data_1KJY
#
_model_server_result.job_id            zykmN3ec96YHoV3qVdN-yg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-11 00:33:14' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1kjy 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"V","auth_seq_id":355}' 
#
_entry.id    1KJY 
#
_exptl.entry_id    1KJY 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              443.201 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            1KJY 
_cell.length_a            69.51 
_cell.length_b            82.04 
_cell.length_c            187.24 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1KJY 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        17 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 2 2 21' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 
PISA tetrameric 4 software_defined_assembly 3 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,E,F,G,H,I,J,K,L,M,X,Y 1 1 
C,D,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,Z,AA 2 1 
C,D,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,Z,AA 3 1 
A,B,E,F,G,H,I,J,K,L,M,X,Y 3 2 
#
loop_
_pdbx_struct_oper_list.id
_pdbx_struct_oper_list.type
_pdbx_struct_oper_list.name
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]
1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 
2 'crystal symmetry operation' 3_665 -x+1,y+1,-z+1/2 -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 69.51 82.04 93.62 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 L N N 
? 4 V N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A O HIS 28 A HIS 57 1_555 I CS CS . A CS 812 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.39 ? 
metalc ? metalc2 A OE2 GLU 29 A GLU 58 1_555 H CS CS . A CS 811 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.841 ? 
metalc ? metalc3 A O ALA 30 A ALA 59 1_555 G CS CS . A CS 808 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.37 ? 
metalc ? metalc4 A N TYR 32 A TYR 61 1_555 G CS CS . A CS 808 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.816 ? 
metalc ? metalc5 A O TYR 32 A TYR 61 1_555 G CS CS . A CS 808 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.312 ? 
metalc ? metalc6 A O PHE 66 A PHE 95 1_555 K CS CS . A CS 816 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.2 ? 
metalc ? metalc7 A O GLY 67 A GLY 96 1_555 K CS CS . A CS 816 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.512 ? 
metalc ? metalc8 A O PHE 111 A PHE 140 1_555 E CS CS . A CS 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.148 ? 
metalc ? metalc9 A OG SER 114 A SER 143 1_555 E CS CS . A CS 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.421 ? 
metalc ? metalc10 A OD1 ASP 129 A ASP 158 1_555 F CS CS . A CS 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.561 ? 
metalc ? metalc11 A O GLU 157 A GLU 186 1_555 J CS CS . A CS 813 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.169 ? 
metalc ? metalc12 A O HIS 159 A HIS 188 1_555 H CS CS . A CS 811 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.911 ? 
metalc ? metalc13 A O THR 161 A THR 190 1_555 I CS CS . A CS 812 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.13 ? 
metalc ? metalc14 L O2B GDP . A GDP 356 1_555 M MG MG . B MG 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.629 ? 
metalc ? metalc15 B OG SER 15 B SER 510 1_555 M MG MG . B MG 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.758 ? 
metalc ? metalc16 M MG MG . B MG 800 1_555 Y O HOH . B HOH 4085 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.855 ? 
metalc ? metalc17 V O1B GDP . C GDP 355 1_555 N MG MG . C MG 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.504 ? 
metalc ? metalc18 N MG MG . C MG 801 1_555 C OD2 ASP 171 C ASP 1200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.069 ? 
metalc ? metalc19 O CS CS . C CS 802 1_555 C O PHE 111 C PHE 1140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.072 ? 
metalc ? metalc20 O CS CS . C CS 802 1_555 C OG SER 114 C SER 1143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.735 ? 
metalc ? metalc21 P CS CS . C CS 805 1_555 C O HIS 28 C HIS 1057 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.516 ? 
metalc ? metalc22 P CS CS . C CS 805 1_555 C O THR 161 C THR 1190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.395 ? 
metalc ? metalc23 Q CS CS . C CS 806 1_555 C O ASN 128 C ASN 1157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.118 ? 
metalc ? metalc24 Q CS CS . C CS 806 1_555 C OD1 ASP 129 C ASP 1158 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.077 ? 
metalc ? metalc25 R CS CS . C CS 809 1_555 C O LYS 63 C LYS 1092 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.506 ? 
metalc ? metalc26 R CS CS . C CS 809 1_555 C OD1 ASP 65 C ASP 1094 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.766 ? 
metalc ? metalc27 R CS CS . C CS 809 1_555 C OD2 ASP 65 C ASP 1094 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.101 ? 
metalc ? metalc28 S CS CS . C CS 810 1_555 C O TYR 32 C TYR 1061 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.758 ? 
metalc ? metalc29 S CS CS . C CS 810 1_555 C N TYR 32 C TYR 1061 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.849 ? 
metalc ? metalc30 T CS CS . C CS 814 1_555 C OE2 GLU 29 C GLU 1058 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.823 ? 
metalc ? metalc31 T CS CS . C CS 814 1_555 C O HIS 159 C HIS 1188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.032 ? 
metalc ? metalc32 T CS CS . C CS 814 1_555 Z O HOH . C HOH 4001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.696 ? 
metalc ? metalc33 U CS CS . C CS 815 1_555 C O GLU 157 C GLU 1186 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.063 ? 
metalc ? metalc34 U CS CS . C CS 815 1_555 Z O HOH . C HOH 4001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.845 ? 
metalc ? metalc35 W CS CS . D CS 807 1_555 D OD2 ASP 1 D ASP 1496 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.687 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H15 N5 O11 P2' 
_chem_comp.formula_weight    443.201 
_chem_comp.id                GDP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     n 
_chem_comp.name              "GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type              'rna linking' 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PB O1B GDP doub 83 n n 
PB O2B GDP sing 84 n n 
PB O3B GDP sing 85 n n 
PB O3A GDP sing 86 n n 
O2B HOB2 GDP sing 87 n n 
O3B HOB3 GDP sing 88 n n 
O3A PA GDP sing 89 n n 
PA O1A GDP doub 90 n n 
PA O2A GDP sing 91 n n 
PA O5' GDP sing 92 n n 
O2A HOA2 GDP sing 93 n n 
O5' C5' GDP sing 94 n n 
C5' C4' GDP sing 95 n n 
C5' H5' GDP sing 96 n n 
C5' "H5''" GDP sing 97 n n 
C4' O4' GDP sing 98 n n 
C4' C3' GDP sing 99 n n 
C4' H4' GDP sing 100 n n 
O4' C1' GDP sing 101 n n 
C3' O3' GDP sing 102 n n 
C3' C2' GDP sing 103 n n 
C3' H3' GDP sing 104 n n 
O3' HO3' GDP sing 105 n n 
C2' O2' GDP sing 106 n n 
C2' C1' GDP sing 107 n n 
C2' H2' GDP sing 108 n n 
O2' HO2' GDP sing 109 n n 
C1' N9 GDP sing 110 n n 
C1' H1' GDP sing 111 n n 
N9 C8 GDP sing 112 n y 
N9 C4 GDP sing 113 n y 
C8 N7 GDP doub 114 n y 
C8 H8 GDP sing 115 n n 
N7 C5 GDP sing 116 n y 
C5 C6 GDP sing 117 n n 
C5 C4 GDP doub 118 n y 
C6 O6 GDP doub 119 n n 
C6 N1 GDP sing 120 n n 
N1 C2 GDP sing 121 n n 
N1 HN1 GDP sing 122 n n 
C2 N2 GDP sing 123 n n 
C2 N3 GDP doub 124 n n 
N2 HN21 GDP sing 125 n n 
N2 HN22 GDP sing 126 n n 
N3 C4 GDP sing 127 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     1KJY 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.014386 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.012189 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.005341 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 3 CS A 1 803 803 CS CS1 . 
F 3 CS A 1 804 804 CS CS1 . 
G 3 CS A 1 808 808 CS CS1 . 
H 3 CS A 1 811 811 CS CS1 . 
I 3 CS A 1 812 812 CS CS1 . 
J 3 CS A 1 813 813 CS CS1 . 
K 3 CS A 1 816 816 CS CS1 . 
L 4 GDP A 1 356 356 GDP GDP . 
M 5 MG B 1 800 800 MG MG2 . 
N 5 MG C 1 801 801 MG MG2 . 
O 3 CS C 1 802 802 CS CS1 . 
P 3 CS C 1 805 805 CS CS1 . 
Q 3 CS C 1 806 806 CS CS1 . 
R 3 CS C 1 809 809 CS CS1 . 
S 3 CS C 1 810 810 CS CS1 . 
T 3 CS C 1 814 814 CS CS1 . 
U 3 CS C 1 815 815 CS CS1 . 
V 4 GDP C 1 355 355 GDP GDP . 
W 3 CS D 1 807 807 CS CS1 . 
X 6 HOH A 1 4000 4000 HOH WAT . 
X 6 HOH A 2 4002 4002 HOH WAT . 
X 6 HOH A 3 4003 4003 HOH WAT . 
X 6 HOH A 4 4004 4004 HOH WAT . 
X 6 HOH A 5 4006 4006 HOH WAT . 
X 6 HOH A 6 4008 4008 HOH WAT . 
X 6 HOH A 7 4009 4009 HOH WAT . 
X 6 HOH A 8 4010 4010 HOH WAT . 
X 6 HOH A 9 4011 4011 HOH WAT . 
X 6 HOH A 10 4013 4013 HOH WAT . 
X 6 HOH A 11 4014 4014 HOH WAT . 
X 6 HOH A 12 4018 4018 HOH WAT . 
X 6 HOH A 13 4020 4020 HOH WAT . 
X 6 HOH A 14 4022 4022 HOH WAT . 
X 6 HOH A 15 4024 4024 HOH WAT . 
X 6 HOH A 16 4026 4026 HOH WAT . 
X 6 HOH A 17 4027 4027 HOH WAT . 
X 6 HOH A 18 4028 4028 HOH WAT . 
X 6 HOH A 19 4030 4030 HOH WAT . 
X 6 HOH A 20 4033 4033 HOH WAT . 
X 6 HOH A 21 4039 4039 HOH WAT . 
X 6 HOH A 22 4042 4042 HOH WAT . 
X 6 HOH A 23 4043 4043 HOH WAT . 
X 6 HOH A 24 4051 4051 HOH WAT . 
X 6 HOH A 25 4053 4053 HOH WAT . 
X 6 HOH A 26 4055 4055 HOH WAT . 
X 6 HOH A 27 4060 4060 HOH WAT . 
X 6 HOH A 28 4063 4063 HOH WAT . 
X 6 HOH A 29 4068 4068 HOH WAT . 
X 6 HOH A 30 4069 4069 HOH WAT . 
X 6 HOH A 31 4070 4070 HOH WAT . 
X 6 HOH A 32 4072 4072 HOH WAT . 
X 6 HOH A 33 4073 4073 HOH WAT . 
X 6 HOH A 34 4075 4075 HOH WAT . 
X 6 HOH A 35 4076 4076 HOH WAT . 
X 6 HOH A 36 4082 4082 HOH WAT . 
X 6 HOH A 37 4083 4083 HOH WAT . 
X 6 HOH A 38 4084 4084 HOH WAT . 
X 6 HOH A 39 4086 4086 HOH WAT . 
X 6 HOH A 40 4087 4087 HOH WAT . 
X 6 HOH A 41 4088 4088 HOH WAT . 
X 6 HOH A 42 4089 4089 HOH WAT . 
X 6 HOH A 43 4090 4090 HOH WAT . 
X 6 HOH A 44 4091 4091 HOH WAT . 
X 6 HOH A 45 4092 4092 HOH WAT . 
X 6 HOH A 46 4093 4093 HOH WAT . 
X 6 HOH A 47 4096 4096 HOH WAT . 
X 6 HOH A 48 4099 4099 HOH WAT . 
X 6 HOH A 49 4101 4101 HOH WAT . 
X 6 HOH A 50 4102 4102 HOH WAT . 
X 6 HOH A 51 4104 4104 HOH WAT . 
X 6 HOH A 52 4107 4107 HOH WAT . 
X 6 HOH A 53 4113 4113 HOH WAT . 
X 6 HOH A 54 4122 4122 HOH WAT . 
X 6 HOH A 55 4133 4133 HOH WAT . 
X 6 HOH A 56 4134 4134 HOH WAT . 
X 6 HOH A 57 4135 4135 HOH WAT . 
X 6 HOH A 58 4136 4136 HOH WAT . 
X 6 HOH A 59 4137 4137 HOH WAT . 
X 6 HOH A 60 4145 4145 HOH WAT . 
X 6 HOH A 61 4147 4147 HOH WAT . 
X 6 HOH A 62 4150 4150 HOH WAT . 
X 6 HOH A 63 4152 4152 HOH WAT . 
X 6 HOH A 64 4154 4154 HOH WAT . 
X 6 HOH A 65 4155 4155 HOH WAT . 
X 6 HOH A 66 4158 4158 HOH WAT . 
X 6 HOH A 67 4161 4161 HOH WAT . 
X 6 HOH A 68 4162 4162 HOH WAT . 
X 6 HOH A 69 4167 4167 HOH WAT . 
X 6 HOH A 70 4168 4168 HOH WAT . 
X 6 HOH A 71 4169 4169 HOH WAT . 
X 6 HOH A 72 4170 4170 HOH WAT . 
X 6 HOH A 73 4174 4174 HOH WAT . 
X 6 HOH A 74 4179 4179 HOH WAT . 
X 6 HOH A 75 4181 4181 HOH WAT . 
X 6 HOH A 76 4185 4185 HOH WAT . 
X 6 HOH A 77 4188 4188 HOH WAT . 
X 6 HOH A 78 4189 4189 HOH WAT . 
X 6 HOH A 79 4190 4190 HOH WAT . 
X 6 HOH A 80 4191 4191 HOH WAT . 
X 6 HOH A 81 4193 4193 HOH WAT . 
X 6 HOH A 82 4195 4195 HOH WAT . 
X 6 HOH A 83 4198 4198 HOH WAT . 
X 6 HOH A 84 4201 4201 HOH WAT . 
X 6 HOH A 85 4202 4202 HOH WAT . 
X 6 HOH A 86 4203 4203 HOH WAT . 
X 6 HOH A 87 4205 4205 HOH WAT . 
X 6 HOH A 88 4206 4206 HOH WAT . 
X 6 HOH A 89 4207 4207 HOH WAT . 
X 6 HOH A 90 4210 4210 HOH WAT . 
X 6 HOH A 91 4211 4211 HOH WAT . 
Y 6 HOH B 1 4085 4085 HOH WAT . 
Y 6 HOH B 2 4129 4129 HOH WAT . 
Y 6 HOH B 3 4130 4130 HOH WAT . 
Y 6 HOH B 4 4143 4143 HOH WAT . 
Y 6 HOH B 5 4149 4149 HOH WAT . 
Y 6 HOH B 6 4160 4160 HOH WAT . 
Y 6 HOH B 7 4165 4165 HOH WAT . 
Y 6 HOH B 8 4166 4166 HOH WAT . 
Y 6 HOH B 9 4171 4171 HOH WAT . 
Y 6 HOH B 10 4172 4172 HOH WAT . 
Y 6 HOH B 11 4180 4180 HOH WAT . 
Y 6 HOH B 12 4184 4184 HOH WAT . 
Y 6 HOH B 13 4194 4194 HOH WAT . 
Y 6 HOH B 14 4208 4208 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 1 4001 4001 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 2 4005 4005 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 3 4007 4007 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 4 4012 4012 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 5 4015 4015 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 6 4016 4016 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 7 4017 4017 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 8 4019 4019 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 9 4021 4021 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 10 4025 4025 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 11 4029 4029 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 12 4031 4031 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 13 4032 4032 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 14 4034 4034 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 15 4035 4035 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 16 4036 4036 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 17 4037 4037 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 18 4038 4038 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 19 4040 4040 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 20 4041 4041 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 21 4044 4044 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 22 4045 4045 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 23 4046 4046 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 24 4047 4047 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 25 4048 4048 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 26 4049 4049 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 27 4050 4050 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 28 4052 4052 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 29 4054 4054 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 30 4056 4056 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 31 4057 4057 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 32 4058 4058 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 33 4059 4059 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 34 4061 4061 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 35 4062 4062 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 36 4064 4064 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 37 4065 4065 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 38 4066 4066 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 39 4067 4067 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 40 4071 4071 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 41 4074 4074 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 42 4077 4077 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 43 4078 4078 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 44 4079 4079 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 45 4080 4080 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 46 4081 4081 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 47 4094 4094 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 48 4095 4095 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 49 4097 4097 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 50 4098 4098 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 51 4103 4103 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 52 4105 4105 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 53 4106 4106 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 54 4108 4108 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 55 4109 4109 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 56 4110 4110 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 57 4111 4111 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 58 4112 4112 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 59 4114 4114 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 60 4115 4115 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 61 4116 4116 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 62 4117 4117 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 63 4118 4118 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 64 4119 4119 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 65 4120 4120 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 66 4121 4121 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 67 4123 4123 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 68 4124 4124 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 69 4125 4125 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 70 4126 4126 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 71 4127 4127 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 72 4128 4128 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 73 4132 4132 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 74 4138 4138 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 75 4141 4141 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 76 4148 4148 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 77 4156 4156 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 78 4159 4159 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 79 4163 4163 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 80 4164 4164 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 81 4175 4175 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 82 4177 4177 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 83 4178 4178 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 84 4183 4183 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 85 4187 4187 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 86 4192 4192 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 87 4196 4196 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 88 4197 4197 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 89 4199 4199 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 90 4200 4200 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 91 4204 4204 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 92 4209 4209 HOH WAT . 
Z 6 HOH C 93 4212 4212 HOH WAT . 
AA 6 HOH D 1 4023 4023 HOH WAT . 
AA 6 HOH D 2 4140 4140 HOH WAT . 
AA 6 HOH D 3 4144 4144 HOH WAT . 
AA 6 HOH D 4 4151 4151 HOH WAT . 
AA 6 HOH D 5 4153 4153 HOH WAT . 
AA 6 HOH D 6 4176 4176 HOH WAT . 
AA 6 HOH D 7 4182 4182 HOH WAT . 
AA 6 HOH D 8 4186 4186 HOH WAT . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 P PB GDP . . . V 4 7.502 56.984 68.554 1 30.07 ? PB GDP 355 C 1 
HETATM 2 O O1B GDP . . . V 4 8.875 57.127 68.106 1 36.44 ? O1B GDP 355 C 1 
HETATM 3 O O2B GDP . . . V 4 7.181 57.583 69.884 1 30.62 ? O2B GDP 355 C 1 
HETATM 4 O O3B GDP . . . V 4 6.446 57.668 67.703 1 40.55 ? O3B GDP 355 C 1 
HETATM 5 O O3A GDP . . . V 4 7.306 55.33 68.875 1 34.37 ? O3A GDP 355 C 1 
HETATM 6 P PA GDP . . . V 4 7.47 54.121 67.754 1 34.18 ? PA GDP 355 C 1 
HETATM 7 O O1A GDP . . . V 4 7.246 52.915 68.641 1 36.8 ? O1A GDP 355 C 1 
HETATM 8 O O2A GDP . . . V 4 7.654 54.183 66.31 1 33.93 ? O2A GDP 355 C 1 
HETATM 9 O O5' GDP . . . V 4 5.872 53.987 67.636 1 30.01 ? O5' GDP 355 C 1 
HETATM 10 C C5' GDP . . . V 4 4.84 54.638 66.927 1 28.27 ? C5' GDP 355 C 1 
HETATM 11 C C4' GDP . . . V 4 3.653 53.577 66.938 1 26.68 ? C4' GDP 355 C 1 
HETATM 12 O O4' GDP . . . V 4 2.996 53.347 65.635 1 25.71 ? O4' GDP 355 C 1 
HETATM 13 C C3' GDP . . . V 4 4.043 52.09 67.243 1 27.98 ? C3' GDP 355 C 1 
HETATM 14 O O3' GDP . . . V 4 2.806 51.434 67.668 1 26.73 ? O3' GDP 355 C 1 
HETATM 15 C C2' GDP . . . V 4 4.5 51.549 65.879 1 27.31 ? C2' GDP 355 C 1 
HETATM 16 O O2' GDP . . . V 4 4.524 50.117 65.82 1 27.11 ? O2' GDP 355 C 1 
HETATM 17 C C1' GDP . . . V 4 3.46 52.163 64.971 1 24.98 ? C1' GDP 355 C 1 
HETATM 18 N N9 GDP . . . V 4 3.979 52.693 63.669 1 25.34 ? N9 GDP 355 C 1 
HETATM 19 C C8 GDP . . . V 4 5.056 53.495 63.363 1 23.92 ? C8 GDP 355 C 1 
HETATM 20 N N7 GDP . . . V 4 5.155 53.76 62.107 1 22.82 ? N7 GDP 355 C 1 
HETATM 21 C C5 GDP . . . V 4 4.086 53.106 61.513 1 23.61 ? C5 GDP 355 C 1 
HETATM 22 C C6 GDP . . . V 4 3.64 53.027 60.148 1 21.56 ? C6 GDP 355 C 1 
HETATM 23 O O6 GDP . . . V 4 4.144 53.566 59.162 1 20.28 ? O6 GDP 355 C 1 
HETATM 24 N N1 GDP . . . V 4 2.484 52.226 60.002 1 21.24 ? N1 GDP 355 C 1 
HETATM 25 C C2 GDP . . . V 4 1.832 51.58 61.031 1 22.37 ? C2 GDP 355 C 1 
HETATM 26 N N2 GDP . . . V 4 0.769 50.867 60.688 1 22.83 ? N2 GDP 355 C 1 
HETATM 27 N N3 GDP . . . V 4 2.232 51.653 62.332 1 23.83 ? N3 GDP 355 C 1 
HETATM 28 C C4 GDP . . . V 4 3.342 52.419 62.469 1 23.7 ? C4 GDP 355 C 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              0 
_model_server_stats.parse_time_ms           8 
_model_server_stats.create_model_time_ms    7 
_model_server_stats.query_time_ms           314 
_model_server_stats.encode_time_ms          5 
_model_server_stats.element_count           28 
#