data_1QYW
#
_model_server_result.job_id            a4Jr8XyxVwJtNqGw5yLK8w 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-03-04 22:30:22' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1qyw 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":500}' 
#
_entry.id    1QYW 
#
_exptl.entry_id    1QYW 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              288.424 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            5ALPHA-ANDROSTAN-3,17-DIONE 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          99.76 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            1QYW 
_cell.length_a            122.646 
_cell.length_b            43.926 
_cell.length_c            60.793 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1QYW 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        5 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'C 1 2 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA,PQS 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1,2 
#
loop_
_pdbx_struct_oper_list.id
_pdbx_struct_oper_list.type
_pdbx_struct_oper_list.name
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]
1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 
2 'crystal symmetry operation' 2_555 -x,y,-z -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 0 0 0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      2 
_struct_asym.id                             B 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
_chem_comp.formula           'C19 H28 O2' 
_chem_comp.formula_weight    288.424 
_chem_comp.id                5SD 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              5ALPHA-ANDROSTAN-3,17-DIONE 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 5SD sing 1 n n 
C1 C10 5SD sing 2 n n 
C1 H1C1 5SD sing 3 n n 
C1 H1C2 5SD sing 4 n n 
C2 C3 5SD sing 5 n n 
C2 H2C1 5SD sing 6 n n 
C2 H2C2 5SD sing 7 n n 
C3 O3 5SD doub 8 n n 
C3 C4 5SD sing 9 n n 
C4 C5 5SD sing 10 n n 
C4 H4C1 5SD sing 11 n n 
C4 H4C2 5SD sing 12 n n 
C5 C6 5SD sing 13 n n 
C5 C10 5SD sing 14 n n 
C5 H5 5SD sing 15 n n 
C6 C7 5SD sing 16 n n 
C6 H6C1 5SD sing 17 n n 
C6 H6C2 5SD sing 18 n n 
C7 C8 5SD sing 19 n n 
C7 H7C1 5SD sing 20 n n 
C7 H7C2 5SD sing 21 n n 
C8 C9 5SD sing 22 n n 
C8 C14 5SD sing 23 n n 
C8 H8 5SD sing 24 n n 
C9 C10 5SD sing 25 n n 
C9 C11 5SD sing 26 n n 
C9 H9 5SD sing 27 n n 
C10 C19 5SD sing 28 n n 
C11 C12 5SD sing 29 n n 
C11 H111 5SD sing 30 n n 
C11 H112 5SD sing 31 n n 
C12 C13 5SD sing 32 n n 
C12 H121 5SD sing 33 n n 
C12 H122 5SD sing 34 n n 
C13 C14 5SD sing 35 n n 
C13 C17 5SD sing 36 n n 
C13 C18 5SD sing 37 n n 
C14 C15 5SD sing 38 n n 
C14 H14 5SD sing 39 n n 
C15 C16 5SD sing 40 n n 
C15 H151 5SD sing 41 n n 
C15 H152 5SD sing 42 n n 
C16 C17 5SD sing 43 n n 
C16 H161 5SD sing 44 n n 
C16 H162 5SD sing 45 n n 
C17 O17 5SD doub 46 n n 
C18 H181 5SD sing 47 n n 
C18 H182 5SD sing 48 n n 
C18 H183 5SD sing 49 n n 
C19 H191 5SD sing 50 n n 
C19 H192 5SD sing 51 n n 
C19 H193 5SD sing 52 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     1QYW 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.008154 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.001402 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.022766 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.016691 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 5SD A 1 500 500 5SD ADN . 
C 3 NAP A 1 361 361 NAP NAP . 
D 4 GOL A 1 600 600 GOL GOL . 
E 5 HOH A 1 601 1 HOH WAT . 
E 5 HOH A 2 602 2 HOH WAT . 
E 5 HOH A 3 603 3 HOH WAT . 
E 5 HOH A 4 604 4 HOH WAT . 
E 5 HOH A 5 605 5 HOH WAT . 
E 5 HOH A 6 606 6 HOH WAT . 
E 5 HOH A 7 607 7 HOH WAT . 
E 5 HOH A 8 608 8 HOH WAT . 
E 5 HOH A 9 609 9 HOH WAT . 
E 5 HOH A 10 610 10 HOH WAT . 
E 5 HOH A 11 611 11 HOH WAT . 
E 5 HOH A 12 612 12 HOH WAT . 
E 5 HOH A 13 613 13 HOH WAT . 
E 5 HOH A 14 614 14 HOH WAT . 
E 5 HOH A 15 615 15 HOH WAT . 
E 5 HOH A 16 616 16 HOH WAT . 
E 5 HOH A 17 617 17 HOH WAT . 
E 5 HOH A 18 618 18 HOH WAT . 
E 5 HOH A 19 619 19 HOH WAT . 
E 5 HOH A 20 620 20 HOH WAT . 
E 5 HOH A 21 621 21 HOH WAT . 
E 5 HOH A 22 622 22 HOH WAT . 
E 5 HOH A 23 623 23 HOH WAT . 
E 5 HOH A 24 624 24 HOH WAT . 
E 5 HOH A 25 625 25 HOH WAT . 
E 5 HOH A 26 626 26 HOH WAT . 
E 5 HOH A 27 627 27 HOH WAT . 
E 5 HOH A 28 628 28 HOH WAT . 
E 5 HOH A 29 629 29 HOH WAT . 
E 5 HOH A 30 630 30 HOH WAT . 
E 5 HOH A 31 631 31 HOH WAT . 
E 5 HOH A 32 632 32 HOH WAT . 
E 5 HOH A 33 633 33 HOH WAT . 
E 5 HOH A 34 634 34 HOH WAT . 
E 5 HOH A 35 635 35 HOH WAT . 
E 5 HOH A 36 636 36 HOH WAT . 
E 5 HOH A 37 637 37 HOH WAT . 
E 5 HOH A 38 638 38 HOH WAT . 
E 5 HOH A 39 639 39 HOH WAT . 
E 5 HOH A 40 640 40 HOH WAT . 
E 5 HOH A 41 641 41 HOH WAT . 
E 5 HOH A 42 642 42 HOH WAT . 
E 5 HOH A 43 643 43 HOH WAT . 
E 5 HOH A 44 644 44 HOH WAT . 
E 5 HOH A 45 645 45 HOH WAT . 
E 5 HOH A 46 646 46 HOH WAT . 
E 5 HOH A 47 647 47 HOH WAT . 
E 5 HOH A 48 648 48 HOH WAT . 
E 5 HOH A 49 649 49 HOH WAT . 
E 5 HOH A 50 650 50 HOH WAT . 
E 5 HOH A 51 651 51 HOH WAT . 
E 5 HOH A 52 652 52 HOH WAT . 
E 5 HOH A 53 653 53 HOH WAT . 
E 5 HOH A 54 654 54 HOH WAT . 
E 5 HOH A 55 655 55 HOH WAT . 
E 5 HOH A 56 656 56 HOH WAT . 
E 5 HOH A 57 657 57 HOH WAT . 
E 5 HOH A 58 658 58 HOH WAT . 
E 5 HOH A 59 659 59 HOH WAT . 
E 5 HOH A 60 660 60 HOH WAT . 
E 5 HOH A 61 661 61 HOH WAT . 
E 5 HOH A 62 662 62 HOH WAT . 
E 5 HOH A 63 663 63 HOH WAT . 
E 5 HOH A 64 664 64 HOH WAT . 
E 5 HOH A 65 665 65 HOH WAT . 
E 5 HOH A 66 666 66 HOH WAT . 
E 5 HOH A 67 667 67 HOH WAT . 
E 5 HOH A 68 668 68 HOH WAT . 
E 5 HOH A 69 669 69 HOH WAT . 
E 5 HOH A 70 670 70 HOH WAT . 
E 5 HOH A 71 671 71 HOH WAT . 
E 5 HOH A 72 672 72 HOH WAT . 
E 5 HOH A 73 673 73 HOH WAT . 
E 5 HOH A 74 674 74 HOH WAT . 
E 5 HOH A 75 675 75 HOH WAT . 
E 5 HOH A 76 676 76 HOH WAT . 
E 5 HOH A 77 677 77 HOH WAT . 
E 5 HOH A 78 678 78 HOH WAT . 
E 5 HOH A 79 679 79 HOH WAT . 
E 5 HOH A 80 680 80 HOH WAT . 
E 5 HOH A 81 681 81 HOH WAT . 
E 5 HOH A 82 682 82 HOH WAT . 
E 5 HOH A 83 683 83 HOH WAT . 
E 5 HOH A 84 684 84 HOH WAT . 
E 5 HOH A 85 685 85 HOH WAT . 
E 5 HOH A 86 686 86 HOH WAT . 
E 5 HOH A 87 687 87 HOH WAT . 
E 5 HOH A 88 688 88 HOH WAT . 
E 5 HOH A 89 689 89 HOH WAT . 
E 5 HOH A 90 690 90 HOH WAT . 
E 5 HOH A 91 691 91 HOH WAT . 
E 5 HOH A 92 692 92 HOH WAT . 
E 5 HOH A 93 693 93 HOH WAT . 
E 5 HOH A 94 694 94 HOH WAT . 
E 5 HOH A 95 695 95 HOH WAT . 
E 5 HOH A 96 696 96 HOH WAT . 
E 5 HOH A 97 697 97 HOH WAT . 
E 5 HOH A 98 698 98 HOH WAT . 
E 5 HOH A 99 699 99 HOH WAT . 
E 5 HOH A 100 700 100 HOH WAT . 
E 5 HOH A 101 701 101 HOH WAT . 
E 5 HOH A 102 702 102 HOH WAT . 
E 5 HOH A 103 703 103 HOH WAT . 
E 5 HOH A 104 704 104 HOH WAT . 
E 5 HOH A 105 705 105 HOH WAT . 
E 5 HOH A 106 706 106 HOH WAT . 
E 5 HOH A 107 707 107 HOH WAT . 
E 5 HOH A 108 708 108 HOH WAT . 
E 5 HOH A 109 709 109 HOH WAT . 
E 5 HOH A 110 710 110 HOH WAT . 
E 5 HOH A 111 711 111 HOH WAT . 
E 5 HOH A 112 712 112 HOH WAT . 
E 5 HOH A 113 713 113 HOH WAT . 
E 5 HOH A 114 714 114 HOH WAT . 
E 5 HOH A 115 715 115 HOH WAT . 
E 5 HOH A 116 716 116 HOH WAT . 
E 5 HOH A 117 717 117 HOH WAT . 
E 5 HOH A 118 718 118 HOH WAT . 
E 5 HOH A 119 719 119 HOH WAT . 
E 5 HOH A 120 720 120 HOH WAT . 
E 5 HOH A 121 721 121 HOH WAT . 
E 5 HOH A 122 722 122 HOH WAT . 
E 5 HOH A 123 723 123 HOH WAT . 
E 5 HOH A 124 724 124 HOH WAT . 
E 5 HOH A 125 725 125 HOH WAT . 
E 5 HOH A 126 726 126 HOH WAT . 
E 5 HOH A 127 727 127 HOH WAT . 
E 5 HOH A 128 728 128 HOH WAT . 
E 5 HOH A 129 729 129 HOH WAT . 
E 5 HOH A 130 730 130 HOH WAT . 
E 5 HOH A 131 731 131 HOH WAT . 
E 5 HOH A 132 732 132 HOH WAT . 
E 5 HOH A 133 733 133 HOH WAT . 
E 5 HOH A 134 734 134 HOH WAT . 
E 5 HOH A 135 735 135 HOH WAT . 
E 5 HOH A 136 736 136 HOH WAT . 
E 5 HOH A 137 737 137 HOH WAT . 
E 5 HOH A 138 738 138 HOH WAT . 
E 5 HOH A 139 739 139 HOH WAT . 
E 5 HOH A 140 740 140 HOH WAT . 
E 5 HOH A 141 741 141 HOH WAT . 
E 5 HOH A 142 742 142 HOH WAT . 
E 5 HOH A 143 743 143 HOH WAT . 
E 5 HOH A 144 744 144 HOH WAT . 
E 5 HOH A 145 745 145 HOH WAT . 
E 5 HOH A 146 746 146 HOH WAT . 
E 5 HOH A 147 747 147 HOH WAT . 
E 5 HOH A 148 748 148 HOH WAT . 
E 5 HOH A 149 749 149 HOH WAT . 
E 5 HOH A 150 750 150 HOH WAT . 
E 5 HOH A 151 751 151 HOH WAT . 
E 5 HOH A 152 752 152 HOH WAT . 
E 5 HOH A 153 753 153 HOH WAT . 
E 5 HOH A 154 754 154 HOH WAT . 
E 5 HOH A 155 755 155 HOH WAT . 
E 5 HOH A 156 756 156 HOH WAT . 
E 5 HOH A 157 757 157 HOH WAT . 
E 5 HOH A 158 758 158 HOH WAT . 
E 5 HOH A 159 759 159 HOH WAT . 
E 5 HOH A 160 760 160 HOH WAT . 
E 5 HOH A 161 761 161 HOH WAT . 
E 5 HOH A 162 762 162 HOH WAT . 
E 5 HOH A 163 763 163 HOH WAT . 
E 5 HOH A 164 764 164 HOH WAT . 
E 5 HOH A 165 765 165 HOH WAT . 
E 5 HOH A 166 766 166 HOH WAT . 
E 5 HOH A 167 767 167 HOH WAT . 
E 5 HOH A 168 768 168 HOH WAT . 
E 5 HOH A 169 769 169 HOH WAT . 
E 5 HOH A 170 770 170 HOH WAT . 
E 5 HOH A 171 771 171 HOH WAT . 
E 5 HOH A 172 772 172 HOH WAT . 
E 5 HOH A 173 773 173 HOH WAT . 
E 5 HOH A 174 774 174 HOH WAT . 
E 5 HOH A 175 775 175 HOH WAT . 
E 5 HOH A 176 776 176 HOH WAT . 
E 5 HOH A 177 777 177 HOH WAT . 
E 5 HOH A 178 778 178 HOH WAT . 
E 5 HOH A 179 779 179 HOH WAT . 
E 5 HOH A 180 780 180 HOH WAT . 
E 5 HOH A 181 781 181 HOH WAT . 
E 5 HOH A 182 782 182 HOH WAT . 
E 5 HOH A 183 783 183 HOH WAT . 
E 5 HOH A 184 784 184 HOH WAT . 
E 5 HOH A 185 785 185 HOH WAT . 
E 5 HOH A 186 786 186 HOH WAT . 
E 5 HOH A 187 787 187 HOH WAT . 
E 5 HOH A 188 788 188 HOH WAT . 
E 5 HOH A 189 789 189 HOH WAT . 
E 5 HOH A 190 790 190 HOH WAT . 
E 5 HOH A 191 791 191 HOH WAT . 
E 5 HOH A 192 792 192 HOH WAT . 
E 5 HOH A 193 793 193 HOH WAT . 
E 5 HOH A 194 794 194 HOH WAT . 
E 5 HOH A 195 795 195 HOH WAT . 
E 5 HOH A 196 796 196 HOH WAT . 
E 5 HOH A 197 797 197 HOH WAT . 
E 5 HOH A 198 798 198 HOH WAT . 
E 5 HOH A 199 799 199 HOH WAT . 
E 5 HOH A 200 800 200 HOH WAT . 
E 5 HOH A 201 801 201 HOH WAT . 
E 5 HOH A 202 802 202 HOH WAT . 
E 5 HOH A 203 803 203 HOH WAT . 
E 5 HOH A 204 804 204 HOH WAT . 
E 5 HOH A 205 805 205 HOH WAT . 
E 5 HOH A 206 806 206 HOH WAT . 
E 5 HOH A 207 807 207 HOH WAT . 
E 5 HOH A 208 808 208 HOH WAT . 
E 5 HOH A 209 809 209 HOH WAT . 
E 5 HOH A 210 810 210 HOH WAT . 
E 5 HOH A 211 811 211 HOH WAT . 
E 5 HOH A 212 812 212 HOH WAT . 
E 5 HOH A 213 813 213 HOH WAT . 
E 5 HOH A 214 814 214 HOH WAT . 
E 5 HOH A 215 815 215 HOH WAT . 
E 5 HOH A 216 816 216 HOH WAT . 
E 5 HOH A 217 817 217 HOH WAT . 
E 5 HOH A 218 818 218 HOH WAT . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 5SD . . . B 2 12.719 6.257 -12.966 1 48.88 ? C1 5SD 500 A 1 
HETATM 2 C C2 5SD . . . B 2 13.036 4.903 -12.345 1 49.89 ? C2 5SD 500 A 1 
HETATM 3 C C3 5SD . . . B 2 13.548 5.183 -10.922 1 50.01 ? C3 5SD 500 A 1 
HETATM 4 O O3 5SD . . . B 2 14.538 4.547 -10.583 1 51.09 ? O3 5SD 500 A 1 
HETATM 5 C C4 5SD . . . B 2 12.841 6.158 -10.069 1 49.89 ? C4 5SD 500 A 1 
HETATM 6 C C5 5SD . . . B 2 12.437 7.454 -10.8 1 50.4 ? C5 5SD 500 A 1 
HETATM 7 C C6 5SD . . . B 2 11.532 8.335 -9.907 1 49.88 ? C6 5SD 500 A 1 
HETATM 8 C C7 5SD . . . B 2 11.102 9.59 -10.659 1 50.99 ? C7 5SD 500 A 1 
HETATM 9 C C8 5SD . . . B 2 10.385 9.254 -11.994 1 48.69 ? C8 5SD 500 A 1 
HETATM 10 C C9 5SD . . . B 2 11.337 8.423 -12.863 1 48.53 ? C9 5SD 500 A 1 
HETATM 11 C C10 5SD . . . B 2 11.729 7.095 -12.142 1 49.22 ? C10 5SD 500 A 1 
HETATM 12 C C11 5SD . . . B 2 10.673 8.181 -14.244 1 48.04 ? C11 5SD 500 A 1 
HETATM 13 C C12 5SD . . . B 2 10.297 9.45 -15.007 1 48 ? C12 5SD 500 A 1 
HETATM 14 C C13 5SD . . . B 2 9.383 10.339 -14.112 1 48.69 ? C13 5SD 500 A 1 
HETATM 15 C C14 5SD . . . B 2 9.965 10.574 -12.765 1 48.56 ? C14 5SD 500 A 1 
HETATM 16 C C15 5SD . . . B 2 8.926 11.492 -12.102 1 48.3 ? C15 5SD 500 A 1 
HETATM 17 C C16 5SD . . . B 2 8.898 12.573 -13.207 1 48.4 ? C16 5SD 500 A 1 
HETATM 18 C C17 5SD . . . B 2 9.099 11.782 -14.513 1 48.52 ? C17 5SD 500 A 1 
HETATM 19 O O17 5SD . . . B 2 9.009 12.257 -15.627 1 50.5 ? O17 5SD 500 A 1 
HETATM 20 C C18 5SD . . . B 2 7.968 9.603 -14.023 1 47.42 ? C18 5SD 500 A 1 
HETATM 21 C C19 5SD . . . B 2 10.425 6.295 -11.863 1 49.54 ? C19 5SD 500 A 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              7 
_model_server_stats.parse_time_ms           7 
_model_server_stats.create_model_time_ms    3 
_model_server_stats.query_time_ms           322 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           21 
#