data_1P7L
#
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_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-06 23:36:29' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          1p7l 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":387}' 
#
_entry.id    1P7L 
#
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_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              24.305 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.entry_id            1P7L 
_cell.length_a            225.82 
_cell.length_b            69.13 
_cell.length_c            118.23 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1P7L 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 F N N 
? 3 G N N 
? 3 K N N 
? 3 L N N 
? 3 P N N 
? 3 Q N N 
? 3 U N N 
? 3 W N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD2 ASP 16 A ASP 16 1_555 G MG MG . A MG 388 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? 
metalc ? metalc2 A OE2 GLU 42 A GLU 42 1_555 J K K . B K 486 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.172 ? 
metalc ? metalc3 A OD1 ASP 238 A ASP 238 1_555 E K K . A K 386 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.275 ? 
metalc ? metalc4 A O CYS 239 A CYS 239 1_555 E K K . A K 386 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.215 ? 
metalc ? metalc5 H O2B ANP . A ANP 384 1_555 E K K . A K 386 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.004 ? 
metalc ? metalc6 H O1A ANP . A ANP 384 1_555 F MG MG . A MG 387 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? 
metalc ? metalc7 H O1G ANP . A ANP 384 1_555 F MG MG . A MG 387 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? 
metalc ? metalc8 H O2B ANP . A ANP 384 1_555 G MG MG . A MG 388 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.228 ? 
metalc ? metalc9 H O2A ANP . A ANP 384 1_555 G MG MG . A MG 388 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.388 ? 
metalc ? metalc10 H O2G ANP . A ANP 384 1_555 G MG MG . A MG 388 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? 
metalc ? metalc11 E K K . A K 386 1_555 B OE2 GLU 42 B GLU 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.156 ? 
metalc ? metalc12 B OD2 ASP 16 B ASP 16 1_555 L MG MG . B MG 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? 
metalc ? metalc13 B OD1 ASP 238 B ASP 238 1_555 J K K . B K 486 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.069 ? 
metalc ? metalc14 B O CYS 239 B CYS 239 1_555 J K K . B K 486 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.274 ? 
metalc ? metalc15 N O2B ANP . B ANP 484 1_555 J K K . B K 486 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.107 ? 
metalc ? metalc16 N O1A ANP . B ANP 484 1_555 K MG MG . B MG 487 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.442 ? 
metalc ? metalc17 N O1G ANP . B ANP 484 1_555 K MG MG . B MG 487 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? 
metalc ? metalc18 N O2B ANP . B ANP 484 1_555 L MG MG . B MG 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.282 ? 
metalc ? metalc19 N O2G ANP . B ANP 484 1_555 L MG MG . B MG 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? 
metalc ? metalc20 N O2A ANP . B ANP 484 1_555 L MG MG . B MG 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? 
metalc ? metalc21 C OD1 ASP 16 C ASP 16 1_555 P MG MG . C MG 688 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.767 ? 
metalc ? metalc22 C OD2 ASP 16 C ASP 16 1_555 P MG MG . C MG 688 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.14 ? 
metalc ? metalc23 C OE2 GLU 42 C GLU 42 1_555 V K K . D K 886 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.015 ? 
metalc ? metalc24 C OD1 ASP 238 C ASP 238 1_555 O K K . C K 686 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.967 ? 
metalc ? metalc25 C O CYS 239 C CYS 239 1_555 O K K . C K 686 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.143 ? 
metalc ? metalc26 C N CYS 239 C CYS 239 1_555 O K K . C K 686 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.719 ? 
metalc ? metalc27 C OD1 ASP 271 C ASP 271 1_555 Q MG MG . C MG 887 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.968 ? 
metalc ? metalc28 T O2B PPK . C PPK 684 1_555 O K K . C K 686 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.287 ? 
metalc ? metalc29 T O2G PPK . C PPK 684 1_555 P MG MG . C MG 688 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.962 ? 
metalc ? metalc30 T O2B PPK . C PPK 684 1_555 P MG MG . C MG 688 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? 
metalc ? metalc31 T O2A PPK . C PPK 684 1_555 P MG MG . C MG 688 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.709 ? 
metalc ? metalc32 T O1G PPK . C PPK 684 1_555 U MG MG . D MG 687 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.529 ? 
metalc ? metalc33 T O1A PPK . C PPK 684 1_555 U MG MG . D MG 687 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.351 ? 
metalc ? metalc34 O K K . C K 686 1_555 D OE2 GLU 42 D GLU 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.039 ? 
metalc ? metalc35 Q MG MG . C MG 887 1_555 X O1G PPK . D PPK 884 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? 
metalc ? metalc36 Q MG MG . C MG 887 1_555 X O1A PPK . D PPK 884 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? 
metalc ? metalc37 D OD1 ASP 16 D ASP 16 1_555 W MG MG . D MG 888 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.881 ? 
metalc ? metalc38 D OD2 ASP 16 D ASP 16 1_555 W MG MG . D MG 888 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? 
metalc ? metalc39 D OD1 ASP 238 D ASP 238 1_555 V K K . D K 886 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.062 ? 
metalc ? metalc40 D O CYS 239 D CYS 239 1_555 V K K . D K 886 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.157 ? 
metalc ? metalc41 X O2B PPK . D PPK 884 1_555 V K K . D K 886 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.293 ? 
metalc ? metalc42 X O2A PPK . D PPK 884 1_555 W MG MG . D MG 888 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.771 ? 
metalc ? metalc43 X O2B PPK . D PPK 884 1_555 W MG MG . D MG 888 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
metalc ? metalc44 X O2G PPK . D PPK 884 1_555 W MG MG . D MG 888 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.776 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     1P7L 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.004428 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.014465 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.008458 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 K A 1 386 386 K K+ . 
F 3 MG A 1 387 387 MG MG+ . 
G 3 MG A 1 388 388 MG MG+ . 
H 4 ANP A 1 384 384 ANP ANP . 
I 5 MET A 1 485 385 MET MET . 
J 2 K B 1 486 386 K K+ . 
K 3 MG B 1 487 387 MG MG+ . 
L 3 MG B 1 488 388 MG MG+ . 
M 5 MET B 1 385 385 MET MET . 
N 4 ANP B 1 484 384 ANP ANP . 
O 2 K C 1 686 386 K K+ . 
P 3 MG C 1 688 388 MG MG+ . 
Q 3 MG C 1 887 387 MG MG+ . 
R 6 SAM C 1 685 385 SAM SAM . 
S 6 SAM C 1 885 385 SAM SAM . 
T 7 PPK C 1 684 384 PPK PPN . 
U 3 MG D 1 687 387 MG MG+ . 
V 2 K D 1 886 386 K K+ . 
W 3 MG D 1 888 388 MG MG+ . 
X 7 PPK D 1 884 384 PPK PPN . 
Y 8 HOH A 1 401 401 HOH H2O . 
Y 8 HOH A 2 411 411 HOH H2O . 
Y 8 HOH A 3 413 413 HOH H2O . 
Y 8 HOH A 4 500 400 HOH H2O . 
Y 8 HOH A 5 501 401 HOH H2O . 
Y 8 HOH A 6 530 430 HOH H2O . 
Z 8 HOH B 1 400 400 HOH H2O . 
Z 8 HOH B 2 513 413 HOH H2O . 
Z 8 HOH B 3 531 431 HOH H2O . 
AA 8 HOH C 1 700 400 HOH H2O . 
AA 8 HOH C 2 702 402 HOH H2O . 
AA 8 HOH C 3 711 411 HOH H2O . 
AA 8 HOH C 4 716 416 HOH H2O . 
AA 8 HOH C 5 731 431 HOH H2O . 
AA 8 HOH C 6 900 400 HOH H2O . 
AA 8 HOH C 7 902 402 HOH H2O . 
AA 8 HOH C 8 930 430 HOH H2O . 
BA 8 HOH D 1 911 411 HOH H2O . 
BA 8 HOH D 2 916 416 HOH H2O . 
BA 8 HOH D 3 931 431 HOH H2O . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MG 
_atom_site.label_atom_id         MG 
_atom_site.label_comp_id         MG 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         F 
_atom_site.label_entity_id       3 
_atom_site.Cartn_x               3.12 
_atom_site.Cartn_y               14.756 
_atom_site.Cartn_z               -9.655 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        22.29 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MG 
_atom_site.auth_comp_id          MG 
_atom_site.auth_seq_id           387 
_atom_site.auth_asym_id          A 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              10 
_model_server_stats.parse_time_ms           30 
_model_server_stats.create_model_time_ms    15 
_model_server_stats.query_time_ms           297 
_model_server_stats.encode_time_ms          11 
_model_server_stats.element_count           1 
#