data_1LG2 # _model_server_result.job_id syLbbHjiNzRps5ds7MELdA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-27 16:14:06' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1lg2 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":1005}' # _entry.id 1LG2 # _exptl.entry_id 1LG2 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 62.068 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 1,2-ETHANEDIOL _entity.pdbx_number_of_molecules 5 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 102.58 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1LG2 _cell.length_a 45.173 _cell.length_b 47.285 _cell.length_c 84.726 _cell.Z_PDB 2 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1LG2 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 5 A CYS 26 1_555 A SG CYS 30 A CYS 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 286 A CYS 307 1_555 A SG CYS 349 A CYS 370 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? # _chem_comp.formula 'C2 H6 O2' _chem_comp.formula_weight 62.068 _chem_comp.id EDO _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 1,2-ETHANEDIOL _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms 'ETHYLENE GLYCOL' # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 O1 EDO sing 83 n n C1 C2 EDO sing 84 n n C1 H11 EDO sing 85 n n C1 H12 EDO sing 86 n n O1 HO1 EDO sing 87 n n C2 O2 EDO sing 88 n n C2 H21 EDO sing 89 n n C2 H22 EDO sing 90 n n O2 HO2 EDO sing 91 n n # _atom_sites.entry_id 1LG2 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.022137 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.00494 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.021148 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.012093 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 EDO A 1 1001 1 EDO EDO . C 2 EDO A 1 1002 2 EDO EDO . D 2 EDO A 1 1003 3 EDO EDO . E 2 EDO A 1 1004 4 EDO EDO . F 2 EDO A 1 1005 5 EDO EDO . G 3 HOH A 1 1006 1 HOH WAT . G 3 HOH A 2 1007 2 HOH WAT . G 3 HOH A 3 1008 3 HOH WAT . G 3 HOH A 4 1009 4 HOH WAT . G 3 HOH A 5 1010 5 HOH WAT . G 3 HOH A 6 1011 6 HOH WAT . G 3 HOH A 7 1012 7 HOH WAT . G 3 HOH A 8 1013 8 HOH WAT . G 3 HOH A 9 1014 9 HOH WAT . G 3 HOH A 10 1015 10 HOH WAT . G 3 HOH A 11 1016 11 HOH WAT . G 3 HOH A 12 1017 12 HOH WAT . G 3 HOH A 13 1018 13 HOH WAT . G 3 HOH A 14 1019 14 HOH WAT . G 3 HOH A 15 1020 15 HOH WAT . G 3 HOH A 16 1021 16 HOH WAT . G 3 HOH A 17 1022 17 HOH WAT . G 3 HOH A 18 1023 18 HOH WAT . G 3 HOH A 19 1024 19 HOH WAT . G 3 HOH A 20 1025 20 HOH WAT . G 3 HOH A 21 1026 21 HOH WAT . G 3 HOH A 22 1027 22 HOH WAT . G 3 HOH A 23 1028 23 HOH WAT . G 3 HOH A 24 1029 24 HOH WAT . G 3 HOH A 25 1030 25 HOH WAT . G 3 HOH A 26 1031 26 HOH WAT . G 3 HOH A 27 1032 27 HOH WAT . G 3 HOH A 28 1033 28 HOH WAT . G 3 HOH A 29 1034 29 HOH WAT . G 3 HOH A 30 1035 30 HOH WAT . G 3 HOH A 31 1036 31 HOH WAT . G 3 HOH A 32 1037 32 HOH WAT . G 3 HOH A 33 1038 33 HOH WAT . G 3 HOH A 34 1039 34 HOH WAT . G 3 HOH A 35 1040 35 HOH WAT . G 3 HOH A 36 1041 36 HOH WAT . G 3 HOH A 37 1042 37 HOH WAT . G 3 HOH A 38 1043 38 HOH WAT . G 3 HOH A 39 1044 39 HOH WAT . G 3 HOH A 40 1045 40 HOH WAT . G 3 HOH A 41 1046 41 HOH WAT . G 3 HOH A 42 1047 42 HOH WAT . G 3 HOH A 43 1048 43 HOH WAT . G 3 HOH A 44 1049 44 HOH WAT . G 3 HOH A 45 1050 45 HOH WAT . G 3 HOH A 46 1051 47 HOH WAT . G 3 HOH A 47 1052 48 HOH WAT . G 3 HOH A 48 1053 49 HOH WAT . G 3 HOH A 49 1054 50 HOH WAT . G 3 HOH A 50 1055 51 HOH WAT . G 3 HOH A 51 1056 52 HOH WAT . G 3 HOH A 52 1057 53 HOH WAT . G 3 HOH A 53 1058 54 HOH WAT . G 3 HOH A 54 1059 55 HOH WAT . G 3 HOH A 55 1060 56 HOH WAT . G 3 HOH A 56 1061 57 HOH WAT . G 3 HOH A 57 1062 58 HOH WAT . G 3 HOH A 58 1063 59 HOH WAT . G 3 HOH A 59 1064 60 HOH WAT . G 3 HOH A 60 1065 61 HOH WAT . G 3 HOH A 61 1066 62 HOH WAT . G 3 HOH A 62 1067 63 HOH WAT . G 3 HOH A 63 1068 65 HOH WAT . G 3 HOH A 64 1069 66 HOH WAT . G 3 HOH A 65 1070 67 HOH WAT . G 3 HOH A 66 1071 68 HOH WAT . G 3 HOH A 67 1072 69 HOH WAT . G 3 HOH A 68 1073 70 HOH WAT . G 3 HOH A 69 1074 71 HOH WAT . G 3 HOH A 70 1075 72 HOH WAT . G 3 HOH A 71 1076 73 HOH WAT . G 3 HOH A 72 1077 74 HOH WAT . G 3 HOH A 73 1078 75 HOH WAT . G 3 HOH A 74 1079 76 HOH WAT . G 3 HOH A 75 1080 77 HOH WAT . G 3 HOH A 76 1081 78 HOH WAT . G 3 HOH A 77 1082 79 HOH WAT . G 3 HOH A 78 1083 80 HOH WAT . G 3 HOH A 79 1084 81 HOH WAT . G 3 HOH A 80 1085 82 HOH WAT . G 3 HOH A 81 1086 83 HOH WAT . G 3 HOH A 82 1087 84 HOH WAT . G 3 HOH A 83 1088 85 HOH WAT . G 3 HOH A 84 1089 86 HOH WAT . G 3 HOH A 85 1090 87 HOH WAT . G 3 HOH A 86 1091 88 HOH WAT . G 3 HOH A 87 1092 89 HOH WAT . G 3 HOH A 88 1093 91 HOH WAT . G 3 HOH A 89 1094 92 HOH WAT . G 3 HOH A 90 1095 93 HOH WAT . G 3 HOH A 91 1096 94 HOH WAT . G 3 HOH A 92 1097 95 HOH WAT . G 3 HOH A 93 1098 96 HOH WAT . G 3 HOH A 94 1099 97 HOH WAT . G 3 HOH A 95 1100 98 HOH WAT . G 3 HOH A 96 1101 99 HOH WAT . G 3 HOH A 97 1102 100 HOH WAT . G 3 HOH A 98 1103 101 HOH WAT . G 3 HOH A 99 1104 102 HOH WAT . G 3 HOH A 100 1105 103 HOH WAT . G 3 HOH A 101 1106 104 HOH WAT . G 3 HOH A 102 1107 105 HOH WAT . G 3 HOH A 103 1108 106 HOH WAT . G 3 HOH A 104 1109 107 HOH WAT . G 3 HOH A 105 1110 108 HOH WAT . G 3 HOH A 106 1111 109 HOH WAT . G 3 HOH A 107 1112 110 HOH WAT . G 3 HOH A 108 1113 111 HOH WAT . G 3 HOH A 109 1114 112 HOH WAT . G 3 HOH A 110 1115 113 HOH WAT . G 3 HOH A 111 1116 114 HOH WAT . G 3 HOH A 112 1117 115 HOH WAT . G 3 HOH A 113 1118 116 HOH WAT . G 3 HOH A 114 1119 117 HOH WAT . G 3 HOH A 115 1120 118 HOH WAT . G 3 HOH A 116 1121 119 HOH WAT . G 3 HOH A 117 1122 120 HOH WAT . G 3 HOH A 118 1123 121 HOH WAT . G 3 HOH A 119 1124 122 HOH WAT . G 3 HOH A 120 1125 123 HOH WAT . G 3 HOH A 121 1126 124 HOH WAT . G 3 HOH A 122 1127 125 HOH WAT . G 3 HOH A 123 1128 126 HOH WAT . G 3 HOH A 124 1129 127 HOH WAT . G 3 HOH A 125 1130 128 HOH WAT . G 3 HOH A 126 1131 129 HOH WAT . G 3 HOH A 127 1132 130 HOH WAT . G 3 HOH A 128 1133 131 HOH WAT . G 3 HOH A 129 1134 132 HOH WAT . G 3 HOH A 130 1135 133 HOH WAT . G 3 HOH A 131 1136 134 HOH WAT . G 3 HOH A 132 1137 135 HOH WAT . G 3 HOH A 133 1138 136 HOH WAT . G 3 HOH A 134 1139 137 HOH WAT . G 3 HOH A 135 1140 138 HOH WAT . G 3 HOH A 136 1141 139 HOH WAT . G 3 HOH A 137 1142 140 HOH WAT . G 3 HOH A 138 1143 141 HOH WAT . G 3 HOH A 139 1144 142 HOH WAT . G 3 HOH A 140 1145 143 HOH WAT . G 3 HOH A 141 1146 144 HOH WAT . G 3 HOH A 142 1147 145 HOH WAT . G 3 HOH A 143 1148 146 HOH WAT . G 3 HOH A 144 1149 147 HOH WAT . G 3 HOH A 145 1150 148 HOH WAT . G 3 HOH A 146 1151 149 HOH WAT . G 3 HOH A 147 1152 150 HOH WAT . G 3 HOH A 148 1153 151 HOH WAT . G 3 HOH A 149 1154 152 HOH WAT . G 3 HOH A 150 1155 153 HOH WAT . G 3 HOH A 151 1156 154 HOH WAT . G 3 HOH A 152 1157 155 HOH WAT . G 3 HOH A 153 1158 156 HOH WAT . G 3 HOH A 154 1159 157 HOH WAT . G 3 HOH A 155 1160 158 HOH WAT . G 3 HOH A 156 1161 159 HOH WAT . G 3 HOH A 157 1162 160 HOH WAT . G 3 HOH A 158 1163 161 HOH WAT . G 3 HOH A 159 1164 162 HOH WAT . G 3 HOH A 160 1165 163 HOH WAT . G 3 HOH A 161 1166 164 HOH WAT . G 3 HOH A 162 1167 165 HOH WAT . G 3 HOH A 163 1168 166 HOH WAT . G 3 HOH A 164 1169 167 HOH WAT . G 3 HOH A 165 1170 168 HOH WAT . G 3 HOH A 166 1171 169 HOH WAT . G 3 HOH A 167 1172 170 HOH WAT . G 3 HOH A 168 1173 171 HOH WAT . G 3 HOH A 169 1174 172 HOH WAT . G 3 HOH A 170 1175 173 HOH WAT . G 3 HOH A 171 1176 174 HOH WAT . G 3 HOH A 172 1177 175 HOH WAT . G 3 HOH A 173 1178 176 HOH WAT . G 3 HOH A 174 1179 177 HOH WAT . G 3 HOH A 175 1180 178 HOH WAT . G 3 HOH A 176 1181 179 HOH WAT . G 3 HOH A 177 1182 180 HOH WAT . G 3 HOH A 178 1183 181 HOH WAT . G 3 HOH A 179 1184 182 HOH WAT . G 3 HOH A 180 1185 183 HOH WAT . G 3 HOH A 181 1186 184 HOH WAT . G 3 HOH A 182 1187 185 HOH WAT . G 3 HOH A 183 1188 186 HOH WAT . G 3 HOH A 184 1189 187 HOH WAT . G 3 HOH A 185 1190 188 HOH WAT . G 3 HOH A 186 1191 189 HOH WAT . G 3 HOH A 187 1192 190 HOH WAT . G 3 HOH A 188 1193 191 HOH WAT . G 3 HOH A 189 1194 192 HOH WAT . G 3 HOH A 190 1195 193 HOH WAT . G 3 HOH A 191 1196 194 HOH WAT . G 3 HOH A 192 1197 195 HOH WAT . G 3 HOH A 193 1198 196 HOH WAT . G 3 HOH A 194 1199 197 HOH WAT . G 3 HOH A 195 1200 198 HOH WAT . G 3 HOH A 196 1201 199 HOH WAT . G 3 HOH A 197 1202 200 HOH WAT . G 3 HOH A 198 1203 201 HOH WAT . G 3 HOH A 199 1204 202 HOH WAT . G 3 HOH A 200 1205 203 HOH WAT . G 3 HOH A 201 1206 204 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 EDO . . . F 2 -13.927 -10.01 19.378 1 27.62 ? C1 EDO 1005 A 1 HETATM 2 O O1 EDO . . . F 2 -14.578 -10.861 20.361 1 29.06 ? O1 EDO 1005 A 1 HETATM 3 C C2 EDO . . . F 2 -13.722 -8.624 19.934 1 27.81 ? C2 EDO 1005 A 1 HETATM 4 O O2 EDO . . . F 2 -14.909 -8.222 20.612 1 28.04 ? O2 EDO 1005 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 12 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 6 _model_server_stats.query_time_ms 271 _model_server_stats.encode_time_ms 10 _model_server_stats.element_count 4 #