data_1PR6
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_model_server_params.name     atom_site 
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_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
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_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              267.241 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
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_entity.pdbx_number_of_molecules    3 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
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_cell.Z_PDB               36 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
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_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        178 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 61 2 2' 
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_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA,PQS 
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_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      6 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
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_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1,2 
#
loop_
_pdbx_struct_oper_list.id
_pdbx_struct_oper_list.type
_pdbx_struct_oper_list.name
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]
1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 
2 'crystal symmetry operation' 12_555 x,x-y,-z+1/6 0.5 0.866025 0 0.866025 -0.5 0 0 0 -1 0 0 40.483333 
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loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 E N N 
? 3 G N N 
? 3 I N N 
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_chem_comp.formula           'C10 H13 N5 O4' 
_chem_comp.formula_weight    267.241 
_chem_comp.id                XYA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              2-(6-AMINO-OCTAHYDRO-PURIN-9-YL)-5-HYDROXYMETHYL-TETRAHYDRO-FURAN-3,4-DIOL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     9-BETA-D-XYLOFURANOSYL-ADENINE 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
O5' C5' XYA sing 352 n n 
O5' H5' XYA sing 353 n n 
C5' C4' XYA sing 354 n n 
C5' "H5'1" XYA sing 355 n n 
C5' "H5'2" XYA sing 356 n n 
C4' O4' XYA sing 357 n n 
C4' C3' XYA sing 358 n n 
C4' H4' XYA sing 359 n n 
O4' C1' XYA sing 360 n n 
C1' N9 XYA sing 361 n n 
C1' C2' XYA sing 362 n n 
C1' H1' XYA sing 363 n n 
N9 C8 XYA sing 364 n y 
N9 C4 XYA sing 365 n y 
C8 N7 XYA doub 366 n y 
C8 H8 XYA sing 367 n n 
N7 C5 XYA sing 368 n y 
C5 C6 XYA doub 369 n y 
C5 C4 XYA sing 370 n y 
C6 N1 XYA sing 371 n y 
C6 N6 XYA sing 372 n n 
N1 C2 XYA doub 373 n y 
C2 N3 XYA sing 374 n y 
C2 H2 XYA sing 375 n n 
N3 C4 XYA doub 376 n y 
N6 HN61 XYA sing 377 n n 
N6 HN62 XYA sing 378 n n 
C2' O2' XYA sing 379 n n 
C2' C3' XYA sing 380 n n 
C2' H2' XYA sing 381 n n 
O2' H1 XYA sing 382 n n 
C3' O3' XYA sing 383 n n 
C3' H3' XYA sing 384 n n 
O3' H3 XYA sing 385 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     1PR6 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.00819 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.004728 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.009457 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.004117 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
D 2 PO4 A 1 1248 247 PO4 PO4 . 
E 3 XYA A 1 1245 245 XYA XYA . 
F 2 PO4 B 1 1249 247 PO4 PO4 . 
G 3 XYA B 1 1246 245 XYA XYA . 
H 2 PO4 C 1 1250 247 PO4 PO4 . 
I 3 XYA C 1 1247 245 XYA XYA . 
J 4 HOH A 1 1249 3 HOH WAT . 
J 4 HOH A 2 1250 6 HOH WAT . 
J 4 HOH A 3 1251 12 HOH WAT . 
J 4 HOH A 4 1252 13 HOH WAT . 
J 4 HOH A 5 1253 20 HOH WAT . 
J 4 HOH A 6 1254 23 HOH WAT . 
J 4 HOH A 7 1255 24 HOH WAT . 
J 4 HOH A 8 1256 28 HOH WAT . 
J 4 HOH A 9 1257 32 HOH WAT . 
J 4 HOH A 10 1258 33 HOH WAT . 
J 4 HOH A 11 1259 43 HOH WAT . 
J 4 HOH A 12 1260 47 HOH WAT . 
J 4 HOH A 13 1261 49 HOH WAT . 
J 4 HOH A 14 1262 51 HOH WAT . 
J 4 HOH A 15 1263 57 HOH WAT . 
J 4 HOH A 16 1264 61 HOH WAT . 
J 4 HOH A 17 1265 65 HOH WAT . 
J 4 HOH A 18 1266 68 HOH WAT . 
J 4 HOH A 19 1267 73 HOH WAT . 
J 4 HOH A 20 1268 75 HOH WAT . 
J 4 HOH A 21 1269 77 HOH WAT . 
J 4 HOH A 22 1270 78 HOH WAT . 
J 4 HOH A 23 1271 79 HOH WAT . 
J 4 HOH A 24 1272 88 HOH WAT . 
J 4 HOH A 25 1273 89 HOH WAT . 
J 4 HOH A 26 1274 91 HOH WAT . 
J 4 HOH A 27 1275 94 HOH WAT . 
J 4 HOH A 28 1276 97 HOH WAT . 
J 4 HOH A 29 1277 98 HOH WAT . 
J 4 HOH A 30 1278 100 HOH WAT . 
J 4 HOH A 31 1279 104 HOH WAT . 
J 4 HOH A 32 1280 107 HOH WAT . 
J 4 HOH A 33 1281 110 HOH WAT . 
J 4 HOH A 34 1282 112 HOH WAT . 
J 4 HOH A 35 1283 113 HOH WAT . 
J 4 HOH A 36 1284 116 HOH WAT . 
J 4 HOH A 37 1285 117 HOH WAT . 
J 4 HOH A 38 1286 122 HOH WAT . 
J 4 HOH A 39 1287 125 HOH WAT . 
J 4 HOH A 40 1288 126 HOH WAT . 
J 4 HOH A 41 1289 130 HOH WAT . 
J 4 HOH A 42 1290 133 HOH WAT . 
J 4 HOH A 43 1291 134 HOH WAT . 
J 4 HOH A 44 1292 138 HOH WAT . 
J 4 HOH A 45 1293 139 HOH WAT . 
J 4 HOH A 46 1294 141 HOH WAT . 
J 4 HOH A 47 1295 152 HOH WAT . 
J 4 HOH A 48 1296 153 HOH WAT . 
J 4 HOH A 49 1297 156 HOH WAT . 
J 4 HOH A 50 1298 164 HOH WAT . 
J 4 HOH A 51 1299 170 HOH WAT . 
J 4 HOH A 52 1300 177 HOH WAT . 
J 4 HOH A 53 1301 181 HOH WAT . 
J 4 HOH A 54 1302 186 HOH WAT . 
J 4 HOH A 55 1303 187 HOH WAT . 
J 4 HOH A 56 1304 197 HOH WAT . 
J 4 HOH A 57 1305 198 HOH WAT . 
J 4 HOH A 58 1306 200 HOH WAT . 
J 4 HOH A 59 1307 206 HOH WAT . 
J 4 HOH A 60 1308 208 HOH WAT . 
J 4 HOH A 61 1309 211 HOH WAT . 
J 4 HOH A 62 1310 213 HOH WAT . 
J 4 HOH A 63 1311 214 HOH WAT . 
J 4 HOH A 64 1312 215 HOH WAT . 
J 4 HOH A 65 1313 218 HOH WAT . 
J 4 HOH A 66 1314 221 HOH WAT . 
J 4 HOH A 67 1315 222 HOH WAT . 
J 4 HOH A 68 1316 225 HOH WAT . 
J 4 HOH A 69 1317 227 HOH WAT . 
J 4 HOH A 70 1318 228 HOH WAT . 
J 4 HOH A 71 1319 235 HOH WAT . 
J 4 HOH A 72 1320 239 HOH WAT . 
J 4 HOH A 73 1321 241 HOH WAT . 
J 4 HOH A 74 1322 243 HOH WAT . 
J 4 HOH A 75 1323 251 HOH WAT . 
J 4 HOH A 76 1324 253 HOH WAT . 
J 4 HOH A 77 1325 262 HOH WAT . 
J 4 HOH A 78 1326 265 HOH WAT . 
J 4 HOH A 79 1327 266 HOH WAT . 
J 4 HOH A 80 1328 270 HOH WAT . 
J 4 HOH A 81 1329 271 HOH WAT . 
J 4 HOH A 82 1330 273 HOH WAT . 
J 4 HOH A 83 1331 274 HOH WAT . 
J 4 HOH A 84 1332 276 HOH WAT . 
J 4 HOH A 85 1333 278 HOH WAT . 
J 4 HOH A 86 1334 282 HOH WAT . 
J 4 HOH A 87 1335 285 HOH WAT . 
J 4 HOH A 88 1336 287 HOH WAT . 
J 4 HOH A 89 1337 288 HOH WAT . 
J 4 HOH A 90 1338 293 HOH WAT . 
J 4 HOH A 91 1339 294 HOH WAT . 
J 4 HOH A 92 1340 297 HOH WAT . 
J 4 HOH A 93 1341 303 HOH WAT . 
J 4 HOH A 94 1342 304 HOH WAT . 
J 4 HOH A 95 1343 305 HOH WAT . 
J 4 HOH A 96 1344 306 HOH WAT . 
J 4 HOH A 97 1345 307 HOH WAT . 
J 4 HOH A 98 1346 309 HOH WAT . 
J 4 HOH A 99 1347 310 HOH WAT . 
J 4 HOH A 100 1348 319 HOH WAT . 
J 4 HOH A 101 1349 322 HOH WAT . 
J 4 HOH A 102 1350 323 HOH WAT . 
J 4 HOH A 103 1351 328 HOH WAT . 
J 4 HOH A 104 1352 333 HOH WAT . 
J 4 HOH A 105 1353 335 HOH WAT . 
J 4 HOH A 106 1354 336 HOH WAT . 
J 4 HOH A 107 1355 339 HOH WAT . 
J 4 HOH A 108 1356 340 HOH WAT . 
J 4 HOH A 109 1357 341 HOH WAT . 
J 4 HOH A 110 1358 343 HOH WAT . 
J 4 HOH A 111 1359 345 HOH WAT . 
J 4 HOH A 112 1360 346 HOH WAT . 
J 4 HOH A 113 1361 350 HOH WAT . 
J 4 HOH A 114 1362 353 HOH WAT . 
K 4 HOH B 1 1250 2 HOH WAT . 
K 4 HOH B 2 1251 5 HOH WAT . 
K 4 HOH B 3 1252 9 HOH WAT . 
K 4 HOH B 4 1253 11 HOH WAT . 
K 4 HOH B 5 1254 15 HOH WAT . 
K 4 HOH B 6 1255 16 HOH WAT . 
K 4 HOH B 7 1256 17 HOH WAT . 
K 4 HOH B 8 1257 18 HOH WAT . 
K 4 HOH B 9 1258 21 HOH WAT . 
K 4 HOH B 10 1259 26 HOH WAT . 
K 4 HOH B 11 1260 27 HOH WAT . 
K 4 HOH B 12 1261 30 HOH WAT . 
K 4 HOH B 13 1262 31 HOH WAT . 
K 4 HOH B 14 1263 35 HOH WAT . 
K 4 HOH B 15 1264 37 HOH WAT . 
K 4 HOH B 16 1265 41 HOH WAT . 
K 4 HOH B 17 1266 42 HOH WAT . 
K 4 HOH B 18 1267 44 HOH WAT . 
K 4 HOH B 19 1268 53 HOH WAT . 
K 4 HOH B 20 1269 55 HOH WAT . 
K 4 HOH B 21 1270 56 HOH WAT . 
K 4 HOH B 22 1271 58 HOH WAT . 
K 4 HOH B 23 1272 60 HOH WAT . 
K 4 HOH B 24 1273 62 HOH WAT . 
K 4 HOH B 25 1274 63 HOH WAT . 
K 4 HOH B 26 1275 64 HOH WAT . 
K 4 HOH B 27 1276 67 HOH WAT . 
K 4 HOH B 28 1277 69 HOH WAT . 
K 4 HOH B 29 1278 71 HOH WAT . 
K 4 HOH B 30 1279 72 HOH WAT . 
K 4 HOH B 31 1280 76 HOH WAT . 
K 4 HOH B 32 1281 81 HOH WAT . 
K 4 HOH B 33 1282 82 HOH WAT . 
K 4 HOH B 34 1283 83 HOH WAT . 
K 4 HOH B 35 1284 84 HOH WAT . 
K 4 HOH B 36 1285 93 HOH WAT . 
K 4 HOH B 37 1286 96 HOH WAT . 
K 4 HOH B 38 1287 99 HOH WAT . 
K 4 HOH B 39 1288 102 HOH WAT . 
K 4 HOH B 40 1289 103 HOH WAT . 
K 4 HOH B 41 1290 106 HOH WAT . 
K 4 HOH B 42 1291 109 HOH WAT . 
K 4 HOH B 43 1292 114 HOH WAT . 
K 4 HOH B 44 1293 115 HOH WAT . 
K 4 HOH B 45 1294 123 HOH WAT . 
K 4 HOH B 46 1295 127 HOH WAT . 
K 4 HOH B 47 1296 131 HOH WAT . 
K 4 HOH B 48 1297 132 HOH WAT . 
K 4 HOH B 49 1298 135 HOH WAT . 
K 4 HOH B 50 1299 136 HOH WAT . 
K 4 HOH B 51 1300 137 HOH WAT . 
K 4 HOH B 52 1301 140 HOH WAT . 
K 4 HOH B 53 1302 143 HOH WAT . 
K 4 HOH B 54 1303 144 HOH WAT . 
K 4 HOH B 55 1304 145 HOH WAT . 
K 4 HOH B 56 1305 146 HOH WAT . 
K 4 HOH B 57 1306 147 HOH WAT . 
K 4 HOH B 58 1307 148 HOH WAT . 
K 4 HOH B 59 1308 155 HOH WAT . 
K 4 HOH B 60 1309 157 HOH WAT . 
K 4 HOH B 61 1310 158 HOH WAT . 
K 4 HOH B 62 1311 159 HOH WAT . 
K 4 HOH B 63 1312 160 HOH WAT . 
K 4 HOH B 64 1313 161 HOH WAT . 
K 4 HOH B 65 1314 166 HOH WAT . 
K 4 HOH B 66 1315 168 HOH WAT . 
K 4 HOH B 67 1316 173 HOH WAT . 
K 4 HOH B 68 1317 174 HOH WAT . 
K 4 HOH B 69 1318 178 HOH WAT . 
K 4 HOH B 70 1319 185 HOH WAT . 
K 4 HOH B 71 1320 195 HOH WAT . 
K 4 HOH B 72 1321 203 HOH WAT . 
K 4 HOH B 73 1322 204 HOH WAT . 
K 4 HOH B 74 1323 209 HOH WAT . 
K 4 HOH B 75 1324 210 HOH WAT . 
K 4 HOH B 76 1325 212 HOH WAT . 
K 4 HOH B 77 1326 220 HOH WAT . 
K 4 HOH B 78 1327 223 HOH WAT . 
K 4 HOH B 79 1328 229 HOH WAT . 
K 4 HOH B 80 1329 230 HOH WAT . 
K 4 HOH B 81 1330 232 HOH WAT . 
K 4 HOH B 82 1331 233 HOH WAT . 
K 4 HOH B 83 1332 234 HOH WAT . 
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