data_1N42 # _model_server_result.job_id sozxfPXBM8SgUV93ee7TmA _model_server_result.datetime_utc '2024-12-22 06:13:19' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1n42 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":410}' # _entry.id 1N42 # _exptl.entry_id 1N42 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 5 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 1N42 _cell.length_a 157.535 _cell.length_b 157.535 _cell.length_c 36.383 _cell.Z_PDB 9 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1N42 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 146 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'H 3' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O MET 26 A MET 26 1_555 B CA CA . A CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? metalc ? metalc2 A O GLY 28 A GLY 28 1_555 B CA CA . A CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.527 ? metalc ? metalc3 A O GLY 30 A GLY 30 1_555 B CA CA . A CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.425 ? metalc ? metalc4 A OE1 GLU 70 A GLU 70 1_555 B CA CA . A CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? metalc ? metalc5 A OE2 GLU 70 A GLU 70 1_555 B CA CA . A CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.687 ? metalc ? metalc6 A O LEU 98 A LEU 98 1_555 C CA CA . A CA 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.657 ? metalc ? metalc7 A O GLY 100 A GLY 100 1_555 C CA CA . A CA 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.509 ? metalc ? metalc8 A O GLY 102 A GLY 102 1_555 C CA CA . A CA 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.992 ? metalc ? metalc9 A OG1 THR 103 A THR 103 1_555 C CA CA . A CA 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.209 ? metalc ? metalc10 A OD1 ASP 142 A ASP 142 1_555 C CA CA . A CA 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.776 ? metalc ? metalc11 A O GLY 181 A GLY 181 1_555 D CA CA . A CA 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.462 ? metalc ? metalc12 A O LYS 184 A LYS 184 1_555 D CA CA . A CA 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? metalc ? metalc13 A O GLY 186 A GLY 186 1_555 D CA CA . A CA 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.287 ? metalc ? metalc14 A OD2 ASP 224 A ASP 224 1_555 E CA CA . A CA 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.654 ? metalc ? metalc15 A O ASP 224 A ASP 224 1_555 E CA CA . A CA 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.648 ? metalc ? metalc16 A OE1 GLU 226 A GLU 226 1_555 D CA CA . A CA 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.471 ? metalc ? metalc17 A OE2 GLU 226 A GLU 226 1_555 D CA CA . A CA 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? metalc ? metalc18 A O THR 227 A THR 227 1_555 E CA CA . A CA 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.913 ? metalc ? metalc19 A OE1 GLU 232 A GLU 232 1_555 E CA CA . A CA 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.195 ? metalc ? metalc20 A OE2 GLU 232 A GLU 232 1_555 E CA CA . A CA 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.703 ? metalc ? metalc21 A O MET 257 A MET 257 1_555 F CA CA . A CA 410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.138 ? metalc ? metalc22 A O GLY 259 A GLY 259 1_555 F CA CA . A CA 410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.747 ? metalc ? metalc23 A O GLY 261 A GLY 261 1_555 F CA CA . A CA 410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? metalc ? metalc24 A OD1 ASP 301 A ASP 301 1_555 F CA CA . A CA 410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.737 ? metalc ? metalc25 A OD2 ASP 301 A ASP 301 1_555 F CA CA . A CA 410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.466 ? metalc ? metalc26 B CA CA . A CA 401 1_555 J O HOH . A HOH 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? metalc ? metalc27 B CA CA . A CA 401 1_555 J O HOH . A HOH 621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.727 ? metalc ? metalc28 D CA CA . A CA 407 1_555 H S SO4 . A SO4 451 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.22 ? metalc ? metalc29 D CA CA . A CA 407 1_555 H O2 SO4 . A SO4 451 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.65 ? metalc ? metalc30 D CA CA . A CA 407 1_555 H O3 SO4 . A SO4 451 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.693 ? metalc ? metalc31 D CA CA . A CA 407 1_555 J O HOH . A HOH 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.568 ? metalc ? metalc32 E CA CA . A CA 408 1_555 J O HOH . A HOH 635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.883 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1N42 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.006348 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.003665 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.00733 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.027485 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 CA A 1 401 401 CA CA . C 2 CA A 1 404 404 CA CA . D 2 CA A 1 407 407 CA CA . E 2 CA A 1 408 408 CA CA . F 2 CA A 1 410 410 CA CA . G 3 SO4 A 1 450 450 SO4 SO4 . H 3 SO4 A 1 451 451 SO4 SO4 . I 3 SO4 A 1 452 452 SO4 SO4 . J 4 HOH A 1 500 500 HOH WAT . J 4 HOH A 2 501 501 HOH WAT . J 4 HOH A 3 502 502 HOH WAT . J 4 HOH A 4 503 503 HOH WAT . J 4 HOH A 5 504 504 HOH WAT . J 4 HOH A 6 505 505 HOH WAT . J 4 HOH A 7 506 506 HOH WAT . J 4 HOH A 8 507 507 HOH WAT . J 4 HOH A 9 508 508 HOH WAT . J 4 HOH A 10 509 509 HOH WAT . J 4 HOH A 11 510 510 HOH WAT . J 4 HOH A 12 511 511 HOH WAT . J 4 HOH A 13 513 513 HOH WAT . J 4 HOH A 14 514 514 HOH WAT . J 4 HOH A 15 515 515 HOH WAT . J 4 HOH A 16 516 516 HOH WAT . J 4 HOH A 17 517 517 HOH WAT . J 4 HOH A 18 518 518 HOH WAT . J 4 HOH A 19 519 519 HOH WAT . J 4 HOH A 20 520 520 HOH WAT . J 4 HOH A 21 521 521 HOH WAT . J 4 HOH A 22 523 523 HOH WAT . J 4 HOH A 23 524 524 HOH WAT . J 4 HOH A 24 525 525 HOH WAT . J 4 HOH A 25 526 526 HOH WAT . J 4 HOH A 26 527 527 HOH WAT . J 4 HOH A 27 528 528 HOH WAT . J 4 HOH A 28 529 529 HOH WAT . J 4 HOH A 29 530 530 HOH WAT . J 4 HOH A 30 531 531 HOH WAT . J 4 HOH A 31 532 532 HOH WAT . J 4 HOH A 32 533 533 HOH WAT . J 4 HOH A 33 534 534 HOH WAT . J 4 HOH A 34 535 535 HOH WAT . J 4 HOH A 35 536 536 HOH WAT . J 4 HOH A 36 537 537 HOH WAT . J 4 HOH A 37 538 538 HOH WAT . J 4 HOH A 38 539 539 HOH WAT . J 4 HOH A 39 540 540 HOH WAT . J 4 HOH A 40 542 542 HOH WAT . J 4 HOH A 41 543 543 HOH WAT . J 4 HOH A 42 544 544 HOH WAT . J 4 HOH A 43 545 545 HOH WAT . J 4 HOH A 44 546 546 HOH WAT . J 4 HOH A 45 547 547 HOH WAT . J 4 HOH A 46 548 548 HOH WAT . J 4 HOH A 47 549 549 HOH WAT . J 4 HOH A 48 550 550 HOH WAT . J 4 HOH A 49 551 551 HOH WAT . J 4 HOH A 50 552 552 HOH WAT . J 4 HOH A 51 553 553 HOH WAT . J 4 HOH A 52 554 554 HOH WAT . J 4 HOH A 53 555 555 HOH WAT . J 4 HOH A 54 556 556 HOH WAT . J 4 HOH A 55 557 557 HOH WAT . J 4 HOH A 56 558 558 HOH WAT . J 4 HOH A 57 559 559 HOH WAT . J 4 HOH A 58 560 560 HOH WAT . J 4 HOH A 59 562 562 HOH WAT . J 4 HOH A 60 563 563 HOH WAT . J 4 HOH A 61 564 564 HOH WAT . J 4 HOH A 62 565 565 HOH WAT . J 4 HOH A 63 566 566 HOH WAT . J 4 HOH A 64 567 567 HOH WAT . J 4 HOH A 65 568 568 HOH WAT . J 4 HOH A 66 569 569 HOH WAT . J 4 HOH A 67 570 570 HOH WAT . J 4 HOH A 68 571 571 HOH WAT . J 4 HOH A 69 573 573 HOH WAT . J 4 HOH A 70 574 574 HOH WAT . J 4 HOH A 71 575 575 HOH WAT . J 4 HOH A 72 576 576 HOH WAT . J 4 HOH A 73 577 577 HOH WAT . J 4 HOH A 74 578 578 HOH WAT . J 4 HOH A 75 579 579 HOH WAT . J 4 HOH A 76 580 580 HOH WAT . J 4 HOH A 77 581 581 HOH WAT . J 4 HOH A 78 582 582 HOH WAT . J 4 HOH A 79 583 583 HOH WAT . J 4 HOH A 80 584 584 HOH WAT . J 4 HOH A 81 585 585 HOH WAT . J 4 HOH A 82 586 586 HOH WAT . J 4 HOH A 83 587 587 HOH WAT . J 4 HOH A 84 588 588 HOH WAT . J 4 HOH A 85 589 589 HOH WAT . J 4 HOH A 86 590 590 HOH WAT . J 4 HOH A 87 591 591 HOH WAT . J 4 HOH A 88 592 592 HOH WAT . J 4 HOH A 89 593 593 HOH WAT . J 4 HOH A 90 594 594 HOH WAT . J 4 HOH A 91 595 595 HOH WAT . J 4 HOH A 92 596 596 HOH WAT . J 4 HOH A 93 597 597 HOH WAT . J 4 HOH A 94 598 598 HOH WAT . J 4 HOH A 95 599 599 HOH WAT . J 4 HOH A 96 600 600 HOH WAT . J 4 HOH A 97 601 601 HOH WAT . J 4 HOH A 98 602 602 HOH WAT . J 4 HOH A 99 603 603 HOH WAT . J 4 HOH A 100 604 604 HOH WAT . J 4 HOH A 101 605 605 HOH WAT . J 4 HOH A 102 606 606 HOH WAT . J 4 HOH A 103 607 607 HOH WAT . J 4 HOH A 104 608 608 HOH WAT . J 4 HOH A 105 609 609 HOH WAT . J 4 HOH A 106 610 610 HOH WAT . J 4 HOH A 107 611 611 HOH WAT . J 4 HOH A 108 612 612 HOH WAT . J 4 HOH A 109 613 613 HOH WAT . J 4 HOH A 110 614 614 HOH WAT . J 4 HOH A 111 615 615 HOH WAT . J 4 HOH A 112 616 616 HOH WAT . J 4 HOH A 113 617 617 HOH WAT . J 4 HOH A 114 618 618 HOH WAT . J 4 HOH A 115 619 619 HOH WAT . J 4 HOH A 116 620 620 HOH WAT . J 4 HOH A 117 621 621 HOH WAT . J 4 HOH A 118 622 622 HOH WAT . J 4 HOH A 119 623 623 HOH WAT . J 4 HOH A 120 624 624 HOH WAT . J 4 HOH A 121 625 625 HOH WAT . J 4 HOH A 122 626 626 HOH WAT . J 4 HOH A 123 627 627 HOH WAT . J 4 HOH A 124 628 628 HOH WAT . J 4 HOH A 125 629 629 HOH WAT . J 4 HOH A 126 630 630 HOH WAT . J 4 HOH A 127 631 631 HOH WAT . J 4 HOH A 128 632 632 HOH WAT . J 4 HOH A 129 633 633 HOH WAT . J 4 HOH A 130 634 634 HOH WAT . J 4 HOH A 131 635 635 HOH WAT . J 4 HOH A 132 636 636 HOH WAT . J 4 HOH A 133 637 637 HOH WAT . J 4 HOH A 134 638 638 HOH WAT . J 4 HOH A 135 639 639 HOH WAT . J 4 HOH A 136 640 640 HOH WAT . J 4 HOH A 137 641 641 HOH WAT . J 4 HOH A 138 642 642 HOH WAT . J 4 HOH A 139 643 643 HOH WAT . J 4 HOH A 140 644 644 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id F _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x -15.898 _atom_site.Cartn_y 50.456 _atom_site.Cartn_z 15.525 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 62.09 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 410 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 7 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 5 _model_server_stats.query_time_ms 339 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #