data_1MWT
#
_model_server_result.job_id            ZZDrYede2VScr26ZoSpHTQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-24 11:17:45' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1mwt 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":1003}' 
#
_entry.id    1MWT 
#
_exptl.entry_id    1MWT 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              112.411 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CADMIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    9 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            1MWT 
_cell.length_a            80.545 
_cell.length_b            103.272 
_cell.length_c            186.825 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1MWT 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? monomeric 1 author_defined_assembly 1 
? monomeric 1 author_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,C,D,E,F,G,H,I,R 1 1 
B,J,K,L,M,N,O,P,Q,S 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 C N N 
? 2 D N N 
? 2 E N N 
? 2 F N N 
? 2 J N N 
? 2 K N N 
? 2 L N N 
? 2 M N N 
? 2 N N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A OG SER 381 A SER 403 1_555 I C7 PNM . A PNM 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.365 sing 
covale ? covale2 B OG SER 381 B SER 403 1_555 Q C7 PNM . B PNM 708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.372 sing 
metalc ? metalc1 A OE1 GLU 37 A GLU 59 4_455 N CD CD . B CD 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.882 ? 
metalc ? metalc2 A OE2 GLU 37 A GLU 59 4_455 N CD CD . B CD 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.554 ? 
metalc ? metalc3 A O GLY 113 A GLY 135 1_555 D CD CD . A CD 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.206 ? 
metalc ? metalc4 A ND1 HIS 121 A HIS 143 1_555 C CD CD . A CD 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? 
metalc ? metalc5 A OE1 GLU 123 A GLU 145 1_555 C CD CD . A CD 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.197 ? 
metalc ? metalc6 A OE2 GLU 123 A GLU 145 1_555 J CD CD . B CD 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? 
metalc ? metalc7 A OE1 GLU 123 A GLU 145 1_555 J CD CD . B CD 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? 
metalc ? metalc8 A OD2 ASP 187 A ASP 209 1_555 K CD CD . B CD 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? 
metalc ? metalc9 A OD1 ASP 187 A ASP 209 1_555 K CD CD . B CD 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.858 ? 
metalc ? metalc10 A NE2 HIS 210 A HIS 232 1_555 E CD CD . A CD 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? 
metalc ? metalc11 A NE2 HIS 289 A HIS 311 1_555 D CD CD . A CD 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? 
metalc ? metalc12 A OD2 ASP 298 A ASP 320 1_555 F CD CD . A CD 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? 
metalc ? metalc13 C CD CD . A CD 1001 1_555 G CL CL . A CL 1005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.46 ? 
metalc ? metalc14 C CD CD . A CD 1001 1_555 R O HOH . A HOH 1141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.245 ? 
metalc ? metalc15 C CD CD . A CD 1001 1_555 B OE1 GLU 123 B GLU 145 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? 
metalc ? metalc16 C CD CD . A CD 1001 1_555 B OE2 GLU 123 B GLU 145 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.473 ? 
metalc ? metalc17 D CD CD . A CD 1002 1_555 H CL CL . A CL 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? 
metalc ? metalc18 D CD CD . A CD 1002 1_555 B OD1 ASP 187 B ASP 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.559 ? 
metalc ? metalc19 D CD CD . A CD 1002 1_555 B OD2 ASP 187 B ASP 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? 
metalc ? metalc20 F CD CD . A CD 1004 1_555 B OE2 GLU 128 B GLU 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.715 ? 
metalc ? metalc21 R O HOH . A HOH 1147 1_555 J CD CD . B CD 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.235 ? 
metalc ? metalc22 B O GLY 113 B GLY 135 1_555 K CD CD . B CD 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? 
metalc ? metalc23 B ND1 HIS 121 B HIS 143 1_555 J CD CD . B CD 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.21 ? 
metalc ? metalc24 B OE1 GLU 123 B GLU 145 1_555 J CD CD . B CD 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.117 ? 
metalc ? metalc25 B NE2 HIS 210 B HIS 232 1_555 N CD CD . B CD 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.397 ? 
metalc ? metalc26 B NE2 HIS 289 B HIS 311 1_555 K CD CD . B CD 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.211 ? 
metalc ? metalc27 B OD1 ASN 547 B ASN 569 1_555 L CD CD . B CD 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.577 ? 
metalc ? metalc28 B OD1 ASP 551 B ASP 573 1_555 L CD CD . B CD 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.724 ? 
metalc ? metalc29 B OD2 ASP 551 B ASP 573 1_555 L CD CD . B CD 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? 
metalc ? metalc30 B ND1 HIS 561 B HIS 583 1_555 M CD CD . B CD 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.88 ? 
metalc ? metalc31 B OD2 ASP 564 B ASP 586 1_555 M CD CD . B CD 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? 
metalc ? metalc32 B OG SER 621 B SER 643 1_555 M CD CD . B CD 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.641 ? 
metalc ? metalc33 J CD CD . B CD 701 1_555 O CL CL . B CL 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? 
metalc ? metalc34 K CD CD . B CD 702 1_555 P CL CL . B CL 707 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.507 ? 
#
_chem_comp.formula           'Cd 2' 
_chem_comp.formula_weight    112.411 
_chem_comp.id                CD 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CADMIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     1MWT 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.012415 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.009683 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.005353 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 CD A 1 1001 1 CD CD2 . 
D 2 CD A 1 1002 4 CD CD2 . 
E 2 CD A 1 1003 7 CD CD2 . 
F 2 CD A 1 1004 9 CD CD2 . 
G 3 CL A 1 1005 11 CL CL1 . 
H 3 CL A 1 1006 13 CL CL1 . 
I 4 PNM A 1 1007 403 PNM PGS . 
J 2 CD B 1 701 2 CD CD2 . 
K 2 CD B 1 702 3 CD CD2 . 
L 2 CD B 1 703 5 CD CD2 . 
M 2 CD B 1 704 6 CD CD2 . 
N 2 CD B 1 705 8 CD CD2 . 
O 3 CL B 1 706 10 CL CL1 . 
P 3 CL B 1 707 12 CL CL1 . 
Q 4 PNM B 1 708 403 PNM PGS . 
R 5 HOH A 1 1101 52 HOH WAT . 
R 5 HOH A 2 1102 62 HOH WAT . 
R 5 HOH A 3 1103 76 HOH WAT . 
R 5 HOH A 4 1104 69 HOH WAT . 
R 5 HOH A 5 1105 47 HOH WAT . 
R 5 HOH A 6 1106 18 HOH WAT . 
R 5 HOH A 7 1107 45 HOH WAT . 
R 5 HOH A 8 1108 49 HOH WAT . 
R 5 HOH A 9 1109 72 HOH WAT . 
R 5 HOH A 10 1110 5 HOH WAT . 
R 5 HOH A 11 1111 61 HOH WAT . 
R 5 HOH A 12 1112 73 HOH WAT . 
R 5 HOH A 13 1113 48 HOH WAT . 
R 5 HOH A 14 1114 55 HOH WAT . 
R 5 HOH A 15 1115 9 HOH WAT . 
R 5 HOH A 16 1116 50 HOH WAT . 
R 5 HOH A 17 1117 102 HOH WAT . 
R 5 HOH A 18 1118 3 HOH WAT . 
R 5 HOH A 19 1119 13 HOH WAT . 
R 5 HOH A 20 1120 58 HOH WAT . 
R 5 HOH A 21 1121 20 HOH WAT . 
R 5 HOH A 22 1122 7 HOH WAT . 
R 5 HOH A 23 1123 36 HOH WAT . 
R 5 HOH A 24 1124 42 HOH WAT . 
R 5 HOH A 25 1125 37 HOH WAT . 
R 5 HOH A 26 1126 44 HOH WAT . 
R 5 HOH A 27 1127 92 HOH WAT . 
R 5 HOH A 28 1128 101 HOH WAT . 
R 5 HOH A 29 1129 29 HOH WAT . 
R 5 HOH A 30 1130 82 HOH WAT . 
R 5 HOH A 31 1131 56 HOH WAT . 
R 5 HOH A 32 1132 14 HOH WAT . 
R 5 HOH A 33 1133 54 HOH WAT . 
R 5 HOH A 34 1134 83 HOH WAT . 
R 5 HOH A 35 1135 84 HOH WAT . 
R 5 HOH A 36 1136 34 HOH WAT . 
R 5 HOH A 37 1137 51 HOH WAT . 
R 5 HOH A 38 1138 40 HOH WAT . 
R 5 HOH A 39 1139 19 HOH WAT . 
R 5 HOH A 40 1140 21 HOH WAT . 
R 5 HOH A 41 1141 23 HOH WAT . 
R 5 HOH A 42 1142 80 HOH WAT . 
R 5 HOH A 43 1143 75 HOH WAT . 
R 5 HOH A 44 1144 99 HOH WAT . 
R 5 HOH A 45 1145 74 HOH WAT . 
R 5 HOH A 46 1146 77 HOH WAT . 
R 5 HOH A 47 1147 53 HOH WAT . 
R 5 HOH A 48 1148 35 HOH WAT . 
R 5 HOH A 49 1149 28 HOH WAT . 
R 5 HOH A 50 1150 24 HOH WAT . 
R 5 HOH A 51 1151 41 HOH WAT . 
R 5 HOH A 52 1152 98 HOH WAT . 
R 5 HOH A 53 1153 25 HOH WAT . 
R 5 HOH A 54 1154 15 HOH WAT . 
R 5 HOH A 55 1155 6 HOH WAT . 
R 5 HOH A 56 1156 8 HOH WAT . 
R 5 HOH A 57 1157 79 HOH WAT . 
R 5 HOH A 58 1158 87 HOH WAT . 
R 5 HOH A 59 1159 38 HOH WAT . 
R 5 HOH A 60 1160 81 HOH WAT . 
R 5 HOH A 61 1161 89 HOH WAT . 
R 5 HOH A 62 1162 59 HOH WAT . 
R 5 HOH A 63 1163 60 HOH WAT . 
S 5 HOH B 1 801 96 HOH WAT . 
S 5 HOH B 2 802 70 HOH WAT . 
S 5 HOH B 3 803 10 HOH WAT . 
S 5 HOH B 4 804 86 HOH WAT . 
S 5 HOH B 5 805 46 HOH WAT . 
S 5 HOH B 6 806 64 HOH WAT . 
S 5 HOH B 7 807 94 HOH WAT . 
S 5 HOH B 8 808 63 HOH WAT . 
S 5 HOH B 9 809 100 HOH WAT . 
S 5 HOH B 10 810 95 HOH WAT . 
S 5 HOH B 11 811 93 HOH WAT . 
S 5 HOH B 12 812 16 HOH WAT . 
S 5 HOH B 13 813 90 HOH WAT . 
S 5 HOH B 14 814 88 HOH WAT . 
S 5 HOH B 15 815 43 HOH WAT . 
S 5 HOH B 16 816 31 HOH WAT . 
S 5 HOH B 17 817 12 HOH WAT . 
S 5 HOH B 18 818 91 HOH WAT . 
S 5 HOH B 19 819 1 HOH WAT . 
S 5 HOH B 20 820 57 HOH WAT . 
S 5 HOH B 21 821 2 HOH WAT . 
S 5 HOH B 22 822 71 HOH WAT . 
S 5 HOH B 23 823 22 HOH WAT . 
S 5 HOH B 24 824 39 HOH WAT . 
S 5 HOH B 25 825 11 HOH WAT . 
S 5 HOH B 26 826 32 HOH WAT . 
S 5 HOH B 27 827 17 HOH WAT . 
S 5 HOH B 28 828 68 HOH WAT . 
S 5 HOH B 29 829 4 HOH WAT . 
S 5 HOH B 30 830 33 HOH WAT . 
S 5 HOH B 31 831 67 HOH WAT . 
S 5 HOH B 32 832 30 HOH WAT . 
S 5 HOH B 33 833 85 HOH WAT . 
S 5 HOH B 34 834 66 HOH WAT . 
S 5 HOH B 35 835 27 HOH WAT . 
S 5 HOH B 36 836 26 HOH WAT . 
S 5 HOH B 37 837 97 HOH WAT . 
S 5 HOH B 38 838 78 HOH WAT . 
S 5 HOH B 39 839 65 HOH WAT . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           CD 
_atom_site.label_atom_id         CD 
_atom_site.label_comp_id         CD 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         E 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               47.085 
_atom_site.Cartn_y               49.932 
_atom_site.Cartn_z               30.007 
_atom_site.occupancy             0.43 
_atom_site.B_iso_or_equiv        67.5 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          CD 
_atom_site.auth_comp_id          CD 
_atom_site.auth_seq_id           1003 
_atom_site.auth_asym_id          A 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              137 
_model_server_stats.parse_time_ms           116 
_model_server_stats.create_model_time_ms    20 
_model_server_stats.query_time_ms           354 
_model_server_stats.encode_time_ms          5 
_model_server_stats.element_count           1 
#