data_1PZN # _model_server_result.job_id G6P70mk_rycB_F_22QiRmw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-24 18:23:00' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1pzn # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"U","auth_seq_id":362}' # _entry.id 1PZN # _exptl.entry_id 1PZN _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 69.085 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description IMIDAZOLE _entity.pdbx_number_of_molecules 9 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1PZN _cell.length_a 144.163 _cell.length_b 193.124 _cell.length_c 176.93 _cell.Z_PDB 56 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1PZN _symmetry.cell_setting orthorhombic _symmetry.Int_Tables_number 20 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'C 2 2 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? tetradecameric 14 author_defined_assembly 1 PISA,PQS heptameric 7 software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA 1 1,2 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA 2 1 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 3_353 -x-2,y,-z-3/2 -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 -288.326 0 -265.395 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 I N N ? 3 J N N ? 3 K N N ? 3 L N N ? 3 O N N ? 3 P N N ? 3 Q N N ? 3 U N N ? 3 DA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C PHE 97 A PHE 97 1_555 A N MSE 98 A MSE 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale2 A C MSE 98 A MSE 98 1_555 A N ARG 99 A ARG 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale3 A C VAL 153 A VAL 153 1_555 A N MSE 154 A MSE 154 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale4 A C MSE 154 A MSE 154 1_555 A N VAL 155 A VAL 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale5 A C GLN 211 A GLN 211 1_555 A N MSE 212 A MSE 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale6 A C MSE 212 A MSE 212 1_555 A N LEU 213 A LEU 213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.319 ? covale ? covale7 B C PHE 97 B PHE 97 1_555 B N MSE 98 B MSE 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale8 B C MSE 98 B MSE 98 1_555 B N ARG 99 B ARG 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale9 B C VAL 153 B VAL 153 1_555 B N MSE 154 B MSE 154 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale10 B C MSE 154 B MSE 154 1_555 B N VAL 155 B VAL 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale11 B C GLN 211 B GLN 211 1_555 B N MSE 212 B MSE 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale12 B C MSE 212 B MSE 212 1_555 B N LEU 213 B LEU 213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale13 C C PHE 97 C PHE 97 1_555 C N MSE 98 C MSE 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale14 C C MSE 98 C MSE 98 1_555 C N ARG 99 C ARG 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale15 C C VAL 153 C VAL 153 1_555 C N MSE 154 C MSE 154 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale16 C C MSE 154 C MSE 154 1_555 C N VAL 155 C VAL 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale17 C C GLN 211 C GLN 211 1_555 C N MSE 212 C MSE 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale18 C C MSE 212 C MSE 212 1_555 C N LEU 213 C LEU 213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale19 D C PHE 97 D PHE 97 1_555 D N MSE 98 D MSE 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale20 D C MSE 98 D MSE 98 1_555 D N ARG 99 D ARG 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale21 D C VAL 153 D VAL 153 1_555 D N MSE 154 D MSE 154 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale22 D C MSE 154 D MSE 154 1_555 D N VAL 155 D VAL 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale23 D C GLN 211 D GLN 211 1_555 D N MSE 212 D MSE 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale24 D C MSE 212 D MSE 212 1_555 D N LEU 213 D LEU 213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale25 E C PHE 97 E PHE 97 1_555 E N MSE 98 E MSE 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale26 E C MSE 98 E MSE 98 1_555 E N ARG 99 E ARG 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? covale ? covale27 E C VAL 153 E VAL 153 1_555 E N MSE 154 E MSE 154 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale28 E C MSE 154 E MSE 154 1_555 E N VAL 155 E VAL 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale29 E C GLN 211 E GLN 211 1_555 E N MSE 212 E MSE 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale30 E C MSE 212 E MSE 212 1_555 E N LEU 213 E LEU 213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale31 F C PHE 97 F PHE 97 1_555 F N MSE 98 F MSE 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? covale ? covale32 F C MSE 98 F MSE 98 1_555 F N ARG 99 F ARG 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale33 F C VAL 153 F VAL 153 1_555 F N MSE 154 F MSE 154 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale34 F C MSE 154 F MSE 154 1_555 F N VAL 155 F VAL 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale35 F C GLN 211 F GLN 211 1_555 F N MSE 212 F MSE 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale36 F C MSE 212 F MSE 212 1_555 F N LEU 213 F LEU 213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale37 G C PHE 97 G PHE 97 1_555 G N MSE 98 G MSE 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale38 G C MSE 98 G MSE 98 1_555 G N ARG 99 G ARG 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale39 G C VAL 153 G VAL 153 1_555 G N MSE 154 G MSE 154 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale40 G C MSE 154 G MSE 154 1_555 G N VAL 155 G VAL 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? covale ? covale41 G C GLN 211 G GLN 211 1_555 G N MSE 212 G MSE 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale42 G C MSE 212 G MSE 212 1_555 G N LEU 213 G LEU 213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? # _chem_comp.formula 'C3 H5 N2 1' _chem_comp.formula_weight 69.085 _chem_comp.id IMD _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name IMIDAZOLE _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag N1 C2 IMD sing 173 n y N1 C5 IMD sing 174 n y N1 HN1 IMD sing 175 n n C2 N3 IMD doub 176 n y C2 H2 IMD sing 177 n n N3 C4 IMD sing 178 n y N3 HN3 IMD sing 179 n n C4 C5 IMD doub 180 n y C4 H4 IMD sing 181 n n C5 H5 IMD sing 182 n n # _atom_sites.entry_id 1PZN _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.006937 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005178 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.005652 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code H 2 SO4 A 1 350 350 SO4 SO4 . 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C5 IMD 362 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 12 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 30 _model_server_stats.query_time_ms 410 _model_server_stats.encode_time_ms 8 _model_server_stats.element_count 5 #