data_1M2B # _model_server_result.job_id LZeEjOuNxffktW_hiQODug _model_server_result.datetime_utc '2024-10-13 02:30:39' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1m2b # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":301}' # _entry.id 1M2B # _exptl.entry_id 1M2B _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 175.82 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 109.8 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1M2B _cell.length_a 67.3 _cell.length_b 59.8 _cell.length_c 46.9 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1M2B _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A SG CYS 9 A CYS 9 1_555 C FE1 FES . A FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 22 A CYS 22 1_555 C FE1 FES . A FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? metalc ? metalc3 A OG SER 55 A SER 55 1_555 C FE2 FES . A FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.967 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 59 A CYS 59 1_555 C FE2 FES . A FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? metalc ? metalc5 B SG CYS 9 B CYS 9 1_555 D FE1 FES . B FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc6 B SG CYS 22 B CYS 22 1_555 D FE1 FES . B FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? metalc ? metalc7 B OG SER 55 B SER 55 1_555 D FE2 FES . B FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? metalc ? metalc8 B SG CYS 59 B CYS 59 1_555 D FE2 FES . B FES 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? # _chem_comp.formula 'Fe2 S2' _chem_comp.formula_weight 175.82 _chem_comp.id FES _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag FE1 S1 FES sing 83 n n FE1 S2 FES sing 84 n n FE2 S1 FES sing 85 n n FE2 S2 FES sing 86 n n # _atom_sites.entry_id 1M2B _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.014859 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.00535 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.016722 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.022662 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 FES A 1 301 1 FES FES . D 2 FES B 1 301 1 FES FES . E 3 HOH A 1 302 2 HOH WAT . E 3 HOH A 2 303 4 HOH WAT . E 3 HOH A 3 304 5 HOH WAT . E 3 HOH A 4 305 6 HOH WAT . E 3 HOH A 5 306 7 HOH WAT . E 3 HOH A 6 307 8 HOH WAT . E 3 HOH A 7 308 9 HOH WAT . E 3 HOH A 8 309 10 HOH WAT . E 3 HOH A 9 310 11 HOH WAT . E 3 HOH A 10 311 12 HOH WAT . E 3 HOH A 11 312 13 HOH WAT . E 3 HOH A 12 313 14 HOH WAT . E 3 HOH A 13 314 15 HOH WAT . E 3 HOH A 14 315 16 HOH WAT . E 3 HOH A 15 316 17 HOH WAT . E 3 HOH A 16 317 18 HOH WAT . E 3 HOH A 17 318 19 HOH WAT . E 3 HOH A 18 319 20 HOH WAT . E 3 HOH A 19 320 21 HOH WAT . E 3 HOH A 20 321 22 HOH WAT . E 3 HOH A 21 322 23 HOH WAT . E 3 HOH A 22 323 24 HOH WAT . E 3 HOH A 23 324 25 HOH WAT . E 3 HOH A 24 325 26 HOH WAT . E 3 HOH A 25 326 27 HOH WAT . E 3 HOH A 26 327 28 HOH WAT . E 3 HOH A 27 328 29 HOH WAT . E 3 HOH A 28 329 30 HOH WAT . E 3 HOH A 29 330 31 HOH WAT . E 3 HOH A 30 331 32 HOH WAT . E 3 HOH A 31 332 33 HOH WAT . E 3 HOH A 32 333 34 HOH WAT . E 3 HOH A 33 334 35 HOH WAT . E 3 HOH A 34 335 36 HOH WAT . E 3 HOH A 35 336 37 HOH WAT . E 3 HOH A 36 337 38 HOH WAT . E 3 HOH A 37 338 39 HOH WAT . E 3 HOH A 38 339 40 HOH WAT . E 3 HOH A 39 340 41 HOH WAT . E 3 HOH A 40 341 42 HOH WAT . E 3 HOH A 41 342 43 HOH WAT . E 3 HOH A 42 343 44 HOH WAT . E 3 HOH A 43 344 45 HOH WAT . E 3 HOH A 44 345 46 HOH WAT . E 3 HOH A 45 346 47 HOH WAT . E 3 HOH A 46 347 48 HOH WAT . E 3 HOH A 47 348 49 HOH WAT . E 3 HOH A 48 349 50 HOH WAT . E 3 HOH A 49 350 51 HOH WAT . E 3 HOH A 50 351 52 HOH WAT . E 3 HOH A 51 352 53 HOH WAT . E 3 HOH A 52 353 54 HOH WAT . E 3 HOH A 53 354 55 HOH WAT . E 3 HOH A 54 355 56 HOH WAT . E 3 HOH A 55 356 57 HOH WAT . E 3 HOH A 56 357 58 HOH WAT . E 3 HOH A 57 358 59 HOH WAT . E 3 HOH A 58 359 60 HOH WAT . E 3 HOH A 59 360 61 HOH WAT . E 3 HOH A 60 361 62 HOH WAT . E 3 HOH A 61 362 63 HOH WAT . E 3 HOH A 62 363 64 HOH WAT . E 3 HOH A 63 364 65 HOH WAT . E 3 HOH A 64 365 66 HOH WAT . E 3 HOH A 65 366 67 HOH WAT . E 3 HOH A 66 367 68 HOH WAT . E 3 HOH A 67 368 69 HOH WAT . E 3 HOH A 68 369 70 HOH WAT . E 3 HOH A 69 370 71 HOH WAT . E 3 HOH A 70 371 72 HOH WAT . E 3 HOH A 71 372 74 HOH WAT . E 3 HOH A 72 373 75 HOH WAT . E 3 HOH A 73 374 76 HOH WAT . E 3 HOH A 74 375 77 HOH WAT . E 3 HOH A 75 376 78 HOH WAT . E 3 HOH A 76 377 79 HOH WAT . E 3 HOH A 77 378 80 HOH WAT . E 3 HOH A 78 379 81 HOH WAT . E 3 HOH A 79 380 82 HOH WAT . E 3 HOH A 80 381 83 HOH WAT . E 3 HOH A 81 382 84 HOH WAT . E 3 HOH A 82 383 85 HOH WAT . E 3 HOH A 83 384 86 HOH WAT . E 3 HOH A 84 385 87 HOH WAT . E 3 HOH A 85 386 88 HOH WAT . E 3 HOH A 86 387 89 HOH WAT . E 3 HOH A 87 388 90 HOH WAT . E 3 HOH A 88 389 91 HOH WAT . E 3 HOH A 89 390 92 HOH WAT . E 3 HOH A 90 391 93 HOH WAT . E 3 HOH A 91 392 94 HOH WAT . E 3 HOH A 92 393 95 HOH WAT . E 3 HOH A 93 394 96 HOH WAT . E 3 HOH A 94 395 97 HOH WAT . E 3 HOH A 95 396 98 HOH WAT . E 3 HOH A 96 397 99 HOH WAT . E 3 HOH A 97 398 100 HOH WAT . E 3 HOH A 98 399 101 HOH WAT . E 3 HOH A 99 400 102 HOH WAT . E 3 HOH A 100 401 103 HOH WAT . E 3 HOH A 101 402 104 HOH WAT . E 3 HOH A 102 403 105 HOH WAT . E 3 HOH A 103 404 106 HOH WAT . E 3 HOH A 104 405 144 HOH WAT . E 3 HOH A 105 406 188 HOH WAT . F 3 HOH B 1 302 1 HOH WAT . F 3 HOH B 2 303 3 HOH WAT . F 3 HOH B 3 304 73 HOH WAT . F 3 HOH B 4 305 107 HOH WAT . F 3 HOH B 5 306 108 HOH WAT . F 3 HOH B 6 307 109 HOH WAT . F 3 HOH B 7 308 110 HOH WAT . F 3 HOH B 8 309 111 HOH WAT . F 3 HOH B 9 310 112 HOH WAT . F 3 HOH B 10 311 113 HOH WAT . F 3 HOH B 11 312 114 HOH WAT . F 3 HOH B 12 313 115 HOH WAT . F 3 HOH B 13 314 116 HOH WAT . F 3 HOH B 14 315 117 HOH WAT . F 3 HOH B 15 316 118 HOH WAT . F 3 HOH B 16 317 119 HOH WAT . F 3 HOH B 17 318 120 HOH WAT . F 3 HOH B 18 319 121 HOH WAT . F 3 HOH B 19 320 122 HOH WAT . F 3 HOH B 20 321 123 HOH WAT . F 3 HOH B 21 322 124 HOH WAT . F 3 HOH B 22 323 125 HOH WAT . F 3 HOH B 23 324 126 HOH WAT . F 3 HOH B 24 325 127 HOH WAT . F 3 HOH B 25 326 128 HOH WAT . F 3 HOH B 26 327 129 HOH WAT . F 3 HOH B 27 328 130 HOH WAT . F 3 HOH B 28 329 131 HOH WAT . F 3 HOH B 29 330 132 HOH WAT . F 3 HOH B 30 331 133 HOH WAT . F 3 HOH B 31 332 134 HOH WAT . F 3 HOH B 32 333 135 HOH WAT . F 3 HOH B 33 334 136 HOH WAT . F 3 HOH B 34 335 137 HOH WAT . F 3 HOH B 35 336 138 HOH WAT . F 3 HOH B 36 337 139 HOH WAT . F 3 HOH B 37 338 140 HOH WAT . F 3 HOH B 38 339 141 HOH WAT . F 3 HOH B 39 340 142 HOH WAT . F 3 HOH B 40 341 143 HOH WAT . F 3 HOH B 41 342 145 HOH WAT . F 3 HOH B 42 343 146 HOH WAT . F 3 HOH B 43 344 147 HOH WAT . F 3 HOH B 44 345 148 HOH WAT . F 3 HOH B 45 346 149 HOH WAT . F 3 HOH B 46 347 150 HOH WAT . F 3 HOH B 47 348 151 HOH WAT . F 3 HOH B 48 349 152 HOH WAT . F 3 HOH B 49 350 153 HOH WAT . F 3 HOH B 50 351 154 HOH WAT . F 3 HOH B 51 352 155 HOH WAT . F 3 HOH B 52 353 156 HOH WAT . F 3 HOH B 53 354 157 HOH WAT . F 3 HOH B 54 355 158 HOH WAT . F 3 HOH B 55 356 159 HOH WAT . F 3 HOH B 56 357 160 HOH WAT . F 3 HOH B 57 358 161 HOH WAT . F 3 HOH B 58 359 162 HOH WAT . F 3 HOH B 59 360 163 HOH WAT . F 3 HOH B 60 361 164 HOH WAT . F 3 HOH B 61 362 165 HOH WAT . F 3 HOH B 62 363 166 HOH WAT . F 3 HOH B 63 364 167 HOH WAT . F 3 HOH B 64 365 168 HOH WAT . F 3 HOH B 65 366 169 HOH WAT . F 3 HOH B 66 367 170 HOH WAT . F 3 HOH B 67 368 171 HOH WAT . F 3 HOH B 68 369 172 HOH WAT . F 3 HOH B 69 370 173 HOH WAT . F 3 HOH B 70 371 174 HOH WAT . F 3 HOH B 71 372 175 HOH WAT . F 3 HOH B 72 373 176 HOH WAT . F 3 HOH B 73 374 177 HOH WAT . F 3 HOH B 74 375 178 HOH WAT . F 3 HOH B 75 376 179 HOH WAT . F 3 HOH B 76 377 180 HOH WAT . F 3 HOH B 77 378 181 HOH WAT . F 3 HOH B 78 379 182 HOH WAT . F 3 HOH B 79 380 183 HOH WAT . F 3 HOH B 80 381 184 HOH WAT . F 3 HOH B 81 382 185 HOH WAT . F 3 HOH B 82 383 186 HOH WAT . F 3 HOH B 83 384 187 HOH WAT . F 3 HOH B 84 385 189 HOH WAT . F 3 HOH B 85 386 190 HOH WAT . F 3 HOH B 86 387 191 HOH WAT . F 3 HOH B 87 388 192 HOH WAT . F 3 HOH B 88 389 193 HOH WAT . F 3 HOH B 89 390 194 HOH WAT . F 3 HOH B 90 391 195 HOH WAT . F 3 HOH B 91 392 196 HOH WAT . F 3 HOH B 92 393 197 HOH WAT . F 3 HOH B 93 394 198 HOH WAT . F 3 HOH B 94 395 199 HOH WAT . F 3 HOH B 95 396 200 HOH WAT . F 3 HOH B 96 397 201 HOH WAT . F 3 HOH B 97 398 202 HOH WAT . F 3 HOH B 98 399 203 HOH WAT . F 3 HOH B 99 400 204 HOH WAT . F 3 HOH B 100 401 205 HOH WAT . F 3 HOH B 101 402 206 HOH WAT . F 3 HOH B 102 403 207 HOH WAT . F 3 HOH B 103 404 208 HOH WAT . F 3 HOH B 104 405 209 HOH WAT . F 3 HOH B 105 406 210 HOH WAT . F 3 HOH B 106 407 211 HOH WAT . F 3 HOH B 107 408 212 HOH WAT . F 3 HOH B 108 409 213 HOH WAT . F 3 HOH B 109 410 214 HOH WAT . F 3 HOH B 110 411 215 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 FE FE1 FES . . . C 2 -5.497 16.657 33.832 1 11.24 ? FE1 FES 301 A 1 HETATM 2 FE FE2 FES . . . C 2 -6.195 16.773 31.235 1 13.76 ? FE2 FES 301 A 1 HETATM 3 S S1 FES . . . C 2 -6.027 18.485 32.61 1 13.83 ? S1 FES 301 A 1 HETATM 4 S S2 FES . . . C 2 -5.865 14.899 32.536 1 12.58 ? S2 FES 301 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 18 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 275 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 4 #