data_1QIW # _model_server_result.job_id SbyCBRUuZhhgvtMwYjjMTg _model_server_result.datetime_utc '2024-10-17 18:25:27' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1qiw # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":150}' # _entry.id 1QIW # _exptl.entry_id 1QIW _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 99.52 _cell.angle_beta 114.47 _cell.angle_gamma 96.86 _cell.entry_id 1QIW _cell.length_a 41.96 _cell.length_b 56.2 _cell.length_c 35.27 _cell.Z_PDB 2 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1QIW _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PQS monomeric 1 software_defined_assembly 1 PQS monomeric 1 software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,D,E,F,G,H 1 1 B,I,J,K,L,M 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 I N N ? 2 J N N ? 2 K N N ? 2 L N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASP 20 A ASP 20 1_555 C CA CA . A CA 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 22 A ASP 22 1_555 C CA CA . A CA 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 22 A ASP 22 1_555 C CA CA . A CA 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.91 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASP 24 A ASP 24 1_555 C CA CA . A CA 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc5 A O THR 26 A THR 26 1_555 C CA CA . A CA 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc6 A OE1 GLU 31 A GLU 31 1_555 C CA CA . A CA 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc7 A OE2 GLU 31 A GLU 31 1_555 C CA CA . A CA 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASP 56 A ASP 56 1_555 D CA CA . A CA 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 58 A ASP 58 1_555 D CA CA . A CA 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? metalc ? metalc10 A OD1 ASN 60 A ASN 60 1_555 D CA CA . A CA 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? metalc ? metalc11 A O THR 62 A THR 62 1_555 D CA CA . A CA 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc12 A OE1 GLU 67 A GLU 67 1_555 D CA CA . A CA 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.34 ? metalc ? metalc13 A OE2 GLU 67 A GLU 67 1_555 D CA CA . A CA 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? metalc ? metalc14 A OD1 ASP 93 A ASP 93 1_555 E CA CA . A CA 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc15 A OD1 ASP 95 A ASP 95 1_555 E CA CA . A CA 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? metalc ? metalc16 A OD1 ASN 97 A ASN 97 1_555 E CA CA . A CA 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc17 A O TYR 99 A TYR 99 1_555 E CA CA . A CA 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? metalc ? metalc18 A OE1 GLU 104 A GLU 104 1_555 E CA CA . A CA 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? metalc ? metalc19 A OE2 GLU 104 A GLU 104 1_555 E CA CA . A CA 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? metalc ? metalc20 A OD1 ASP 129 A ASP 129 1_555 F CA CA . A CA 152 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? metalc ? metalc21 A OD1 ASP 131 A ASP 131 1_555 F CA CA . A CA 152 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.923 ? metalc ? metalc22 A OD2 ASP 131 A ASP 131 1_555 F CA CA . A CA 152 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc23 A OD1 ASP 133 A ASP 133 1_555 F CA CA . A CA 152 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc24 A OD2 ASP 133 A ASP 133 1_555 F CA CA . A CA 152 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.012 ? metalc ? metalc25 A O GLN 135 A GLN 135 1_555 F CA CA . A CA 152 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? metalc ? metalc26 A OE1 GLU 140 A GLU 140 1_555 F CA CA . A CA 152 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc27 A OE2 GLU 140 A GLU 140 1_555 F CA CA . A CA 152 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? metalc ? metalc28 B OD1 ASP 20 B ASP 20 1_555 I CA CA . B CA 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? metalc ? metalc29 B OD1 ASP 22 B ASP 22 1_555 I CA CA . B CA 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? metalc ? metalc30 B OD2 ASP 22 B ASP 22 1_555 I CA CA . B CA 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.004 ? metalc ? metalc31 B OD1 ASP 24 B ASP 24 1_555 I CA CA . B CA 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc32 B O THR 26 B THR 26 1_555 I CA CA . B CA 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc33 B OE1 GLU 31 B GLU 31 1_555 I CA CA . B CA 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? metalc ? metalc34 B OE2 GLU 31 B GLU 31 1_555 I CA CA . B CA 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc35 B OD1 ASP 56 B ASP 56 1_555 J CA CA . B CA 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc36 B OD1 ASP 58 B ASP 58 1_555 J CA CA . B CA 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? metalc ? metalc37 B OD1 ASN 60 B ASN 60 1_555 J CA CA . B CA 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? metalc ? metalc38 B O THR 62 B THR 62 1_555 J CA CA . B CA 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? metalc ? metalc39 B OE1 GLU 67 B GLU 67 1_555 J CA CA . B CA 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc40 B OE2 GLU 67 B GLU 67 1_555 J CA CA . B CA 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc41 B OD1 ASP 93 B ASP 93 1_555 K CA CA . B CA 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? metalc ? metalc42 B OD1 ASP 95 B ASP 95 1_555 K CA CA . B CA 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc ? metalc43 B OD1 ASN 97 B ASN 97 1_555 K CA CA . B CA 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? metalc ? metalc44 B ND2 ASN 97 B ASN 97 1_555 K CA CA . B CA 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.308 ? metalc ? metalc45 B O TYR 99 B TYR 99 1_555 K CA CA . B CA 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? metalc ? metalc46 B OE1 GLU 104 B GLU 104 1_555 K CA CA . B CA 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc47 B OE2 GLU 104 B GLU 104 1_555 K CA CA . B CA 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? metalc ? metalc48 B OD1 ASP 129 B ASP 129 1_555 L CA CA . B CA 152 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? metalc ? metalc49 B OD1 ASP 131 B ASP 131 1_555 L CA CA . B CA 152 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc50 B OD2 ASP 131 B ASP 131 1_555 L CA CA . B CA 152 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.124 ? metalc ? metalc51 B OD2 ASP 133 B ASP 133 1_555 L CA CA . B CA 152 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.725 ? metalc ? metalc52 B OD1 ASP 133 B ASP 133 1_555 L CA CA . B CA 152 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? metalc ? metalc53 B O GLN 135 B GLN 135 1_555 L CA CA . B CA 152 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? metalc ? metalc54 B OE2 GLU 140 B GLU 140 1_555 L CA CA . B CA 152 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? metalc ? metalc55 B OE1 GLU 140 B GLU 140 1_555 L CA CA . B CA 152 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1QIW _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.023832 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.002867 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.011868 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.017922 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.004387 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.03207 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 CA A 1 149 149 CA CA . D 2 CA A 1 150 150 CA CA . E 2 CA A 1 151 151 CA CA . F 2 CA A 1 152 152 CA CA . G 3 DPD A 1 153 153 DPD DPD . H 3 DPD A 1 154 154 DPD DPD . I 2 CA B 1 149 149 CA CA . J 2 CA B 1 150 150 CA CA . K 2 CA B 1 151 151 CA CA . L 2 CA B 1 152 152 CA CA . M 3 DPD B 1 154 154 DPD DPD . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id D _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 23.077 _atom_site.Cartn_y 17.184 _atom_site.Cartn_z 16.376 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 18.49 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 150 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 7 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 277 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #