data_1LG2
#
_model_server_result.job_id            OYQ9YG_SMDM0B_RVIEtPLA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-23 22:29:23' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1lg2 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":1004}' 
#
_entry.id    1LG2 
#
_exptl.entry_id    1LG2 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              62.068 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            1,2-ETHANEDIOL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    5 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          102.58 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            1LG2 
_cell.length_a            45.173 
_cell.length_b            47.285 
_cell.length_c            84.726 
_cell.Z_PDB               2 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1LG2 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    monomeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      1 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 B N N 
? 2 C N N 
? 2 D N N 
? 2 E N N 
? 2 F N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 5 A CYS 26 1_555 A SG CYS 30 A CYS 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 286 A CYS 307 1_555 A SG CYS 349 A CYS 370 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
#
_chem_comp.formula           'C2 H6 O2' 
_chem_comp.formula_weight    62.068 
_chem_comp.id                EDO 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              1,2-ETHANEDIOL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     'ETHYLENE GLYCOL' 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1 EDO sing 83 n n 
C1 C2 EDO sing 84 n n 
C1 H11 EDO sing 85 n n 
C1 H12 EDO sing 86 n n 
O1 HO1 EDO sing 87 n n 
C2 O2 EDO sing 88 n n 
C2 H21 EDO sing 89 n n 
C2 H22 EDO sing 90 n n 
O2 HO2 EDO sing 91 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     1LG2 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.022137 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.00494 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.021148 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.012093 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 EDO A 1 1001 1 EDO EDO . 
C 2 EDO A 1 1002 2 EDO EDO . 
D 2 EDO A 1 1003 3 EDO EDO . 
E 2 EDO A 1 1004 4 EDO EDO . 
F 2 EDO A 1 1005 5 EDO EDO . 
G 3 HOH A 1 1006 1 HOH WAT . 
G 3 HOH A 2 1007 2 HOH WAT . 
G 3 HOH A 3 1008 3 HOH WAT . 
G 3 HOH A 4 1009 4 HOH WAT . 
G 3 HOH A 5 1010 5 HOH WAT . 
G 3 HOH A 6 1011 6 HOH WAT . 
G 3 HOH A 7 1012 7 HOH WAT . 
G 3 HOH A 8 1013 8 HOH WAT . 
G 3 HOH A 9 1014 9 HOH WAT . 
G 3 HOH A 10 1015 10 HOH WAT . 
G 3 HOH A 11 1016 11 HOH WAT . 
G 3 HOH A 12 1017 12 HOH WAT . 
G 3 HOH A 13 1018 13 HOH WAT . 
G 3 HOH A 14 1019 14 HOH WAT . 
G 3 HOH A 15 1020 15 HOH WAT . 
G 3 HOH A 16 1021 16 HOH WAT . 
G 3 HOH A 17 1022 17 HOH WAT . 
G 3 HOH A 18 1023 18 HOH WAT . 
G 3 HOH A 19 1024 19 HOH WAT . 
G 3 HOH A 20 1025 20 HOH WAT . 
G 3 HOH A 21 1026 21 HOH WAT . 
G 3 HOH A 22 1027 22 HOH WAT . 
G 3 HOH A 23 1028 23 HOH WAT . 
G 3 HOH A 24 1029 24 HOH WAT . 
G 3 HOH A 25 1030 25 HOH WAT . 
G 3 HOH A 26 1031 26 HOH WAT . 
G 3 HOH A 27 1032 27 HOH WAT . 
G 3 HOH A 28 1033 28 HOH WAT . 
G 3 HOH A 29 1034 29 HOH WAT . 
G 3 HOH A 30 1035 30 HOH WAT . 
G 3 HOH A 31 1036 31 HOH WAT . 
G 3 HOH A 32 1037 32 HOH WAT . 
G 3 HOH A 33 1038 33 HOH WAT . 
G 3 HOH A 34 1039 34 HOH WAT . 
G 3 HOH A 35 1040 35 HOH WAT . 
G 3 HOH A 36 1041 36 HOH WAT . 
G 3 HOH A 37 1042 37 HOH WAT . 
G 3 HOH A 38 1043 38 HOH WAT . 
G 3 HOH A 39 1044 39 HOH WAT . 
G 3 HOH A 40 1045 40 HOH WAT . 
G 3 HOH A 41 1046 41 HOH WAT . 
G 3 HOH A 42 1047 42 HOH WAT . 
G 3 HOH A 43 1048 43 HOH WAT . 
G 3 HOH A 44 1049 44 HOH WAT . 
G 3 HOH A 45 1050 45 HOH WAT . 
G 3 HOH A 46 1051 47 HOH WAT . 
G 3 HOH A 47 1052 48 HOH WAT . 
G 3 HOH A 48 1053 49 HOH WAT . 
G 3 HOH A 49 1054 50 HOH WAT . 
G 3 HOH A 50 1055 51 HOH WAT . 
G 3 HOH A 51 1056 52 HOH WAT . 
G 3 HOH A 52 1057 53 HOH WAT . 
G 3 HOH A 53 1058 54 HOH WAT . 
G 3 HOH A 54 1059 55 HOH WAT . 
G 3 HOH A 55 1060 56 HOH WAT . 
G 3 HOH A 56 1061 57 HOH WAT . 
G 3 HOH A 57 1062 58 HOH WAT . 
G 3 HOH A 58 1063 59 HOH WAT . 
G 3 HOH A 59 1064 60 HOH WAT . 
G 3 HOH A 60 1065 61 HOH WAT . 
G 3 HOH A 61 1066 62 HOH WAT . 
G 3 HOH A 62 1067 63 HOH WAT . 
G 3 HOH A 63 1068 65 HOH WAT . 
G 3 HOH A 64 1069 66 HOH WAT . 
G 3 HOH A 65 1070 67 HOH WAT . 
G 3 HOH A 66 1071 68 HOH WAT . 
G 3 HOH A 67 1072 69 HOH WAT . 
G 3 HOH A 68 1073 70 HOH WAT . 
G 3 HOH A 69 1074 71 HOH WAT . 
G 3 HOH A 70 1075 72 HOH WAT . 
G 3 HOH A 71 1076 73 HOH WAT . 
G 3 HOH A 72 1077 74 HOH WAT . 
G 3 HOH A 73 1078 75 HOH WAT . 
G 3 HOH A 74 1079 76 HOH WAT . 
G 3 HOH A 75 1080 77 HOH WAT . 
G 3 HOH A 76 1081 78 HOH WAT . 
G 3 HOH A 77 1082 79 HOH WAT . 
G 3 HOH A 78 1083 80 HOH WAT . 
G 3 HOH A 79 1084 81 HOH WAT . 
G 3 HOH A 80 1085 82 HOH WAT . 
G 3 HOH A 81 1086 83 HOH WAT . 
G 3 HOH A 82 1087 84 HOH WAT . 
G 3 HOH A 83 1088 85 HOH WAT . 
G 3 HOH A 84 1089 86 HOH WAT . 
G 3 HOH A 85 1090 87 HOH WAT . 
G 3 HOH A 86 1091 88 HOH WAT . 
G 3 HOH A 87 1092 89 HOH WAT . 
G 3 HOH A 88 1093 91 HOH WAT . 
G 3 HOH A 89 1094 92 HOH WAT . 
G 3 HOH A 90 1095 93 HOH WAT . 
G 3 HOH A 91 1096 94 HOH WAT . 
G 3 HOH A 92 1097 95 HOH WAT . 
G 3 HOH A 93 1098 96 HOH WAT . 
G 3 HOH A 94 1099 97 HOH WAT . 
G 3 HOH A 95 1100 98 HOH WAT . 
G 3 HOH A 96 1101 99 HOH WAT . 
G 3 HOH A 97 1102 100 HOH WAT . 
G 3 HOH A 98 1103 101 HOH WAT . 
G 3 HOH A 99 1104 102 HOH WAT . 
G 3 HOH A 100 1105 103 HOH WAT . 
G 3 HOH A 101 1106 104 HOH WAT . 
G 3 HOH A 102 1107 105 HOH WAT . 
G 3 HOH A 103 1108 106 HOH WAT . 
G 3 HOH A 104 1109 107 HOH WAT . 
G 3 HOH A 105 1110 108 HOH WAT . 
G 3 HOH A 106 1111 109 HOH WAT . 
G 3 HOH A 107 1112 110 HOH WAT . 
G 3 HOH A 108 1113 111 HOH WAT . 
G 3 HOH A 109 1114 112 HOH WAT . 
G 3 HOH A 110 1115 113 HOH WAT . 
G 3 HOH A 111 1116 114 HOH WAT . 
G 3 HOH A 112 1117 115 HOH WAT . 
G 3 HOH A 113 1118 116 HOH WAT . 
G 3 HOH A 114 1119 117 HOH WAT . 
G 3 HOH A 115 1120 118 HOH WAT . 
G 3 HOH A 116 1121 119 HOH WAT . 
G 3 HOH A 117 1122 120 HOH WAT . 
G 3 HOH A 118 1123 121 HOH WAT . 
G 3 HOH A 119 1124 122 HOH WAT . 
G 3 HOH A 120 1125 123 HOH WAT . 
G 3 HOH A 121 1126 124 HOH WAT . 
G 3 HOH A 122 1127 125 HOH WAT . 
G 3 HOH A 123 1128 126 HOH WAT . 
G 3 HOH A 124 1129 127 HOH WAT . 
G 3 HOH A 125 1130 128 HOH WAT . 
G 3 HOH A 126 1131 129 HOH WAT . 
G 3 HOH A 127 1132 130 HOH WAT . 
G 3 HOH A 128 1133 131 HOH WAT . 
G 3 HOH A 129 1134 132 HOH WAT . 
G 3 HOH A 130 1135 133 HOH WAT . 
G 3 HOH A 131 1136 134 HOH WAT . 
G 3 HOH A 132 1137 135 HOH WAT . 
G 3 HOH A 133 1138 136 HOH WAT . 
G 3 HOH A 134 1139 137 HOH WAT . 
G 3 HOH A 135 1140 138 HOH WAT . 
G 3 HOH A 136 1141 139 HOH WAT . 
G 3 HOH A 137 1142 140 HOH WAT . 
G 3 HOH A 138 1143 141 HOH WAT . 
G 3 HOH A 139 1144 142 HOH WAT . 
G 3 HOH A 140 1145 143 HOH WAT . 
G 3 HOH A 141 1146 144 HOH WAT . 
G 3 HOH A 142 1147 145 HOH WAT . 
G 3 HOH A 143 1148 146 HOH WAT . 
G 3 HOH A 144 1149 147 HOH WAT . 
G 3 HOH A 145 1150 148 HOH WAT . 
G 3 HOH A 146 1151 149 HOH WAT . 
G 3 HOH A 147 1152 150 HOH WAT . 
G 3 HOH A 148 1153 151 HOH WAT . 
G 3 HOH A 149 1154 152 HOH WAT . 
G 3 HOH A 150 1155 153 HOH WAT . 
G 3 HOH A 151 1156 154 HOH WAT . 
G 3 HOH A 152 1157 155 HOH WAT . 
G 3 HOH A 153 1158 156 HOH WAT . 
G 3 HOH A 154 1159 157 HOH WAT . 
G 3 HOH A 155 1160 158 HOH WAT . 
G 3 HOH A 156 1161 159 HOH WAT . 
G 3 HOH A 157 1162 160 HOH WAT . 
G 3 HOH A 158 1163 161 HOH WAT . 
G 3 HOH A 159 1164 162 HOH WAT . 
G 3 HOH A 160 1165 163 HOH WAT . 
G 3 HOH A 161 1166 164 HOH WAT . 
G 3 HOH A 162 1167 165 HOH WAT . 
G 3 HOH A 163 1168 166 HOH WAT . 
G 3 HOH A 164 1169 167 HOH WAT . 
G 3 HOH A 165 1170 168 HOH WAT . 
G 3 HOH A 166 1171 169 HOH WAT . 
G 3 HOH A 167 1172 170 HOH WAT . 
G 3 HOH A 168 1173 171 HOH WAT . 
G 3 HOH A 169 1174 172 HOH WAT . 
G 3 HOH A 170 1175 173 HOH WAT . 
G 3 HOH A 171 1176 174 HOH WAT . 
G 3 HOH A 172 1177 175 HOH WAT . 
G 3 HOH A 173 1178 176 HOH WAT . 
G 3 HOH A 174 1179 177 HOH WAT . 
G 3 HOH A 175 1180 178 HOH WAT . 
G 3 HOH A 176 1181 179 HOH WAT . 
G 3 HOH A 177 1182 180 HOH WAT . 
G 3 HOH A 178 1183 181 HOH WAT . 
G 3 HOH A 179 1184 182 HOH WAT . 
G 3 HOH A 180 1185 183 HOH WAT . 
G 3 HOH A 181 1186 184 HOH WAT . 
G 3 HOH A 182 1187 185 HOH WAT . 
G 3 HOH A 183 1188 186 HOH WAT . 
G 3 HOH A 184 1189 187 HOH WAT . 
G 3 HOH A 185 1190 188 HOH WAT . 
G 3 HOH A 186 1191 189 HOH WAT . 
G 3 HOH A 187 1192 190 HOH WAT . 
G 3 HOH A 188 1193 191 HOH WAT . 
G 3 HOH A 189 1194 192 HOH WAT . 
G 3 HOH A 190 1195 193 HOH WAT . 
G 3 HOH A 191 1196 194 HOH WAT . 
G 3 HOH A 192 1197 195 HOH WAT . 
G 3 HOH A 193 1198 196 HOH WAT . 
G 3 HOH A 194 1199 197 HOH WAT . 
G 3 HOH A 195 1200 198 HOH WAT . 
G 3 HOH A 196 1201 199 HOH WAT . 
G 3 HOH A 197 1202 200 HOH WAT . 
G 3 HOH A 198 1203 201 HOH WAT . 
G 3 HOH A 199 1204 202 HOH WAT . 
G 3 HOH A 200 1205 203 HOH WAT . 
G 3 HOH A 201 1206 204 HOH WAT . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 EDO . . . E 2 5.724 -4.896 16.595 1 31.97 ? C1 EDO 1004 A 1 
HETATM 2 O O1 EDO . . . E 2 4.416 -4.921 15.967 1 37.05 ? O1 EDO 1004 A 1 
HETATM 3 C C2 EDO . . . E 2 6.3 -3.521 16.517 1 31.18 ? C2 EDO 1004 A 1 
HETATM 4 O O2 EDO . . . E 2 5.907 -2.775 17.66 1 28.03 ? O2 EDO 1004 A 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              51 
_model_server_stats.parse_time_ms           7 
_model_server_stats.create_model_time_ms    3 
_model_server_stats.query_time_ms           370 
_model_server_stats.encode_time_ms          4 
_model_server_stats.element_count           4 
#