data_1R4S # _model_server_result.job_id xoCow6iSuSmD60Wvi0VFMw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-24 21:24:18' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1r4s # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":800}' # _entry.id 1R4S # _exptl.entry_id 1R4S _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 182.137 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description '9-METHYL URIC ACID' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1R4S _cell.length_a 80.083 _cell.length_b 96.46 _cell.length_c 105.674 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1R4S _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 23 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'I 2 2 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA,PQS _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2,3,4 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 2_665 -x+1,-y+1,z -1 0 0 0 -1 0 0 0 1 80.083 96.46 0 3 'crystal symmetry operation' 3_656 -x+1,y,-z+1 -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 80.083 0 105.674 4 'crystal symmetry operation' 4_566 x,-y+1,-z+1 1 0 0 0 -1 0 0 0 -1 0 96.46 105.674 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 3 _struct_asym.id C _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 35 A CYS 35 1_555 B SG CYS . A CYS 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? covale ? covale1 A C SAC 1 A SAC 1 1_555 A N ALA 2 A ALA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? # _chem_comp.formula 'C6 H6 N4 O3' _chem_comp.formula_weight 182.137 _chem_comp.id MUA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name '9-METHYL URIC ACID' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag N1 C2 MUA sing 237 n y N1 C6 MUA sing 238 n y N1 HN1 MUA sing 239 n n C2 O2 MUA doub 240 n n C2 N3 MUA sing 241 n y N3 C4 MUA sing 242 n y N3 HN3 MUA sing 243 n n C4 C5 MUA doub 244 n y C4 N9 MUA sing 245 n y C5 C6 MUA sing 246 n y C5 N7 MUA sing 247 n y C6 O6 MUA doub 248 n n N7 C8 MUA sing 249 n y N7 HN7 MUA sing 250 n n C8 N9 MUA sing 251 n y C8 O8 MUA doub 252 n n N9 C10 MUA sing 253 n n C10 H101 MUA sing 254 n n C10 H102 MUA sing 255 n n C10 H103 MUA sing 256 n n # _atom_sites.entry_id 1R4S _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.012487 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.010367 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.009463 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 CYS A 1 700 700 CYS FCY . C 3 MUA A 1 800 800 MUA MUA . D 4 HOH A 1 1001 1001 HOH WAT . D 4 HOH A 2 1002 1002 HOH WAT . D 4 HOH A 3 1003 1003 HOH WAT . D 4 HOH A 4 1004 1004 HOH WAT . D 4 HOH A 5 1005 1005 HOH WAT . D 4 HOH A 6 1006 1006 HOH WAT . D 4 HOH A 7 1007 1007 HOH WAT . D 4 HOH A 8 1008 1008 HOH WAT . D 4 HOH A 9 1009 1009 HOH WAT . D 4 HOH A 10 1010 1010 HOH WAT . D 4 HOH A 11 1011 1011 HOH WAT . D 4 HOH A 12 1012 1012 HOH WAT . D 4 HOH A 13 1013 1013 HOH WAT . D 4 HOH A 14 1014 1014 HOH WAT . D 4 HOH A 15 1015 1015 HOH WAT . D 4 HOH A 16 1016 1016 HOH WAT . D 4 HOH A 17 1017 1017 HOH WAT . D 4 HOH A 18 1018 1018 HOH WAT . D 4 HOH A 19 1019 1019 HOH WAT . D 4 HOH A 20 1020 1020 HOH WAT . D 4 HOH A 21 1021 1021 HOH WAT . D 4 HOH A 22 1022 1022 HOH WAT . D 4 HOH A 23 1023 1023 HOH WAT . D 4 HOH A 24 1024 1024 HOH WAT . D 4 HOH A 25 1025 1025 HOH WAT . D 4 HOH A 26 1026 1026 HOH WAT . D 4 HOH A 27 1027 1027 HOH WAT . D 4 HOH A 28 1028 1028 HOH WAT . D 4 HOH A 29 1029 1029 HOH WAT . D 4 HOH A 30 1030 1030 HOH WAT . D 4 HOH A 31 1031 1031 HOH WAT . D 4 HOH A 32 1032 1032 HOH WAT . D 4 HOH A 33 1033 1033 HOH WAT . D 4 HOH A 34 1034 1034 HOH WAT . D 4 HOH A 35 1035 1035 HOH WAT . D 4 HOH A 36 1036 1036 HOH WAT . D 4 HOH A 37 1037 1037 HOH WAT . D 4 HOH A 38 1038 1038 HOH WAT . D 4 HOH A 39 1039 1039 HOH WAT . D 4 HOH A 40 1040 1040 HOH WAT . D 4 HOH A 41 1041 1041 HOH WAT . D 4 HOH A 42 1042 1042 HOH WAT . D 4 HOH A 43 1043 1043 HOH WAT . D 4 HOH A 44 1044 1044 HOH WAT . D 4 HOH A 45 1045 1045 HOH WAT . D 4 HOH A 46 1046 1046 HOH WAT . D 4 HOH A 47 1047 1047 HOH WAT . D 4 HOH A 48 1048 1048 HOH WAT . D 4 HOH A 49 1049 1049 HOH WAT . D 4 HOH A 50 1050 1050 HOH WAT . D 4 HOH A 51 1051 1051 HOH WAT . D 4 HOH A 52 1052 1052 HOH WAT . D 4 HOH A 53 1053 1053 HOH WAT . D 4 HOH A 54 1054 1054 HOH WAT . D 4 HOH A 55 1055 1055 HOH WAT . D 4 HOH A 56 1056 1056 HOH WAT . D 4 HOH A 57 1057 1057 HOH WAT . D 4 HOH A 58 1058 1058 HOH WAT . D 4 HOH A 59 1059 1059 HOH WAT . D 4 HOH A 60 1060 1060 HOH WAT . D 4 HOH A 61 1061 1061 HOH WAT . D 4 HOH A 62 1062 1062 HOH WAT . D 4 HOH A 63 1063 1063 HOH WAT . D 4 HOH A 64 1064 1064 HOH WAT . D 4 HOH A 65 1065 1065 HOH WAT . D 4 HOH A 66 1066 1066 HOH WAT . D 4 HOH A 67 1067 1067 HOH WAT . D 4 HOH A 68 1068 1068 HOH WAT . D 4 HOH A 69 1069 1069 HOH WAT . D 4 HOH A 70 1070 1070 HOH WAT . D 4 HOH A 71 1071 1071 HOH WAT . D 4 HOH A 72 1072 1072 HOH WAT . D 4 HOH A 73 1073 1073 HOH WAT . D 4 HOH A 74 1074 1074 HOH WAT . D 4 HOH A 75 1075 1075 HOH WAT . D 4 HOH A 76 1076 1076 HOH WAT . D 4 HOH A 77 1077 1077 HOH WAT . D 4 HOH A 78 1078 1078 HOH WAT . D 4 HOH A 79 1079 1079 HOH WAT . D 4 HOH A 80 1080 1080 HOH WAT . D 4 HOH A 81 1081 1081 HOH WAT . D 4 HOH A 82 1082 1082 HOH WAT . D 4 HOH A 83 1083 1083 HOH WAT . D 4 HOH A 84 1084 1084 HOH WAT . D 4 HOH A 85 1085 1085 HOH WAT . D 4 HOH A 86 1086 1086 HOH WAT . D 4 HOH A 87 1087 1087 HOH WAT . D 4 HOH A 88 1088 1088 HOH WAT . D 4 HOH A 89 1089 1089 HOH WAT . D 4 HOH A 90 1090 1090 HOH WAT . D 4 HOH A 91 1091 1091 HOH WAT . D 4 HOH A 92 1092 1092 HOH WAT . D 4 HOH A 93 1093 1093 HOH WAT . D 4 HOH A 94 1094 1094 HOH WAT . D 4 HOH A 95 1095 1095 HOH WAT . D 4 HOH A 96 1096 1096 HOH WAT . D 4 HOH A 97 1097 1097 HOH WAT . D 4 HOH A 98 1098 1098 HOH WAT . D 4 HOH A 99 1099 1099 HOH WAT . D 4 HOH A 100 1100 1100 HOH WAT . D 4 HOH A 101 1101 1101 HOH WAT . D 4 HOH A 102 1102 1102 HOH WAT . D 4 HOH A 103 1103 1103 HOH WAT . D 4 HOH A 104 1104 1104 HOH WAT . D 4 HOH A 105 1105 1105 HOH WAT . D 4 HOH A 106 1106 1106 HOH WAT . D 4 HOH A 107 1107 1107 HOH WAT . D 4 HOH A 108 1108 1108 HOH WAT . D 4 HOH A 109 1109 1109 HOH WAT . D 4 HOH A 110 1110 1110 HOH WAT . D 4 HOH A 111 1111 1111 HOH WAT . D 4 HOH A 112 1112 1112 HOH WAT . D 4 HOH A 113 1113 1113 HOH WAT . D 4 HOH A 114 1114 1114 HOH WAT . D 4 HOH A 115 1115 1115 HOH WAT . D 4 HOH A 116 1116 1116 HOH WAT . D 4 HOH A 117 1117 1117 HOH WAT . D 4 HOH A 118 1118 1118 HOH WAT . D 4 HOH A 119 1119 1119 HOH WAT . D 4 HOH A 120 1120 1120 HOH WAT . D 4 HOH A 121 1121 1121 HOH WAT . D 4 HOH A 122 1122 1122 HOH WAT . D 4 HOH A 123 1123 1123 HOH WAT . D 4 HOH A 124 1124 1124 HOH WAT . D 4 HOH A 125 1125 1125 HOH WAT . D 4 HOH A 126 1126 1126 HOH WAT . D 4 HOH A 127 1127 1127 HOH WAT . D 4 HOH A 128 1128 1128 HOH WAT . D 4 HOH A 129 1129 1129 HOH WAT . D 4 HOH A 130 1130 1130 HOH WAT . D 4 HOH A 131 1131 1131 HOH WAT . D 4 HOH A 132 1132 1132 HOH WAT . D 4 HOH A 133 1133 1133 HOH WAT . D 4 HOH A 134 1134 1134 HOH WAT . D 4 HOH A 135 1135 1135 HOH WAT . D 4 HOH A 136 1136 1136 HOH WAT . D 4 HOH A 137 1137 1137 HOH WAT . D 4 HOH A 138 1138 1138 HOH WAT . D 4 HOH A 139 1139 1139 HOH WAT . D 4 HOH A 140 1140 1140 HOH WAT . D 4 HOH A 141 1141 1141 HOH WAT . D 4 HOH A 142 1142 1142 HOH WAT . D 4 HOH A 143 1143 1143 HOH WAT . D 4 HOH A 144 1144 1144 HOH WAT . D 4 HOH A 145 1145 1145 HOH WAT . D 4 HOH A 146 1146 1146 HOH WAT . D 4 HOH A 147 1147 1147 HOH WAT . D 4 HOH A 148 1148 1148 HOH WAT . D 4 HOH A 149 1149 1149 HOH WAT . D 4 HOH A 150 1150 1150 HOH WAT . D 4 HOH A 151 1151 1151 HOH WAT . D 4 HOH A 152 1152 1152 HOH WAT . D 4 HOH A 153 1153 1153 HOH WAT . D 4 HOH A 154 1154 1154 HOH WAT . D 4 HOH A 155 1155 1155 HOH WAT . D 4 HOH A 156 1156 1156 HOH WAT . D 4 HOH A 157 1157 1157 HOH WAT . D 4 HOH A 158 1158 1158 HOH WAT . D 4 HOH A 159 1159 1159 HOH WAT . D 4 HOH A 160 1160 1160 HOH WAT . D 4 HOH A 161 1161 1161 HOH WAT . D 4 HOH A 162 1162 1162 HOH WAT . D 4 HOH A 163 1163 1163 HOH WAT . D 4 HOH A 164 1164 1164 HOH WAT . D 4 HOH A 165 1165 1165 HOH WAT . D 4 HOH A 166 1166 1166 HOH WAT . D 4 HOH A 167 1167 1167 HOH WAT . D 4 HOH A 168 1168 1168 HOH WAT . D 4 HOH A 169 1169 1169 HOH WAT . D 4 HOH A 170 1170 1170 HOH WAT . D 4 HOH A 171 1171 1171 HOH WAT . D 4 HOH A 172 1172 1172 HOH WAT . D 4 HOH A 173 1173 1173 HOH WAT . D 4 HOH A 174 1174 1174 HOH WAT . D 4 HOH A 175 1175 1175 HOH WAT . D 4 HOH A 176 1176 1176 HOH WAT . D 4 HOH A 177 1177 1177 HOH WAT . D 4 HOH A 178 1178 1178 HOH WAT . D 4 HOH A 179 1179 1179 HOH WAT . D 4 HOH A 180 1180 1180 HOH WAT . D 4 HOH A 181 1181 1181 HOH WAT . D 4 HOH A 182 1182 1182 HOH WAT . D 4 HOH A 183 1183 1183 HOH WAT . D 4 HOH A 184 1184 1184 HOH WAT . D 4 HOH A 185 1185 1185 HOH WAT . D 4 HOH A 186 1186 1186 HOH WAT . D 4 HOH A 187 1187 1187 HOH WAT . D 4 HOH A 188 1188 1188 HOH WAT . D 4 HOH A 189 1189 1189 HOH WAT . D 4 HOH A 190 1190 1190 HOH WAT . D 4 HOH A 191 1191 1191 HOH WAT . D 4 HOH A 192 1192 1192 HOH WAT . D 4 HOH A 193 1193 1193 HOH WAT . D 4 HOH A 194 1194 1194 HOH WAT . D 4 HOH A 195 1195 1195 HOH WAT . D 4 HOH A 196 1196 1196 HOH WAT . D 4 HOH A 197 1197 1197 HOH WAT . D 4 HOH A 198 1198 1198 HOH WAT . D 4 HOH A 199 1199 1199 HOH WAT . D 4 HOH A 200 1200 1200 HOH WAT . D 4 HOH A 201 1201 1201 HOH WAT . D 4 HOH A 202 1202 1202 HOH WAT . D 4 HOH A 203 1203 1203 HOH WAT . D 4 HOH A 204 1204 1204 HOH WAT . D 4 HOH A 205 1205 1205 HOH WAT . D 4 HOH A 206 1206 1206 HOH WAT . D 4 HOH A 207 1207 1207 HOH WAT . D 4 HOH A 208 1208 1208 HOH WAT . D 4 HOH A 209 1209 1209 HOH WAT . D 4 HOH A 210 1210 1210 HOH WAT . D 4 HOH A 211 1211 1211 HOH WAT . D 4 HOH A 212 1212 1212 HOH WAT . D 4 HOH A 213 1213 1213 HOH WAT . D 4 HOH A 214 1214 1214 HOH WAT . D 4 HOH A 215 1215 1215 HOH WAT . D 4 HOH A 216 1216 1216 HOH WAT . D 4 HOH A 217 1217 1217 HOH WAT . D 4 HOH A 218 1218 1218 HOH WAT . D 4 HOH A 219 1219 1219 HOH WAT . D 4 HOH A 220 1220 1220 HOH WAT . D 4 HOH A 221 1221 1221 HOH WAT . D 4 HOH A 222 1222 1222 HOH WAT . D 4 HOH A 223 1223 1223 HOH WAT . D 4 HOH A 224 1224 1224 HOH WAT . D 4 HOH A 225 1225 1225 HOH WAT . D 4 HOH A 226 1226 1226 HOH WAT . D 4 HOH A 227 1227 1227 HOH WAT . D 4 HOH A 228 1228 1228 HOH WAT . D 4 HOH A 229 1229 1229 HOH WAT . D 4 HOH A 230 1230 1230 HOH WAT . D 4 HOH A 231 1231 1231 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 N N1 MUA . . . C 3 30.028 27.842 36.831 1 21.99 ? N1 MUA 800 A 1 HETATM 2 C C2 MUA . . . C 3 29.269 27.642 37.958 1 21.42 ? C2 MUA 800 A 1 HETATM 3 O O2 MUA . . . C 3 28.122 28.027 37.996 1 20.83 ? O2 MUA 800 A 1 HETATM 4 N N3 MUA . . . C 3 29.848 26.983 39.047 1 22.39 ? N3 MUA 800 A 1 HETATM 5 C C4 MUA . . . C 3 31.091 26.548 38.885 1 24.79 ? C4 MUA 800 A 1 HETATM 6 C C5 MUA . . . C 3 31.867 26.724 37.766 1 23.42 ? C5 MUA 800 A 1 HETATM 7 C C6 MUA . . . C 3 31.331 27.451 36.621 1 23.73 ? C6 MUA 800 A 1 HETATM 8 O O6 MUA . . . C 3 31.932 27.694 35.585 1 23.93 ? O6 MUA 800 A 1 HETATM 9 N N7 MUA . . . C 3 33.06 26.145 37.949 1 23.55 ? N7 MUA 800 A 1 HETATM 10 C C8 MUA . . . C 3 33.133 25.555 39.219 1 23.12 ? C8 MUA 800 A 1 HETATM 11 N N9 MUA . . . C 3 31.929 25.774 39.878 1 21.3 ? N9 MUA 800 A 1 HETATM 12 C C10 MUA . . . C 3 31.469 25.365 41.296 1 31.75 ? C10 MUA 800 A 1 HETATM 13 O O8 MUA . . . C 3 34.071 24.951 39.663 1 34.15 ? O8 MUA 800 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 64 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 283 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 13 #