data_1OCO # _model_server_result.job_id PDbGWCl7IUp1VJcGb7_d1A _model_server_result.datetime_utc '2024-11-25 16:15:40' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1oco # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"HA","auth_seq_id":229}' # _entry.id 1OCO # _exptl.entry_id 1OCO _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 63.546 _entity.id 14 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'COPPER (II) ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1OCO _cell.length_a 189.1 _cell.length_b 210.5 _cell.length_c 178.6 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1OCO _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 26-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 26 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 14 AA N N ? 14 GA N N ? 14 HA N N ? 14 JA N N ? 14 PA N N ? 14 QA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 H SG CYS 29 H CYS 29 1_555 H SG CYS 64 H CYS 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf2 H SG CYS 39 H CYS 39 1_555 H SG CYS 53 H CYS 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? disulf ? disulf3 U SG CYS 29 U CYS 29 1_555 U SG CYS 64 U CYS 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf4 U SG CYS 39 U CYS 39 1_555 U SG CYS 53 U CYS 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc1 A O GLU 40 A GLU 40 1_555 CA NA NA . A NA 519 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.405 ? metalc ? metalc2 A OE2 GLU 40 A GLU 40 1_555 CA NA NA . A NA 519 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.53 ? metalc ? metalc3 A O GLY 45 A GLY 45 1_555 CA NA NA . A NA 519 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? metalc ? metalc4 A NE2 HIS 61 A HIS 61 1_555 DA FE HEA . A HEA 515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.853 ? metalc ? metalc5 A ND1 HIS 240 A HIS 240 1_555 AA CU CU . A CU 517 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.158 ? metalc ? metalc6 A NE2 HIS 290 A HIS 290 1_555 AA CU CU . A CU 517 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.01 ? metalc ? metalc7 A NE2 HIS 291 A HIS 291 1_555 AA CU CU . A CU 517 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.956 ? metalc ? metalc8 A NE2 HIS 368 A HIS 368 1_555 BA MG MG . A MG 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.21 ? metalc ? metalc9 A OD2 ASP 369 A ASP 369 1_555 BA MG MG . A MG 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.15 ? metalc ? metalc10 A NE2 HIS 376 A HIS 376 1_555 EA FE HEA . A HEA 516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? metalc ? metalc11 A NE2 HIS 378 A HIS 378 1_555 DA FE HEA . A HEA 515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.904 ? metalc ? metalc12 A O SER 441 A SER 441 1_555 CA NA NA . A NA 519 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? metalc ? metalc13 EA FE HEA . A HEA 516 1_555 FA C CMO . A CMO 520 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.909 ? metalc ? metalc14 EA FE HEA . A HEA 516 1_555 FA O CMO . A CMO 520 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.075 ? metalc ? metalc15 AA CU CU . A CU 517 1_555 FA O CMO . A CMO 520 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? metalc ? metalc16 BA MG MG . A MG 518 1_555 B OE1 GLU 198 B GLU 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.113 ? metalc ? metalc17 B ND1 HIS 161 B HIS 161 1_555 GA CU CU . B CU 228 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.921 ? metalc ? metalc18 B SG CYS 196 B CYS 196 1_555 GA CU CU . B CU 228 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? metalc ? metalc19 B SG CYS 196 B CYS 196 1_555 HA CU CU . B CU 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? metalc ? metalc20 B O GLU 198 B GLU 198 1_555 HA CU CU . B CU 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.38 ? metalc ? metalc21 B SG CYS 200 B CYS 200 1_555 GA CU CU . B CU 228 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc22 B SG CYS 200 B CYS 200 1_555 HA CU CU . B CU 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.209 ? metalc ? metalc23 B ND1 HIS 204 B HIS 204 1_555 HA CU CU . B CU 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? metalc ? metalc24 B SD MET 207 B MET 207 1_555 GA CU CU . B CU 228 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.672 ? metalc ? metalc25 GA CU CU . B CU 228 1_555 HA CU CU . B CU 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? metalc ? metalc26 F SG CYS 60 F CYS 60 1_555 IA ZN ZN . F ZN 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.198 ? metalc ? metalc27 F SG CYS 62 F CYS 62 1_555 IA ZN ZN . F ZN 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.175 ? metalc ? metalc28 F SG CYS 82 F CYS 82 1_555 IA ZN ZN . F ZN 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.16 ? metalc ? metalc29 F SG CYS 85 F CYS 85 1_555 IA ZN ZN . F ZN 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? metalc ? metalc30 N OE2 GLU 40 N GLU 40 1_555 LA NA NA . N NA 519 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.556 ? metalc ? metalc31 N O GLU 40 N GLU 40 1_555 LA NA NA . N NA 519 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? metalc ? metalc32 N O GLY 45 N GLY 45 1_555 LA NA NA . N NA 519 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.367 ? metalc ? metalc33 N NE2 HIS 61 N HIS 61 1_555 MA FE HEA . N HEA 515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.702 ? metalc ? metalc34 N ND1 HIS 240 N HIS 240 1_555 JA CU CU . N CU 517 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.146 ? metalc ? metalc35 N NE2 HIS 290 N HIS 290 1_555 JA CU CU . N CU 517 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? metalc ? metalc36 N NE2 HIS 291 N HIS 291 1_555 JA CU CU . N CU 517 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.988 ? metalc ? metalc37 N NE2 HIS 368 N HIS 368 1_555 KA MG MG . N MG 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? metalc ? metalc38 N OD2 ASP 369 N ASP 369 1_555 KA MG MG . N MG 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.14 ? metalc ? metalc39 N NE2 HIS 376 N HIS 376 1_555 NA FE HEA . N HEA 516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.06 ? metalc ? metalc40 N NE2 HIS 378 N HIS 378 1_555 MA FE HEA . N HEA 515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? metalc ? metalc41 N O SER 441 N SER 441 1_555 LA NA NA . N NA 519 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? metalc ? metalc42 NA FE HEA . N HEA 516 1_555 OA C CMO . N CMO 520 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.88 ? metalc ? metalc43 NA FE HEA . N HEA 516 1_555 OA O CMO . N CMO 520 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.867 ? metalc ? metalc44 JA CU CU . N CU 517 1_555 OA O CMO . N CMO 520 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.559 ? metalc ? metalc45 KA MG MG . N MG 518 1_555 O OE1 GLU 198 O GLU 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? metalc ? metalc46 O ND1 HIS 161 O HIS 161 1_555 PA CU CU . O CU 228 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? metalc ? metalc47 O SG CYS 196 O CYS 196 1_555 PA CU CU . O CU 228 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? metalc ? metalc48 O SG CYS 196 O CYS 196 1_555 QA CU CU . O CU 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc49 O O GLU 198 O GLU 198 1_555 QA CU CU . O CU 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc ? metalc50 O SG CYS 200 O CYS 200 1_555 PA CU CU . O CU 228 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? metalc ? metalc51 O SG CYS 200 O CYS 200 1_555 QA CU CU . O CU 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? metalc ? metalc52 O ND1 HIS 204 O HIS 204 1_555 QA CU CU . O CU 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? metalc ? metalc53 O SD MET 207 O MET 207 1_555 PA CU CU . O CU 228 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.724 ? metalc ? metalc54 PA CU CU . O CU 228 1_555 QA CU CU . O CU 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc55 S SG CYS 60 S CYS 60 1_555 RA ZN ZN . S ZN 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? metalc ? metalc56 S SG CYS 62 S CYS 62 1_555 RA ZN ZN . S ZN 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? metalc ? metalc57 S SG CYS 82 S CYS 82 1_555 RA ZN ZN . S ZN 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.218 ? metalc ? metalc58 S SG CYS 85 S CYS 85 1_555 RA ZN ZN . S ZN 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.132 ? # _chem_comp.formula 'Cu 2' _chem_comp.formula_weight 63.546 _chem_comp.id CU _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'COPPER (II) ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1OCO _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.005288 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.004751 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.005599 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code AA 14 CU A 1 517 517 CU CU . BA 15 MG A 1 518 518 MG MG . CA 16 NA A 1 519 519 NA NA . DA 17 HEA A 1 515 515 HEA HEA . EA 17 HEA A 1 516 516 HEA HEA . FA 18 CMO A 1 520 520 CMO CMO . GA 14 CU B 1 228 228 CU CU . HA 14 CU B 1 229 229 CU CU . IA 19 ZN F 1 99 99 ZN ZN . JA 14 CU N 1 517 517 CU CU . KA 15 MG N 1 518 518 MG MG . LA 16 NA N 1 519 519 NA NA . MA 17 HEA N 1 515 515 HEA HEA . NA 17 HEA N 1 516 516 HEA HEA . OA 18 CMO N 1 520 520 CMO CMO . PA 14 CU O 1 228 228 CU CU . QA 14 CU O 1 229 229 CU CU . RA 19 ZN S 1 99 99 ZN ZN . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CU _atom_site.label_atom_id CU _atom_site.label_comp_id CU _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id HA _atom_site.label_entity_id 14 _atom_site.Cartn_x 56.706 _atom_site.Cartn_y 320.054 _atom_site.Cartn_z 173.444 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 19.92 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CU _atom_site.auth_comp_id CU _atom_site.auth_seq_id 229 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 16 _model_server_stats.parse_time_ms 19 _model_server_stats.create_model_time_ms 29 _model_server_stats.query_time_ms 268 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #