data_1LQY # _model_server_result.job_id UDJIulUzh3-Q9rLD4H5hCg _model_server_result.datetime_utc '2024-10-11 06:16:07' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1lqy # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":301}' # _entry.id 1LQY # _exptl.entry_id 1LQY _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 58.693 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'NICKEL (II) ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1LQY _cell.length_a 42.013 _cell.length_b 43.075 _cell.length_c 92.225 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1LQY _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A NE2 HIS 97 A HIS 97 1_555 C NI NI . A NI 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 110 A CYS 110 1_555 B NI NI . A NI 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.693 ? metalc ? metalc3 A NE2 HIS 153 A HIS 153 1_555 B NI NI . A NI 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.133 ? metalc ? metalc4 A NE2 HIS 157 A HIS 157 1_555 B NI NI . A NI 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.166 ? metalc ? metalc5 B NI NI . A NI 301 1_555 D O2 BB2 . A BB2 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.151 ? metalc ? metalc6 B NI NI . A NI 301 1_555 D O4 BB2 . A BB2 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? metalc ? metalc7 C NI NI . A NI 302 1_555 E O HOH . A HOH 485 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? metalc ? metalc8 C NI NI . A NI 302 1_555 E O HOH . A HOH 549 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc9 C NI NI . A NI 302 1_555 E O HOH . A HOH 555 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? metalc ? metalc10 C NI NI . A NI 302 1_555 E O HOH . A HOH 617 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.397 ? # _chem_comp.formula 'Ni 2' _chem_comp.formula_weight 58.693 _chem_comp.id NI _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'NICKEL (II) ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1LQY _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.023802 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.023215 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.010843 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 NI A 1 301 1 NI NI . C 2 NI A 1 302 2 NI NI . D 3 BB2 A 1 401 1 BB2 ATN . E 4 HOH A 1 402 1 HOH WAT . E 4 HOH A 2 403 2 HOH WAT . E 4 HOH A 3 404 3 HOH WAT . E 4 HOH A 4 405 4 HOH WAT . E 4 HOH A 5 406 5 HOH WAT . E 4 HOH A 6 407 6 HOH WAT . E 4 HOH A 7 408 7 HOH WAT . E 4 HOH A 8 409 8 HOH WAT . E 4 HOH A 9 410 9 HOH WAT . E 4 HOH A 10 411 10 HOH WAT . E 4 HOH A 11 412 11 HOH WAT . E 4 HOH A 12 413 12 HOH WAT . E 4 HOH A 13 414 13 HOH WAT . E 4 HOH A 14 415 14 HOH WAT . E 4 HOH A 15 416 15 HOH WAT . E 4 HOH A 16 417 16 HOH WAT . E 4 HOH A 17 418 17 HOH WAT . E 4 HOH A 18 419 18 HOH WAT . E 4 HOH A 19 420 19 HOH WAT . E 4 HOH A 20 421 20 HOH WAT . E 4 HOH A 21 422 21 HOH WAT . E 4 HOH A 22 423 22 HOH WAT . E 4 HOH A 23 424 23 HOH WAT . E 4 HOH A 24 425 24 HOH WAT . E 4 HOH A 25 426 25 HOH WAT . E 4 HOH A 26 427 26 HOH WAT . E 4 HOH A 27 428 27 HOH WAT . E 4 HOH A 28 429 28 HOH WAT . E 4 HOH A 29 430 29 HOH WAT . E 4 HOH A 30 431 30 HOH WAT . E 4 HOH A 31 432 31 HOH WAT . E 4 HOH A 32 433 32 HOH WAT . E 4 HOH A 33 434 33 HOH WAT . E 4 HOH A 34 435 34 HOH WAT . E 4 HOH A 35 436 35 HOH WAT . E 4 HOH A 36 437 36 HOH WAT . E 4 HOH A 37 438 37 HOH WAT . E 4 HOH A 38 439 38 HOH WAT . E 4 HOH A 39 440 39 HOH WAT . E 4 HOH A 40 441 40 HOH WAT . E 4 HOH A 41 442 41 HOH WAT . E 4 HOH A 42 443 42 HOH WAT . E 4 HOH A 43 444 43 HOH WAT . E 4 HOH A 44 445 44 HOH WAT . E 4 HOH A 45 446 45 HOH WAT . E 4 HOH A 46 447 46 HOH WAT . E 4 HOH A 47 448 47 HOH WAT . E 4 HOH A 48 449 48 HOH WAT . E 4 HOH A 49 450 49 HOH WAT . E 4 HOH A 50 451 50 HOH WAT . E 4 HOH A 51 452 51 HOH WAT . E 4 HOH A 52 453 52 HOH WAT . E 4 HOH A 53 454 53 HOH WAT . E 4 HOH A 54 455 54 HOH WAT . E 4 HOH A 55 456 55 HOH WAT . E 4 HOH A 56 457 56 HOH WAT . E 4 HOH A 57 458 57 HOH WAT . E 4 HOH A 58 459 58 HOH WAT . E 4 HOH A 59 460 59 HOH WAT . E 4 HOH A 60 461 60 HOH WAT . E 4 HOH A 61 462 61 HOH WAT . E 4 HOH A 62 463 62 HOH WAT . E 4 HOH A 63 464 63 HOH WAT . E 4 HOH A 64 465 64 HOH WAT . E 4 HOH A 65 466 65 HOH WAT . E 4 HOH A 66 467 66 HOH WAT . E 4 HOH A 67 468 67 HOH WAT . E 4 HOH A 68 469 68 HOH WAT . E 4 HOH A 69 470 69 HOH WAT . E 4 HOH A 70 471 70 HOH WAT . E 4 HOH A 71 472 71 HOH WAT . E 4 HOH A 72 473 72 HOH WAT . E 4 HOH A 73 474 73 HOH WAT . E 4 HOH A 74 475 74 HOH WAT . E 4 HOH A 75 476 75 HOH WAT . E 4 HOH A 76 477 76 HOH WAT . E 4 HOH A 77 478 77 HOH WAT . E 4 HOH A 78 479 78 HOH WAT . E 4 HOH A 79 480 79 HOH WAT . E 4 HOH A 80 481 80 HOH WAT . E 4 HOH A 81 482 81 HOH WAT . E 4 HOH A 82 483 82 HOH WAT . E 4 HOH A 83 484 83 HOH WAT . E 4 HOH A 84 485 84 HOH WAT . E 4 HOH A 85 486 85 HOH WAT . E 4 HOH A 86 487 86 HOH WAT . E 4 HOH A 87 488 87 HOH WAT . E 4 HOH A 88 489 88 HOH WAT . E 4 HOH A 89 490 89 HOH WAT . E 4 HOH A 90 491 90 HOH WAT . E 4 HOH A 91 492 91 HOH WAT . E 4 HOH A 92 493 92 HOH WAT . E 4 HOH A 93 494 93 HOH WAT . E 4 HOH A 94 495 94 HOH WAT . E 4 HOH A 95 496 95 HOH WAT . E 4 HOH A 96 497 96 HOH WAT . E 4 HOH A 97 498 97 HOH WAT . E 4 HOH A 98 499 98 HOH WAT . E 4 HOH A 99 500 99 HOH WAT . E 4 HOH A 100 501 100 HOH WAT . E 4 HOH A 101 502 101 HOH WAT . E 4 HOH A 102 503 102 HOH WAT . E 4 HOH A 103 504 103 HOH WAT . E 4 HOH A 104 505 104 HOH WAT . E 4 HOH A 105 506 105 HOH WAT . E 4 HOH A 106 507 106 HOH WAT . E 4 HOH A 107 508 107 HOH WAT . E 4 HOH A 108 509 108 HOH WAT . E 4 HOH A 109 510 109 HOH WAT . E 4 HOH A 110 511 110 HOH WAT . E 4 HOH A 111 512 111 HOH WAT . E 4 HOH A 112 513 112 HOH WAT . E 4 HOH A 113 514 113 HOH WAT . E 4 HOH A 114 515 114 HOH WAT . E 4 HOH A 115 516 115 HOH WAT . E 4 HOH A 116 517 116 HOH WAT . E 4 HOH A 117 518 117 HOH WAT . E 4 HOH A 118 519 118 HOH WAT . E 4 HOH A 119 520 119 HOH WAT . E 4 HOH A 120 521 120 HOH WAT . E 4 HOH A 121 522 121 HOH WAT . E 4 HOH A 122 523 122 HOH WAT . E 4 HOH A 123 524 123 HOH WAT . E 4 HOH A 124 525 124 HOH WAT . E 4 HOH A 125 526 125 HOH WAT . E 4 HOH A 126 527 126 HOH WAT . E 4 HOH A 127 528 127 HOH WAT . E 4 HOH A 128 529 128 HOH WAT . E 4 HOH A 129 530 129 HOH WAT . E 4 HOH A 130 531 130 HOH WAT . E 4 HOH A 131 532 131 HOH WAT . E 4 HOH A 132 533 132 HOH WAT . E 4 HOH A 133 534 133 HOH WAT . E 4 HOH A 134 535 134 HOH WAT . E 4 HOH A 135 536 135 HOH WAT . E 4 HOH A 136 537 136 HOH WAT . E 4 HOH A 137 538 137 HOH WAT . E 4 HOH A 138 539 138 HOH WAT . E 4 HOH A 139 540 139 HOH WAT . E 4 HOH A 140 541 140 HOH WAT . E 4 HOH A 141 542 141 HOH WAT . E 4 HOH A 142 543 142 HOH WAT . E 4 HOH A 143 544 143 HOH WAT . E 4 HOH A 144 545 144 HOH WAT . E 4 HOH A 145 546 145 HOH WAT . E 4 HOH A 146 547 146 HOH WAT . E 4 HOH A 147 548 147 HOH WAT . E 4 HOH A 148 549 148 HOH WAT . E 4 HOH A 149 550 149 HOH WAT . E 4 HOH A 150 551 150 HOH WAT . E 4 HOH A 151 552 151 HOH WAT . E 4 HOH A 152 553 152 HOH WAT . E 4 HOH A 153 554 153 HOH WAT . E 4 HOH A 154 555 154 HOH WAT . E 4 HOH A 155 556 155 HOH WAT . E 4 HOH A 156 557 156 HOH WAT . E 4 HOH A 157 558 157 HOH WAT . E 4 HOH A 158 559 158 HOH WAT . E 4 HOH A 159 560 159 HOH WAT . E 4 HOH A 160 561 160 HOH WAT . E 4 HOH A 161 562 161 HOH WAT . E 4 HOH A 162 563 162 HOH WAT . E 4 HOH A 163 564 163 HOH WAT . E 4 HOH A 164 565 164 HOH WAT . E 4 HOH A 165 566 165 HOH WAT . E 4 HOH A 166 567 166 HOH WAT . E 4 HOH A 167 568 167 HOH WAT . E 4 HOH A 168 569 168 HOH WAT . E 4 HOH A 169 570 169 HOH WAT . E 4 HOH A 170 571 170 HOH WAT . E 4 HOH A 171 572 171 HOH WAT . E 4 HOH A 172 573 172 HOH WAT . E 4 HOH A 173 574 173 HOH WAT . E 4 HOH A 174 575 174 HOH WAT . E 4 HOH A 175 576 175 HOH WAT . E 4 HOH A 176 577 176 HOH WAT . E 4 HOH A 177 578 177 HOH WAT . E 4 HOH A 178 579 178 HOH WAT . E 4 HOH A 179 580 179 HOH WAT . E 4 HOH A 180 581 180 HOH WAT . E 4 HOH A 181 582 181 HOH WAT . E 4 HOH A 182 583 182 HOH WAT . E 4 HOH A 183 584 183 HOH WAT . E 4 HOH A 184 585 184 HOH WAT . E 4 HOH A 185 586 185 HOH WAT . E 4 HOH A 186 587 186 HOH WAT . E 4 HOH A 187 588 187 HOH WAT . E 4 HOH A 188 589 188 HOH WAT . E 4 HOH A 189 590 189 HOH WAT . E 4 HOH A 190 591 190 HOH WAT . E 4 HOH A 191 592 191 HOH WAT . E 4 HOH A 192 593 192 HOH WAT . E 4 HOH A 193 594 193 HOH WAT . E 4 HOH A 194 595 194 HOH WAT . E 4 HOH A 195 596 195 HOH WAT . E 4 HOH A 196 597 196 HOH WAT . E 4 HOH A 197 598 197 HOH WAT . E 4 HOH A 198 599 198 HOH WAT . E 4 HOH A 199 600 199 HOH WAT . E 4 HOH A 200 601 200 HOH WAT . E 4 HOH A 201 602 201 HOH WAT . E 4 HOH A 202 603 202 HOH WAT . E 4 HOH A 203 604 203 HOH WAT . E 4 HOH A 204 605 204 HOH WAT . E 4 HOH A 205 606 205 HOH WAT . E 4 HOH A 206 607 206 HOH WAT . E 4 HOH A 207 608 207 HOH WAT . E 4 HOH A 208 609 208 HOH WAT . E 4 HOH A 209 610 209 HOH WAT . E 4 HOH A 210 611 210 HOH WAT . E 4 HOH A 211 612 211 HOH WAT . E 4 HOH A 212 613 212 HOH WAT . E 4 HOH A 213 614 213 HOH WAT . E 4 HOH A 214 615 214 HOH WAT . E 4 HOH A 215 616 215 HOH WAT . E 4 HOH A 216 617 216 HOH WAT . E 4 HOH A 217 618 217 HOH WAT . E 4 HOH A 218 619 218 HOH WAT . E 4 HOH A 219 620 219 HOH WAT . E 4 HOH A 220 621 220 HOH WAT . E 4 HOH A 221 622 221 HOH WAT . E 4 HOH A 222 623 222 HOH WAT . E 4 HOH A 223 624 223 HOH WAT . E 4 HOH A 224 625 224 HOH WAT . E 4 HOH A 225 626 225 HOH WAT . E 4 HOH A 226 627 226 HOH WAT . E 4 HOH A 227 628 227 HOH WAT . E 4 HOH A 228 629 228 HOH WAT . E 4 HOH A 229 630 229 HOH WAT . E 4 HOH A 230 631 230 HOH WAT . E 4 HOH A 231 632 231 HOH WAT . E 4 HOH A 232 633 232 HOH WAT . E 4 HOH A 233 634 233 HOH WAT . E 4 HOH A 234 635 234 HOH WAT . E 4 HOH A 235 636 235 HOH WAT . E 4 HOH A 236 637 236 HOH WAT . E 4 HOH A 237 638 237 HOH WAT . E 4 HOH A 238 639 238 HOH WAT . E 4 HOH A 239 640 239 HOH WAT . E 4 HOH A 240 641 240 HOH WAT . E 4 HOH A 241 642 241 HOH WAT . E 4 HOH A 242 643 242 HOH WAT . E 4 HOH A 243 644 243 HOH WAT . E 4 HOH A 244 645 244 HOH WAT . E 4 HOH A 245 646 245 HOH WAT . E 4 HOH A 246 647 246 HOH WAT . E 4 HOH A 247 648 247 HOH WAT . E 4 HOH A 248 649 248 HOH WAT . E 4 HOH A 249 650 249 HOH WAT . E 4 HOH A 250 651 250 HOH WAT . E 4 HOH A 251 652 251 HOH WAT . E 4 HOH A 252 653 252 HOH WAT . E 4 HOH A 253 654 253 HOH WAT . E 4 HOH A 254 655 254 HOH WAT . E 4 HOH A 255 656 255 HOH WAT . E 4 HOH A 256 657 256 HOH WAT . E 4 HOH A 257 658 257 HOH WAT . E 4 HOH A 258 659 258 HOH WAT . E 4 HOH A 259 660 259 HOH WAT . E 4 HOH A 260 661 260 HOH WAT . E 4 HOH A 261 662 261 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol NI _atom_site.label_atom_id NI _atom_site.label_comp_id NI _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id B _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 17.682 _atom_site.Cartn_y 8.854 _atom_site.Cartn_z 32.262 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 13.58 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id NI _atom_site.auth_comp_id NI _atom_site.auth_seq_id 301 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 7 _model_server_stats.parse_time_ms 6 _model_server_stats.create_model_time_ms 15 _model_server_stats.query_time_ms 302 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 1 #