data_1PS3
#
_model_server_result.job_id            4LWPds7erXej-C7ZK93ihA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-24 16:41:29' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1ps3 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":1602}' 
#
_entry.id    1PS3 
#
_exptl.entry_id    1PS3 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              118.174 
_entity.id                          5 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            1PS3 
_cell.length_a            69.089 
_cell.length_b            109.803 
_cell.length_c            138.896 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1PS3 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    monomeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      1 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      5 
_struct_asym.id                             E 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 31 A CYS 31 1_555 A SG CYS 1032 A CYS 1032 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 275 A CYS 275 1_555 A SG CYS 282 A CYS 282 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf3 A SG CYS 283 A CYS 283 1_555 A SG CYS 297 A CYS 297 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf4 A SG CYS 902 A CYS 902 1_555 A SG CYS 987 A CYS 987 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
disulf ? disulf5 A SG CYS 1000 A CYS 1000 1_555 A SG CYS 1009 A CYS 1009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? 
metalc ? metalc1 A NE2 HIS 90 A HIS 90 1_555 C ZN ZN . A ZN 1601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.156 ? 
metalc ? metalc2 A OD1 ASP 92 A ASP 92 1_555 C ZN ZN . A ZN 1601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? 
metalc ? metalc3 A OD1 ASP 204 A ASP 204 1_555 C ZN ZN . A ZN 1601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.122 ? 
metalc ? metalc4 A NE2 HIS 471 A HIS 471 1_555 C ZN ZN . A ZN 1601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? 
metalc ? metalc5 D O2 KIF . A KIF 1501 1_555 C ZN ZN . A ZN 1601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? 
metalc ? metalc6 D O3 KIF . A KIF 1501 1_555 C ZN ZN . A ZN 1601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? 
#
_chem_comp.formula           'C6 H14 O2' 
_chem_comp.formula_weight    118.174 
_chem_comp.id                MRD 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 MRD sing 266 n n 
C1 H1C1 MRD sing 267 n n 
C1 H1C2 MRD sing 268 n n 
C1 H1C3 MRD sing 269 n n 
C2 O2 MRD sing 270 n n 
C2 CM MRD sing 271 n n 
C2 C3 MRD sing 272 n n 
O2 H2 MRD sing 273 n n 
CM HMC1 MRD sing 274 n n 
CM HMC2 MRD sing 275 n n 
CM HMC3 MRD sing 276 n n 
C3 C4 MRD sing 277 n n 
C3 H3C1 MRD sing 278 n n 
C3 H3C2 MRD sing 279 n n 
C4 O4 MRD sing 280 n n 
C4 C5 MRD sing 281 n n 
C4 H4 MRD sing 282 n n 
O4 HA MRD sing 283 n n 
C5 H5C1 MRD sing 284 n n 
C5 H5C2 MRD sing 285 n n 
C5 H5C3 MRD sing 286 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     1PS3 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.014474 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.009107 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.0072 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 NAG A 1 1046 1 NAG NAG . 
C 3 ZN A 1 1601 601 ZN ZN . 
D 4 KIF A 1 1501 501 KIF KIF . 
E 5 MRD A 1 1602 1 MRD MPD . 
F 6 HOH A 1 1603 1 HOH WAT . 
F 6 HOH A 2 1604 2 HOH WAT . 
F 6 HOH A 3 1605 3 HOH WAT . 
F 6 HOH A 4 1606 4 HOH WAT . 
F 6 HOH A 5 1607 5 HOH WAT . 
F 6 HOH A 6 1608 6 HOH WAT . 
F 6 HOH A 7 1609 7 HOH WAT . 
F 6 HOH A 8 1610 8 HOH WAT . 
F 6 HOH A 9 1611 9 HOH WAT . 
F 6 HOH A 10 1612 10 HOH WAT . 
F 6 HOH A 11 1613 11 HOH WAT . 
F 6 HOH A 12 1614 12 HOH WAT . 
F 6 HOH A 13 1615 13 HOH WAT . 
F 6 HOH A 14 1616 14 HOH WAT . 
F 6 HOH A 15 1617 15 HOH WAT . 
F 6 HOH A 16 1618 16 HOH WAT . 
F 6 HOH A 17 1619 17 HOH WAT . 
F 6 HOH A 18 1620 18 HOH WAT . 
F 6 HOH A 19 1621 19 HOH WAT . 
F 6 HOH A 20 1622 20 HOH WAT . 
F 6 HOH A 21 1623 21 HOH WAT . 
F 6 HOH A 22 1624 22 HOH WAT . 
F 6 HOH A 23 1625 23 HOH WAT . 
F 6 HOH A 24 1626 24 HOH WAT . 
F 6 HOH A 25 1627 25 HOH WAT . 
F 6 HOH A 26 1628 26 HOH WAT . 
F 6 HOH A 27 1629 27 HOH WAT . 
F 6 HOH A 28 1630 28 HOH WAT . 
F 6 HOH A 29 1631 29 HOH WAT . 
F 6 HOH A 30 1632 30 HOH WAT . 
F 6 HOH A 31 1633 31 HOH WAT . 
F 6 HOH A 32 1634 32 HOH WAT . 
F 6 HOH A 33 1635 33 HOH WAT . 
F 6 HOH A 34 1636 34 HOH WAT . 
F 6 HOH A 35 1637 35 HOH WAT . 
F 6 HOH A 36 1638 36 HOH WAT . 
F 6 HOH A 37 1639 37 HOH WAT . 
F 6 HOH A 38 1640 38 HOH WAT . 
F 6 HOH A 39 1641 39 HOH WAT . 
F 6 HOH A 40 1642 40 HOH WAT . 
F 6 HOH A 41 1643 41 HOH WAT . 
F 6 HOH A 42 1644 42 HOH WAT . 
F 6 HOH A 43 1645 43 HOH WAT . 
F 6 HOH A 44 1646 44 HOH WAT . 
F 6 HOH A 45 1647 45 HOH WAT . 
F 6 HOH A 46 1648 46 HOH WAT . 
F 6 HOH A 47 1649 47 HOH WAT . 
F 6 HOH A 48 1650 48 HOH WAT . 
F 6 HOH A 49 1651 49 HOH WAT . 
F 6 HOH A 50 1652 50 HOH WAT . 
F 6 HOH A 51 1653 51 HOH WAT . 
F 6 HOH A 52 1654 52 HOH WAT . 
F 6 HOH A 53 1655 53 HOH WAT . 
F 6 HOH A 54 1656 54 HOH WAT . 
F 6 HOH A 55 1657 55 HOH WAT . 
F 6 HOH A 56 1658 56 HOH WAT . 
F 6 HOH A 57 1659 57 HOH WAT . 
F 6 HOH A 58 1660 58 HOH WAT . 
F 6 HOH A 59 1661 59 HOH WAT . 
F 6 HOH A 60 1662 60 HOH WAT . 
F 6 HOH A 61 1663 61 HOH WAT . 
F 6 HOH A 62 1664 62 HOH WAT . 
F 6 HOH A 63 1665 63 HOH WAT . 
F 6 HOH A 64 1666 64 HOH WAT . 
F 6 HOH A 65 1667 65 HOH WAT . 
F 6 HOH A 66 1668 66 HOH WAT . 
F 6 HOH A 67 1669 67 HOH WAT . 
F 6 HOH A 68 1670 68 HOH WAT . 
F 6 HOH A 69 1671 69 HOH WAT . 
F 6 HOH A 70 1672 70 HOH WAT . 
F 6 HOH A 71 1673 71 HOH WAT . 
F 6 HOH A 72 1674 72 HOH WAT . 
F 6 HOH A 73 1675 73 HOH WAT . 
F 6 HOH A 74 1676 74 HOH WAT . 
F 6 HOH A 75 1677 75 HOH WAT . 
F 6 HOH A 76 1678 76 HOH WAT . 
F 6 HOH A 77 1679 77 HOH WAT . 
F 6 HOH A 78 1680 78 HOH WAT . 
F 6 HOH A 79 1681 79 HOH WAT . 
F 6 HOH A 80 1682 80 HOH WAT . 
F 6 HOH A 81 1683 81 HOH WAT . 
F 6 HOH A 82 1684 82 HOH WAT . 
F 6 HOH A 83 1685 83 HOH WAT . 
F 6 HOH A 84 1686 84 HOH WAT . 
F 6 HOH A 85 1687 85 HOH WAT . 
F 6 HOH A 86 1688 86 HOH WAT . 
F 6 HOH A 87 1689 87 HOH WAT . 
F 6 HOH A 88 1690 88 HOH WAT . 
F 6 HOH A 89 1691 89 HOH WAT . 
F 6 HOH A 90 1692 90 HOH WAT . 
F 6 HOH A 91 1693 91 HOH WAT . 
F 6 HOH A 92 1694 92 HOH WAT . 
F 6 HOH A 93 1695 93 HOH WAT . 
F 6 HOH A 94 1696 94 HOH WAT . 
F 6 HOH A 95 1697 95 HOH WAT . 
F 6 HOH A 96 1698 96 HOH WAT . 
F 6 HOH A 97 1699 97 HOH WAT . 
F 6 HOH A 98 1700 98 HOH WAT . 
F 6 HOH A 99 1701 99 HOH WAT . 
F 6 HOH A 100 1702 100 HOH WAT . 
F 6 HOH A 101 1703 101 HOH WAT . 
F 6 HOH A 102 1704 102 HOH WAT . 
F 6 HOH A 103 1705 103 HOH WAT . 
F 6 HOH A 104 1706 104 HOH WAT . 
F 6 HOH A 105 1707 105 HOH WAT . 
F 6 HOH A 106 1708 106 HOH WAT . 
F 6 HOH A 107 1709 107 HOH WAT . 
F 6 HOH A 108 1710 108 HOH WAT . 
F 6 HOH A 109 1711 109 HOH WAT . 
F 6 HOH A 110 1712 110 HOH WAT . 
F 6 HOH A 111 1713 111 HOH WAT . 
F 6 HOH A 112 1714 112 HOH WAT . 
F 6 HOH A 113 1715 113 HOH WAT . 
F 6 HOH A 114 1716 114 HOH WAT . 
F 6 HOH A 115 1717 115 HOH WAT . 
F 6 HOH A 116 1718 116 HOH WAT . 
F 6 HOH A 117 1719 117 HOH WAT . 
F 6 HOH A 118 1720 118 HOH WAT . 
F 6 HOH A 119 1721 119 HOH WAT . 
F 6 HOH A 120 1722 120 HOH WAT . 
F 6 HOH A 121 1723 121 HOH WAT . 
F 6 HOH A 122 1724 122 HOH WAT . 
F 6 HOH A 123 1725 123 HOH WAT . 
F 6 HOH A 124 1726 124 HOH WAT . 
F 6 HOH A 125 1727 125 HOH WAT . 
F 6 HOH A 126 1728 126 HOH WAT . 
F 6 HOH A 127 1729 127 HOH WAT . 
F 6 HOH A 128 1730 128 HOH WAT . 
F 6 HOH A 129 1731 129 HOH WAT . 
F 6 HOH A 130 1732 130 HOH WAT . 
F 6 HOH A 131 1733 131 HOH WAT . 
F 6 HOH A 132 1734 132 HOH WAT . 
F 6 HOH A 133 1735 133 HOH WAT . 
F 6 HOH A 134 1736 134 HOH WAT . 
F 6 HOH A 135 1737 135 HOH WAT . 
F 6 HOH A 136 1738 136 HOH WAT . 
F 6 HOH A 137 1739 137 HOH WAT . 
F 6 HOH A 138 1740 138 HOH WAT . 
F 6 HOH A 139 1741 139 HOH WAT . 
F 6 HOH A 140 1742 140 HOH WAT . 
F 6 HOH A 141 1743 141 HOH WAT . 
F 6 HOH A 142 1744 142 HOH WAT . 
F 6 HOH A 143 1745 143 HOH WAT . 
F 6 HOH A 144 1746 144 HOH WAT . 
F 6 HOH A 145 1747 145 HOH WAT . 
F 6 HOH A 146 1748 146 HOH WAT . 
F 6 HOH A 147 1749 147 HOH WAT . 
F 6 HOH A 148 1750 148 HOH WAT . 
F 6 HOH A 149 1751 149 HOH WAT . 
F 6 HOH A 150 1752 150 HOH WAT . 
F 6 HOH A 151 1753 151 HOH WAT . 
F 6 HOH A 152 1754 152 HOH WAT . 
F 6 HOH A 153 1755 153 HOH WAT . 
F 6 HOH A 154 1756 154 HOH WAT . 
F 6 HOH A 155 1757 155 HOH WAT . 
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F 6 HOH A 157 1759 157 HOH WAT . 
F 6 HOH A 158 1760 158 HOH WAT . 
F 6 HOH A 159 1761 159 HOH WAT . 
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F 6 HOH A 161 1763 161 HOH WAT . 
F 6 HOH A 162 1764 162 HOH WAT . 
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F 6 HOH A 164 1766 164 HOH WAT . 
F 6 HOH A 165 1767 165 HOH WAT . 
F 6 HOH A 166 1768 166 HOH WAT . 
F 6 HOH A 167 1769 167 HOH WAT . 
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