data_1M2A # _model_server_result.job_id rVrtBzxYe8-kPqMZfDNMdw _model_server_result.datetime_utc '2024-12-02 03:58:46' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1m2a # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":302}' # _entry.id 1M2A # _exptl.entry_id 1M2A _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 110.3 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1M2A _cell.length_a 67.2 _cell.length_b 59.8 _cell.length_c 47.2 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1M2A _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 PISA dimeric 2 software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K 1 1 A,C,D,E,F,G,J 2 1 B,H,I,K 2 2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 1_556 x,y,z+1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 -16.375363 0 44.268358 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A N ALA 1 A ALA 1 4_557 E ZN ZN . A ZN 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 9 A CYS 9 1_555 G FE1 FES . A FES 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 12 A ASP 12 1_555 E ZN ZN . A ZN 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.133 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASP 12 A ASP 12 1_555 E ZN ZN . A ZN 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? metalc ? metalc5 A ND1 HIS 17 A HIS 17 1_555 D ZN ZN . A ZN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.112 ? metalc ? metalc6 A SG CYS 22 A CYS 22 1_555 G FE1 FES . A FES 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? metalc ? metalc7 A SG CYS 55 A CYS 55 1_555 G FE2 FES . A FES 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.341 ? metalc ? metalc8 A SG CYS 59 A CYS 59 1_555 G FE2 FES . A FES 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 83 A ASP 83 1_555 C ZN ZN . A ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.722 ? metalc ? metalc10 A OD2 ASP 83 A ASP 83 1_555 C ZN ZN . A ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? metalc ? metalc11 A OE1 GLU 97 A GLU 97 1_555 F ZN ZN . A ZN 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.921 ? metalc ? metalc12 C ZN ZN . A ZN 301 1_555 B OD2 ASP 83 B ASP 83 1_556 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc13 C ZN ZN . A ZN 301 1_555 B OD1 ASP 83 B ASP 83 1_556 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.731 ? metalc ? metalc14 D ZN ZN . A ZN 302 1_555 J O HOH . A HOH 385 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.118 ? metalc ? metalc15 D ZN ZN . A ZN 302 1_555 J O HOH . A HOH 386 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.245 ? metalc ? metalc16 D ZN ZN . A ZN 302 1_555 B OE2 GLU 97 B GLU 97 3_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? metalc ? metalc17 F ZN ZN . A ZN 304 1_555 J O HOH . A HOH 373 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.244 ? metalc ? metalc18 F ZN ZN . A ZN 304 1_555 B ND1 HIS 17 B HIS 17 3_445 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? metalc ? metalc19 B SG CYS 9 B CYS 9 1_555 I FE1 FES . B FES 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? metalc ? metalc20 B SG CYS 22 B CYS 22 1_555 I FE1 FES . B FES 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? metalc ? metalc21 B SG CYS 55 B CYS 55 1_555 I FE2 FES . B FES 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? metalc ? metalc22 B SG CYS 59 B CYS 59 1_555 I FE2 FES . B FES 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1M2A _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.014881 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.005505 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.016722 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.022589 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 ZN A 1 301 1 ZN ZN2 . D 2 ZN A 1 302 2 ZN ZN2 . E 2 ZN A 1 303 3 ZN ZN2 . F 2 ZN A 1 304 4 ZN ZN2 . G 3 FES A 1 201 1 FES FES . H 4 SO4 B 1 401 1 SO4 SO4 . I 3 FES B 1 202 2 FES FES . J 5 HOH A 1 305 1 HOH WAT . J 5 HOH A 2 306 2 HOH WAT . J 5 HOH A 3 307 3 HOH WAT . J 5 HOH A 4 308 4 HOH WAT . J 5 HOH A 5 309 5 HOH WAT . J 5 HOH A 6 310 6 HOH WAT . J 5 HOH A 7 311 7 HOH WAT . J 5 HOH A 8 312 8 HOH WAT . J 5 HOH A 9 313 9 HOH WAT . J 5 HOH A 10 314 10 HOH WAT . J 5 HOH A 11 315 11 HOH WAT . J 5 HOH A 12 316 12 HOH WAT . J 5 HOH A 13 317 13 HOH WAT . J 5 HOH A 14 318 14 HOH WAT . J 5 HOH A 15 319 15 HOH WAT . J 5 HOH A 16 320 16 HOH WAT . J 5 HOH A 17 321 17 HOH WAT . J 5 HOH A 18 322 18 HOH WAT . J 5 HOH A 19 323 19 HOH WAT . J 5 HOH A 20 324 20 HOH WAT . J 5 HOH A 21 325 21 HOH WAT . J 5 HOH A 22 326 22 HOH WAT . J 5 HOH A 23 327 23 HOH WAT . J 5 HOH A 24 328 24 HOH WAT . J 5 HOH A 25 329 25 HOH WAT . J 5 HOH A 26 330 26 HOH WAT . J 5 HOH A 27 331 27 HOH WAT . J 5 HOH A 28 332 28 HOH WAT . J 5 HOH A 29 333 29 HOH WAT . J 5 HOH A 30 334 30 HOH WAT . J 5 HOH A 31 335 31 HOH WAT . J 5 HOH A 32 336 32 HOH WAT . J 5 HOH A 33 337 33 HOH WAT . J 5 HOH A 34 338 34 HOH WAT . J 5 HOH A 35 339 35 HOH WAT . J 5 HOH A 36 340 36 HOH WAT . J 5 HOH A 37 341 37 HOH WAT . J 5 HOH A 38 342 38 HOH WAT . J 5 HOH A 39 343 39 HOH WAT . J 5 HOH A 40 344 40 HOH WAT . J 5 HOH A 41 345 41 HOH WAT . J 5 HOH A 42 346 42 HOH WAT . J 5 HOH A 43 347 43 HOH WAT . J 5 HOH A 44 348 44 HOH WAT . J 5 HOH A 45 349 45 HOH WAT . J 5 HOH A 46 350 46 HOH WAT . J 5 HOH A 47 351 47 HOH WAT . J 5 HOH A 48 352 48 HOH WAT . J 5 HOH A 49 353 49 HOH WAT . J 5 HOH A 50 354 50 HOH WAT . J 5 HOH A 51 355 51 HOH WAT . J 5 HOH A 52 356 52 HOH WAT . J 5 HOH A 53 357 53 HOH WAT . J 5 HOH A 54 358 54 HOH WAT . J 5 HOH A 55 359 55 HOH WAT . J 5 HOH A 56 360 56 HOH WAT . J 5 HOH A 57 361 57 HOH WAT . J 5 HOH A 58 362 58 HOH WAT . J 5 HOH A 59 363 59 HOH WAT . J 5 HOH A 60 364 60 HOH WAT . J 5 HOH A 61 365 61 HOH WAT . J 5 HOH A 62 366 62 HOH WAT . J 5 HOH A 63 367 63 HOH WAT . J 5 HOH A 64 368 64 HOH WAT . J 5 HOH A 65 369 65 HOH WAT . J 5 HOH A 66 370 66 HOH WAT . J 5 HOH A 67 371 67 HOH WAT . J 5 HOH A 68 372 68 HOH WAT . J 5 HOH A 69 373 69 HOH WAT . J 5 HOH A 70 374 70 HOH WAT . J 5 HOH A 71 375 71 HOH WAT . J 5 HOH A 72 376 72 HOH WAT . J 5 HOH A 73 377 73 HOH WAT . J 5 HOH A 74 378 74 HOH WAT . J 5 HOH A 75 379 76 HOH WAT . J 5 HOH A 76 380 77 HOH WAT . J 5 HOH A 77 381 79 HOH WAT . J 5 HOH A 78 382 80 HOH WAT . J 5 HOH A 79 383 81 HOH WAT . J 5 HOH A 80 384 150 HOH WAT . J 5 HOH A 81 385 164 HOH WAT . J 5 HOH A 82 386 165 HOH WAT . J 5 HOH A 83 387 166 HOH WAT . J 5 HOH A 84 388 168 HOH WAT . J 5 HOH A 85 389 170 HOH WAT . J 5 HOH A 86 390 172 HOH WAT . J 5 HOH A 87 391 173 HOH WAT . J 5 HOH A 88 392 174 HOH WAT . J 5 HOH A 89 393 175 HOH WAT . J 5 HOH A 90 394 177 HOH WAT . J 5 HOH A 91 395 178 HOH WAT . J 5 HOH A 92 396 179 HOH WAT . J 5 HOH A 93 397 180 HOH WAT . J 5 HOH A 94 398 183 HOH WAT . J 5 HOH A 95 399 184 HOH WAT . K 5 HOH B 1 402 75 HOH WAT . K 5 HOH B 2 403 78 HOH WAT . K 5 HOH B 3 404 82 HOH WAT . K 5 HOH B 4 405 83 HOH WAT . K 5 HOH B 5 406 84 HOH WAT . K 5 HOH B 6 407 85 HOH WAT . K 5 HOH B 7 408 86 HOH WAT . K 5 HOH B 8 409 87 HOH WAT . K 5 HOH B 9 410 88 HOH WAT . K 5 HOH B 10 411 89 HOH WAT . K 5 HOH B 11 412 90 HOH WAT . K 5 HOH B 12 413 91 HOH WAT . K 5 HOH B 13 414 92 HOH WAT . K 5 HOH B 14 415 93 HOH WAT . K 5 HOH B 15 416 94 HOH WAT . K 5 HOH B 16 417 95 HOH WAT . K 5 HOH B 17 418 96 HOH WAT . K 5 HOH B 18 419 97 HOH WAT . K 5 HOH B 19 420 98 HOH WAT . K 5 HOH B 20 421 99 HOH WAT . K 5 HOH B 21 422 100 HOH WAT . K 5 HOH B 22 423 101 HOH WAT . K 5 HOH B 23 424 102 HOH WAT . K 5 HOH B 24 425 103 HOH WAT . K 5 HOH B 25 426 104 HOH WAT . K 5 HOH B 26 427 105 HOH WAT . K 5 HOH B 27 428 106 HOH WAT . K 5 HOH B 28 429 107 HOH WAT . K 5 HOH B 29 430 108 HOH WAT . K 5 HOH B 30 431 109 HOH WAT . K 5 HOH B 31 432 110 HOH WAT . K 5 HOH B 32 433 111 HOH WAT . K 5 HOH B 33 434 112 HOH WAT . K 5 HOH B 34 435 113 HOH WAT . K 5 HOH B 35 436 114 HOH WAT . K 5 HOH B 36 437 115 HOH WAT . K 5 HOH B 37 438 116 HOH WAT . K 5 HOH B 38 439 117 HOH WAT . K 5 HOH B 39 440 118 HOH WAT . K 5 HOH B 40 441 119 HOH WAT . K 5 HOH B 41 442 120 HOH WAT . K 5 HOH B 42 443 121 HOH WAT . K 5 HOH B 43 444 122 HOH WAT . K 5 HOH B 44 445 123 HOH WAT . K 5 HOH B 45 446 124 HOH WAT . K 5 HOH B 46 447 125 HOH WAT . K 5 HOH B 47 448 126 HOH WAT . K 5 HOH B 48 449 127 HOH WAT . K 5 HOH B 49 450 128 HOH WAT . K 5 HOH B 50 451 129 HOH WAT . K 5 HOH B 51 452 130 HOH WAT . K 5 HOH B 52 453 131 HOH WAT . K 5 HOH B 53 454 132 HOH WAT . K 5 HOH B 54 455 133 HOH WAT . K 5 HOH B 55 456 134 HOH WAT . K 5 HOH B 56 457 135 HOH WAT . K 5 HOH B 57 458 136 HOH WAT . K 5 HOH B 58 459 137 HOH WAT . K 5 HOH B 59 460 138 HOH WAT . K 5 HOH B 60 461 139 HOH WAT . K 5 HOH B 61 462 140 HOH WAT . K 5 HOH B 62 463 141 HOH WAT . K 5 HOH B 63 464 142 HOH WAT . K 5 HOH B 64 465 143 HOH WAT . K 5 HOH B 65 466 144 HOH WAT . K 5 HOH B 66 467 145 HOH WAT . K 5 HOH B 67 468 146 HOH WAT . K 5 HOH B 68 469 147 HOH WAT . K 5 HOH B 69 470 148 HOH WAT . K 5 HOH B 70 471 149 HOH WAT . K 5 HOH B 71 472 151 HOH WAT . K 5 HOH B 72 473 152 HOH WAT . K 5 HOH B 73 474 153 HOH WAT . K 5 HOH B 74 475 154 HOH WAT . K 5 HOH B 75 476 155 HOH WAT . K 5 HOH B 76 477 156 HOH WAT . K 5 HOH B 77 478 157 HOH WAT . K 5 HOH B 78 479 158 HOH WAT . K 5 HOH B 79 480 159 HOH WAT . K 5 HOH B 80 481 160 HOH WAT . K 5 HOH B 81 482 161 HOH WAT . K 5 HOH B 82 483 162 HOH WAT . K 5 HOH B 83 484 163 HOH WAT . K 5 HOH B 84 485 167 HOH WAT . K 5 HOH B 85 486 169 HOH WAT . K 5 HOH B 86 487 171 HOH WAT . K 5 HOH B 87 488 176 HOH WAT . K 5 HOH B 88 489 181 HOH WAT . K 5 HOH B 89 490 182 HOH WAT . K 5 HOH B 90 491 185 HOH WAT . K 5 HOH B 91 492 186 HOH WAT . K 5 HOH B 92 493 187 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id D _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x -9.033 _atom_site.Cartn_y 25.223 _atom_site.Cartn_z 25.455 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 28.16 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 302 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 8 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 25 _model_server_stats.query_time_ms 334 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #