data_1KYZ # _model_server_result.job_id qBaA6np6cWvE3DK80MicPw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-27 17:07:14' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1kyz # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":366}' # _entry.id 1KYZ # _exptl.entry_id 1KYZ _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 194.184 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description '3-(4-HYDROXY-3-METHOXYPHENYL)-2-PROPENOIC ACID' _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 112.18 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1KYZ _cell.length_a 103.729 _cell.length_b 61.865 _cell.length_c 111.229 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1KYZ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 3 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 2 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 ? dimeric 2 author_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,D,E,H,I,J,L 1 1 B,F,G,K 2 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 2_556 -x,y,-z+1 -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 -41.990902 0 102.998323 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 D N N ? 2 F N N ? 2 I N N # _chem_comp.formula 'C10 H10 O4' _chem_comp.formula_weight 194.184 _chem_comp.id FER _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name '3-(4-HYDROXY-3-METHOXYPHENYL)-2-PROPENOIC ACID' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms 'FERULIC ACID' # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C4 C5 FER doub 83 n y C4 C3 FER sing 84 n y C4 O4 FER sing 85 n n C5 C6 FER sing 86 n y C5 H5 FER sing 87 n n C6 C1 FER doub 88 n y C6 H6 FER sing 89 n n C3 C2 FER doub 90 n y C3 O3 FER sing 91 n n C2 C1 FER sing 92 n y C2 H2 FER sing 93 n n C1 C7 FER sing 94 n n C10 O3 FER sing 95 n n C10 H101 FER sing 96 n n C10 H102 FER sing 97 n n C10 H103 FER sing 98 n n C7 C8 FER doub 99 e n C7 H7 FER sing 100 n n C8 C9 FER sing 101 n n C8 H8 FER sing 102 n n C9 O1 FER doub 103 n n C9 O2 FER sing 104 n n O2 HO2 FER sing 105 n n O4 HO4 FER sing 106 n n # _atom_sites.entry_id 1KYZ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.009641 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.00393 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.016164 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.009709 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 2 FER A 1 366 0 FER FER . E 3 SAH A 1 1698 1699 SAH SAH . F 2 FER C 1 366 0 FER FER . G 3 SAH C 1 1699 1699 SAH SAH . H 3 SAH E 1 1697 1699 SAH SAH . I 2 FER E 1 1698 0 FER FER . J 4 HOH A 1 1699 5 HOH WAT . J 4 HOH A 2 1700 6 HOH WAT . J 4 HOH A 3 1701 7 HOH WAT . J 4 HOH A 4 1702 10 HOH WAT . J 4 HOH A 5 1703 14 HOH WAT . J 4 HOH A 6 1704 15 HOH WAT . J 4 HOH A 7 1705 20 HOH WAT . J 4 HOH A 8 1706 22 HOH WAT . J 4 HOH A 9 1707 24 HOH WAT . J 4 HOH A 10 1708 29 HOH WAT . J 4 HOH A 11 1709 31 HOH WAT . J 4 HOH A 12 1710 32 HOH WAT . J 4 HOH A 13 1711 40 HOH WAT . J 4 HOH A 14 1712 43 HOH WAT . J 4 HOH A 15 1713 45 HOH WAT . J 4 HOH A 16 1714 46 HOH WAT . J 4 HOH A 17 1715 48 HOH WAT . J 4 HOH A 18 1716 49 HOH WAT . J 4 HOH A 19 1717 51 HOH WAT . J 4 HOH A 20 1718 52 HOH WAT . J 4 HOH A 21 1719 57 HOH WAT . J 4 HOH A 22 1720 63 HOH WAT . J 4 HOH A 23 1721 64 HOH WAT . J 4 HOH A 24 1722 65 HOH WAT . J 4 HOH A 25 1723 66 HOH WAT . J 4 HOH A 26 1724 67 HOH WAT . J 4 HOH A 27 1725 70 HOH WAT . J 4 HOH A 28 1726 75 HOH WAT . J 4 HOH A 29 1727 77 HOH WAT . J 4 HOH A 30 1728 80 HOH WAT . J 4 HOH A 31 1729 81 HOH WAT . J 4 HOH A 32 1730 84 HOH WAT . J 4 HOH A 33 1731 87 HOH WAT . J 4 HOH A 34 1732 90 HOH WAT . J 4 HOH A 35 1733 98 HOH WAT . J 4 HOH A 36 1734 100 HOH WAT . J 4 HOH A 37 1735 102 HOH WAT . J 4 HOH A 38 1736 107 HOH WAT . J 4 HOH A 39 1737 109 HOH WAT . J 4 HOH A 40 1738 110 HOH WAT . J 4 HOH A 41 1739 113 HOH WAT . J 4 HOH A 42 1740 115 HOH WAT . J 4 HOH A 43 1741 121 HOH WAT . J 4 HOH A 44 1742 124 HOH WAT . J 4 HOH A 45 1743 128 HOH WAT . J 4 HOH A 46 1744 129 HOH WAT . J 4 HOH A 47 1745 131 HOH WAT . J 4 HOH A 48 1746 133 HOH WAT . J 4 HOH A 49 1747 136 HOH WAT . J 4 HOH A 50 1748 138 HOH WAT . J 4 HOH A 51 1749 141 HOH WAT . J 4 HOH A 52 1750 142 HOH WAT . J 4 HOH A 53 1751 144 HOH WAT . J 4 HOH A 54 1752 145 HOH WAT . J 4 HOH A 55 1753 146 HOH WAT . J 4 HOH A 56 1754 147 HOH WAT . J 4 HOH A 57 1755 152 HOH WAT . J 4 HOH A 58 1756 153 HOH WAT . J 4 HOH A 59 1757 155 HOH WAT . J 4 HOH A 60 1758 172 HOH WAT . J 4 HOH A 61 1759 174 HOH WAT . J 4 HOH A 62 1760 178 HOH WAT . J 4 HOH A 63 1761 181 HOH WAT . J 4 HOH A 64 1762 182 HOH WAT . J 4 HOH A 65 1763 192 HOH WAT . J 4 HOH A 66 1764 196 HOH WAT . J 4 HOH A 67 1765 199 HOH WAT . J 4 HOH A 68 1766 201 HOH WAT . J 4 HOH A 69 1767 202 HOH WAT . J 4 HOH A 70 1768 205 HOH WAT . J 4 HOH A 71 1769 207 HOH WAT . J 4 HOH A 72 1770 209 HOH WAT . J 4 HOH A 73 1771 211 HOH WAT . J 4 HOH A 74 1772 213 HOH WAT . J 4 HOH A 75 1773 214 HOH WAT . J 4 HOH A 76 1774 219 HOH WAT . J 4 HOH A 77 1775 220 HOH WAT . J 4 HOH A 78 1776 222 HOH WAT . J 4 HOH A 79 1777 224 HOH WAT . J 4 HOH A 80 1778 226 HOH WAT . J 4 HOH A 81 1779 231 HOH WAT . J 4 HOH A 82 1780 237 HOH WAT . J 4 HOH A 83 1781 239 HOH WAT . J 4 HOH A 84 1782 241 HOH WAT . J 4 HOH A 85 1783 242 HOH WAT . J 4 HOH A 86 1784 243 HOH WAT . J 4 HOH A 87 1785 247 HOH WAT . J 4 HOH A 88 1786 249 HOH WAT . J 4 HOH A 89 1787 254 HOH WAT . J 4 HOH A 90 1788 257 HOH WAT . J 4 HOH A 91 1789 259 HOH WAT . K 4 HOH C 1 1700 18 HOH WAT . K 4 HOH C 2 1701 25 HOH WAT . K 4 HOH C 3 1702 35 HOH WAT . K 4 HOH C 4 1703 50 HOH WAT . K 4 HOH C 5 1704 53 HOH WAT . K 4 HOH C 6 1705 54 HOH WAT . K 4 HOH C 7 1706 58 HOH WAT . K 4 HOH C 8 1707 61 HOH WAT . K 4 HOH C 9 1708 68 HOH WAT . K 4 HOH C 10 1709 71 HOH WAT . K 4 HOH C 11 1710 72 HOH WAT . K 4 HOH C 12 1711 78 HOH WAT . K 4 HOH C 13 1712 85 HOH WAT . K 4 HOH C 14 1713 86 HOH WAT . K 4 HOH C 15 1714 91 HOH WAT . K 4 HOH C 16 1715 92 HOH WAT . K 4 HOH C 17 1716 104 HOH WAT . K 4 HOH C 18 1717 108 HOH WAT . K 4 HOH C 19 1718 116 HOH WAT . K 4 HOH C 20 1719 117 HOH WAT . K 4 HOH C 21 1720 118 HOH WAT . K 4 HOH C 22 1721 123 HOH WAT . K 4 HOH C 23 1722 126 HOH WAT . K 4 HOH C 24 1723 132 HOH WAT . K 4 HOH C 25 1724 140 HOH WAT . K 4 HOH C 26 1725 149 HOH WAT . K 4 HOH C 27 1726 151 HOH WAT . K 4 HOH C 28 1727 154 HOH WAT . K 4 HOH C 29 1728 162 HOH WAT . K 4 HOH C 30 1729 163 HOH WAT . K 4 HOH C 31 1730 164 HOH WAT . K 4 HOH C 32 1731 166 HOH WAT . K 4 HOH C 33 1732 167 HOH WAT . K 4 HOH C 34 1733 168 HOH WAT . K 4 HOH C 35 1734 176 HOH WAT . K 4 HOH C 36 1735 177 HOH WAT . K 4 HOH C 37 1736 180 HOH WAT . K 4 HOH C 38 1737 189 HOH WAT . K 4 HOH C 39 1738 191 HOH WAT . K 4 HOH C 40 1739 216 HOH WAT . K 4 HOH C 41 1740 227 HOH WAT . K 4 HOH C 42 1741 228 HOH WAT . K 4 HOH C 43 1742 230 HOH WAT . K 4 HOH C 44 1743 234 HOH WAT . K 4 HOH C 45 1744 235 HOH WAT . K 4 HOH C 46 1745 238 HOH WAT . K 4 HOH C 47 1746 240 HOH WAT . K 4 HOH C 48 1747 244 HOH WAT . K 4 HOH C 49 1748 245 HOH WAT . K 4 HOH C 50 1749 252 HOH WAT . K 4 HOH C 51 1750 253 HOH WAT . K 4 HOH C 52 1751 256 HOH WAT . K 4 HOH C 53 1752 258 HOH WAT . K 4 HOH C 54 1753 261 HOH WAT . K 4 HOH C 55 1754 264 HOH WAT . L 4 HOH E 1 1699 1 HOH WAT . L 4 HOH E 2 1700 2 HOH WAT . L 4 HOH E 3 1701 3 HOH WAT . L 4 HOH E 4 1702 4 HOH WAT . L 4 HOH E 5 1703 8 HOH WAT . L 4 HOH E 6 1704 9 HOH WAT . L 4 HOH E 7 1705 11 HOH WAT . L 4 HOH E 8 1706 12 HOH WAT . L 4 HOH E 9 1707 13 HOH WAT . L 4 HOH E 10 1708 16 HOH WAT . L 4 HOH E 11 1709 17 HOH WAT . L 4 HOH E 12 1710 19 HOH WAT . L 4 HOH E 13 1711 21 HOH WAT . L 4 HOH E 14 1712 23 HOH WAT . L 4 HOH E 15 1713 26 HOH WAT . L 4 HOH E 16 1714 27 HOH WAT . L 4 HOH E 17 1715 28 HOH WAT . L 4 HOH E 18 1716 30 HOH WAT . L 4 HOH E 19 1717 33 HOH WAT . L 4 HOH E 20 1718 34 HOH WAT . L 4 HOH E 21 1719 36 HOH WAT . L 4 HOH E 22 1720 37 HOH WAT . L 4 HOH E 23 1721 38 HOH WAT . L 4 HOH E 24 1722 39 HOH WAT . L 4 HOH E 25 1723 41 HOH WAT . L 4 HOH E 26 1724 42 HOH WAT . L 4 HOH E 27 1725 44 HOH WAT . L 4 HOH E 28 1726 47 HOH WAT . L 4 HOH E 29 1727 55 HOH WAT . L 4 HOH E 30 1728 56 HOH WAT . L 4 HOH E 31 1729 59 HOH WAT . L 4 HOH E 32 1730 60 HOH WAT . L 4 HOH E 33 1731 62 HOH WAT . L 4 HOH E 34 1732 69 HOH WAT . L 4 HOH E 35 1733 73 HOH WAT . L 4 HOH E 36 1734 74 HOH WAT . L 4 HOH E 37 1735 76 HOH WAT . L 4 HOH E 38 1736 79 HOH WAT . L 4 HOH E 39 1737 82 HOH WAT . L 4 HOH E 40 1738 83 HOH WAT . L 4 HOH E 41 1739 88 HOH WAT . L 4 HOH E 42 1740 89 HOH WAT . L 4 HOH E 43 1741 93 HOH WAT . L 4 HOH E 44 1742 94 HOH WAT . L 4 HOH E 45 1743 95 HOH WAT . L 4 HOH E 46 1744 96 HOH WAT . L 4 HOH E 47 1745 97 HOH WAT . L 4 HOH E 48 1746 99 HOH WAT . L 4 HOH E 49 1747 101 HOH WAT . L 4 HOH E 50 1748 103 HOH WAT . L 4 HOH E 51 1749 105 HOH WAT . L 4 HOH E 52 1750 106 HOH WAT . L 4 HOH E 53 1751 111 HOH WAT . L 4 HOH E 54 1752 112 HOH WAT . L 4 HOH E 55 1753 114 HOH WAT . L 4 HOH E 56 1754 119 HOH WAT . L 4 HOH E 57 1755 120 HOH WAT . L 4 HOH E 58 1756 122 HOH WAT . L 4 HOH E 59 1757 125 HOH WAT . L 4 HOH E 60 1758 127 HOH WAT . L 4 HOH E 61 1759 130 HOH WAT . L 4 HOH E 62 1760 134 HOH WAT . L 4 HOH E 63 1761 135 HOH WAT . L 4 HOH E 64 1762 137 HOH WAT . L 4 HOH E 65 1763 139 HOH WAT . L 4 HOH E 66 1764 143 HOH WAT . L 4 HOH E 67 1765 148 HOH WAT . L 4 HOH E 68 1766 150 HOH WAT . L 4 HOH E 69 1767 156 HOH WAT . L 4 HOH E 70 1768 157 HOH WAT . L 4 HOH E 71 1769 158 HOH WAT . L 4 HOH E 72 1770 159 HOH WAT . L 4 HOH E 73 1771 160 HOH WAT . L 4 HOH E 74 1772 161 HOH WAT . L 4 HOH E 75 1773 165 HOH WAT . L 4 HOH E 76 1774 169 HOH WAT . L 4 HOH E 77 1775 170 HOH WAT . L 4 HOH E 78 1776 171 HOH WAT . L 4 HOH E 79 1777 173 HOH WAT . L 4 HOH E 80 1778 175 HOH WAT . L 4 HOH E 81 1779 179 HOH WAT . L 4 HOH E 82 1780 183 HOH WAT . L 4 HOH E 83 1781 184 HOH WAT . L 4 HOH E 84 1782 185 HOH WAT . L 4 HOH E 85 1783 186 HOH WAT . L 4 HOH E 86 1784 187 HOH WAT . L 4 HOH E 87 1785 188 HOH WAT . L 4 HOH E 88 1786 190 HOH WAT . L 4 HOH E 89 1787 193 HOH WAT . L 4 HOH E 90 1788 194 HOH WAT . L 4 HOH E 91 1789 195 HOH WAT . L 4 HOH E 92 1790 197 HOH WAT . L 4 HOH E 93 1791 198 HOH WAT . L 4 HOH E 94 1792 200 HOH WAT . L 4 HOH E 95 1793 203 HOH WAT . L 4 HOH E 96 1794 204 HOH WAT . L 4 HOH E 97 1795 206 HOH WAT . L 4 HOH E 98 1796 208 HOH WAT . L 4 HOH E 99 1797 210 HOH WAT . L 4 HOH E 100 1798 212 HOH WAT . L 4 HOH E 101 1799 215 HOH WAT . L 4 HOH E 102 1800 217 HOH WAT . L 4 HOH E 103 1801 218 HOH WAT . L 4 HOH E 104 1802 221 HOH WAT . L 4 HOH E 105 1803 223 HOH WAT . L 4 HOH E 106 1804 225 HOH WAT . L 4 HOH E 107 1805 229 HOH WAT . L 4 HOH E 108 1806 232 HOH WAT . L 4 HOH E 109 1807 233 HOH WAT . L 4 HOH E 110 1808 236 HOH WAT . L 4 HOH E 111 1809 246 HOH WAT . L 4 HOH E 112 1810 248 HOH WAT . L 4 HOH E 113 1811 250 HOH WAT . L 4 HOH E 114 1812 251 HOH WAT . L 4 HOH E 115 1813 255 HOH WAT . L 4 HOH E 116 1814 260 HOH WAT . L 4 HOH E 117 1815 262 HOH WAT . L 4 HOH E 118 1816 263 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C4 FER . . . D 2 27.099 17.539 30.806 1 81.3 ? C4 FER 366 A 1 HETATM 2 C C5 FER . . . D 2 27.277 16.877 29.559 1 80.44 ? C5 FER 366 A 1 HETATM 3 C C6 FER . . . D 2 26.933 17.501 28.334 1 80.71 ? C6 FER 366 A 1 HETATM 4 C C3 FER . . . D 2 26.553 18.871 30.846 1 81.88 ? C3 FER 366 A 1 HETATM 5 C C2 FER . . . D 2 26.212 19.482 29.583 1 81.07 ? C2 FER 366 A 1 HETATM 6 C C1 FER . . . D 2 26.391 18.823 28.317 1 80.12 ? C1 FER 366 A 1 HETATM 7 C C10 FER . . . D 2 25.88 20.762 32.265 1 80.7 ? C10 FER 366 A 1 HETATM 8 C C7 FER . . . D 2 26.063 19.414 26.999 1 77.73 ? C7 FER 366 A 1 HETATM 9 C C8 FER . . . D 2 25.546 20.652 26.767 1 76.7 ? C8 FER 366 A 1 HETATM 10 C C9 FER . . . D 2 25.263 21.154 25.392 1 76.96 ? C9 FER 366 A 1 HETATM 11 O O1 FER . . . D 2 24.797 22.288 25.29 1 75.64 ? O1 FER 366 A 1 HETATM 12 O O2 FER . . . D 2 25.5 20.422 24.274 1 74.63 ? O2 FER 366 A 1 HETATM 13 O O4 FER . . . D 2 27.442 16.915 31.964 1 80.4 ? O4 FER 366 A 1 HETATM 14 O O3 FER . . . D 2 26.408 19.449 32.108 1 82.51 ? O3 FER 366 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 9 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 28 _model_server_stats.query_time_ms 328 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 14 #