data_1KQJ # _model_server_result.job_id reHaCAQFx9m_s2qouxfD3w _model_server_result.datetime_utc '2024-12-21 15:49:15' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1kqj # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":303}' # _entry.id 1KQJ # _exptl.entry_id 1KQJ _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 92.094 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description GLYCEROL _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 122.56 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1KQJ _cell.length_a 83.55 _cell.length_b 49.9 _cell.length_c 71.01 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1KQJ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 D N N ? 4 E N N ? 4 F N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A SG CYS 192 A CYS 192 1_555 C FE2 SF4 . A SF4 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.425 ? metalc ? metalc2 A ND1 HIS 199 A HIS 199 1_555 C FE3 SF4 . A SF4 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.192 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 202 A CYS 202 1_555 C FE1 SF4 . A SF4 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 208 A CYS 208 1_555 C FE4 SF4 . A SF4 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.37 ? # _chem_comp.formula 'C3 H8 O3' _chem_comp.formula_weight 92.094 _chem_comp.id GOL _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name GLYCEROL _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms GLYCERIN;PROPANE-1,2,3-TRIOL # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 O1 GOL sing 129 n n C1 C2 GOL sing 130 n n C1 H11 GOL sing 131 n n C1 H12 GOL sing 132 n n O1 HO1 GOL sing 133 n n C2 O2 GOL sing 134 n n C2 C3 GOL sing 135 n n C2 H2 GOL sing 136 n n O2 HO2 GOL sing 137 n n C3 O3 GOL sing 138 n n C3 H31 GOL sing 139 n n C3 H32 GOL sing 140 n n O3 HO3 GOL sing 141 n n # _atom_sites.entry_id 1KQJ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.011969 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.007643 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.02004 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.016709 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 SO4 A 1 301 301 SO4 SO4 . C 3 SF4 A 1 300 300 SF4 FS4 . D 4 GOL A 1 302 302 GOL CRY . E 4 GOL A 1 303 303 GOL CRY . F 4 GOL A 1 304 304 GOL CRY . G 5 HOH A 1 401 401 HOH WAT . G 5 HOH A 2 402 402 HOH WAT . G 5 HOH A 3 403 403 HOH WAT . G 5 HOH A 4 404 404 HOH WAT . G 5 HOH A 5 405 405 HOH WAT . G 5 HOH A 6 406 406 HOH WAT . G 5 HOH A 7 407 407 HOH WAT . G 5 HOH A 8 408 408 HOH WAT . G 5 HOH A 9 409 409 HOH WAT . G 5 HOH A 10 410 410 HOH WAT . G 5 HOH A 11 411 411 HOH WAT . G 5 HOH A 12 412 412 HOH WAT . G 5 HOH A 13 413 413 HOH WAT . G 5 HOH A 14 414 414 HOH WAT . G 5 HOH A 15 415 415 HOH WAT . G 5 HOH A 16 416 416 HOH WAT . G 5 HOH A 17 417 417 HOH WAT . G 5 HOH A 18 418 418 HOH WAT . G 5 HOH A 19 419 419 HOH WAT . G 5 HOH A 20 420 420 HOH WAT . G 5 HOH A 21 421 421 HOH WAT . G 5 HOH A 22 422 422 HOH WAT . G 5 HOH A 23 423 423 HOH WAT . G 5 HOH A 24 424 424 HOH WAT . G 5 HOH A 25 425 425 HOH WAT . G 5 HOH A 26 426 426 HOH WAT . G 5 HOH A 27 427 427 HOH WAT . G 5 HOH A 28 428 428 HOH WAT . G 5 HOH A 29 429 429 HOH WAT . G 5 HOH A 30 430 430 HOH WAT . G 5 HOH A 31 431 431 HOH WAT . G 5 HOH A 32 432 432 HOH WAT . G 5 HOH A 33 433 433 HOH WAT . G 5 HOH A 34 434 434 HOH WAT . G 5 HOH A 35 435 435 HOH WAT . G 5 HOH A 36 436 436 HOH WAT . G 5 HOH A 37 437 437 HOH WAT . G 5 HOH A 38 438 438 HOH WAT . G 5 HOH A 39 439 439 HOH WAT . G 5 HOH A 40 440 440 HOH WAT . G 5 HOH A 41 441 441 HOH WAT . G 5 HOH A 42 442 442 HOH WAT . G 5 HOH A 43 443 443 HOH WAT . G 5 HOH A 44 444 444 HOH WAT . G 5 HOH A 45 445 445 HOH WAT . G 5 HOH A 46 446 446 HOH WAT . G 5 HOH A 47 447 447 HOH WAT . G 5 HOH A 48 448 448 HOH WAT . G 5 HOH A 49 449 449 HOH WAT . G 5 HOH A 50 450 450 HOH WAT . G 5 HOH A 51 451 451 HOH WAT . G 5 HOH A 52 452 452 HOH WAT . G 5 HOH A 53 453 453 HOH WAT . G 5 HOH A 54 454 454 HOH WAT . G 5 HOH A 55 455 455 HOH WAT . G 5 HOH A 56 456 456 HOH WAT . G 5 HOH A 57 457 457 HOH WAT . G 5 HOH A 58 458 458 HOH WAT . G 5 HOH A 59 459 459 HOH WAT . G 5 HOH A 60 460 460 HOH WAT . G 5 HOH A 61 461 461 HOH WAT . G 5 HOH A 62 462 462 HOH WAT . G 5 HOH A 63 463 463 HOH WAT . G 5 HOH A 64 464 464 HOH WAT . G 5 HOH A 65 465 465 HOH WAT . G 5 HOH A 66 466 466 HOH WAT . G 5 HOH A 67 467 467 HOH WAT . G 5 HOH A 68 468 468 HOH WAT . G 5 HOH A 69 469 469 HOH WAT . G 5 HOH A 70 470 470 HOH WAT . G 5 HOH A 71 471 471 HOH WAT . G 5 HOH A 72 472 472 HOH WAT . G 5 HOH A 73 473 473 HOH WAT . G 5 HOH A 74 474 474 HOH WAT . G 5 HOH A 75 475 475 HOH WAT . G 5 HOH A 76 476 476 HOH WAT . G 5 HOH A 77 477 477 HOH WAT . G 5 HOH A 78 478 478 HOH WAT . G 5 HOH A 79 479 479 HOH WAT . G 5 HOH A 80 480 480 HOH WAT . G 5 HOH A 81 481 481 HOH WAT . G 5 HOH A 82 482 482 HOH WAT . G 5 HOH A 83 483 483 HOH WAT . G 5 HOH A 84 484 484 HOH WAT . G 5 HOH A 85 485 485 HOH WAT . G 5 HOH A 86 486 486 HOH WAT . G 5 HOH A 87 487 487 HOH WAT . G 5 HOH A 88 488 488 HOH WAT . G 5 HOH A 89 489 489 HOH WAT . G 5 HOH A 90 490 490 HOH WAT . G 5 HOH A 91 491 491 HOH WAT . G 5 HOH A 92 492 492 HOH WAT . G 5 HOH A 93 493 493 HOH WAT . G 5 HOH A 94 494 494 HOH WAT . G 5 HOH A 95 495 495 HOH WAT . G 5 HOH A 96 496 496 HOH WAT . G 5 HOH A 97 497 497 HOH WAT . G 5 HOH A 98 498 498 HOH WAT . G 5 HOH A 99 499 499 HOH WAT . G 5 HOH A 100 500 500 HOH WAT . G 5 HOH A 101 501 501 HOH WAT . G 5 HOH A 102 502 502 HOH WAT . G 5 HOH A 103 503 503 HOH WAT . G 5 HOH A 104 504 504 HOH WAT . G 5 HOH A 105 505 505 HOH WAT . G 5 HOH A 106 506 506 HOH WAT . G 5 HOH A 107 507 507 HOH WAT . G 5 HOH A 108 508 508 HOH WAT . G 5 HOH A 109 509 509 HOH WAT . G 5 HOH A 110 510 510 HOH WAT . G 5 HOH A 111 511 511 HOH WAT . G 5 HOH A 112 512 512 HOH WAT . G 5 HOH A 113 513 513 HOH WAT . G 5 HOH A 114 514 514 HOH WAT . G 5 HOH A 115 515 515 HOH WAT . G 5 HOH A 116 516 516 HOH WAT . G 5 HOH A 117 517 517 HOH WAT . G 5 HOH A 118 518 518 HOH WAT . G 5 HOH A 119 519 519 HOH WAT . G 5 HOH A 120 520 520 HOH WAT . G 5 HOH A 121 521 521 HOH WAT . G 5 HOH A 122 522 522 HOH WAT . G 5 HOH A 123 523 523 HOH WAT . G 5 HOH A 124 524 524 HOH WAT . G 5 HOH A 125 525 525 HOH WAT . G 5 HOH A 126 526 526 HOH WAT . G 5 HOH A 127 527 527 HOH WAT . G 5 HOH A 128 528 528 HOH WAT . G 5 HOH A 129 529 529 HOH WAT . G 5 HOH A 130 530 530 HOH WAT . G 5 HOH A 131 531 531 HOH WAT . G 5 HOH A 132 532 532 HOH WAT . G 5 HOH A 133 533 533 HOH WAT . G 5 HOH A 134 534 534 HOH WAT . G 5 HOH A 135 535 535 HOH WAT . G 5 HOH A 136 536 536 HOH WAT . G 5 HOH A 137 537 537 HOH WAT . G 5 HOH A 138 538 538 HOH WAT . G 5 HOH A 139 539 539 HOH WAT . G 5 HOH A 140 540 540 HOH WAT . G 5 HOH A 141 541 541 HOH WAT . G 5 HOH A 142 542 542 HOH WAT . G 5 HOH A 143 543 543 HOH WAT . G 5 HOH A 144 544 544 HOH WAT . G 5 HOH A 145 545 545 HOH WAT . G 5 HOH A 146 546 546 HOH WAT . G 5 HOH A 147 547 547 HOH WAT . G 5 HOH A 148 548 548 HOH WAT . G 5 HOH A 149 549 549 HOH WAT . G 5 HOH A 150 550 550 HOH WAT . G 5 HOH A 151 551 551 HOH WAT . G 5 HOH A 152 552 552 HOH WAT . G 5 HOH A 153 553 553 HOH WAT . G 5 HOH A 154 554 554 HOH WAT . G 5 HOH A 155 555 555 HOH WAT . G 5 HOH A 156 556 556 HOH WAT . G 5 HOH A 157 557 557 HOH WAT . G 5 HOH A 158 558 558 HOH WAT . G 5 HOH A 159 559 559 HOH WAT . G 5 HOH A 160 560 560 HOH WAT . G 5 HOH A 161 561 561 HOH WAT . G 5 HOH A 162 562 562 HOH WAT . G 5 HOH A 163 563 563 HOH WAT . G 5 HOH A 164 564 564 HOH WAT . G 5 HOH A 165 565 565 HOH WAT . G 5 HOH A 166 566 566 HOH WAT . G 5 HOH A 167 567 567 HOH WAT . G 5 HOH A 168 568 568 HOH WAT . G 5 HOH A 169 569 569 HOH WAT . G 5 HOH A 170 570 570 HOH WAT . G 5 HOH A 171 571 571 HOH WAT . G 5 HOH A 172 572 572 HOH WAT . G 5 HOH A 173 573 573 HOH WAT . G 5 HOH A 174 574 574 HOH WAT . G 5 HOH A 175 575 575 HOH WAT . G 5 HOH A 176 576 576 HOH WAT . G 5 HOH A 177 577 577 HOH WAT . G 5 HOH A 178 578 578 HOH WAT . G 5 HOH A 179 579 579 HOH WAT . G 5 HOH A 180 580 580 HOH WAT . G 5 HOH A 181 581 581 HOH WAT . G 5 HOH A 182 582 582 HOH WAT . G 5 HOH A 183 583 583 HOH WAT . G 5 HOH A 184 584 584 HOH WAT . G 5 HOH A 185 585 585 HOH WAT . G 5 HOH A 186 586 586 HOH WAT . G 5 HOH A 187 587 587 HOH WAT . G 5 HOH A 188 588 588 HOH WAT . G 5 HOH A 189 589 589 HOH WAT . G 5 HOH A 190 590 590 HOH WAT . G 5 HOH A 191 591 591 HOH WAT . G 5 HOH A 192 592 592 HOH WAT . G 5 HOH A 193 593 593 HOH WAT . G 5 HOH A 194 594 594 HOH WAT . G 5 HOH A 195 595 595 HOH WAT . G 5 HOH A 196 596 596 HOH WAT . G 5 HOH A 197 597 597 HOH WAT . G 5 HOH A 198 598 598 HOH WAT . G 5 HOH A 199 599 599 HOH WAT . G 5 HOH A 200 600 600 HOH WAT . G 5 HOH A 201 601 601 HOH WAT . G 5 HOH A 202 602 602 HOH WAT . G 5 HOH A 203 603 603 HOH WAT . G 5 HOH A 204 604 604 HOH WAT . G 5 HOH A 205 605 605 HOH WAT . G 5 HOH A 206 606 606 HOH WAT . G 5 HOH A 207 607 607 HOH WAT . G 5 HOH A 208 608 608 HOH WAT . G 5 HOH A 209 609 609 HOH WAT . G 5 HOH A 210 610 610 HOH WAT . G 5 HOH A 211 611 611 HOH WAT . G 5 HOH A 212 612 612 HOH WAT . G 5 HOH A 213 613 613 HOH WAT . G 5 HOH A 214 614 614 HOH WAT . G 5 HOH A 215 615 615 HOH WAT . G 5 HOH A 216 616 616 HOH WAT . G 5 HOH A 217 617 617 HOH WAT . G 5 HOH A 218 618 618 HOH WAT . G 5 HOH A 219 619 619 HOH WAT . G 5 HOH A 220 620 620 HOH WAT . G 5 HOH A 221 621 621 HOH WAT . G 5 HOH A 222 622 622 HOH WAT . G 5 HOH A 223 623 623 HOH WAT . G 5 HOH A 224 624 624 HOH WAT . G 5 HOH A 225 625 625 HOH WAT . G 5 HOH A 226 626 626 HOH WAT . G 5 HOH A 227 627 627 HOH WAT . G 5 HOH A 228 628 628 HOH WAT . G 5 HOH A 229 629 629 HOH WAT . G 5 HOH A 230 630 630 HOH WAT . G 5 HOH A 231 631 631 HOH WAT . G 5 HOH A 232 632 632 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 GOL . . . E 4 7.63 -3.093 21.02 1 24.63 ? C1 GOL 303 A 1 HETATM 2 O O1 GOL . . . E 4 7.052 -2.24 21.954 1 18.54 ? O1 GOL 303 A 1 HETATM 3 C C2 GOL . . . E 4 7.936 -2.232 19.816 1 25.19 ? C2 GOL 303 A 1 HETATM 4 O O2 GOL . . . E 4 7.725 -3.067 18.624 1 25.11 ? O2 GOL 303 A 1 HETATM 5 C C3 GOL . . . E 4 9.438 -1.78 19.848 1 27.41 ? C3 GOL 303 A 1 HETATM 6 O O3 GOL . . . E 4 9.967 -2.382 18.649 1 32.36 ? O3 GOL 303 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 12 _model_server_stats.parse_time_ms 15 _model_server_stats.create_model_time_ms 8 _model_server_stats.query_time_ms 340 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 6 #