data_1QE5 # _model_server_result.job_id w2FuBxet-pC2Iu9WW6Grlw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-15 08:34:52' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1qe5 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":303}' # _entry.id 1QE5 # _exptl.entry_id 1QE5 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 94.971 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'PHOSPHATE ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1QE5 _cell.length_a 64.12 _cell.length_b 108.9 _cell.length_c 119.3 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1QE5 _symmetry.cell_setting orthorhombic _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 G N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O GLU 45 A GLU 53 4_445 F CA CA . B CA 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? metalc ? metalc2 B O GLY 110 B GLY 126 1_555 F CA CA . B CA 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.567 ? metalc ? metalc3 B OE1 GLU 112 B GLU 128 1_555 F CA CA . B CA 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.464 ? metalc ? metalc4 F CA CA . B CA 300 1_555 I O HOH . B HOH 452 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? metalc ? metalc5 F CA CA . B CA 300 1_555 I O HOH . B HOH 453 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.589 ? metalc ? metalc6 F CA CA . B CA 300 1_555 I O HOH . B HOH 478 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.64 ? metalc ? metalc7 F CA CA . B CA 300 1_555 I O HOH . B HOH 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? # _chem_comp.formula 'O4 P -3' _chem_comp.formula_weight 94.971 _chem_comp.id PO4 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'PHOSPHATE ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag P O1 PO4 doub 260 n n P O2 PO4 sing 261 n n P O3 PO4 sing 262 n n P O4 PO4 sing 263 n n # _atom_sites.entry_id 1QE5 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.015596 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009183 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.008382 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 2 PO4 A 1 303 303 PO4 PO4 . E 2 PO4 B 1 302 302 PO4 PO4 . F 3 CA B 1 300 300 CA CA . G 2 PO4 C 1 301 301 PO4 PO4 . H 4 HOH A 1 320 320 HOH WAT . H 4 HOH A 2 321 321 HOH WAT . H 4 HOH A 3 322 322 HOH WAT . H 4 HOH A 4 323 323 HOH WAT . H 4 HOH A 5 324 324 HOH WAT . H 4 HOH A 6 326 326 HOH WAT . H 4 HOH A 7 330 330 HOH WAT . H 4 HOH A 8 331 331 HOH WAT . H 4 HOH A 9 332 332 HOH WAT . H 4 HOH A 10 349 349 HOH WAT . H 4 HOH A 11 350 350 HOH WAT . H 4 HOH A 12 351 351 HOH WAT . H 4 HOH A 13 352 352 HOH WAT . H 4 HOH A 14 353 353 HOH WAT . H 4 HOH A 15 354 354 HOH WAT . H 4 HOH A 16 356 356 HOH WAT . H 4 HOH A 17 363 363 HOH WAT . H 4 HOH A 18 364 364 HOH WAT . H 4 HOH A 19 366 366 HOH WAT . H 4 HOH A 20 372 372 HOH WAT . H 4 HOH A 21 374 374 HOH WAT . H 4 HOH A 22 376 376 HOH WAT . H 4 HOH A 23 379 379 HOH WAT . H 4 HOH A 24 383 383 HOH WAT . H 4 HOH A 25 389 389 HOH WAT . H 4 HOH A 26 392 392 HOH WAT . H 4 HOH A 27 394 394 HOH WAT . H 4 HOH A 28 399 399 HOH WAT . H 4 HOH A 29 405 405 HOH WAT . H 4 HOH A 30 408 408 HOH WAT . H 4 HOH A 31 410 410 HOH WAT . H 4 HOH A 32 417 417 HOH WAT . H 4 HOH A 33 418 418 HOH WAT . H 4 HOH A 34 430 430 HOH WAT . H 4 HOH A 35 434 434 HOH WAT . H 4 HOH A 36 436 436 HOH WAT . H 4 HOH A 37 439 439 HOH WAT . H 4 HOH A 38 441 441 HOH WAT . H 4 HOH A 39 443 443 HOH WAT . H 4 HOH A 40 446 446 HOH WAT . H 4 HOH A 41 448 448 HOH WAT . H 4 HOH A 42 456 456 HOH WAT . H 4 HOH A 43 457 457 HOH WAT . H 4 HOH A 44 463 463 HOH WAT . H 4 HOH A 45 466 466 HOH WAT . H 4 HOH A 46 468 468 HOH WAT . H 4 HOH A 47 472 472 HOH WAT . H 4 HOH A 48 481 481 HOH WAT . H 4 HOH A 49 486 486 HOH WAT . H 4 HOH A 50 488 488 HOH WAT . H 4 HOH A 51 489 489 HOH WAT . H 4 HOH A 52 492 492 HOH WAT . H 4 HOH A 53 506 506 HOH WAT . H 4 HOH A 54 507 507 HOH WAT . H 4 HOH A 55 510 510 HOH WAT . H 4 HOH A 56 511 511 HOH WAT . H 4 HOH A 57 513 513 HOH WAT . H 4 HOH A 58 518 518 HOH WAT . H 4 HOH A 59 519 519 HOH WAT . H 4 HOH A 60 524 524 HOH WAT . H 4 HOH A 61 534 534 HOH WAT . H 4 HOH A 62 535 535 HOH WAT . H 4 HOH A 63 536 536 HOH WAT . H 4 HOH A 64 537 537 HOH WAT . H 4 HOH A 65 538 538 HOH WAT . H 4 HOH A 66 539 539 HOH WAT . H 4 HOH A 67 540 540 HOH WAT . H 4 HOH A 68 541 541 HOH WAT . H 4 HOH A 69 543 543 HOH WAT . H 4 HOH A 70 544 544 HOH WAT . H 4 HOH A 71 546 546 HOH WAT . H 4 HOH A 72 549 549 HOH WAT . H 4 HOH A 73 552 552 HOH WAT . H 4 HOH A 74 555 555 HOH WAT . H 4 HOH A 75 556 556 HOH WAT . H 4 HOH A 76 560 560 HOH WAT . H 4 HOH A 77 561 561 HOH WAT . H 4 HOH A 78 562 562 HOH WAT . H 4 HOH A 79 566 566 HOH WAT . H 4 HOH A 80 570 570 HOH WAT . H 4 HOH A 81 571 571 HOH WAT . I 4 HOH B 1 316 316 HOH WAT . I 4 HOH B 2 318 318 HOH WAT . I 4 HOH B 3 325 325 HOH WAT . I 4 HOH B 4 327 327 HOH WAT . I 4 HOH B 5 328 328 HOH WAT . I 4 HOH B 6 333 333 HOH WAT . I 4 HOH B 7 334 334 HOH WAT . I 4 HOH B 8 335 335 HOH WAT . I 4 HOH B 9 336 336 HOH WAT . I 4 HOH B 10 357 357 HOH WAT . I 4 HOH B 11 358 358 HOH WAT . I 4 HOH B 12 359 359 HOH WAT . I 4 HOH B 13 360 360 HOH WAT . I 4 HOH B 14 361 361 HOH WAT . I 4 HOH B 15 362 362 HOH WAT . I 4 HOH B 16 365 365 HOH WAT . I 4 HOH B 17 367 367 HOH WAT . I 4 HOH B 18 370 370 HOH WAT . I 4 HOH B 19 371 371 HOH WAT . I 4 HOH B 20 373 373 HOH WAT . I 4 HOH B 21 380 380 HOH WAT . I 4 HOH B 22 384 384 HOH WAT . I 4 HOH B 23 387 387 HOH WAT . I 4 HOH B 24 390 390 HOH WAT . I 4 HOH B 25 393 393 HOH WAT . I 4 HOH B 26 395 395 HOH WAT . I 4 HOH B 27 398 398 HOH WAT . I 4 HOH B 28 400 400 HOH WAT . I 4 HOH B 29 401 401 HOH WAT . I 4 HOH B 30 402 402 HOH WAT . I 4 HOH B 31 403 403 HOH WAT . I 4 HOH B 32 406 406 HOH WAT . I 4 HOH B 33 411 411 HOH WAT . I 4 HOH B 34 420 420 HOH WAT . I 4 HOH B 35 421 421 HOH WAT . I 4 HOH B 36 422 422 HOH WAT . I 4 HOH B 37 423 423 HOH WAT . I 4 HOH B 38 426 426 HOH WAT . I 4 HOH B 39 428 428 HOH WAT . I 4 HOH B 40 433 433 HOH WAT . I 4 HOH B 41 437 437 HOH WAT . I 4 HOH B 42 438 438 HOH WAT . I 4 HOH B 43 440 440 HOH WAT . I 4 HOH B 44 442 442 HOH WAT . I 4 HOH B 45 444 444 HOH WAT . I 4 HOH B 46 450 450 HOH WAT . I 4 HOH B 47 452 452 HOH WAT . I 4 HOH B 48 453 453 HOH WAT . I 4 HOH B 49 454 454 HOH WAT . I 4 HOH B 50 458 458 HOH WAT . I 4 HOH B 51 461 461 HOH WAT . I 4 HOH B 52 465 465 HOH WAT . I 4 HOH B 53 467 467 HOH WAT . I 4 HOH B 54 470 470 HOH WAT . I 4 HOH B 55 471 471 HOH WAT . I 4 HOH B 56 473 473 HOH WAT . I 4 HOH B 57 475 475 HOH WAT . I 4 HOH B 58 476 476 HOH WAT . I 4 HOH B 59 478 478 HOH WAT . I 4 HOH B 60 480 480 HOH WAT . I 4 HOH B 61 483 483 HOH WAT . I 4 HOH B 62 484 484 HOH WAT . I 4 HOH B 63 485 485 HOH WAT . I 4 HOH B 64 490 490 HOH WAT . I 4 HOH B 65 491 491 HOH WAT . I 4 HOH B 66 496 496 HOH WAT . I 4 HOH B 67 497 497 HOH WAT . I 4 HOH B 68 500 500 HOH WAT . I 4 HOH B 69 501 501 HOH WAT . I 4 HOH B 70 502 502 HOH WAT . I 4 HOH B 71 503 503 HOH WAT . I 4 HOH B 72 508 508 HOH WAT . I 4 HOH B 73 515 515 HOH WAT . I 4 HOH B 74 516 516 HOH WAT . I 4 HOH B 75 520 520 HOH WAT . I 4 HOH B 76 522 522 HOH WAT . I 4 HOH B 77 523 523 HOH WAT . I 4 HOH B 78 525 525 HOH WAT . I 4 HOH B 79 526 526 HOH WAT . I 4 HOH B 80 527 527 HOH WAT . I 4 HOH B 81 530 530 HOH WAT . I 4 HOH B 82 531 531 HOH WAT . I 4 HOH B 83 532 532 HOH WAT . I 4 HOH B 84 533 533 HOH WAT . I 4 HOH B 85 542 542 HOH WAT . I 4 HOH B 86 545 545 HOH WAT . I 4 HOH B 87 553 553 HOH WAT . I 4 HOH B 88 554 554 HOH WAT . I 4 HOH B 89 559 559 HOH WAT . I 4 HOH B 90 564 564 HOH WAT . I 4 HOH B 91 565 565 HOH WAT . I 4 HOH B 92 567 567 HOH WAT . I 4 HOH B 93 568 568 HOH WAT . I 4 HOH B 94 569 569 HOH WAT . I 4 HOH B 95 572 572 HOH WAT . J 4 HOH C 1 311 311 HOH WAT . J 4 HOH C 2 312 312 HOH WAT . J 4 HOH C 3 313 313 HOH WAT . J 4 HOH C 4 314 314 HOH WAT . J 4 HOH C 5 315 315 HOH WAT . J 4 HOH C 6 317 317 HOH WAT . J 4 HOH C 7 319 319 HOH WAT . J 4 HOH C 8 329 329 HOH WAT . J 4 HOH C 9 337 337 HOH WAT . J 4 HOH C 10 338 338 HOH WAT . J 4 HOH C 11 339 339 HOH WAT . J 4 HOH C 12 340 340 HOH WAT . J 4 HOH C 13 341 341 HOH WAT . J 4 HOH C 14 342 342 HOH WAT . J 4 HOH C 15 343 343 HOH WAT . J 4 HOH C 16 344 344 HOH WAT . J 4 HOH C 17 345 345 HOH WAT . J 4 HOH C 18 346 346 HOH WAT . J 4 HOH C 19 347 347 HOH WAT . J 4 HOH C 20 348 348 HOH WAT . J 4 HOH C 21 355 355 HOH WAT . J 4 HOH C 22 368 368 HOH WAT . J 4 HOH C 23 369 369 HOH WAT . J 4 HOH C 24 375 375 HOH WAT . J 4 HOH C 25 377 377 HOH WAT . J 4 HOH C 26 378 378 HOH WAT . J 4 HOH C 27 381 381 HOH WAT . J 4 HOH C 28 382 382 HOH WAT . J 4 HOH C 29 385 385 HOH WAT . J 4 HOH C 30 386 386 HOH WAT . J 4 HOH C 31 388 388 HOH WAT . J 4 HOH C 32 391 391 HOH WAT . J 4 HOH C 33 396 396 HOH WAT . J 4 HOH C 34 397 397 HOH WAT . J 4 HOH C 35 404 404 HOH WAT . J 4 HOH C 36 407 407 HOH WAT . J 4 HOH C 37 409 409 HOH WAT . J 4 HOH C 38 412 412 HOH WAT . J 4 HOH C 39 413 413 HOH WAT . J 4 HOH C 40 414 414 HOH WAT . J 4 HOH C 41 415 415 HOH WAT . J 4 HOH C 42 416 416 HOH WAT . J 4 HOH C 43 419 419 HOH WAT . J 4 HOH C 44 424 424 HOH WAT . J 4 HOH C 45 425 425 HOH WAT . J 4 HOH C 46 427 427 HOH WAT . J 4 HOH C 47 429 429 HOH WAT . J 4 HOH C 48 431 431 HOH WAT . J 4 HOH C 49 432 432 HOH WAT . J 4 HOH C 50 435 435 HOH WAT . J 4 HOH C 51 445 445 HOH WAT . J 4 HOH C 52 447 447 HOH WAT . J 4 HOH C 53 449 449 HOH WAT . J 4 HOH C 54 451 451 HOH WAT . J 4 HOH C 55 455 455 HOH WAT . J 4 HOH C 56 459 459 HOH WAT . J 4 HOH C 57 460 460 HOH WAT . J 4 HOH C 58 462 462 HOH WAT . J 4 HOH C 59 464 464 HOH WAT . J 4 HOH C 60 469 469 HOH WAT . J 4 HOH C 61 474 474 HOH WAT . J 4 HOH C 62 477 477 HOH WAT . J 4 HOH C 63 479 479 HOH WAT . J 4 HOH C 64 482 482 HOH WAT . J 4 HOH C 65 487 487 HOH WAT . J 4 HOH C 66 493 493 HOH WAT . J 4 HOH C 67 494 494 HOH WAT . J 4 HOH C 68 495 495 HOH WAT . J 4 HOH C 69 498 498 HOH WAT . J 4 HOH C 70 499 499 HOH WAT . J 4 HOH C 71 504 504 HOH WAT . J 4 HOH C 72 505 505 HOH WAT . J 4 HOH C 73 509 509 HOH WAT . J 4 HOH C 74 512 512 HOH WAT . J 4 HOH C 75 514 514 HOH WAT . J 4 HOH C 76 517 517 HOH WAT . J 4 HOH C 77 521 521 HOH WAT . J 4 HOH C 78 528 528 HOH WAT . J 4 HOH C 79 529 529 HOH WAT . J 4 HOH C 80 547 547 HOH WAT . J 4 HOH C 81 548 548 HOH WAT . J 4 HOH C 82 550 550 HOH WAT . J 4 HOH C 83 551 551 HOH WAT . J 4 HOH C 84 557 557 HOH WAT . J 4 HOH C 85 558 558 HOH WAT . J 4 HOH C 86 563 563 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P P PO4 . . . D 2 12.004 -19.959 6.081 1 15.37 ? P PO4 303 A 1 HETATM 2 O O1 PO4 . . . D 2 12.475 -18.462 6.033 1 25.48 ? O1 PO4 303 A 1 HETATM 3 O O2 PO4 . . . D 2 10.916 -20.248 5.129 1 15.86 ? O2 PO4 303 A 1 HETATM 4 O O3 PO4 . . . D 2 13.158 -20.881 5.952 1 18.41 ? O3 PO4 303 A 1 HETATM 5 O O4 PO4 . . . D 2 11.368 -20.182 7.494 1 18.23 ? O4 PO4 303 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 8 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 7 _model_server_stats.query_time_ms 245 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 5 #