data_1PZ0 # _model_server_result.job_id G1Fdl6zHYPBRp-3tH_op8Q _model_server_result.datetime_utc '2024-11-13 09:00:45' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1pz0 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":314}' # _entry.id 1PZ0 # _exptl.entry_id 1PZ0 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 22.99 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'SODIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1PZ0 _cell.length_a 45.525 _cell.length_b 84.262 _cell.length_c 93.953 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1PZ0 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id B _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C THR 50 A THR 50 1_555 A N MSE 51 A MSE 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale2 A C MSE 51 A MSE 51 1_555 A N LEU 52 A LEU 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale3 A C GLU 142 A GLU 142 1_555 A N MSE 143 A MSE 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale4 A C MSE 143 A MSE 143 1_555 A N LYS 144 A LYS 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? metalc ? metalc1 A O LEU 268 A LEU 268 1_555 B NA NA . A NA 314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.592 ? metalc ? metalc2 A O ARG 270 A ARG 270 1_555 B NA NA . A NA 314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? metalc ? metalc3 A O ILE 273 A ILE 273 1_555 B NA NA . A NA 314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.633 ? metalc ? metalc4 B NA NA . A NA 314 1_555 D O HOH . A HOH 337 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? metalc ? metalc5 B NA NA . A NA 314 1_555 D O HOH . A HOH 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? metalc ? metalc6 B NA NA . A NA 314 1_555 D O HOH . A HOH 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.621 ? # _chem_comp.formula 'Na 1' _chem_comp.formula_weight 22.99 _chem_comp.id NA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'SODIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1PZ0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.021966 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.011868 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.010644 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 NA A 1 314 314 NA NA . C 3 NAP A 1 313 313 NAP NAP . D 4 HOH A 1 315 1 HOH WAT . D 4 HOH A 2 316 2 HOH WAT . D 4 HOH A 3 317 3 HOH WAT . D 4 HOH A 4 318 4 HOH WAT . D 4 HOH A 5 319 5 HOH WAT . D 4 HOH A 6 320 6 HOH WAT . D 4 HOH A 7 321 7 HOH WAT . D 4 HOH A 8 322 8 HOH WAT . D 4 HOH A 9 323 9 HOH WAT . D 4 HOH A 10 324 10 HOH WAT . D 4 HOH A 11 325 11 HOH WAT . D 4 HOH A 12 326 12 HOH WAT . D 4 HOH A 13 327 13 HOH WAT . D 4 HOH A 14 328 14 HOH WAT . D 4 HOH A 15 329 15 HOH WAT . D 4 HOH A 16 330 16 HOH WAT . D 4 HOH A 17 331 17 HOH WAT . D 4 HOH A 18 332 18 HOH WAT . D 4 HOH A 19 333 19 HOH WAT . D 4 HOH A 20 334 20 HOH WAT . D 4 HOH A 21 335 21 HOH WAT . D 4 HOH A 22 336 22 HOH WAT . D 4 HOH A 23 337 23 HOH WAT . D 4 HOH A 24 338 24 HOH WAT . D 4 HOH A 25 339 25 HOH WAT . D 4 HOH A 26 340 26 HOH WAT . D 4 HOH A 27 341 27 HOH WAT . D 4 HOH A 28 342 28 HOH WAT . D 4 HOH A 29 343 29 HOH WAT . D 4 HOH A 30 344 30 HOH WAT . D 4 HOH A 31 345 31 HOH WAT . D 4 HOH A 32 346 32 HOH WAT . D 4 HOH A 33 347 33 HOH WAT . D 4 HOH A 34 348 34 HOH WAT . D 4 HOH A 35 349 35 HOH WAT . D 4 HOH A 36 350 36 HOH WAT . D 4 HOH A 37 351 37 HOH WAT . D 4 HOH A 38 352 38 HOH WAT . D 4 HOH A 39 353 39 HOH WAT . D 4 HOH A 40 354 40 HOH WAT . D 4 HOH A 41 355 41 HOH WAT . D 4 HOH A 42 356 42 HOH WAT . D 4 HOH A 43 357 43 HOH WAT . D 4 HOH A 44 358 44 HOH WAT . D 4 HOH A 45 359 45 HOH WAT . D 4 HOH A 46 360 46 HOH WAT . D 4 HOH A 47 361 47 HOH WAT . D 4 HOH A 48 362 48 HOH WAT . D 4 HOH A 49 363 49 HOH WAT . D 4 HOH A 50 364 50 HOH WAT . D 4 HOH A 51 365 51 HOH WAT . D 4 HOH A 52 366 52 HOH WAT . D 4 HOH A 53 367 53 HOH WAT . D 4 HOH A 54 368 54 HOH WAT . D 4 HOH A 55 369 55 HOH WAT . D 4 HOH A 56 370 56 HOH WAT . D 4 HOH A 57 371 57 HOH WAT . D 4 HOH A 58 372 58 HOH WAT . D 4 HOH A 59 373 59 HOH WAT . D 4 HOH A 60 374 60 HOH WAT . D 4 HOH A 61 375 61 HOH WAT . D 4 HOH A 62 376 62 HOH WAT . D 4 HOH A 63 377 63 HOH WAT . D 4 HOH A 64 378 64 HOH WAT . D 4 HOH A 65 379 65 HOH WAT . D 4 HOH A 66 380 66 HOH WAT . D 4 HOH A 67 381 67 HOH WAT . D 4 HOH A 68 382 68 HOH WAT . D 4 HOH A 69 383 69 HOH WAT . D 4 HOH A 70 384 70 HOH WAT . D 4 HOH A 71 385 71 HOH WAT . D 4 HOH A 72 386 72 HOH WAT . D 4 HOH A 73 387 73 HOH WAT . D 4 HOH A 74 388 74 HOH WAT . D 4 HOH A 75 389 75 HOH WAT . D 4 HOH A 76 390 76 HOH WAT . D 4 HOH A 77 391 77 HOH WAT . D 4 HOH A 78 392 78 HOH WAT . D 4 HOH A 79 393 79 HOH WAT . D 4 HOH A 80 394 80 HOH WAT . D 4 HOH A 81 395 81 HOH WAT . D 4 HOH A 82 396 82 HOH WAT . D 4 HOH A 83 397 83 HOH WAT . D 4 HOH A 84 398 84 HOH WAT . D 4 HOH A 85 399 85 HOH WAT . D 4 HOH A 86 400 86 HOH WAT . D 4 HOH A 87 401 87 HOH WAT . D 4 HOH A 88 402 88 HOH WAT . D 4 HOH A 89 403 89 HOH WAT . D 4 HOH A 90 404 90 HOH WAT . D 4 HOH A 91 405 91 HOH WAT . D 4 HOH A 92 406 92 HOH WAT . D 4 HOH A 93 407 93 HOH WAT . D 4 HOH A 94 408 94 HOH WAT . D 4 HOH A 95 409 95 HOH WAT . D 4 HOH A 96 410 96 HOH WAT . D 4 HOH A 97 411 97 HOH WAT . D 4 HOH A 98 412 98 HOH WAT . D 4 HOH A 99 413 99 HOH WAT . D 4 HOH A 100 414 100 HOH WAT . D 4 HOH A 101 415 101 HOH WAT . D 4 HOH A 102 416 102 HOH WAT . D 4 HOH A 103 417 103 HOH WAT . D 4 HOH A 104 418 104 HOH WAT . D 4 HOH A 105 419 105 HOH WAT . D 4 HOH A 106 420 106 HOH WAT . D 4 HOH A 107 421 107 HOH WAT . D 4 HOH A 108 422 108 HOH WAT . D 4 HOH A 109 423 109 HOH WAT . D 4 HOH A 110 424 110 HOH WAT . D 4 HOH A 111 425 111 HOH WAT . D 4 HOH A 112 426 112 HOH WAT . D 4 HOH A 113 427 113 HOH WAT . D 4 HOH A 114 428 114 HOH WAT . D 4 HOH A 115 429 115 HOH WAT . D 4 HOH A 116 430 116 HOH WAT . D 4 HOH A 117 431 117 HOH WAT . D 4 HOH A 118 432 118 HOH WAT . D 4 HOH A 119 433 119 HOH WAT . D 4 HOH A 120 434 120 HOH WAT . D 4 HOH A 121 435 121 HOH WAT . D 4 HOH A 122 436 122 HOH WAT . D 4 HOH A 123 437 123 HOH WAT . D 4 HOH A 124 438 124 HOH WAT . D 4 HOH A 125 439 125 HOH WAT . D 4 HOH A 126 440 126 HOH WAT . D 4 HOH A 127 441 127 HOH WAT . D 4 HOH A 128 442 128 HOH WAT . D 4 HOH A 129 443 129 HOH WAT . D 4 HOH A 130 444 130 HOH WAT . D 4 HOH A 131 445 131 HOH WAT . D 4 HOH A 132 446 132 HOH WAT . D 4 HOH A 133 447 133 HOH WAT . D 4 HOH A 134 448 134 HOH WAT . D 4 HOH A 135 449 135 HOH WAT . D 4 HOH A 136 450 136 HOH WAT . D 4 HOH A 137 451 137 HOH WAT . D 4 HOH A 138 452 138 HOH WAT . D 4 HOH A 139 453 139 HOH WAT . D 4 HOH A 140 454 140 HOH WAT . D 4 HOH A 141 455 141 HOH WAT . D 4 HOH A 142 456 142 HOH WAT . D 4 HOH A 143 457 143 HOH WAT . D 4 HOH A 144 458 144 HOH WAT . D 4 HOH A 145 459 145 HOH WAT . D 4 HOH A 146 460 146 HOH WAT . D 4 HOH A 147 461 147 HOH WAT . D 4 HOH A 148 462 148 HOH WAT . D 4 HOH A 149 463 149 HOH WAT . D 4 HOH A 150 464 150 HOH WAT . D 4 HOH A 151 465 151 HOH WAT . D 4 HOH A 152 466 152 HOH WAT . D 4 HOH A 153 467 153 HOH WAT . D 4 HOH A 154 468 154 HOH WAT . D 4 HOH A 155 469 155 HOH WAT . D 4 HOH A 156 470 156 HOH WAT . D 4 HOH A 157 471 157 HOH WAT . D 4 HOH A 158 472 158 HOH WAT . D 4 HOH A 159 473 159 HOH WAT . D 4 HOH A 160 474 160 HOH WAT . D 4 HOH A 161 475 161 HOH WAT . D 4 HOH A 162 476 162 HOH WAT . D 4 HOH A 163 477 163 HOH WAT . D 4 HOH A 164 478 164 HOH WAT . D 4 HOH A 165 479 165 HOH WAT . D 4 HOH A 166 480 166 HOH WAT . D 4 HOH A 167 481 167 HOH WAT . D 4 HOH A 168 482 168 HOH WAT . D 4 HOH A 169 483 169 HOH WAT . D 4 HOH A 170 484 170 HOH WAT . D 4 HOH A 171 485 171 HOH WAT . D 4 HOH A 172 486 172 HOH WAT . D 4 HOH A 173 487 173 HOH WAT . D 4 HOH A 174 488 174 HOH WAT . D 4 HOH A 175 489 175 HOH WAT . D 4 HOH A 176 490 176 HOH WAT . D 4 HOH A 177 491 177 HOH WAT . D 4 HOH A 178 492 178 HOH WAT . D 4 HOH A 179 493 179 HOH WAT . D 4 HOH A 180 494 180 HOH WAT . D 4 HOH A 181 495 181 HOH WAT . D 4 HOH A 182 496 182 HOH WAT . D 4 HOH A 183 497 183 HOH WAT . D 4 HOH A 184 498 184 HOH WAT . D 4 HOH A 185 499 185 HOH WAT . D 4 HOH A 186 500 186 HOH WAT . D 4 HOH A 187 501 187 HOH WAT . D 4 HOH A 188 502 188 HOH WAT . D 4 HOH A 189 503 189 HOH WAT . D 4 HOH A 190 504 190 HOH WAT . D 4 HOH A 191 505 191 HOH WAT . D 4 HOH A 192 506 192 HOH WAT . D 4 HOH A 193 507 193 HOH WAT . D 4 HOH A 194 508 194 HOH WAT . D 4 HOH A 195 509 195 HOH WAT . D 4 HOH A 196 510 196 HOH WAT . D 4 HOH A 197 511 197 HOH WAT . D 4 HOH A 198 512 198 HOH WAT . D 4 HOH A 199 513 199 HOH WAT . D 4 HOH A 200 514 200 HOH WAT . D 4 HOH A 201 515 201 HOH WAT . D 4 HOH A 202 516 202 HOH WAT . D 4 HOH A 203 517 203 HOH WAT . D 4 HOH A 204 518 204 HOH WAT . D 4 HOH A 205 519 205 HOH WAT . D 4 HOH A 206 520 206 HOH WAT . D 4 HOH A 207 521 207 HOH WAT . D 4 HOH A 208 522 208 HOH WAT . D 4 HOH A 209 523 209 HOH WAT . D 4 HOH A 210 524 210 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol NA _atom_site.label_atom_id NA _atom_site.label_comp_id NA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id B _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 22.09 _atom_site.Cartn_y 5.498 _atom_site.Cartn_z 61.662 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 24.15 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id NA _atom_site.auth_comp_id NA _atom_site.auth_seq_id 314 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 7 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 5 _model_server_stats.query_time_ms 306 _model_server_stats.encode_time_ms 9 _model_server_stats.element_count 1 #