data_1Q08 # _model_server_result.job_id 9zOip4fJfCSGzBvvEZtjhg _model_server_result.datetime_utc '2025-01-06 20:47:02' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1q08 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":402}' # _entry.id 1Q08 # _exptl.entry_id 1Q08 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1Q08 _cell.length_a 41.989 _cell.length_b 46.681 _cell.length_c 118.927 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1Q08 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 D N N ? 3 E N N ? 3 H N N ? 3 I N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A SG CYS 37 A CYS 79 1_555 H ZN ZN . B ZN 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.426 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 37 A CYS 79 1_555 I ZN ZN . B ZN 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.425 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 72 A CYS 114 1_555 D ZN ZN . A ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 73 A CYS 115 1_555 E ZN ZN . A ZN 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc5 A ND1 HIS 77 A HIS 119 1_555 E ZN ZN . A ZN 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.23 ? metalc ? metalc6 A SG CYS 82 A CYS 124 1_555 D ZN ZN . A ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.427 ? metalc ? metalc7 C O4 PO4 . A PO4 301 1_555 D ZN ZN . A ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.127 ? metalc ? metalc8 C O2 PO4 . A PO4 301 1_555 E ZN ZN . A ZN 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.13 ? metalc ? metalc9 D ZN ZN . A ZN 401 1_555 B SG CYS 37 B CYS 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? metalc ? metalc10 E ZN ZN . A ZN 402 1_555 B SG CYS 37 B CYS 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.442 ? metalc ? metalc11 F MG MG . A MG 501 1_555 J O HOH . A HOH 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? metalc ? metalc12 F MG MG . A MG 501 1_555 J O HOH . A HOH 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.148 ? metalc ? metalc13 F MG MG . A MG 501 1_555 J O HOH . A HOH 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.119 ? metalc ? metalc14 F MG MG . A MG 501 1_555 J O HOH . A HOH 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? metalc ? metalc15 F MG MG . A MG 501 1_555 J O HOH . A HOH 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.119 ? metalc ? metalc16 F MG MG . A MG 501 1_555 J O HOH . A HOH 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.167 ? metalc ? metalc17 B SG CYS 72 B CYS 114 1_555 H ZN ZN . B ZN 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.341 ? metalc ? metalc18 B SG CYS 73 B CYS 115 1_555 I ZN ZN . B ZN 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? metalc ? metalc19 B ND1 HIS 77 B HIS 119 1_555 I ZN ZN . B ZN 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc20 B SG CYS 82 B CYS 124 1_555 H ZN ZN . B ZN 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.472 ? metalc ? metalc21 G O3 PO4 . B PO4 302 1_555 H ZN ZN . B ZN 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? metalc ? metalc22 G O2 PO4 . B PO4 302 1_555 I ZN ZN . B ZN 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.156 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1Q08 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.023816 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.021422 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.008409 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 PO4 A 1 301 1 PO4 PO4 . D 3 ZN A 1 401 1 ZN ZN . E 3 ZN A 1 402 2 ZN ZN . F 4 MG A 1 501 1 MG MG2 . G 2 PO4 B 1 302 2 PO4 PO4 . H 3 ZN B 1 403 3 ZN ZN . I 3 ZN B 1 404 4 ZN ZN . J 5 HOH A 1 502 1 HOH WAT . J 5 HOH A 2 503 2 HOH WAT . J 5 HOH A 3 504 3 HOH WAT . J 5 HOH A 4 505 4 HOH WAT . J 5 HOH A 5 506 5 HOH WAT . J 5 HOH A 6 507 6 HOH WAT . J 5 HOH A 7 508 7 HOH WAT . J 5 HOH A 8 509 9 HOH WAT . J 5 HOH A 9 510 10 HOH WAT . J 5 HOH A 10 511 11 HOH WAT . J 5 HOH A 11 512 15 HOH WAT . J 5 HOH A 12 513 17 HOH WAT . J 5 HOH A 13 514 19 HOH WAT . J 5 HOH A 14 515 20 HOH WAT . J 5 HOH A 15 516 22 HOH WAT . J 5 HOH A 16 517 25 HOH WAT . J 5 HOH A 17 518 26 HOH WAT . J 5 HOH A 18 519 27 HOH WAT . J 5 HOH A 19 520 29 HOH WAT . J 5 HOH A 20 521 31 HOH WAT . J 5 HOH A 21 522 32 HOH WAT . J 5 HOH A 22 523 33 HOH WAT . J 5 HOH A 23 524 34 HOH WAT . J 5 HOH A 24 525 36 HOH WAT . J 5 HOH A 25 526 37 HOH WAT . J 5 HOH A 26 527 38 HOH WAT . J 5 HOH A 27 528 39 HOH WAT . J 5 HOH A 28 529 40 HOH WAT . J 5 HOH A 29 530 42 HOH WAT . J 5 HOH A 30 531 44 HOH WAT . J 5 HOH A 31 532 48 HOH WAT . J 5 HOH A 32 533 53 HOH WAT . J 5 HOH A 33 534 56 HOH WAT . J 5 HOH A 34 535 58 HOH WAT . J 5 HOH A 35 536 59 HOH WAT . J 5 HOH A 36 537 64 HOH WAT . J 5 HOH A 37 538 66 HOH WAT . J 5 HOH A 38 539 68 HOH WAT . J 5 HOH A 39 540 70 HOH WAT . J 5 HOH A 40 541 71 HOH WAT . J 5 HOH A 41 542 75 HOH WAT . J 5 HOH A 42 543 76 HOH WAT . J 5 HOH A 43 544 77 HOH WAT . J 5 HOH A 44 545 83 HOH WAT . J 5 HOH A 45 546 84 HOH WAT . J 5 HOH A 46 547 86 HOH WAT . J 5 HOH A 47 548 87 HOH WAT . J 5 HOH A 48 549 91 HOH WAT . J 5 HOH A 49 550 95 HOH WAT . J 5 HOH A 50 551 97 HOH WAT . J 5 HOH A 51 552 104 HOH WAT . J 5 HOH A 52 553 106 HOH WAT . J 5 HOH A 53 554 108 HOH WAT . J 5 HOH A 54 555 109 HOH WAT . J 5 HOH A 55 556 110 HOH WAT . J 5 HOH A 56 557 115 HOH WAT . J 5 HOH A 57 558 121 HOH WAT . J 5 HOH A 58 559 122 HOH WAT . J 5 HOH A 59 560 125 HOH WAT . J 5 HOH A 60 561 127 HOH WAT . J 5 HOH A 61 562 129 HOH WAT . J 5 HOH A 62 563 130 HOH WAT . J 5 HOH A 63 564 132 HOH WAT . J 5 HOH A 64 565 133 HOH WAT . J 5 HOH A 65 566 134 HOH WAT . J 5 HOH A 66 567 135 HOH WAT . J 5 HOH A 67 568 137 HOH WAT . J 5 HOH A 68 569 138 HOH WAT . J 5 HOH A 69 570 140 HOH WAT . J 5 HOH A 70 571 141 HOH WAT . J 5 HOH A 71 572 142 HOH WAT . J 5 HOH A 72 573 143 HOH WAT . J 5 HOH A 73 574 144 HOH WAT . J 5 HOH A 74 575 147 HOH WAT . J 5 HOH A 75 576 152 HOH WAT . J 5 HOH A 76 577 153 HOH WAT . J 5 HOH A 77 578 154 HOH WAT . J 5 HOH A 78 579 155 HOH WAT . J 5 HOH A 79 580 159 HOH WAT . J 5 HOH A 80 581 160 HOH WAT . J 5 HOH A 81 582 161 HOH WAT . J 5 HOH A 82 583 162 HOH WAT . J 5 HOH A 83 584 163 HOH WAT . J 5 HOH A 84 585 167 HOH WAT . J 5 HOH A 85 586 170 HOH WAT . J 5 HOH A 86 587 171 HOH WAT . J 5 HOH A 87 588 173 HOH WAT . J 5 HOH A 88 589 174 HOH WAT . J 5 HOH A 89 590 175 HOH WAT . J 5 HOH A 90 591 176 HOH WAT . J 5 HOH A 91 592 177 HOH WAT . J 5 HOH A 92 593 179 HOH WAT . J 5 HOH A 93 594 180 HOH WAT . J 5 HOH A 94 595 183 HOH WAT . J 5 HOH A 95 596 184 HOH WAT . J 5 HOH A 96 597 189 HOH WAT . J 5 HOH A 97 598 191 HOH WAT . J 5 HOH A 98 599 192 HOH WAT . J 5 HOH A 99 600 196 HOH WAT . J 5 HOH A 100 601 198 HOH WAT . J 5 HOH A 101 602 200 HOH WAT . J 5 HOH A 102 603 203 HOH WAT . J 5 HOH A 103 604 204 HOH WAT . J 5 HOH A 104 605 208 HOH WAT . J 5 HOH A 105 606 209 HOH WAT . J 5 HOH A 106 607 210 HOH WAT . J 5 HOH A 107 608 211 HOH WAT . J 5 HOH A 108 609 213 HOH WAT . J 5 HOH A 109 610 215 HOH WAT . J 5 HOH A 110 611 219 HOH WAT . J 5 HOH A 111 612 220 HOH WAT . J 5 HOH A 112 613 221 HOH WAT . J 5 HOH A 113 614 222 HOH WAT . J 5 HOH A 114 615 226 HOH WAT . J 5 HOH A 115 616 233 HOH WAT . J 5 HOH A 116 617 234 HOH WAT . K 5 HOH B 1 405 8 HOH WAT . K 5 HOH B 2 406 12 HOH WAT . K 5 HOH B 3 407 13 HOH WAT . K 5 HOH B 4 408 14 HOH WAT . K 5 HOH B 5 409 16 HOH WAT . K 5 HOH B 6 410 18 HOH WAT . K 5 HOH B 7 411 21 HOH WAT . K 5 HOH B 8 412 23 HOH WAT . K 5 HOH B 9 413 24 HOH WAT . K 5 HOH B 10 414 28 HOH WAT . K 5 HOH B 11 415 30 HOH WAT . K 5 HOH B 12 416 35 HOH WAT . K 5 HOH B 13 417 41 HOH WAT . K 5 HOH B 14 418 43 HOH WAT . K 5 HOH B 15 419 45 HOH WAT . K 5 HOH B 16 420 46 HOH WAT . K 5 HOH B 17 421 47 HOH WAT . K 5 HOH B 18 422 49 HOH WAT . K 5 HOH B 19 423 50 HOH WAT . K 5 HOH B 20 424 51 HOH WAT . K 5 HOH B 21 425 52 HOH WAT . K 5 HOH B 22 426 54 HOH WAT . K 5 HOH B 23 427 55 HOH WAT . K 5 HOH B 24 428 57 HOH WAT . K 5 HOH B 25 429 60 HOH WAT . K 5 HOH B 26 430 61 HOH WAT . K 5 HOH B 27 431 62 HOH WAT . K 5 HOH B 28 432 63 HOH WAT . K 5 HOH B 29 433 65 HOH WAT . K 5 HOH B 30 434 67 HOH WAT . K 5 HOH B 31 435 69 HOH WAT . K 5 HOH B 32 436 72 HOH WAT . K 5 HOH B 33 437 73 HOH WAT . K 5 HOH B 34 438 74 HOH WAT . K 5 HOH B 35 439 78 HOH WAT . K 5 HOH B 36 440 79 HOH WAT . K 5 HOH B 37 441 80 HOH WAT . K 5 HOH B 38 442 81 HOH WAT . K 5 HOH B 39 443 82 HOH WAT . K 5 HOH B 40 444 85 HOH WAT . K 5 HOH B 41 445 88 HOH WAT . K 5 HOH B 42 446 89 HOH WAT . K 5 HOH B 43 447 90 HOH WAT . K 5 HOH B 44 448 92 HOH WAT . K 5 HOH B 45 449 93 HOH WAT . K 5 HOH B 46 450 94 HOH WAT . K 5 HOH B 47 451 96 HOH WAT . K 5 HOH B 48 452 98 HOH WAT . K 5 HOH B 49 453 99 HOH WAT . K 5 HOH B 50 454 100 HOH WAT . K 5 HOH B 51 455 101 HOH WAT . K 5 HOH B 52 456 102 HOH WAT . K 5 HOH B 53 457 103 HOH WAT . K 5 HOH B 54 458 105 HOH WAT . K 5 HOH B 55 459 107 HOH WAT . K 5 HOH B 56 460 111 HOH WAT . K 5 HOH B 57 461 112 HOH WAT . K 5 HOH B 58 462 113 HOH WAT . K 5 HOH B 59 463 114 HOH WAT . K 5 HOH B 60 464 116 HOH WAT . K 5 HOH B 61 465 117 HOH WAT . K 5 HOH B 62 466 118 HOH WAT . K 5 HOH B 63 467 119 HOH WAT . K 5 HOH B 64 468 120 HOH WAT . K 5 HOH B 65 469 123 HOH WAT . K 5 HOH B 66 470 124 HOH WAT . K 5 HOH B 67 471 126 HOH WAT . K 5 HOH B 68 472 128 HOH WAT . K 5 HOH B 69 473 131 HOH WAT . K 5 HOH B 70 474 136 HOH WAT . K 5 HOH B 71 475 139 HOH WAT . K 5 HOH B 72 476 145 HOH WAT . K 5 HOH B 73 477 146 HOH WAT . K 5 HOH B 74 478 148 HOH WAT . K 5 HOH B 75 479 149 HOH WAT . K 5 HOH B 76 480 150 HOH WAT . K 5 HOH B 77 481 151 HOH WAT . K 5 HOH B 78 482 156 HOH WAT . K 5 HOH B 79 483 157 HOH WAT . K 5 HOH B 80 484 158 HOH WAT . K 5 HOH B 81 485 164 HOH WAT . K 5 HOH B 82 486 165 HOH WAT . K 5 HOH B 83 487 166 HOH WAT . K 5 HOH B 84 488 168 HOH WAT . K 5 HOH B 85 489 169 HOH WAT . K 5 HOH B 86 490 172 HOH WAT . K 5 HOH B 87 491 178 HOH WAT . K 5 HOH B 88 492 181 HOH WAT . K 5 HOH B 89 493 182 HOH WAT . K 5 HOH B 90 494 185 HOH WAT . K 5 HOH B 91 495 186 HOH WAT . K 5 HOH B 92 496 187 HOH WAT . K 5 HOH B 93 497 188 HOH WAT . K 5 HOH B 94 498 190 HOH WAT . K 5 HOH B 95 499 193 HOH WAT . K 5 HOH B 96 500 194 HOH WAT . K 5 HOH B 97 501 195 HOH WAT . K 5 HOH B 98 502 197 HOH WAT . K 5 HOH B 99 503 199 HOH WAT . K 5 HOH B 100 504 201 HOH WAT . K 5 HOH B 101 505 202 HOH WAT . K 5 HOH B 102 506 205 HOH WAT . K 5 HOH B 103 507 206 HOH WAT . K 5 HOH B 104 508 207 HOH WAT . K 5 HOH B 105 509 212 HOH WAT . K 5 HOH B 106 510 214 HOH WAT . K 5 HOH B 107 511 216 HOH WAT . K 5 HOH B 108 512 217 HOH WAT . K 5 HOH B 109 513 218 HOH WAT . K 5 HOH B 110 514 223 HOH WAT . K 5 HOH B 111 515 224 HOH WAT . K 5 HOH B 112 516 225 HOH WAT . K 5 HOH B 113 517 227 HOH WAT . K 5 HOH B 114 518 228 HOH WAT . K 5 HOH B 115 519 229 HOH WAT . K 5 HOH B 116 520 230 HOH WAT . K 5 HOH B 117 521 231 HOH WAT . K 5 HOH B 118 522 232 HOH WAT . K 5 HOH B 119 523 235 HOH WAT . K 5 HOH B 120 524 236 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id E _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 34.875 _atom_site.Cartn_y 1.512 _atom_site.Cartn_z 15.504 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 17.69 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 402 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 5 _model_server_stats.parse_time_ms 5 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 242 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #