data_1KTT # _model_server_result.job_id fsw1Ai7Od2jMQYdUZ_AIag _model_server_result.datetime_utc '2024-10-24 04:27:10' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1ktt # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":1}' # _entry.id 1KTT # _exptl.entry_id 1KTT _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 419.499 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 4-(5-BENZENESULFONYLAMINO-1-METHYL-1H-BENZOIMIDAZOL-2-YLMETHYL)-BENZAMIDINE _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 100 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1KTT _cell.length_a 69.9 _cell.length_b 70.9 _cell.length_c 72.5 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1KTT _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 4 _struct_asym.id D _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 9 A CYS 1 1_555 B SG CYS 119 B CYS 122 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 28 B CYS 42 1_555 B SG CYS 44 B CYS 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf3 B SG CYS 173 B CYS 168 1_555 B SG CYS 187 B CYS 182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf4 B SG CYS 201 B CYS 191 1_555 B SG CYS 231 B CYS 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? covale ? covale1 C C GLU 8 C GLU 262 1_555 C N TYS 9 C TYS 263 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale2 C C TYS 9 C TYS 263 1_555 C N LEU 10 C LEU 264 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? # _chem_comp.formula 'C22 H21 N5 O2 S' _chem_comp.formula_weight 419.499 _chem_comp.id C02 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 4-(5-BENZENESULFONYLAMINO-1-METHYL-1H-BENZOIMIDAZOL-2-YLMETHYL)-BENZAMIDINE _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1KTT _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.014306 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.002523 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.014104 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.014006 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 4 C02 B 1 1 1 C02 C02 . E 5 HOH A 1 534 534 HOH WAT . E 5 HOH A 2 538 538 HOH WAT . E 5 HOH A 3 547 547 HOH WAT . E 5 HOH A 4 550 550 HOH WAT . E 5 HOH A 5 555 555 HOH WAT . E 5 HOH A 6 559 559 HOH WAT . E 5 HOH A 7 580 580 HOH WAT . E 5 HOH A 8 582 582 HOH WAT . E 5 HOH A 9 606 606 HOH WAT . E 5 HOH A 10 618 618 HOH WAT . E 5 HOH A 11 702 702 HOH WAT . E 5 HOH A 12 714 714 HOH WAT . E 5 HOH A 13 715 715 HOH WAT . E 5 HOH A 14 729 729 HOH WAT . E 5 HOH A 15 732 732 HOH WAT . E 5 HOH A 16 737 737 HOH WAT . E 5 HOH A 17 741 741 HOH WAT . E 5 HOH A 18 748 748 HOH WAT . E 5 HOH A 19 770 770 HOH WAT . E 5 HOH A 20 773 773 HOH WAT . E 5 HOH A 21 774 774 HOH WAT . E 5 HOH A 22 782 782 HOH WAT . E 5 HOH A 23 783 783 HOH WAT . F 5 HOH B 1 500 500 HOH WAT . F 5 HOH B 2 501 501 HOH WAT . F 5 HOH B 3 502 502 HOH WAT . F 5 HOH B 4 503 503 HOH WAT . F 5 HOH B 5 504 504 HOH WAT . F 5 HOH B 6 505 505 HOH WAT . F 5 HOH B 7 506 506 HOH WAT . F 5 HOH B 8 507 507 HOH WAT . F 5 HOH B 9 508 508 HOH WAT . F 5 HOH B 10 509 509 HOH WAT . F 5 HOH B 11 510 510 HOH WAT . F 5 HOH B 12 511 511 HOH WAT . F 5 HOH B 13 512 512 HOH WAT . F 5 HOH B 14 513 513 HOH WAT . F 5 HOH B 15 514 514 HOH WAT . F 5 HOH B 16 515 515 HOH WAT . F 5 HOH B 17 516 516 HOH WAT . F 5 HOH B 18 517 517 HOH WAT . F 5 HOH B 19 518 518 HOH WAT . F 5 HOH B 20 519 519 HOH WAT . F 5 HOH B 21 520 520 HOH WAT . F 5 HOH B 22 521 521 HOH WAT . F 5 HOH B 23 522 522 HOH WAT . F 5 HOH B 24 523 523 HOH WAT . F 5 HOH B 25 524 524 HOH WAT . F 5 HOH B 26 525 525 HOH WAT . F 5 HOH B 27 526 526 HOH WAT . F 5 HOH B 28 527 527 HOH WAT . F 5 HOH B 29 528 528 HOH WAT . F 5 HOH B 30 529 529 HOH WAT . F 5 HOH B 31 531 531 HOH WAT . F 5 HOH B 32 532 532 HOH WAT . F 5 HOH B 33 533 533 HOH WAT . F 5 HOH B 34 535 535 HOH WAT . F 5 HOH B 35 536 536 HOH WAT . F 5 HOH B 36 537 537 HOH WAT . F 5 HOH B 37 539 539 HOH WAT . F 5 HOH B 38 540 540 HOH WAT . F 5 HOH B 39 541 541 HOH WAT . F 5 HOH B 40 543 543 HOH WAT . F 5 HOH B 41 544 544 HOH WAT . F 5 HOH B 42 545 545 HOH WAT . F 5 HOH B 43 546 546 HOH WAT . F 5 HOH B 44 548 548 HOH WAT . F 5 HOH B 45 549 549 HOH WAT . F 5 HOH B 46 551 551 HOH WAT . F 5 HOH B 47 552 552 HOH WAT . F 5 HOH B 48 553 553 HOH WAT . F 5 HOH B 49 554 554 HOH WAT . F 5 HOH B 50 556 556 HOH WAT . F 5 HOH B 51 557 557 HOH WAT . F 5 HOH B 52 558 558 HOH WAT . F 5 HOH B 53 560 560 HOH WAT . F 5 HOH B 54 561 561 HOH WAT . F 5 HOH B 55 562 562 HOH WAT . F 5 HOH B 56 563 563 HOH WAT . F 5 HOH B 57 564 564 HOH WAT . F 5 HOH B 58 565 565 HOH WAT . F 5 HOH B 59 566 566 HOH WAT . F 5 HOH B 60 567 567 HOH WAT . F 5 HOH B 61 568 568 HOH WAT . F 5 HOH B 62 569 569 HOH WAT . F 5 HOH B 63 570 570 HOH WAT . F 5 HOH B 64 571 571 HOH WAT . F 5 HOH B 65 572 572 HOH WAT . F 5 HOH B 66 573 573 HOH WAT . F 5 HOH B 67 574 574 HOH WAT . F 5 HOH B 68 575 575 HOH WAT . F 5 HOH B 69 576 576 HOH WAT . F 5 HOH B 70 578 578 HOH WAT . F 5 HOH B 71 579 579 HOH WAT . F 5 HOH B 72 581 581 HOH WAT . F 5 HOH B 73 583 583 HOH WAT . F 5 HOH B 74 584 584 HOH WAT . F 5 HOH B 75 585 585 HOH WAT . F 5 HOH B 76 587 587 HOH WAT . F 5 HOH B 77 588 588 HOH WAT . F 5 HOH B 78 589 589 HOH WAT . F 5 HOH B 79 590 590 HOH WAT . F 5 HOH B 80 592 592 HOH WAT . F 5 HOH B 81 593 593 HOH WAT . F 5 HOH B 82 594 594 HOH WAT . F 5 HOH B 83 595 595 HOH WAT . F 5 HOH B 84 596 596 HOH WAT . F 5 HOH B 85 597 597 HOH WAT . F 5 HOH B 86 598 598 HOH WAT . F 5 HOH B 87 599 599 HOH WAT . F 5 HOH B 88 600 600 HOH WAT . F 5 HOH B 89 601 601 HOH WAT . F 5 HOH B 90 602 602 HOH WAT . F 5 HOH B 91 603 603 HOH WAT . F 5 HOH B 92 604 604 HOH WAT . F 5 HOH B 93 605 605 HOH WAT . F 5 HOH B 94 607 607 HOH WAT . F 5 HOH B 95 608 608 HOH WAT . F 5 HOH B 96 609 609 HOH WAT . F 5 HOH B 97 610 610 HOH WAT . F 5 HOH B 98 611 611 HOH WAT . F 5 HOH B 99 612 612 HOH WAT . F 5 HOH B 100 613 613 HOH WAT . F 5 HOH B 101 614 614 HOH WAT . F 5 HOH B 102 615 615 HOH WAT . F 5 HOH B 103 616 616 HOH WAT . F 5 HOH B 104 619 619 HOH WAT . F 5 HOH B 105 620 620 HOH WAT . F 5 HOH B 106 700 700 HOH WAT . F 5 HOH B 107 701 701 HOH WAT . F 5 HOH B 108 703 703 HOH WAT . F 5 HOH B 109 704 704 HOH WAT . F 5 HOH B 110 705 705 HOH WAT . F 5 HOH B 111 706 706 HOH WAT . F 5 HOH B 112 707 707 HOH WAT . F 5 HOH B 113 708 708 HOH WAT . F 5 HOH B 114 709 709 HOH WAT . F 5 HOH B 115 710 710 HOH WAT . F 5 HOH B 116 711 711 HOH WAT . F 5 HOH B 117 712 712 HOH WAT . F 5 HOH B 118 713 713 HOH WAT . F 5 HOH B 119 716 716 HOH WAT . F 5 HOH B 120 717 717 HOH WAT . F 5 HOH B 121 718 718 HOH WAT . F 5 HOH B 122 719 719 HOH WAT . F 5 HOH B 123 720 720 HOH WAT . F 5 HOH B 124 721 721 HOH WAT . F 5 HOH B 125 722 722 HOH WAT . F 5 HOH B 126 723 723 HOH WAT . F 5 HOH B 127 724 724 HOH WAT . F 5 HOH B 128 727 727 HOH WAT . F 5 HOH B 129 728 728 HOH WAT . F 5 HOH B 130 730 730 HOH WAT . F 5 HOH B 131 731 731 HOH WAT . F 5 HOH B 132 733 733 HOH WAT . F 5 HOH B 133 734 734 HOH WAT . F 5 HOH B 134 735 735 HOH WAT . F 5 HOH B 135 736 736 HOH WAT . F 5 HOH B 136 738 738 HOH WAT . F 5 HOH B 137 739 739 HOH WAT . F 5 HOH B 138 740 740 HOH WAT . F 5 HOH B 139 742 742 HOH WAT . F 5 HOH B 140 743 743 HOH WAT . F 5 HOH B 141 744 744 HOH WAT . F 5 HOH B 142 745 745 HOH WAT . F 5 HOH B 143 746 746 HOH WAT . F 5 HOH B 144 747 747 HOH WAT . F 5 HOH B 145 749 749 HOH WAT . F 5 HOH B 146 750 750 HOH WAT . F 5 HOH B 147 751 751 HOH WAT . F 5 HOH B 148 752 752 HOH WAT . F 5 HOH B 149 753 753 HOH WAT . F 5 HOH B 150 754 754 HOH WAT . F 5 HOH B 151 755 755 HOH WAT . F 5 HOH B 152 756 756 HOH WAT . F 5 HOH B 153 757 757 HOH WAT . F 5 HOH B 154 758 758 HOH WAT . F 5 HOH B 155 759 759 HOH WAT . F 5 HOH B 156 762 762 HOH WAT . F 5 HOH B 157 763 763 HOH WAT . F 5 HOH B 158 764 764 HOH WAT . F 5 HOH B 159 765 765 HOH WAT . F 5 HOH B 160 766 766 HOH WAT . F 5 HOH B 161 767 767 HOH WAT . F 5 HOH B 162 768 768 HOH WAT . F 5 HOH B 163 769 769 HOH WAT . F 5 HOH B 164 771 771 HOH WAT . F 5 HOH B 165 772 772 HOH WAT . F 5 HOH B 166 775 775 HOH WAT . F 5 HOH B 167 776 776 HOH WAT . F 5 HOH B 168 777 777 HOH WAT . F 5 HOH B 169 778 778 HOH WAT . F 5 HOH B 170 779 779 HOH WAT . F 5 HOH B 171 780 780 HOH WAT . F 5 HOH B 172 781 781 HOH WAT . F 5 HOH B 173 784 784 HOH WAT . F 5 HOH B 174 785 785 HOH WAT . G 5 HOH C 1 542 542 HOH WAT . G 5 HOH C 2 577 577 HOH WAT . G 5 HOH C 3 586 586 HOH WAT . G 5 HOH C 4 591 591 HOH WAT . G 5 HOH C 5 617 617 HOH WAT . G 5 HOH C 6 725 725 HOH WAT . G 5 HOH C 7 726 726 HOH WAT . G 5 HOH C 8 760 760 HOH WAT . G 5 HOH C 9 761 761 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 N N1 C02 . . . D 4 10.58 -10.568 24.565 1 41.41 ? N1 C02 1 B 1 HETATM 2 C C2 C02 . . . D 4 10.826 -11.585 23.707 1 43.65 ? C2 C02 1 B 1 HETATM 3 N N3 C02 . . . D 4 9.961 -12.625 23.648 1 41.79 ? N3 C02 1 B 1 HETATM 4 C C4 C02 . . . D 4 12.026 -11.583 22.894 1 43.49 ? C4 C02 1 B 1 HETATM 5 C C5 C02 . . . D 4 12.856 -10.463 22.875 1 44.46 ? C5 C02 1 B 1 HETATM 6 C C6 C02 . . . D 4 14.023 -10.453 22.109 1 45 ? C6 C02 1 B 1 HETATM 7 C C7 C02 . . . D 4 14.371 -11.574 21.348 1 46.08 ? C7 C02 1 B 1 HETATM 8 C C8 C02 . . . D 4 13.536 -12.699 21.362 1 45.48 ? C8 C02 1 B 1 HETATM 9 C C9 C02 . . . D 4 12.366 -12.703 22.133 1 44.53 ? C9 C02 1 B 1 HETATM 10 C C10 C02 . . . D 4 15.644 -11.563 20.538 1 46.44 ? C10 C02 1 B 1 HETATM 11 C C11 C02 . . . D 4 16.632 -12.59 21.074 1 46.82 ? C11 C02 1 B 1 HETATM 12 N N12 C02 . . . D 4 16.308 -13.613 21.871 1 46.98 ? N12 C02 1 B 1 HETATM 13 C C13 C02 . . . D 4 17.415 -14.31 22.147 1 47.35 ? C13 C02 1 B 1 HETATM 14 C C14 C02 . . . D 4 18.471 -13.688 21.491 1 47.24 ? C14 C02 1 B 1 HETATM 15 N N15 C02 . . . D 4 17.962 -12.63 20.838 1 47.27 ? N15 C02 1 B 1 HETATM 16 C C16 C02 . . . D 4 18.718 -11.676 20.007 1 47.78 ? C16 C02 1 B 1 HETATM 17 C C17 C02 . . . D 4 19.758 -14.22 21.613 1 47.17 ? C17 C02 1 B 1 HETATM 18 C C18 C02 . . . D 4 19.986 -15.378 22.392 1 47.12 ? C18 C02 1 B 1 HETATM 19 C C19 C02 . . . D 4 18.925 -15.99 23.038 1 47.76 ? C19 C02 1 B 1 HETATM 20 C C20 C02 . . . D 4 17.636 -15.445 22.91 1 47.35 ? C20 C02 1 B 1 HETATM 21 N N21 C02 . . . D 4 19.108 -17.004 23.964 1 48.34 ? N21 C02 1 B 1 HETATM 22 S S22 C02 . . . D 4 19.473 -16.762 25.655 1 49.06 ? S22 C02 1 B 1 HETATM 23 C C23 C02 . . . D 4 20.662 -15.509 25.767 1 49.35 ? C23 C02 1 B 1 HETATM 24 C C24 C02 . . . D 4 21.933 -15.725 25.228 1 49.12 ? C24 C02 1 B 1 HETATM 25 C C25 C02 . . . D 4 22.901 -14.719 25.298 1 48.89 ? C25 C02 1 B 1 HETATM 26 C C26 C02 . . . D 4 22.595 -13.502 25.905 1 49.06 ? C26 C02 1 B 1 HETATM 27 C C27 C02 . . . D 4 21.324 -13.287 26.443 1 49.83 ? C27 C02 1 B 1 HETATM 28 C C28 C02 . . . D 4 20.358 -14.291 26.372 1 49.17 ? C28 C02 1 B 1 HETATM 29 O O29 C02 . . . D 4 18.275 -16.39 26.361 1 48.71 ? O29 C02 1 B 1 HETATM 30 O O30 C02 . . . D 4 20.001 -17.943 26.271 1 49.14 ? O30 C02 1 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 7 _model_server_stats.parse_time_ms 6 _model_server_stats.create_model_time_ms 19 _model_server_stats.query_time_ms 272 _model_server_stats.encode_time_ms 8 _model_server_stats.element_count 30 #