data_1KZY # _model_server_result.job_id YGRrpBegEQzBphXzY1fNYA _model_server_result.datetime_utc '2024-10-24 04:28:08' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1kzy # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":1}' # _entry.id 1KZY # _exptl.entry_id 1KZY _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1KZY _cell.length_a 73.132 _cell.length_b 94.976 _cell.length_c 133.68 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1KZY _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 E N N ? 3 F N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 C SG CYS 83 C CYS 1796 1_555 C SG CYS 89 C CYS 1802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.618 ? disulf ? disulf2 D SG CYS 83 D CYS 1796 1_555 D SG CYS 89 D CYS 1802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.474 ? metalc ? metalc1 E ZN ZN . A ZN 1 1_555 A SG CYS 82 A CYS 176 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.215 ? metalc ? metalc2 E ZN ZN . A ZN 1 1_555 A ND1 HIS 85 A HIS 179 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? metalc ? metalc3 E ZN ZN . A ZN 1 1_555 A SG CYS 144 A CYS 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? metalc ? metalc4 E ZN ZN . A ZN 1 1_555 A SG CYS 148 A CYS 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? metalc ? metalc5 F ZN ZN . B ZN 1 1_555 B SG CYS 82 B CYS 176 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc6 F ZN ZN . B ZN 1 1_555 B ND1 HIS 85 B HIS 179 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.119 ? metalc ? metalc7 F ZN ZN . B ZN 1 1_555 B SG CYS 144 B CYS 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc8 F ZN ZN . B ZN 1 1_555 B SG CYS 148 B CYS 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.516 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1KZY _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.013674 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.010529 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007481 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 3 ZN A 1 1 1 ZN ZN . F 3 ZN B 1 1 1 ZN ZN . G 4 HOH A 1 290 1 HOH WAT . G 4 HOH A 2 291 7 HOH WAT . G 4 HOH A 3 292 9 HOH WAT . G 4 HOH A 4 293 10 HOH WAT . G 4 HOH A 5 294 18 HOH WAT . G 4 HOH A 6 295 26 HOH WAT . G 4 HOH A 7 296 28 HOH WAT . G 4 HOH A 8 297 36 HOH WAT . G 4 HOH A 9 298 37 HOH WAT . G 4 HOH A 10 299 40 HOH WAT . G 4 HOH A 11 300 41 HOH WAT . G 4 HOH A 12 301 42 HOH WAT . G 4 HOH A 13 302 44 HOH WAT . G 4 HOH A 14 303 47 HOH WAT . G 4 HOH A 15 304 49 HOH WAT . G 4 HOH A 16 305 53 HOH WAT . G 4 HOH A 17 306 56 HOH WAT . G 4 HOH A 18 307 62 HOH WAT . G 4 HOH A 19 308 63 HOH WAT . G 4 HOH A 20 309 66 HOH WAT . G 4 HOH A 21 310 67 HOH WAT . G 4 HOH A 22 311 74 HOH WAT . G 4 HOH A 23 312 75 HOH WAT . G 4 HOH A 24 313 76 HOH WAT . G 4 HOH A 25 314 77 HOH WAT . G 4 HOH A 26 315 78 HOH WAT . G 4 HOH A 27 316 80 HOH WAT . G 4 HOH A 28 317 87 HOH WAT . G 4 HOH A 29 318 92 HOH WAT . G 4 HOH A 30 319 93 HOH WAT . G 4 HOH A 31 320 95 HOH WAT . G 4 HOH A 32 321 98 HOH WAT . G 4 HOH A 33 322 99 HOH WAT . G 4 HOH A 34 323 103 HOH WAT . G 4 HOH A 35 324 108 HOH WAT . G 4 HOH A 36 325 111 HOH WAT . G 4 HOH A 37 326 112 HOH WAT . G 4 HOH A 38 327 115 HOH WAT . G 4 HOH A 39 328 126 HOH WAT . G 4 HOH A 40 329 128 HOH WAT . G 4 HOH A 41 330 131 HOH WAT . G 4 HOH A 42 331 132 HOH WAT . G 4 HOH A 43 332 139 HOH WAT . G 4 HOH A 44 333 140 HOH WAT . G 4 HOH A 45 334 141 HOH WAT . G 4 HOH A 46 335 144 HOH WAT . G 4 HOH A 47 336 151 HOH WAT . G 4 HOH A 48 337 165 HOH WAT . G 4 HOH A 49 338 170 HOH WAT . G 4 HOH A 50 339 173 HOH WAT . G 4 HOH A 51 340 179 HOH WAT . G 4 HOH A 52 341 191 HOH WAT . G 4 HOH A 53 342 193 HOH WAT . G 4 HOH A 54 343 194 HOH WAT . G 4 HOH A 55 344 198 HOH WAT . G 4 HOH A 56 345 200 HOH WAT . G 4 HOH A 57 346 214 HOH WAT . H 4 HOH B 1 290 3 HOH WAT . H 4 HOH B 2 291 11 HOH WAT . H 4 HOH B 3 292 12 HOH WAT . H 4 HOH B 4 293 13 HOH WAT . H 4 HOH B 5 294 17 HOH WAT . H 4 HOH B 6 295 20 HOH WAT . H 4 HOH B 7 296 21 HOH WAT . H 4 HOH B 8 297 24 HOH WAT . H 4 HOH B 9 298 25 HOH WAT . H 4 HOH B 10 299 27 HOH WAT . H 4 HOH B 11 300 29 HOH WAT . H 4 HOH B 12 301 33 HOH WAT . H 4 HOH B 13 302 39 HOH WAT . H 4 HOH B 14 303 46 HOH WAT . H 4 HOH B 15 304 57 HOH WAT . H 4 HOH B 16 305 82 HOH WAT . H 4 HOH B 17 306 83 HOH WAT . H 4 HOH B 18 307 86 HOH WAT . H 4 HOH B 19 308 90 HOH WAT . H 4 HOH B 20 309 94 HOH WAT . H 4 HOH B 21 310 96 HOH WAT . H 4 HOH B 22 311 97 HOH WAT . H 4 HOH B 23 312 100 HOH WAT . H 4 HOH B 24 313 101 HOH WAT . H 4 HOH B 25 314 102 HOH WAT . H 4 HOH B 26 315 104 HOH WAT . H 4 HOH B 27 316 116 HOH WAT . H 4 HOH B 28 317 120 HOH WAT . H 4 HOH B 29 318 121 HOH WAT . H 4 HOH B 30 319 122 HOH WAT . H 4 HOH B 31 320 123 HOH WAT . H 4 HOH B 32 321 127 HOH WAT . H 4 HOH B 33 322 129 HOH WAT . H 4 HOH B 34 323 135 HOH WAT . H 4 HOH B 35 324 136 HOH WAT . H 4 HOH B 36 325 143 HOH WAT . H 4 HOH B 37 326 148 HOH WAT . H 4 HOH B 38 327 154 HOH WAT . H 4 HOH B 39 328 155 HOH WAT . H 4 HOH B 40 329 158 HOH WAT . H 4 HOH B 41 330 159 HOH WAT . H 4 HOH B 42 331 164 HOH WAT . H 4 HOH B 43 332 166 HOH WAT . H 4 HOH B 44 333 169 HOH WAT . H 4 HOH B 45 334 171 HOH WAT . H 4 HOH B 46 335 175 HOH WAT . H 4 HOH B 47 336 178 HOH WAT . H 4 HOH B 48 337 181 HOH WAT . H 4 HOH B 49 338 186 HOH WAT . H 4 HOH B 50 339 187 HOH WAT . H 4 HOH B 51 340 188 HOH WAT . H 4 HOH B 52 341 189 HOH WAT . H 4 HOH B 53 342 190 HOH WAT . H 4 HOH B 54 343 197 HOH WAT . H 4 HOH B 55 344 201 HOH WAT . H 4 HOH B 56 345 203 HOH WAT . H 4 HOH B 57 346 204 HOH WAT . H 4 HOH B 58 347 206 HOH WAT . I 4 HOH C 1 2 2 HOH WAT . I 4 HOH C 2 5 5 HOH WAT . I 4 HOH C 3 15 15 HOH WAT . I 4 HOH C 4 23 23 HOH WAT . I 4 HOH C 5 30 30 HOH WAT . I 4 HOH C 6 31 31 HOH WAT . I 4 HOH C 7 38 38 HOH WAT . I 4 HOH C 8 48 48 HOH WAT . I 4 HOH C 9 52 52 HOH WAT . I 4 HOH C 10 59 59 HOH WAT . I 4 HOH C 11 60 60 HOH WAT . I 4 HOH C 12 68 68 HOH WAT . I 4 HOH C 13 71 71 HOH WAT . I 4 HOH C 14 72 72 HOH WAT . I 4 HOH C 15 81 81 HOH WAT . I 4 HOH C 16 88 88 HOH WAT . I 4 HOH C 17 89 89 HOH WAT . I 4 HOH C 18 105 105 HOH WAT . I 4 HOH C 19 107 107 HOH WAT . I 4 HOH C 20 109 109 HOH WAT . I 4 HOH C 21 110 110 HOH WAT . I 4 HOH C 22 114 114 HOH WAT . I 4 HOH C 23 118 118 HOH WAT . I 4 HOH C 24 119 119 HOH WAT . I 4 HOH C 25 130 130 HOH WAT . I 4 HOH C 26 134 134 HOH WAT . I 4 HOH C 27 137 137 HOH WAT . I 4 HOH C 28 138 138 HOH WAT . I 4 HOH C 29 152 152 HOH WAT . I 4 HOH C 30 153 153 HOH WAT . I 4 HOH C 31 156 156 HOH WAT . I 4 HOH C 32 157 157 HOH WAT . I 4 HOH C 33 160 160 HOH WAT . I 4 HOH C 34 161 161 HOH WAT . I 4 HOH C 35 162 162 HOH WAT . I 4 HOH C 36 167 167 HOH WAT . I 4 HOH C 37 168 168 HOH WAT . I 4 HOH C 38 172 172 HOH WAT . I 4 HOH C 39 180 180 HOH WAT . I 4 HOH C 40 182 182 HOH WAT . I 4 HOH C 41 184 184 HOH WAT . I 4 HOH C 42 185 185 HOH WAT . I 4 HOH C 43 195 195 HOH WAT . I 4 HOH C 44 205 205 HOH WAT . I 4 HOH C 45 207 207 HOH WAT . I 4 HOH C 46 208 208 HOH WAT . I 4 HOH C 47 210 210 HOH WAT . I 4 HOH C 48 211 211 HOH WAT . I 4 HOH C 49 212 212 HOH WAT . I 4 HOH C 50 216 216 HOH WAT . J 4 HOH D 1 4 4 HOH WAT . J 4 HOH D 2 6 6 HOH WAT . J 4 HOH D 3 8 8 HOH WAT . J 4 HOH D 4 14 14 HOH WAT . J 4 HOH D 5 16 16 HOH WAT . J 4 HOH D 6 19 19 HOH WAT . J 4 HOH D 7 22 22 HOH WAT . J 4 HOH D 8 32 32 HOH WAT . J 4 HOH D 9 34 34 HOH WAT . J 4 HOH D 10 35 35 HOH WAT . J 4 HOH D 11 43 43 HOH WAT . J 4 HOH D 12 45 45 HOH WAT . J 4 HOH D 13 50 50 HOH WAT . J 4 HOH D 14 51 51 HOH WAT . J 4 HOH D 15 54 54 HOH WAT . J 4 HOH D 16 55 55 HOH WAT . J 4 HOH D 17 58 58 HOH WAT . J 4 HOH D 18 61 61 HOH WAT . J 4 HOH D 19 64 64 HOH WAT . J 4 HOH D 20 65 65 HOH WAT . J 4 HOH D 21 69 69 HOH WAT . J 4 HOH D 22 70 70 HOH WAT . J 4 HOH D 23 73 73 HOH WAT . J 4 HOH D 24 79 79 HOH WAT . J 4 HOH D 25 84 84 HOH WAT . J 4 HOH D 26 85 85 HOH WAT . J 4 HOH D 27 91 91 HOH WAT . J 4 HOH D 28 106 106 HOH WAT . J 4 HOH D 29 113 113 HOH WAT . J 4 HOH D 30 117 117 HOH WAT . J 4 HOH D 31 124 124 HOH WAT . J 4 HOH D 32 125 125 HOH WAT . J 4 HOH D 33 133 133 HOH WAT . J 4 HOH D 34 142 142 HOH WAT . J 4 HOH D 35 145 145 HOH WAT . J 4 HOH D 36 146 146 HOH WAT . J 4 HOH D 37 147 147 HOH WAT . J 4 HOH D 38 149 149 HOH WAT . J 4 HOH D 39 150 150 HOH WAT . J 4 HOH D 40 163 163 HOH WAT . J 4 HOH D 41 174 174 HOH WAT . J 4 HOH D 42 176 176 HOH WAT . J 4 HOH D 43 177 177 HOH WAT . J 4 HOH D 44 183 183 HOH WAT . J 4 HOH D 45 192 192 HOH WAT . J 4 HOH D 46 196 196 HOH WAT . J 4 HOH D 47 199 199 HOH WAT . J 4 HOH D 48 202 202 HOH WAT . J 4 HOH D 49 209 209 HOH WAT . J 4 HOH D 50 213 213 HOH WAT . J 4 HOH D 51 215 215 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id E _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 29.391 _atom_site.Cartn_y 17.717 _atom_site.Cartn_z 53.08 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 41.12 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 1 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 9 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 23 _model_server_stats.query_time_ms 318 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #