data_1NMZ # _model_server_result.job_id xSQg7uFMRH1KEvG9JPfKPA _model_server_result.datetime_utc '2024-10-16 10:22:43' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1nmz # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":402}' # _entry.id 1NMZ # _exptl.entry_id 1NMZ _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1NMZ _cell.length_a 101.301 _cell.length_b 101.301 _cell.length_c 49.513 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1NMZ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 96 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 43 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA,PQS _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 8_665 -y+1,-x+1,-z+1/2 0 -1 0 -1 0 0 0 0 -1 101.301 101.301 24.7565 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OG SER 23 A SER 20 1_555 B MG MG . A MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.195 ? metalc ? metalc2 E O2B ANP . A ANP 303 1_555 B MG MG . A MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.982 ? metalc ? metalc3 E O2G ANP . A ANP 303 1_555 B MG MG . A MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc4 B MG MG . A MG 401 1_555 F O HOH . A HOH 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.133 ? metalc ? metalc5 B MG MG . A MG 401 1_555 F O HOH . A HOH 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? metalc ? metalc6 B MG MG . A MG 401 1_555 F O HOH . A HOH 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? metalc ? metalc7 C MG MG . A MG 402 1_555 F O HOH . A HOH 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? metalc ? metalc8 C MG MG . A MG 402 1_555 F O HOH . A HOH 501 8_665 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? metalc ? metalc9 C MG MG . A MG 402 1_555 F O HOH . A HOH 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? metalc ? metalc10 C MG MG . A MG 402 1_555 F O HOH . A HOH 502 8_665 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? metalc ? metalc11 C MG MG . A MG 402 1_555 F O HOH . A HOH 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.089 ? metalc ? metalc12 C MG MG . A MG 402 1_555 F O HOH . A HOH 503 8_665 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.089 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1NMZ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.009872 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009872 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.020197 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 MG A 1 401 401 MG IUM . C 2 MG A 1 402 402 MG IUM . D 3 NYM A 1 301 301 NYM NMP . E 4 ANP A 1 303 303 ANP ANP . F 5 HOH A 1 501 501 HOH WAT . F 5 HOH A 2 502 502 HOH WAT . F 5 HOH A 3 503 503 HOH WAT . F 5 HOH A 4 504 504 HOH WAT . F 5 HOH A 5 505 505 HOH WAT . F 5 HOH A 6 506 506 HOH WAT . F 5 HOH A 7 507 507 HOH WAT . F 5 HOH A 8 508 508 HOH WAT . F 5 HOH A 9 509 509 HOH WAT . F 5 HOH A 10 510 510 HOH WAT . F 5 HOH A 11 511 511 HOH WAT . F 5 HOH A 12 512 512 HOH WAT . F 5 HOH A 13 513 513 HOH WAT . F 5 HOH A 14 514 514 HOH WAT . F 5 HOH A 15 515 515 HOH WAT . F 5 HOH A 16 516 516 HOH WAT . F 5 HOH A 17 517 517 HOH WAT . F 5 HOH A 18 518 518 HOH WAT . F 5 HOH A 19 519 519 HOH WAT . F 5 HOH A 20 520 520 HOH WAT . F 5 HOH A 21 521 521 HOH WAT . F 5 HOH A 22 522 522 HOH WAT . F 5 HOH A 23 523 523 HOH WAT . F 5 HOH A 24 524 524 HOH WAT . F 5 HOH A 25 525 525 HOH WAT . F 5 HOH A 26 526 526 HOH WAT . F 5 HOH A 27 527 527 HOH WAT . F 5 HOH A 28 528 528 HOH WAT . F 5 HOH A 29 529 529 HOH WAT . F 5 HOH A 30 530 530 HOH WAT . F 5 HOH A 31 531 531 HOH WAT . F 5 HOH A 32 533 533 HOH WAT . F 5 HOH A 33 534 534 HOH WAT . F 5 HOH A 34 535 535 HOH WAT . F 5 HOH A 35 536 536 HOH WAT . F 5 HOH A 36 537 537 HOH WAT . F 5 HOH A 37 538 538 HOH WAT . F 5 HOH A 38 539 539 HOH WAT . F 5 HOH A 39 540 540 HOH WAT . F 5 HOH A 40 541 541 HOH WAT . F 5 HOH A 41 542 542 HOH WAT . F 5 HOH A 42 543 543 HOH WAT . F 5 HOH A 43 544 544 HOH WAT . F 5 HOH A 44 545 545 HOH WAT . F 5 HOH A 45 546 546 HOH WAT . F 5 HOH A 46 547 547 HOH WAT . F 5 HOH A 47 548 548 HOH WAT . F 5 HOH A 48 549 549 HOH WAT . F 5 HOH A 49 550 550 HOH WAT . F 5 HOH A 50 551 551 HOH WAT . F 5 HOH A 51 552 552 HOH WAT . F 5 HOH A 52 553 553 HOH WAT . F 5 HOH A 53 554 554 HOH WAT . F 5 HOH A 54 555 555 HOH WAT . F 5 HOH A 55 556 556 HOH WAT . F 5 HOH A 56 558 558 HOH WAT . F 5 HOH A 57 559 559 HOH WAT . F 5 HOH A 58 560 560 HOH WAT . F 5 HOH A 59 561 561 HOH WAT . F 5 HOH A 60 562 562 HOH WAT . F 5 HOH A 61 563 563 HOH WAT . F 5 HOH A 62 564 564 HOH WAT . F 5 HOH A 63 565 565 HOH WAT . F 5 HOH A 64 566 566 HOH WAT . F 5 HOH A 65 567 567 HOH WAT . F 5 HOH A 66 568 568 HOH WAT . F 5 HOH A 67 569 569 HOH WAT . F 5 HOH A 68 570 570 HOH WAT . F 5 HOH A 69 571 571 HOH WAT . F 5 HOH A 70 573 573 HOH WAT . F 5 HOH A 71 574 574 HOH WAT . F 5 HOH A 72 575 575 HOH WAT . F 5 HOH A 73 576 576 HOH WAT . F 5 HOH A 74 577 577 HOH WAT . F 5 HOH A 75 580 580 HOH WAT . F 5 HOH A 76 581 581 HOH WAT . F 5 HOH A 77 582 582 HOH WAT . F 5 HOH A 78 583 583 HOH WAT . F 5 HOH A 79 584 584 HOH WAT . F 5 HOH A 80 585 585 HOH WAT . F 5 HOH A 81 586 586 HOH WAT . F 5 HOH A 82 587 587 HOH WAT . F 5 HOH A 83 588 588 HOH WAT . F 5 HOH A 84 589 589 HOH WAT . F 5 HOH A 85 590 590 HOH WAT . F 5 HOH A 86 591 591 HOH WAT . F 5 HOH A 87 592 592 HOH WAT . F 5 HOH A 88 594 594 HOH WAT . F 5 HOH A 89 597 597 HOH WAT . F 5 HOH A 90 598 598 HOH WAT . F 5 HOH A 91 599 599 HOH WAT . F 5 HOH A 92 600 600 HOH WAT . F 5 HOH A 93 601 601 HOH WAT . F 5 HOH A 94 602 602 HOH WAT . F 5 HOH A 95 603 603 HOH WAT . F 5 HOH A 96 604 604 HOH WAT . F 5 HOH A 97 605 605 HOH WAT . F 5 HOH A 98 606 606 HOH WAT . F 5 HOH A 99 608 608 HOH WAT . F 5 HOH A 100 610 610 HOH WAT . F 5 HOH A 101 611 611 HOH WAT . F 5 HOH A 102 612 612 HOH WAT . F 5 HOH A 103 613 613 HOH WAT . F 5 HOH A 104 614 614 HOH WAT . F 5 HOH A 105 615 615 HOH WAT . F 5 HOH A 106 618 618 HOH WAT . F 5 HOH A 107 619 619 HOH WAT . F 5 HOH A 108 621 621 HOH WAT . F 5 HOH A 109 623 623 HOH WAT . F 5 HOH A 110 624 624 HOH WAT . F 5 HOH A 111 625 625 HOH WAT . F 5 HOH A 112 627 627 HOH WAT . F 5 HOH A 113 628 628 HOH WAT . F 5 HOH A 114 630 630 HOH WAT . F 5 HOH A 115 631 631 HOH WAT . F 5 HOH A 116 633 633 HOH WAT . F 5 HOH A 117 634 634 HOH WAT . F 5 HOH A 118 636 636 HOH WAT . F 5 HOH A 119 638 638 HOH WAT . F 5 HOH A 120 639 639 HOH WAT . F 5 HOH A 121 640 640 HOH WAT . F 5 HOH A 122 641 641 HOH WAT . F 5 HOH A 123 642 642 HOH WAT . F 5 HOH A 124 643 643 HOH WAT . F 5 HOH A 125 644 644 HOH WAT . F 5 HOH A 126 645 645 HOH WAT . F 5 HOH A 127 646 646 HOH WAT . F 5 HOH A 128 647 647 HOH WAT . F 5 HOH A 129 653 653 HOH WAT . F 5 HOH A 130 654 654 HOH WAT . F 5 HOH A 131 656 656 HOH WAT . F 5 HOH A 132 657 657 HOH WAT . F 5 HOH A 133 658 658 HOH WAT . F 5 HOH A 134 659 659 HOH WAT . F 5 HOH A 135 660 660 HOH WAT . F 5 HOH A 136 662 662 HOH WAT . F 5 HOH A 137 664 664 HOH WAT . F 5 HOH A 138 666 666 HOH WAT . F 5 HOH A 139 667 667 HOH WAT . F 5 HOH A 140 668 668 HOH WAT . F 5 HOH A 141 669 669 HOH WAT . F 5 HOH A 142 670 670 HOH WAT . F 5 HOH A 143 673 673 HOH WAT . F 5 HOH A 144 675 675 HOH WAT . F 5 HOH A 145 676 676 HOH WAT . F 5 HOH A 146 677 677 HOH WAT . F 5 HOH A 147 678 678 HOH WAT . F 5 HOH A 148 679 679 HOH WAT . F 5 HOH A 149 680 680 HOH WAT . F 5 HOH A 150 681 681 HOH WAT . F 5 HOH A 151 682 682 HOH WAT . F 5 HOH A 152 683 683 HOH WAT . F 5 HOH A 153 684 684 HOH WAT . F 5 HOH A 154 685 685 HOH WAT . F 5 HOH A 155 687 687 HOH WAT . F 5 HOH A 156 688 688 HOH WAT . F 5 HOH A 157 690 690 HOH WAT . F 5 HOH A 158 692 692 HOH WAT . F 5 HOH A 159 693 693 HOH WAT . F 5 HOH A 160 694 694 HOH WAT . F 5 HOH A 161 695 695 HOH WAT . F 5 HOH A 162 696 696 HOH WAT . F 5 HOH A 163 697 697 HOH WAT . F 5 HOH A 164 702 702 HOH WAT . F 5 HOH A 165 704 704 HOH WAT . F 5 HOH A 166 708 708 HOH WAT . F 5 HOH A 167 709 709 HOH WAT . F 5 HOH A 168 711 711 HOH WAT . F 5 HOH A 169 713 713 HOH WAT . F 5 HOH A 170 714 714 HOH WAT . F 5 HOH A 171 715 715 HOH WAT . F 5 HOH A 172 716 716 HOH WAT . F 5 HOH A 173 717 717 HOH WAT . F 5 HOH A 174 718 718 HOH WAT . F 5 HOH A 175 719 719 HOH WAT . F 5 HOH A 176 721 721 HOH WAT . F 5 HOH A 177 724 724 HOH WAT . F 5 HOH A 178 726 726 HOH WAT . F 5 HOH A 179 727 727 HOH WAT . F 5 HOH A 180 728 728 HOH WAT . F 5 HOH A 181 729 729 HOH WAT . F 5 HOH A 182 730 730 HOH WAT . F 5 HOH A 183 731 731 HOH WAT . F 5 HOH A 184 732 732 HOH WAT . F 5 HOH A 185 733 733 HOH WAT . F 5 HOH A 186 734 734 HOH WAT . F 5 HOH A 187 735 735 HOH WAT . F 5 HOH A 188 736 736 HOH WAT . F 5 HOH A 189 737 737 HOH WAT . F 5 HOH A 190 738 738 HOH WAT . F 5 HOH A 191 739 739 HOH WAT . F 5 HOH A 192 740 740 HOH WAT . F 5 HOH A 193 741 741 HOH WAT . F 5 HOH A 194 742 742 HOH WAT . F 5 HOH A 195 743 743 HOH WAT . F 5 HOH A 196 744 744 HOH WAT . F 5 HOH A 197 745 745 HOH WAT . F 5 HOH A 198 746 746 HOH WAT . F 5 HOH A 199 749 749 HOH WAT . F 5 HOH A 200 750 750 HOH WAT . F 5 HOH A 201 751 751 HOH WAT . F 5 HOH A 202 752 752 HOH WAT . F 5 HOH A 203 753 753 HOH WAT . F 5 HOH A 204 754 754 HOH WAT . F 5 HOH A 205 755 755 HOH WAT . F 5 HOH A 206 756 756 HOH WAT . F 5 HOH A 207 757 757 HOH WAT . F 5 HOH A 208 758 758 HOH WAT . F 5 HOH A 209 759 759 HOH WAT . F 5 HOH A 210 761 761 HOH WAT . F 5 HOH A 211 762 762 HOH WAT . F 5 HOH A 212 763 763 HOH WAT . F 5 HOH A 213 764 764 HOH WAT . F 5 HOH A 214 765 765 HOH WAT . F 5 HOH A 215 766 766 HOH WAT . F 5 HOH A 216 767 767 HOH WAT . F 5 HOH A 217 768 768 HOH WAT . F 5 HOH A 218 769 769 HOH WAT . F 5 HOH A 219 770 770 HOH WAT . F 5 HOH A 220 771 771 HOH WAT . F 5 HOH A 221 772 772 HOH WAT . F 5 HOH A 222 773 773 HOH WAT . F 5 HOH A 223 774 774 HOH WAT . F 5 HOH A 224 775 775 HOH WAT . F 5 HOH A 225 776 776 HOH WAT . F 5 HOH A 226 777 777 HOH WAT . F 5 HOH A 227 778 778 HOH WAT . F 5 HOH A 228 779 779 HOH WAT . F 5 HOH A 229 780 780 HOH WAT . F 5 HOH A 230 781 781 HOH WAT . F 5 HOH A 231 782 782 HOH WAT . F 5 HOH A 232 783 783 HOH WAT . F 5 HOH A 233 784 784 HOH WAT . F 5 HOH A 234 785 785 HOH WAT . F 5 HOH A 235 786 786 HOH WAT . F 5 HOH A 236 787 787 HOH WAT . F 5 HOH A 237 788 788 HOH WAT . F 5 HOH A 238 789 789 HOH WAT . F 5 HOH A 239 790 790 HOH WAT . F 5 HOH A 240 791 791 HOH WAT . F 5 HOH A 241 792 792 HOH WAT . F 5 HOH A 242 793 793 HOH WAT . F 5 HOH A 243 794 794 HOH WAT . F 5 HOH A 244 795 795 HOH WAT . F 5 HOH A 245 797 797 HOH WAT . F 5 HOH A 246 798 798 HOH WAT . F 5 HOH A 247 799 799 HOH WAT . F 5 HOH A 248 800 800 HOH WAT . F 5 HOH A 249 801 801 HOH WAT . F 5 HOH A 250 802 802 HOH WAT . F 5 HOH A 251 803 803 HOH WAT . F 5 HOH A 252 804 804 HOH WAT . F 5 HOH A 253 805 805 HOH WAT . F 5 HOH A 254 806 806 HOH WAT . F 5 HOH A 255 807 807 HOH WAT . F 5 HOH A 256 808 808 HOH WAT . F 5 HOH A 257 809 809 HOH WAT . F 5 HOH A 258 810 810 HOH WAT . F 5 HOH A 259 812 812 HOH WAT . F 5 HOH A 260 813 813 HOH WAT . F 5 HOH A 261 814 814 HOH WAT . F 5 HOH A 262 815 815 HOH WAT . F 5 HOH A 263 816 816 HOH WAT . F 5 HOH A 264 817 817 HOH WAT . F 5 HOH A 265 818 818 HOH WAT . F 5 HOH A 266 819 819 HOH WAT . F 5 HOH A 267 820 820 HOH WAT . F 5 HOH A 268 821 821 HOH WAT . F 5 HOH A 269 822 822 HOH WAT . F 5 HOH A 270 823 823 HOH WAT . F 5 HOH A 271 824 824 HOH WAT . F 5 HOH A 272 825 825 HOH WAT . F 5 HOH A 273 826 826 HOH WAT . F 5 HOH A 274 827 827 HOH WAT . F 5 HOH A 275 828 828 HOH WAT . F 5 HOH A 276 829 829 HOH WAT . F 5 HOH A 277 831 831 HOH WAT . F 5 HOH A 278 832 832 HOH WAT . F 5 HOH A 279 833 833 HOH WAT . F 5 HOH A 280 834 834 HOH WAT . F 5 HOH A 281 835 835 HOH WAT . F 5 HOH A 282 836 836 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id C _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 5.889 _atom_site.Cartn_y 95.412 _atom_site.Cartn_z 12.378 _atom_site.occupancy 0.5 _atom_site.B_iso_or_equiv 24.89 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 402 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 62 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 269 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #