data_1OCZ # _model_server_result.job_id 9W8EqKn8XIyN5B9fj7eIKA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-24 02:57:53' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1ocz # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"LA","auth_seq_id":518}' # _entry.id 1OCZ # _exptl.entry_id 1OCZ _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 15 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1OCZ _cell.length_a 189.2 _cell.length_b 210.6 _cell.length_c 178.5 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1OCZ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 26-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 26 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 15 BA N N ? 15 LA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 H SG CYS 29 H CYS 29 1_555 H SG CYS 64 H CYS 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf2 H SG CYS 39 H CYS 39 1_555 H SG CYS 53 H CYS 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.548 ? disulf ? disulf3 U SG CYS 29 U CYS 29 1_555 U SG CYS 64 U CYS 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf4 U SG CYS 39 U CYS 39 1_555 U SG CYS 53 U CYS 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.541 ? metalc ? metalc1 FA FE HEA . A HEA 515 1_555 A CE1 HIS 61 A HIS 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.892 ? metalc ? metalc2 FA FE HEA . A HEA 515 1_555 A NE2 HIS 378 A HIS 378 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.875 ? metalc ? metalc3 GA FE HEA . A HEA 516 1_555 A NE2 HIS 376 A HIS 376 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.923 ? metalc ? metalc4 GA FE HEA . A HEA 516 1_555 DA N1 AZI . A AZI 520 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? metalc ? metalc5 AA CU CU . A CU 517 1_555 A ND1 HIS 240 A HIS 240 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? metalc ? metalc6 AA CU CU . A CU 517 1_555 A NE2 HIS 290 A HIS 290 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? metalc ? metalc7 AA CU CU . A CU 517 1_555 A NE2 HIS 291 A HIS 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.942 ? metalc ? metalc8 BA MG MG . A MG 518 1_555 A NE2 HIS 368 A HIS 368 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? metalc ? metalc9 BA MG MG . A MG 518 1_555 A OD2 ASP 369 A ASP 369 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.159 ? metalc ? metalc10 BA MG MG . A MG 518 1_555 B OE1 GLU 198 B GLU 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.097 ? metalc ? metalc11 CA NA NA . A NA 519 1_555 A O GLY 45 A GLY 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? metalc ? metalc12 CA NA NA . A NA 519 1_555 A O GLU 40 A GLU 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.47 ? metalc ? metalc13 CA NA NA . A NA 519 1_555 A O SER 441 A SER 441 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.405 ? metalc ? metalc14 AA CU CU . A CU 517 1_555 DA N3 AZI . A AZI 520 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.874 ? metalc ? metalc15 HA CU CU . B CU 228 1_555 B ND1 HIS 161 B HIS 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.857 ? metalc ? metalc16 HA CU CU . B CU 228 1_555 B SG CYS 196 B CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.209 ? metalc ? metalc17 HA CU CU . B CU 228 1_555 B SG CYS 200 B CYS 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc18 IA CU CU . B CU 229 1_555 B SG CYS 196 B CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc19 IA CU CU . B CU 229 1_555 B O GLU 198 B GLU 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? metalc ? metalc20 IA CU CU . B CU 229 1_555 B SG CYS 200 B CYS 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? metalc ? metalc21 IA CU CU . B CU 229 1_555 B ND1 HIS 204 B HIS 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.983 ? metalc ? metalc22 JA ZN ZN . F ZN 99 1_555 F SG CYS 60 F CYS 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.223 ? metalc ? metalc23 JA ZN ZN . F ZN 99 1_555 F SG CYS 62 F CYS 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.245 ? metalc ? metalc24 JA ZN ZN . F ZN 99 1_555 F SG CYS 82 F CYS 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? metalc ? metalc25 JA ZN ZN . F ZN 99 1_555 F SG CYS 85 F CYS 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.168 ? metalc ? metalc26 PA FE HEA . N HEA 515 1_555 N CE1 HIS 61 N HIS 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.862 ? metalc ? metalc27 PA FE HEA . N HEA 515 1_555 N NE2 HIS 378 N HIS 378 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.961 ? metalc ? metalc28 QA FE HEA . N HEA 516 1_555 N NE2 HIS 376 N HIS 376 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.996 ? metalc ? metalc29 QA FE HEA . N HEA 516 1_555 NA N1 AZI . N AZI 520 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.122 ? metalc ? metalc30 KA CU CU . N CU 517 1_555 N ND1 HIS 240 N HIS 240 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? metalc ? metalc31 KA CU CU . N CU 517 1_555 N NE2 HIS 290 N HIS 290 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.943 ? metalc ? metalc32 KA CU CU . N CU 517 1_555 N NE2 HIS 291 N HIS 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.931 ? metalc ? metalc33 KA CU CU . N CU 517 1_555 NA N3 AZI . N AZI 520 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.866 ? metalc ? metalc34 LA MG MG . N MG 518 1_555 N NE2 HIS 368 N HIS 368 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.235 ? metalc ? metalc35 LA MG MG . N MG 518 1_555 N OD2 ASP 369 N ASP 369 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.167 ? metalc ? metalc36 LA MG MG . N MG 518 1_555 O OE1 GLU 198 O GLU 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? metalc ? metalc37 MA NA NA . N NA 519 1_555 N O GLU 40 N GLU 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.406 ? metalc ? metalc38 MA NA NA . N NA 519 1_555 N O GLY 45 N GLY 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? metalc ? metalc39 MA NA NA . N NA 519 1_555 N O SER 441 N SER 441 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.416 ? metalc ? metalc40 RA CU CU . O CU 228 1_555 O SD MET 207 O MET 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.689 ? metalc ? metalc41 RA CU CU . O CU 228 1_555 O ND1 HIS 161 O HIS 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.942 ? metalc ? metalc42 RA CU CU . O CU 228 1_555 O SG CYS 196 O CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? metalc ? metalc43 RA CU CU . O CU 228 1_555 O SG CYS 200 O CYS 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? metalc ? metalc44 SA CU CU . O CU 229 1_555 O SG CYS 196 O CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc45 SA CU CU . O CU 229 1_555 O O GLU 198 O GLU 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? metalc ? metalc46 SA CU CU . O CU 229 1_555 O SG CYS 200 O CYS 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.243 ? metalc ? metalc47 SA CU CU . O CU 229 1_555 O ND1 HIS 204 O HIS 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? metalc ? metalc48 TA ZN ZN . S ZN 99 1_555 S SG CYS 60 S CYS 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.192 ? metalc ? metalc49 TA ZN ZN . S ZN 99 1_555 S SG CYS 62 S CYS 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc50 TA ZN ZN . S ZN 99 1_555 S SG CYS 82 S CYS 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? metalc ? metalc51 TA ZN ZN . S ZN 99 1_555 S SG CYS 85 S CYS 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? metalc ? metalc52 FA FE HEA . A HEA 515 1_555 A ND1 HIS 61 A HIS 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.103 ? metalc ? metalc53 FA FE HEA . A HEA 515 1_555 A NE2 HIS 61 A HIS 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.467 ? metalc ? metalc54 GA FE HEA . A HEA 516 1_555 DA N2 AZI . A AZI 520 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.115 ? metalc ? metalc55 AA CU CU . A CU 517 1_555 DA N2 AZI . A AZI 520 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.477 ? metalc ? metalc56 CA NA NA . A NA 519 1_555 A OE2 GLU 40 A GLU 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.56 ? metalc ? metalc57 HA CU CU . B CU 228 1_555 B SD MET 207 B MET 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.68 ? metalc ? metalc58 HA CU CU . B CU 228 1_555 IA CU CU . B CU 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.513 ? covale ? covale1 N OD1 ASN 422 N ASN 422 1_555 OA N2 AZI . N AZI 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.989 ? metalc ? metalc59 PA FE HEA . N HEA 515 1_555 N ND1 HIS 61 N HIS 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.061 ? metalc ? metalc60 PA FE HEA . N HEA 515 1_555 N NE2 HIS 61 N HIS 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? metalc ? metalc61 KA CU CU . N CU 517 1_555 NA N2 AZI . N AZI 520 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.209 ? metalc ? metalc62 MA NA NA . N NA 519 1_555 N OE2 GLU 40 N GLU 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.546 ? metalc ? metalc63 RA CU CU . O CU 228 1_555 SA CU CU . O CU 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1OCZ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.005285 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.004748 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.005602 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code AA 14 CU A 1 517 517 CU CU . BA 15 MG A 1 518 518 MG MG . CA 16 NA A 1 519 519 NA NA . DA 17 AZI A 1 520 520 AZI AZI . EA 17 AZI A 1 521 521 AZI AZI . FA 18 HEA A 1 515 515 HEA HEA . GA 18 HEA A 1 516 516 HEA HEA . HA 14 CU B 1 228 228 CU CU . IA 14 CU B 1 229 229 CU CU . JA 19 ZN F 1 99 99 ZN ZN . KA 14 CU N 1 517 517 CU CU . LA 15 MG N 1 518 518 MG MG . MA 16 NA N 1 519 519 NA NA . NA 17 AZI N 1 520 520 AZI AZI . OA 17 AZI N 1 521 521 AZI AZI . PA 18 HEA N 1 515 515 HEA HEA . QA 18 HEA N 1 516 516 HEA HEA . RA 14 CU O 1 228 228 CU CU . SA 14 CU O 1 229 229 CU CU . TA 19 ZN S 1 99 99 ZN ZN . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id LA _atom_site.label_entity_id 15 _atom_site.Cartn_x 127.74 _atom_site.Cartn_y 322.971 _atom_site.Cartn_z 174.943 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 30.85 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 518 _atom_site.auth_asym_id N _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 15 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 30 _model_server_stats.query_time_ms 233 _model_server_stats.encode_time_ms 20 _model_server_stats.element_count 1 #