HOH WAT . C 3 HOH A 2 501 501 HOH WAT . C 3 HOH A 3 502 502 HOH WAT . C 3 HOH A 4 503 503 HOH WAT . C 3 HOH A 5 504 504 HOH WAT . C 3 HOH A 6 505 505 HOH WAT . C 3 HOH A 7 506 506 HOH WAT . C 3 HOH A 8 507 507 HOH WAT . C 3 HOH A 9 508 508 HOH WAT . C 3 HOH A 10 509 509 HOH WAT . C 3 HOH A 11 510 510 HOH WAT . C 3 HOH A 12 511 511 HOH WAT . C 3 HOH A 13 512 512 HOH WAT . C 3 HOH A 14 513 513 HOH WAT . C 3 HOH A 15 514 514 HOH WAT . C 3 HOH A 16 515 515 HOH WAT . C 3 HOH A 17 516 516 HOH WAT . C 3 HOH A 18 517 517 HOH WAT . C 3 HOH A 19 518 518 HOH WAT . C 3 HOH A 20 519 519 HOH WAT . C 3 HOH A 21 520 520 HOH WAT . C 3 HOH A 22 521 521 HOH WAT . C 3 HOH A 23 522 522 HOH WAT . C 3 HOH A 24 523 523 HOH WAT . C 3 HOH A 25 524 524 HOH WAT . C 3 HOH A 26 525 525 HOH WAT . C 3 HOH A 27 526 526 HOH WAT . C 3 HOH A 28 527 527 HOH WAT . C 3 HOH A 29 528 528 HOH WAT . C 3 HOH A 30 529 529 HOH WAT . C 3 HOH A 31 530 530 HOH WAT . C 3 HOH A 32 531 531 HOH WAT . C 3 HOH A 33 532 532 HOH WAT . C 3 HOH A 34 533 533 HOH WAT . C 3 HOH A 35 534 534 HOH WAT . C 3 HOH A 36 535 535 HOH WAT . C 3 HOH A 37 536 536 HOH WAT . C 3 HOH A 38 537 537 HOH WAT . C 3 HOH A 39 538 538 HOH WAT . C 3 HOH A 40 539 539 HOH WAT . C 3 HOH A 41 540 540 HOH WAT . C 3 HOH A 42 541 541 HOH WAT . C 3 HOH A 43 542 542 HOH WAT . C 3 HOH A 44 543 543 HOH WAT . C 3 HOH A 45 544 544 HOH WAT . C 3 HOH A 46 545 545 HOH WAT . C 3 HOH A 47 546 546 HOH WAT . C 3 HOH A 48 547 547 HOH WAT . C 3 HOH A 49 548 548 HOH WAT . C 3 HOH A 50 549 549 HOH WAT . C 3 HOH A 51 550 550 HOH WAT . C 3 HOH A 52 551 551 HOH WAT . C 3 HOH A 53 552 552 HOH WAT . C 3 HOH A 54 553 553 HOH WAT . C 3 HOH A 55 554 554 HOH WAT . C 3 HOH A 56 555 555 HOH WAT . C 3 HOH A 57 556 556 HOH WAT . C 3 HOH A 58 557 557 HOH WAT . C 3 HOH A 59 558 558 HOH WAT . C 3 HOH A 60 559 559 HOH WAT . C 3 HOH A 61 560 560 HOH WAT . C 3 HOH A 62 561 561 HOH WAT . C 3 HOH A 63 562 562 HOH WAT . C 3 HOH A 64 563 563 HOH WAT . C 3 HOH A 65 564 564 HOH WAT . C 3 HOH A 66 565 565 HOH WAT . C 3 HOH A 67 566 566 HOH WAT . C 3 HOH A 68 567 567 HOH WAT . C 3 HOH A 69 568 568 HOH WAT . C 3 HOH A 70 569 569 HOH WAT . C 3 HOH A 71 570 570 HOH WAT . C 3 HOH A 72 571 571 HOH WAT . C 3 HOH A 73 572 572 HOH WAT . C 3 HOH A 74 573 573 HOH WAT . C 3 HOH A 75 574 574 HOH WAT . C 3 HOH A 76 575 575 HOH WAT . C 3 HOH A 77 576 576 HOH WAT . C 3 HOH A 78 577 577 HOH WAT . C 3 HOH A 79 578 578 HOH WAT . C 3 HOH A 80 579 579 HOH WAT . C 3 HOH A 81 580 580 HOH WAT . C 3 HOH A 82 581 581 HOH WAT . C 3 HOH A 83 582 582 HOH WAT . C 3 HOH A 84 583 583 HOH WAT . C 3 HOH A 85 584 584 HOH WAT . C 3 HOH A 86 585 585 HOH WAT . C 3 HOH A 87 586 586 HOH WAT . C 3 HOH A 88 587 587 HOH WAT . C 3 HOH A 89 588 588 HOH WAT . C 3 HOH A 90 589 589 HOH WAT . C 3 HOH A 91 590 590 HOH WAT . C 3 HOH A 92 591 591 HOH WAT . C 3 HOH A 93 592 592 HOH WAT . C 3 HOH A 94 593 593 HOH WAT . C 3 HOH A 95 594 594 HOH WAT . C 3 HOH A 96 595 595 HOH WAT . C 3 HOH A 97 596 596 HOH WAT . C 3 HOH A 98 597 597 HOH WAT . C 3 HOH A 99 598 598 HOH WAT . C 3 HOH A 100 599 599 HOH WAT . C 3 HOH A 101 600 600 HOH WAT . C 3 HOH A 102 601 601 HOH WAT . C 3 HOH A 103 602 602 HOH WAT . C 3 HOH A 104 604 604 HOH WAT . C 3 HOH A 105 605 605 HOH WAT . C 3 HOH A 106 606 606 HOH WAT . C 3 HOH A 107 607 607 HOH WAT . C 3 HOH A 108 608 608 HOH WAT . C 3 HOH A 109 609 609 HOH WAT . C 3 HOH A 110 610 610 HOH WAT . C 3 HOH A 111 611 611 HOH WAT . C 3 HOH A 112 612 612 HOH WAT . C 3 HOH A 113 613 613 HOH WAT . C 3 HOH A 114 614 614 HOH WAT . C 3 HOH A 115 615 615 HOH WAT . C 3 HOH A 116 616 616 HOH WAT . C 3 HOH A 117 617 617 HOH WAT . C 3 HOH A 118 618 618 HOH WAT . C 3 HOH A 119 619 619 HOH WAT . C 3 HOH A 120 620 620 HOH WAT . C 3 HOH A 121 621 621 HOH WAT . C 3 HOH A 122 622 622 HOH WAT . C 3 HOH A 123 623 623 HOH WAT . C 3 HOH A 124 624 624 HOH WAT . C 3 HOH A 125 625 625 HOH WAT . C 3 HOH A 126 626 626 HOH WAT . C 3 HOH A 127 627 627 HOH WAT . C 3 HOH A 128 628 628 HOH WAT . C 3 HOH A 129 629 629 HOH WAT . C 3 HOH A 130 630 630 HOH WAT . C 3 HOH A 131 631 631 HOH WAT . C 3 HOH A 132 632 632 HOH WAT . C 3 HOH A 133 633 633 HOH WAT . C 3 HOH A 134 634 634 HOH WAT . C 3 HOH A 135 635 635 HOH WAT . C 3 HOH A 136 636 636 HOH WAT . C 3 HOH A 137 637 637 HOH WAT . C 3 HOH A 138 638 638 HOH WAT . C 3 HOH A 139 639 639 HOH WAT . C 3 HOH A 140 640 640 HOH WAT . C 3 HOH A 141 641 641 HOH WAT . C 3 HOH A 142 642 642 HOH WAT . C 3 HOH A 143 643 643 HOH WAT . C 3 HOH A 144 644 644 HOH WAT . C 3 HOH A 145 645 645 HOH WAT . C 3 HOH A 146 646 646 HOH WAT . C 3 HOH A 147 647 647 HOH WAT . C 3 HOH A 148 648 648 HOH WAT . C 3 HOH A 149 649 649 HOH WAT . C 3 HOH A 150 650 650 HOH WAT . C 3 HOH A 151 651 651 HOH WAT . C 3 HOH A 152 652 652 HOH WAT . C 3 HOH A 153 653 653 HOH WAT . C 3 HOH A 154 654 654 HOH WAT . C 3 HOH A 155 655 655 HOH WAT . C 3 HOH A 156 656 656 HOH WAT . C 3 HOH A 157 657 657 HOH WAT . C 3 HOH A 158 658 658 HOH WAT . C 3 HOH A 159 659 659 HOH WAT . C 3 HOH A 160 660 660 HOH WAT . C 3 HOH A 161 661 661 HOH WAT . C 3 HOH A 162 662 662 HOH WAT . C 3 HOH A 163 663 663 HOH WAT . C 3 HOH A 164 664 664 HOH WAT . C 3 HOH A 165 665 665 HOH WAT . C 3 HOH A 166 666 666 HOH WAT . C 3 HOH A 167 667 667 HOH WAT . C 3 HOH A 168 668 668 HOH WAT . C 3 HOH A 169 669 669 HOH WAT . C 3 HOH A 170 670 670 HOH WAT . C 3 HOH A 171 671 671 HOH WAT . C 3 HOH A 172 672 672 HOH WAT . C 3 HOH A 173 673 673 HOH WAT . C 3 HOH A 174 674 674 HOH WAT . C 3 HOH A 175 675 675 HOH WAT . C 3 HOH A 176 676 676 HOH WAT . C 3 HOH A 177 677 677 HOH WAT . C 3 HOH A 178 678 678 HOH WAT . C 3 HOH A 179 679 679 HOH WAT . C 3 HOH A 180 680 680 HOH WAT . C 3 HOH A 181 681 681 HOH WAT . C 3 HOH A 182 682 682 HOH WAT . C 3 HOH A 183 683 683 HOH WAT . C 3 HOH A 184 684 684 HOH WAT . C 3 HOH A 185 685 685 HOH WAT . C 3 HOH A 186 686 686 HOH WAT . C 3 HOH A 187 687 687 HOH WAT . C 3 HOH A 188 688 688 HOH WAT . C 3 HOH A 189 689 689 HOH WAT . C 3 HOH A 190 690 690 HOH WAT . C 3 HOH A 191 691 691 HOH WAT . C 3 HOH A 192 692 692 HOH WAT . C 3 HOH A 193 693 693 HOH WAT . C 3 HOH A 194 694 694 HOH WAT . C 3 HOH A 195 695 695 HOH WAT . C 3 HOH A 196 696 696 HOH WAT . C 3 HOH A 197 697 697 HOH WAT . C 3 HOH A 198 698 698 HOH WAT . C 3 HOH A 199 699 699 HOH WAT . C 3 HOH A 200 700 700 HOH WAT . C 3 HOH A 201 701 701 HOH WAT . C 3 HOH A 202 702 702 HOH WAT . C 3 HOH A 203 703 703 HOH WAT . C 3 HOH A 204 704 704 HOH WAT . C 3 HOH A 205 705 705 HOH WAT . C 3 HOH A 206 706 706 HOH WAT . C 3 HOH A 207 707 707 HOH WAT . C 3 HOH A 208 708 708 HOH WAT . C 3 HOH A 209 709 709 HOH WAT . C 3 HOH A 210 710 710 HOH WAT . C 3 HOH A 211 711 711 HOH WAT . C 3 HOH A 212 712 712 HOH WAT . C 3 HOH A 213 713 713 HOH WAT . C 3 HOH A 214 714 714 HOH WAT . C 3 HOH A 215 715 715 HOH WAT . C 3 HOH A 216 716 716 HOH WAT . C 3 HOH A 217 717 717 HOH WAT . C 3 HOH A 218 718 718 HOH WAT . C 3 HOH A 219 719 719 HOH WAT . C 3 HOH A 220 720 720 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id B _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 8.902 _atom_site.Cartn_y 38.441 _atom_site.Cartn_z 10.434 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 23.7 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 497 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 69 _model_server_stats.parse_time_ms 17 _model_server_stats.create_model_time_ms 6 _model_server_stats.query_time_ms 290 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #