data_1MQO # _model_server_result.job_id YVO5ajMcwszs6OFGx5kFBw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-24 15:51:46' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1mqo # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":2}' # _entry.id 1MQO # _exptl.entry_id 1MQO _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 112.411 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CADMIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 93.24 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1MQO _cell.length_a 53.26 _cell.length_b 61.38 _cell.length_c 69.65 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1MQO _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N ? 2 D N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 B CD CD . A CD 1 1_555 A NE2 HIS 86 A HIS 116 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc ? metalc2 B CD CD . A CD 1 1_555 A ND1 HIS 88 A HIS 118 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? metalc ? metalc3 B CD CD . A CD 1 1_555 A OD1 ASP 90 A ASP 120 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.887 ? metalc ? metalc4 B CD CD . A CD 1 1_555 A OD2 ASP 90 A ASP 120 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? metalc ? metalc5 B CD CD . A CD 1 1_555 A NE2 HIS 149 A HIS 196 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.438 ? metalc ? metalc6 B CD CD . A CD 1 1_555 E O3 CIT . A CIT 300 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.222 ? metalc ? metalc7 B CD CD . A CD 1 1_555 E O4 CIT . A CIT 300 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.543 ? metalc ? metalc8 D CD CD . A CD 2 1_555 A SG CYS 168 A CYS 221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? metalc ? metalc9 D CD CD . A CD 2 1_555 A NE2 HIS 210 A HIS 263 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? metalc ? metalc10 D CD CD . A CD 2 1_555 E O7 CIT . A CIT 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.611 ? metalc ? metalc11 D CD CD . A CD 2 1_555 E O6 CIT . A CIT 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.244 ? metalc ? metalc12 D CD CD . A CD 2 1_555 E O3 CIT . A CIT 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc13 D CD CD . A CD 2 1_555 F O HOH . A HOH 335 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.439 ? metalc ? metalc14 C CD CD . A CD 3 1_555 A NE2 HIS 86 A HIS 116 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? metalc ? metalc15 C CD CD . A CD 3 1_555 A OD2 ASP 90 A ASP 120 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.926 ? metalc ? metalc16 C CD CD . A CD 3 1_555 A OD1 ASP 90 A ASP 120 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.619 ? metalc ? metalc17 C CD CD . A CD 3 1_555 A NE2 HIS 149 A HIS 196 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? metalc ? metalc18 C CD CD . A CD 3 1_555 E O3 CIT . A CIT 300 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.06 ? # _chem_comp.formula 'Cd 2' _chem_comp.formula_weight 112.411 _chem_comp.id CD _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CADMIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1MQO _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.018776 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.001063 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.016292 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.01438 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 CD A 1 1 1 CD CD . C 2 CD A 1 3 3 CD CD . D 2 CD A 1 2 2 CD CD . E 3 CIT A 1 300 300 CIT CIT . F 4 HOH A 1 301 1 HOH WAT . F 4 HOH A 2 302 2 HOH WAT . F 4 HOH A 3 303 3 HOH WAT . F 4 HOH A 4 304 4 HOH WAT . F 4 HOH A 5 305 5 HOH WAT . F 4 HOH A 6 306 6 HOH WAT . F 4 HOH A 7 307 7 HOH WAT . F 4 HOH A 8 308 8 HOH WAT . F 4 HOH A 9 309 9 HOH WAT . F 4 HOH A 10 310 10 HOH WAT . F 4 HOH A 11 311 11 HOH WAT . F 4 HOH A 12 312 12 HOH WAT . F 4 HOH A 13 313 13 HOH WAT . F 4 HOH A 14 314 14 HOH WAT . F 4 HOH A 15 315 15 HOH WAT . F 4 HOH A 16 316 16 HOH WAT . F 4 HOH A 17 317 17 HOH WAT . F 4 HOH A 18 318 18 HOH WAT . F 4 HOH A 19 319 19 HOH WAT . F 4 HOH A 20 320 20 HOH WAT . F 4 HOH A 21 321 21 HOH WAT . F 4 HOH A 22 322 22 HOH WAT . F 4 HOH A 23 323 23 HOH WAT . F 4 HOH A 24 324 24 HOH WAT . F 4 HOH A 25 325 25 HOH WAT . F 4 HOH A 26 326 26 HOH WAT . F 4 HOH A 27 327 27 HOH WAT . F 4 HOH A 28 328 28 HOH WAT . F 4 HOH A 29 329 29 HOH WAT . F 4 HOH A 30 330 30 HOH WAT . F 4 HOH A 31 331 31 HOH WAT . F 4 HOH A 32 332 32 HOH WAT . F 4 HOH A 33 333 33 HOH WAT . F 4 HOH A 34 334 34 HOH WAT . F 4 HOH A 35 335 35 HOH WAT . F 4 HOH A 36 336 36 HOH WAT . F 4 HOH A 37 337 37 HOH WAT . F 4 HOH A 38 338 38 HOH WAT . F 4 HOH A 39 339 39 HOH WAT . F 4 HOH A 40 340 40 HOH WAT . F 4 HOH A 41 341 41 HOH WAT . F 4 HOH A 42 342 42 HOH WAT . F 4 HOH A 43 343 43 HOH WAT . F 4 HOH A 44 344 44 HOH WAT . F 4 HOH A 45 345 45 HOH WAT . F 4 HOH A 46 346 46 HOH WAT . F 4 HOH A 47 347 47 HOH WAT . F 4 HOH A 48 348 48 HOH WAT . F 4 HOH A 49 349 49 HOH WAT . F 4 HOH A 50 350 50 HOH WAT . F 4 HOH A 51 351 51 HOH WAT . F 4 HOH A 52 352 52 HOH WAT . F 4 HOH A 53 353 53 HOH WAT . F 4 HOH A 54 354 54 HOH WAT . F 4 HOH A 55 355 55 HOH WAT . F 4 HOH A 56 356 56 HOH WAT . F 4 HOH A 57 357 57 HOH WAT . F 4 HOH A 58 358 58 HOH WAT . F 4 HOH A 59 359 59 HOH WAT . F 4 HOH A 60 360 60 HOH WAT . F 4 HOH A 61 361 61 HOH WAT . F 4 HOH A 62 362 62 HOH WAT . F 4 HOH A 63 363 63 HOH WAT . F 4 HOH A 64 364 64 HOH WAT . F 4 HOH A 65 365 65 HOH WAT . F 4 HOH A 66 366 66 HOH WAT . F 4 HOH A 67 367 67 HOH WAT . F 4 HOH A 68 368 68 HOH WAT . F 4 HOH A 69 369 69 HOH WAT . F 4 HOH A 70 370 70 HOH WAT . F 4 HOH A 71 371 71 HOH WAT . F 4 HOH A 72 372 72 HOH WAT . F 4 HOH A 73 373 73 HOH WAT . F 4 HOH A 74 374 74 HOH WAT . F 4 HOH A 75 375 75 HOH WAT . F 4 HOH A 76 376 76 HOH WAT . F 4 HOH A 77 377 77 HOH WAT . F 4 HOH A 78 378 78 HOH WAT . F 4 HOH A 79 379 79 HOH WAT . F 4 HOH A 80 380 80 HOH WAT . F 4 HOH A 81 381 81 HOH WAT . F 4 HOH A 82 382 82 HOH WAT . F 4 HOH A 83 383 83 HOH WAT . F 4 HOH A 84 384 84 HOH WAT . F 4 HOH A 85 385 85 HOH WAT . F 4 HOH A 86 386 86 HOH WAT . F 4 HOH A 87 387 87 HOH WAT . F 4 HOH A 88 388 88 HOH WAT . F 4 HOH A 89 389 89 HOH WAT . F 4 HOH A 90 390 90 HOH WAT . F 4 HOH A 91 391 91 HOH WAT . F 4 HOH A 92 392 92 HOH WAT . F 4 HOH A 93 393 93 HOH WAT . F 4 HOH A 94 394 94 HOH WAT . F 4 HOH A 95 395 95 HOH WAT . F 4 HOH A 96 396 96 HOH WAT . F 4 HOH A 97 397 97 HOH WAT . F 4 HOH A 98 398 98 HOH WAT . F 4 HOH A 99 399 99 HOH WAT . F 4 HOH A 100 400 100 HOH WAT . F 4 HOH A 101 401 101 HOH WAT . F 4 HOH A 102 402 102 HOH WAT . F 4 HOH A 103 403 103 HOH WAT . F 4 HOH A 104 404 104 HOH WAT . F 4 HOH A 105 405 105 HOH WAT . F 4 HOH A 106 406 106 HOH WAT . F 4 HOH A 107 407 107 HOH WAT . F 4 HOH A 108 408 108 HOH WAT . F 4 HOH A 109 409 109 HOH WAT . F 4 HOH A 110 410 110 HOH WAT . F 4 HOH A 111 411 111 HOH WAT . F 4 HOH A 112 412 112 HOH WAT . F 4 HOH A 113 413 113 HOH WAT . F 4 HOH A 114 414 114 HOH WAT . F 4 HOH A 115 415 115 HOH WAT . F 4 HOH A 116 416 116 HOH WAT . F 4 HOH A 117 417 117 HOH WAT . F 4 HOH A 118 418 118 HOH WAT . F 4 HOH A 119 419 119 HOH WAT . F 4 HOH A 120 420 120 HOH WAT . F 4 HOH A 121 421 121 HOH WAT . F 4 HOH A 122 422 122 HOH WAT . F 4 HOH A 123 423 123 HOH WAT . F 4 HOH A 124 424 124 HOH WAT . F 4 HOH A 125 425 125 HOH WAT . F 4 HOH A 126 426 126 HOH WAT . F 4 HOH A 127 427 127 HOH WAT . F 4 HOH A 128 428 128 HOH WAT . F 4 HOH A 129 429 129 HOH WAT . F 4 HOH A 130 430 130 HOH WAT . F 4 HOH A 131 431 131 HOH WAT . F 4 HOH A 132 432 132 HOH WAT . F 4 HOH A 133 433 133 HOH WAT . F 4 HOH A 134 434 134 HOH WAT . F 4 HOH A 135 435 135 HOH WAT . F 4 HOH A 136 436 136 HOH WAT . F 4 HOH A 137 437 137 HOH WAT . F 4 HOH A 138 438 138 HOH WAT . F 4 HOH A 139 439 139 HOH WAT . F 4 HOH A 140 440 140 HOH WAT . F 4 HOH A 141 441 141 HOH WAT . F 4 HOH A 142 442 142 HOH WAT . F 4 HOH A 143 443 143 HOH WAT . F 4 HOH A 144 444 144 HOH WAT . F 4 HOH A 145 445 145 HOH WAT . F 4 HOH A 146 446 146 HOH WAT . F 4 HOH A 147 447 147 HOH WAT . F 4 HOH A 148 448 148 HOH WAT . F 4 HOH A 149 449 149 HOH WAT . F 4 HOH A 150 450 150 HOH WAT . F 4 HOH A 151 451 151 HOH WAT . F 4 HOH A 152 452 152 HOH WAT . F 4 HOH A 153 453 153 HOH WAT . F 4 HOH A 154 454 154 HOH WAT . F 4 HOH A 155 455 155 HOH WAT . F 4 HOH A 156 456 156 HOH WAT . F 4 HOH A 157 457 157 HOH WAT . F 4 HOH A 158 458 158 HOH WAT . F 4 HOH A 159 459 159 HOH WAT . F 4 HOH A 160 460 160 HOH WAT . F 4 HOH A 161 461 161 HOH WAT . F 4 HOH A 162 462 162 HOH WAT . F 4 HOH A 163 463 163 HOH WAT . F 4 HOH A 164 464 164 HOH WAT . F 4 HOH A 165 465 165 HOH WAT . F 4 HOH A 166 466 166 HOH WAT . F 4 HOH A 167 467 167 HOH WAT . F 4 HOH A 168 468 168 HOH WAT . F 4 HOH A 169 469 169 HOH WAT . F 4 HOH A 170 470 170 HOH WAT . F 4 HOH A 171 471 171 HOH WAT . F 4 HOH A 172 472 172 HOH WAT . F 4 HOH A 173 473 173 HOH WAT . F 4 HOH A 174 474 174 HOH WAT . F 4 HOH A 175 475 175 HOH WAT . F 4 HOH A 176 476 176 HOH WAT . F 4 HOH A 177 477 177 HOH WAT . F 4 HOH A 178 478 178 HOH WAT . F 4 HOH A 179 479 179 HOH WAT . F 4 HOH A 180 480 180 HOH WAT . F 4 HOH A 181 481 181 HOH WAT . F 4 HOH A 182 482 182 HOH WAT . F 4 HOH A 183 483 183 HOH WAT . F 4 HOH A 184 484 184 HOH WAT . F 4 HOH A 185 485 185 HOH WAT . F 4 HOH A 186 486 186 HOH WAT . F 4 HOH A 187 487 187 HOH WAT . F 4 HOH A 188 488 188 HOH WAT . F 4 HOH A 189 489 189 HOH WAT . F 4 HOH A 190 490 190 HOH WAT . F 4 HOH A 191 491 191 HOH WAT . F 4 HOH A 192 492 192 HOH WAT . F 4 HOH A 193 493 193 HOH WAT . F 4 HOH A 194 494 194 HOH WAT . F 4 HOH A 195 495 195 HOH WAT . F 4 HOH A 196 496 196 HOH WAT . F 4 HOH A 197 497 197 HOH WAT . F 4 HOH A 198 498 198 HOH WAT . F 4 HOH A 199 499 199 HOH WAT . F 4 HOH A 200 500 200 HOH WAT . F 4 HOH A 201 501 201 HOH WAT . F 4 HOH A 202 502 202 HOH WAT . F 4 HOH A 203 503 203 HOH WAT . F 4 HOH A 204 504 204 HOH WAT . F 4 HOH A 205 505 205 HOH WAT . F 4 HOH A 206 506 206 HOH WAT . F 4 HOH A 207 507 207 HOH WAT . F 4 HOH A 208 508 208 HOH WAT . F 4 HOH A 209 509 209 HOH WAT . F 4 HOH A 210 510 210 HOH WAT . F 4 HOH A 211 511 211 HOH WAT . F 4 HOH A 212 512 212 HOH WAT . F 4 HOH A 213 513 213 HOH WAT . F 4 HOH A 214 514 214 HOH WAT . F 4 HOH A 215 515 215 HOH WAT . F 4 HOH A 216 516 216 HOH WAT . F 4 HOH A 217 517 217 HOH WAT . F 4 HOH A 218 518 218 HOH WAT . F 4 HOH A 219 519 219 HOH WAT . F 4 HOH A 220 520 220 HOH WAT . F 4 HOH A 221 521 221 HOH WAT . F 4 HOH A 222 522 222 HOH WAT . F 4 HOH A 223 523 223 HOH WAT . F 4 HOH A 224 524 224 HOH WAT . F 4 HOH A 225 525 225 HOH WAT . F 4 HOH A 226 526 226 HOH WAT . F 4 HOH A 227 527 227 HOH WAT . F 4 HOH A 228 528 228 HOH WAT . F 4 HOH A 229 529 229 HOH WAT . F 4 HOH A 230 530 230 HOH WAT . F 4 HOH A 231 531 231 HOH WAT . F 4 HOH A 232 532 232 HOH WAT . F 4 HOH A 233 533 233 HOH WAT . F 4 HOH A 234 534 234 HOH WAT . F 4 HOH A 235 535 235 HOH WAT . F 4 HOH A 236 536 236 HOH WAT . F 4 HOH A 237 537 237 HOH WAT . F 4 HOH A 238 538 238 HOH WAT . F 4 HOH A 239 539 239 HOH WAT . F 4 HOH A 240 540 240 HOH WAT . F 4 HOH A 241 541 241 HOH WAT . F 4 HOH A 242 542 242 HOH WAT . F 4 HOH A 243 543 243 HOH WAT . F 4 HOH A 244 544 244 HOH WAT . F 4 HOH A 245 545 245 HOH WAT . F 4 HOH A 246 546 246 HOH WAT . F 4 HOH A 247 547 247 HOH WAT . F 4 HOH A 248 548 248 HOH WAT . F 4 HOH A 249 549 249 HOH WAT . F 4 HOH A 250 550 250 HOH WAT . F 4 HOH A 251 551 251 HOH WAT . F 4 HOH A 252 552 252 HOH WAT . F 4 HOH A 253 553 253 HOH WAT . F 4 HOH A 254 554 254 HOH WAT . F 4 HOH A 255 555 255 HOH WAT . F 4 HOH A 256 556 256 HOH WAT . F 4 HOH A 257 557 257 HOH WAT . F 4 HOH A 258 558 258 HOH WAT . F 4 HOH A 259 559 259 HOH WAT . F 4 HOH A 260 560 260 HOH WAT . F 4 HOH A 261 561 261 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CD _atom_site.label_atom_id CD _atom_site.label_comp_id CD _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id D _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 10.545 _atom_site.Cartn_y 7.266 _atom_site.Cartn_z 24.067 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 12.47 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CD _atom_site.auth_comp_id CD _atom_site.auth_seq_id 2 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 6 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 295 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #