data_1QBK # _model_server_result.job_id zv2NyKTiqiuMkJFVGI0uMg _model_server_result.datetime_utc '2024-12-28 09:23:50' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1qbk # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":217}' # _entry.id 1QBK # _exptl.entry_id 1QBK _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details Sigma _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 1QBK _cell.length_a 133.11 _cell.length_b 133.11 _cell.length_c 138.41 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1QBK _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 154 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 32 2 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 PISA tetrameric 4 software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D 1 1 A,B,C,D 2 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 5_675 x-y+1,-y+2,-z+1/3 1 0 0 0 -1 0 0 0 -1 0 230.553283 46.136667 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 3 _struct_asym.id C _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C ILE 174 B ILE 174 1_555 A N MSE 175 B MSE 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale2 A C MSE 175 B MSE 175 1_555 A N ILE 176 B ILE 176 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale3 A C LEU 209 B LEU 209 1_555 A N MSE 210 B MSE 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale4 A C MSE 210 B MSE 210 1_555 A N LEU 211 B LEU 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale5 A C VAL 240 B VAL 240 1_555 A N MSE 241 B MSE 241 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale6 A C MSE 241 B MSE 241 1_555 A N LEU 242 B LEU 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale7 A C HIS 253 B HIS 253 1_555 A N MSE 254 B MSE 254 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale8 A C MSE 254 B MSE 254 1_555 A N HIS 255 B HIS 255 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale9 A C TYR 260 B TYR 260 1_555 A N MSE 261 B MSE 261 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale10 A C MSE 261 B MSE 261 1_555 A N LEU 262 B LEU 262 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale11 A C GLY 307 B GLY 307 1_555 A N MSE 308 B MSE 308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale12 A C MSE 308 B MSE 308 1_555 A N LYS 309 B LYS 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale13 A C CYS 428 B CYS 428 1_555 A N MSE 429 B MSE 429 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale14 A C MSE 429 B MSE 429 1_555 A N GLN 430 B GLN 430 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale15 A C GLY 431 B GLY 431 1_555 A N MSE 432 B MSE 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale16 A C MSE 432 B MSE 432 1_555 A N ILE 433 B ILE 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale17 A C LEU 481 B LEU 481 1_555 A N MSE 482 B MSE 482 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale18 A C MSE 482 B MSE 482 1_555 A N THR 483 B THR 483 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale19 A C GLN 563 B GLN 563 1_555 A N MSE 564 B MSE 564 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale20 A C MSE 564 B MSE 564 1_555 A N LEU 565 B LEU 565 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale21 A C LEU 565 B LEU 565 1_555 A N MSE 566 B MSE 566 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale22 A C MSE 566 B MSE 566 1_555 A N PRO 567 B PRO 567 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? covale ? covale23 A C ASN 574 B ASN 574 1_555 A N MSE 575 B MSE 575 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? covale ? covale24 A C MSE 575 B MSE 575 1_555 A N LEU 576 B LEU 576 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale25 A C ALA 623 B ALA 623 1_555 A N MSE 624 B MSE 624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale26 A C MSE 624 B MSE 624 1_555 A N LEU 625 B LEU 625 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale27 A C PHE 640 B PHE 640 1_555 A N MSE 641 B MSE 641 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale28 A C MSE 641 B MSE 641 1_555 A N ILE 642 B ILE 642 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale29 A C LEU 671 B LEU 671 1_555 A N MSE 672 B MSE 672 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale30 A C MSE 672 B MSE 672 1_555 A N TYR 673 B TYR 673 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale31 A C CYS 675 B CYS 675 1_555 A N MSE 676 B MSE 676 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale32 A C MSE 676 B MSE 676 1_555 A N GLN 677 B GLN 677 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale33 A C LYS 679 B LYS 679 1_555 A N MSE 680 B MSE 680 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? covale ? covale34 A C MSE 680 B MSE 680 1_555 A N PRO 681 B PRO 681 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale35 A C PHE 709 B PHE 709 1_555 A N MSE 710 B MSE 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale36 A C MSE 710 B MSE 710 1_555 A N PRO 711 B PRO 711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? covale ? covale37 A C GLN 738 B GLN 738 1_555 A N MSE 739 B MSE 739 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale38 A C MSE 739 B MSE 739 1_555 A N GLY 740 B GLY 740 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale39 A C GLU 742 B GLU 742 1_555 A N MSE 743 B MSE 743 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale40 A C MSE 743 B MSE 743 1_555 A N GLN 744 B GLN 744 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? covale ? covale41 A C PRO 748 B PRO 748 1_555 A N MSE 749 B MSE 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale42 A C MSE 749 B MSE 749 1_555 A N VAL 750 B VAL 750 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale43 A C PRO 788 B PRO 788 1_555 A N MSE 789 B MSE 789 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale44 A C MSE 789 B MSE 789 1_555 A N LEU 790 B LEU 790 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale45 A C THR 819 B THR 819 1_555 A N MSE 820 B MSE 820 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale46 A C MSE 820 B MSE 820 1_555 A N ILE 821 B ILE 821 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale47 A C ASP 851 B ASP 851 1_555 A N MSE 852 B MSE 852 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale48 A C MSE 852 B MSE 852 1_555 A N PHE 853 B PHE 853 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale49 B C ILE 88 C ILE 88 1_555 B N MSE 89 C MSE 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale50 B C MSE 89 C MSE 89 1_555 B N PHE 90 C PHE 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale51 B C ALA 178 C ALA 178 1_555 B N MSE 179 C MSE 179 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale52 B C MSE 179 C MSE 179 1_555 B N PRO 180 C PRO 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? covale ? covale53 B C VAL 188 C VAL 188 1_555 B N MSE 189 C MSE 189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale54 B C MSE 189 C MSE 189 1_555 B N ASP 190 C ASP 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? metalc ? metalc1 B OG1 THR 24 C THR 24 1_555 C MG MG . C MG 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc ? metalc2 B OG1 THR 42 C THR 42 1_555 C MG MG . C MG 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.495 ? metalc ? metalc3 B N THR 42 C THR 42 1_555 C MG MG . C MG 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.085 ? metalc ? metalc4 C MG MG . C MG 217 1_555 D O2G GNP . C GNP 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.696 ? metalc ? metalc5 C MG MG . C MG 217 1_555 D O2B GNP . C GNP 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.754 ? metalc ? metalc6 C MG MG . C MG 217 1_555 D N3B GNP . C GNP 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.607 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1QBK _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007513 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.004337 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008675 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007225 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 3 MG C 1 217 168 MG MG . D 4 GNP C 1 218 167 GNP GNP . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id C _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x -36.008 _atom_site.Cartn_y 124.659 _atom_site.Cartn_z 40.183 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 54.5 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 217 _atom_site.auth_asym_id C _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 17 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 13 _model_server_stats.query_time_ms 294 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 1 #