data_1PV8 # _model_server_result.job_id '_bF4hxSTb4Iq_F_OPf1eqQ' _model_server_result.datetime_utc '2024-11-25 18:46:04' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1pv8 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":401}' # _entry.id 1PV8 # _exptl.entry_id 1PV8 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 1PV8 _cell.length_a 89.571 _cell.length_b 89.571 _cell.length_c 153.19 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1PV8 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 173 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 63' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA,PQS _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2,3 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 2_765 -y+2,x-y+1,z -0.5 -0.866025 0 0.866025 -0.5 0 0 0 1 134.3565 77.570761 0 3 'crystal symmetry operation' 3_675 -x+y+1,-x+2,z -0.5 0.866025 0 -0.866025 -0.5 0 0 0 1 0 155.141523 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 E N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A NZ LYS 199 A LYS 199 1_555 D C5 PB1 . A PB1 350 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.288 ? covale ? covale2 A NZ LYS 252 A LYS 252 1_555 D C3 PB1 . A PB1 350 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1PV8 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.011164 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.006446 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.012891 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006528 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 ZN A 1 401 401 ZN ZN2 . D 3 PB1 A 1 350 350 PB1 PB1 . E 2 ZN B 1 401 401 ZN ZN2 . F 4 HOH A 1 501 501 HOH WAT . F 4 HOH A 2 507 507 HOH WAT . F 4 HOH A 3 508 508 HOH WAT . F 4 HOH A 4 509 509 HOH WAT . F 4 HOH A 5 510 510 HOH WAT . F 4 HOH A 6 511 511 HOH WAT . F 4 HOH A 7 513 513 HOH WAT . F 4 HOH A 8 520 520 HOH WAT . F 4 HOH A 9 521 521 HOH WAT . F 4 HOH A 10 524 524 HOH WAT . F 4 HOH A 11 527 527 HOH WAT . F 4 HOH A 12 530 530 HOH WAT . F 4 HOH A 13 534 534 HOH WAT . F 4 HOH A 14 535 535 HOH WAT . F 4 HOH A 15 536 536 HOH WAT . F 4 HOH A 16 539 539 HOH WAT . F 4 HOH A 17 541 541 HOH WAT . F 4 HOH A 18 542 542 HOH WAT . F 4 HOH A 19 544 544 HOH WAT . F 4 HOH A 20 546 546 HOH WAT . F 4 HOH A 21 547 547 HOH WAT . F 4 HOH A 22 549 549 HOH WAT . F 4 HOH A 23 551 551 HOH WAT . F 4 HOH A 24 553 553 HOH WAT . F 4 HOH A 25 554 554 HOH WAT . F 4 HOH A 26 555 555 HOH WAT . F 4 HOH A 27 557 557 HOH WAT . F 4 HOH A 28 560 560 HOH WAT . F 4 HOH A 29 561 561 HOH WAT . F 4 HOH A 30 563 563 HOH WAT . F 4 HOH A 31 564 564 HOH WAT . F 4 HOH A 32 565 565 HOH WAT . F 4 HOH A 33 567 567 HOH WAT . F 4 HOH A 34 569 569 HOH WAT . F 4 HOH A 35 570 570 HOH WAT . F 4 HOH A 36 571 571 HOH WAT . F 4 HOH A 37 574 574 HOH WAT . F 4 HOH A 38 577 577 HOH WAT . F 4 HOH A 39 579 579 HOH WAT . F 4 HOH A 40 580 580 HOH WAT . F 4 HOH A 41 581 581 HOH WAT . F 4 HOH A 42 582 582 HOH WAT . F 4 HOH A 43 583 583 HOH WAT . F 4 HOH A 44 584 584 HOH WAT . F 4 HOH A 45 585 585 HOH WAT . F 4 HOH A 46 586 586 HOH WAT . F 4 HOH A 47 589 589 HOH WAT . F 4 HOH A 48 595 595 HOH WAT . F 4 HOH A 49 597 597 HOH WAT . F 4 HOH A 50 599 599 HOH WAT . F 4 HOH A 51 600 600 HOH WAT . F 4 HOH A 52 601 601 HOH WAT . F 4 HOH A 53 602 602 HOH WAT . F 4 HOH A 54 607 607 HOH WAT . F 4 HOH A 55 608 608 HOH WAT . F 4 HOH A 56 609 609 HOH WAT . F 4 HOH A 57 610 610 HOH WAT . F 4 HOH A 58 611 611 HOH WAT . F 4 HOH A 59 613 613 HOH WAT . F 4 HOH A 60 615 615 HOH WAT . F 4 HOH A 61 621 621 HOH WAT . F 4 HOH A 62 626 626 HOH WAT . F 4 HOH A 63 628 628 HOH WAT . F 4 HOH A 64 629 629 HOH WAT . F 4 HOH A 65 632 632 HOH WAT . F 4 HOH A 66 633 633 HOH WAT . F 4 HOH A 67 635 635 HOH WAT . F 4 HOH A 68 636 636 HOH WAT . F 4 HOH A 69 637 637 HOH WAT . F 4 HOH A 70 642 642 HOH WAT . F 4 HOH A 71 643 643 HOH WAT . F 4 HOH A 72 646 646 HOH WAT . F 4 HOH A 73 647 647 HOH WAT . F 4 HOH A 74 648 648 HOH WAT . F 4 HOH A 75 650 650 HOH WAT . F 4 HOH A 76 653 653 HOH WAT . F 4 HOH A 77 654 654 HOH WAT . F 4 HOH A 78 656 656 HOH WAT . F 4 HOH A 79 659 659 HOH WAT . F 4 HOH A 80 662 662 HOH WAT . F 4 HOH A 81 664 664 HOH WAT . F 4 HOH A 82 665 665 HOH WAT . F 4 HOH A 83 667 667 HOH WAT . F 4 HOH A 84 672 672 HOH WAT . F 4 HOH A 85 673 673 HOH WAT . F 4 HOH A 86 674 674 HOH WAT . F 4 HOH A 87 676 676 HOH WAT . F 4 HOH A 88 677 677 HOH WAT . F 4 HOH A 89 679 679 HOH WAT . F 4 HOH A 90 680 680 HOH WAT . F 4 HOH A 91 684 684 HOH WAT . F 4 HOH A 92 686 686 HOH WAT . F 4 HOH A 93 687 687 HOH WAT . F 4 HOH A 94 688 688 HOH WAT . F 4 HOH A 95 690 690 HOH WAT . F 4 HOH A 96 691 691 HOH WAT . F 4 HOH A 97 692 692 HOH WAT . F 4 HOH A 98 693 693 HOH WAT . F 4 HOH A 99 695 695 HOH WAT . F 4 HOH A 100 701 701 HOH WAT . F 4 HOH A 101 703 703 HOH WAT . F 4 HOH A 102 704 704 HOH WAT . F 4 HOH A 103 706 706 HOH WAT . F 4 HOH A 104 710 710 HOH WAT . F 4 HOH A 105 711 711 HOH WAT . F 4 HOH A 106 712 712 HOH WAT . F 4 HOH A 107 717 717 HOH WAT . F 4 HOH A 108 719 719 HOH WAT . F 4 HOH A 109 722 722 HOH WAT . F 4 HOH A 110 725 725 HOH WAT . F 4 HOH A 111 726 726 HOH WAT . F 4 HOH A 112 727 727 HOH WAT . F 4 HOH A 113 730 730 HOH WAT . F 4 HOH A 114 732 732 HOH WAT . F 4 HOH A 115 733 733 HOH WAT . F 4 HOH A 116 734 734 HOH WAT . F 4 HOH A 117 735 735 HOH WAT . F 4 HOH A 118 736 736 HOH WAT . F 4 HOH A 119 737 737 HOH WAT . F 4 HOH A 120 738 738 HOH WAT . F 4 HOH A 121 739 739 HOH WAT . F 4 HOH A 122 740 740 HOH WAT . F 4 HOH A 123 741 741 HOH WAT . G 4 HOH B 1 502 502 HOH WAT . G 4 HOH B 2 503 503 HOH WAT . G 4 HOH B 3 504 504 HOH WAT . G 4 HOH B 4 505 505 HOH WAT . G 4 HOH B 5 506 506 HOH WAT . G 4 HOH B 6 512 512 HOH WAT . G 4 HOH B 7 514 514 HOH WAT . G 4 HOH B 8 515 515 HOH WAT . G 4 HOH B 9 516 516 HOH WAT . G 4 HOH B 10 517 517 HOH WAT . G 4 HOH B 11 518 518 HOH WAT . G 4 HOH B 12 519 519 HOH WAT . G 4 HOH B 13 522 522 HOH WAT . G 4 HOH B 14 523 523 HOH WAT . G 4 HOH B 15 525 525 HOH WAT . G 4 HOH B 16 526 526 HOH WAT . G 4 HOH B 17 528 528 HOH WAT . G 4 HOH B 18 529 529 HOH WAT . G 4 HOH B 19 531 531 HOH WAT . G 4 HOH B 20 532 532 HOH WAT . G 4 HOH B 21 533 533 HOH WAT . G 4 HOH B 22 537 537 HOH WAT . G 4 HOH B 23 538 538 HOH WAT . G 4 HOH B 24 540 540 HOH WAT . G 4 HOH B 25 543 543 HOH WAT . G 4 HOH B 26 545 545 HOH WAT . G 4 HOH B 27 548 548 HOH WAT . G 4 HOH B 28 550 550 HOH WAT . G 4 HOH B 29 552 552 HOH WAT . G 4 HOH B 30 556 556 HOH WAT . G 4 HOH B 31 558 558 HOH WAT . G 4 HOH B 32 559 559 HOH WAT . G 4 HOH B 33 562 562 HOH WAT . G 4 HOH B 34 566 566 HOH WAT . G 4 HOH B 35 568 568 HOH WAT . G 4 HOH B 36 572 572 HOH WAT . G 4 HOH B 37 573 573 HOH WAT . G 4 HOH B 38 575 575 HOH WAT . G 4 HOH B 39 576 576 HOH WAT . G 4 HOH B 40 578 578 HOH WAT . G 4 HOH B 41 587 587 HOH WAT . G 4 HOH B 42 588 588 HOH WAT . G 4 HOH B 43 590 590 HOH WAT . G 4 HOH B 44 591 591 HOH WAT . G 4 HOH B 45 592 592 HOH WAT . G 4 HOH B 46 593 593 HOH WAT . G 4 HOH B 47 594 594 HOH WAT . G 4 HOH B 48 596 596 HOH WAT . G 4 HOH B 49 598 598 HOH WAT . G 4 HOH B 50 603 603 HOH WAT . G 4 HOH B 51 604 604 HOH WAT . G 4 HOH B 52 605 605 HOH WAT . G 4 HOH B 53 606 606 HOH WAT . G 4 HOH B 54 612 612 HOH WAT . G 4 HOH B 55 614 614 HOH WAT . G 4 HOH B 56 616 616 HOH WAT . G 4 HOH B 57 617 617 HOH WAT . G 4 HOH B 58 618 618 HOH WAT . G 4 HOH B 59 619 619 HOH WAT . G 4 HOH B 60 620 620 HOH WAT . G 4 HOH B 61 622 622 HOH WAT . G 4 HOH B 62 623 623 HOH WAT . G 4 HOH B 63 624 624 HOH WAT . G 4 HOH B 64 625 625 HOH WAT . G 4 HOH B 65 627 627 HOH WAT . G 4 HOH B 66 630 630 HOH WAT . G 4 HOH B 67 631 631 HOH WAT . G 4 HOH B 68 634 634 HOH WAT . G 4 HOH B 69 638 638 HOH WAT . G 4 HOH B 70 639 639 HOH WAT . G 4 HOH B 71 640 640 HOH WAT . G 4 HOH B 72 641 641 HOH WAT . G 4 HOH B 73 644 644 HOH WAT . G 4 HOH B 74 645 645 HOH WAT . G 4 HOH B 75 649 649 HOH WAT . G 4 HOH B 76 651 651 HOH WAT . G 4 HOH B 77 652 652 HOH WAT . G 4 HOH B 78 655 655 HOH WAT . G 4 HOH B 79 657 657 HOH WAT . G 4 HOH B 80 658 658 HOH WAT . G 4 HOH B 81 660 660 HOH WAT . G 4 HOH B 82 661 661 HOH WAT . G 4 HOH B 83 663 663 HOH WAT . G 4 HOH B 84 666 666 HOH WAT . G 4 HOH B 85 668 668 HOH WAT . G 4 HOH B 86 669 669 HOH WAT . G 4 HOH B 87 670 670 HOH WAT . G 4 HOH B 88 671 671 HOH WAT . G 4 HOH B 89 675 675 HOH WAT . G 4 HOH B 90 678 678 HOH WAT . G 4 HOH B 91 681 681 HOH WAT . G 4 HOH B 92 682 682 HOH WAT . G 4 HOH B 93 683 683 HOH WAT . G 4 HOH B 94 685 685 HOH WAT . G 4 HOH B 95 689 689 HOH WAT . G 4 HOH B 96 694 694 HOH WAT . G 4 HOH B 97 696 696 HOH WAT . G 4 HOH B 98 697 697 HOH WAT . G 4 HOH B 99 698 698 HOH WAT . G 4 HOH B 100 699 699 HOH WAT . G 4 HOH B 101 700 700 HOH WAT . G 4 HOH B 102 702 702 HOH WAT . G 4 HOH B 103 705 705 HOH WAT . G 4 HOH B 104 707 707 HOH WAT . G 4 HOH B 105 708 708 HOH WAT . G 4 HOH B 106 709 709 HOH WAT . G 4 HOH B 107 713 713 HOH WAT . G 4 HOH B 108 714 714 HOH WAT . G 4 HOH B 109 715 715 HOH WAT . G 4 HOH B 110 716 716 HOH WAT . G 4 HOH B 111 718 718 HOH WAT . G 4 HOH B 112 720 720 HOH WAT . G 4 HOH B 113 721 721 HOH WAT . G 4 HOH B 114 723 723 HOH WAT . G 4 HOH B 115 724 724 HOH WAT . G 4 HOH B 116 728 728 HOH WAT . G 4 HOH B 117 729 729 HOH WAT . G 4 HOH B 118 731 731 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id C _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 30.327 _atom_site.Cartn_y 56.433 _atom_site.Cartn_z 23.819 _atom_site.occupancy 0.5 _atom_site.B_iso_or_equiv 92 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 401 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 67 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 7 _model_server_stats.query_time_ms 265 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #