data_1S0N # _model_server_result.job_id Z2fQqOLIekYPhggcIz06gQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-16 10:09:06' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1s0n # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":403}' # _entry.id 1S0N # _exptl.entry_id 1S0N _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1S0N _cell.length_a 99.112 _cell.length_b 102.66 _cell.length_c 53.176 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1S0N _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 18 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 D N N ? 4 E N N ? 4 F N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 C OD1 ASP 7 A ASP 7 1_555 D CA CA . A CA 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.322 ? metalc ? metalc2 C OD2 ASP 7 A ASP 7 1_555 D CA CA . A CA 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.849 ? metalc ? metalc3 C OD1 ASP 7 A ASP 7 1_555 E CA CA . A CA 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? metalc ? metalc4 C O PHE 8 A PHE 8 1_555 E CA CA . A CA 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.253 ? metalc ? metalc5 C OD2 ASP 105 A ASP 105 1_555 E CA CA . A CA 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.488 ? metalc ? metalc6 C OE2 GLU 106 A GLU 106 1_555 D CA CA . A CA 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc7 C O ALA 181 A ALA 181 1_555 F CA CA . A CA 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.565 ? metalc ? metalc8 C O ILE 186 A ILE 186 1_555 F CA CA . A CA 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.667 ? metalc ? metalc9 D CA CA . A CA 403 1_555 G O1A DCP . A DCP 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.152 ? metalc ? metalc10 D CA CA . A CA 403 1_555 J O HOH . A HOH 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.57 ? metalc ? metalc11 D CA CA . A CA 403 1_555 J O HOH . A HOH 813 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.118 ? metalc ? metalc12 E CA CA . A CA 404 1_555 G O1G DCP . A DCP 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.225 ? metalc ? metalc13 E CA CA . A CA 404 1_555 G O2B DCP . A DCP 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.494 ? metalc ? metalc14 E CA CA . A CA 404 1_555 G O1A DCP . A DCP 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.474 ? metalc ? metalc15 F CA CA . A CA 405 1_555 J O HOH . A HOH 816 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N1 DG 1 P DG 1 1_555 B N3 DC 18 T DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N2 DG 1 P DG 1 1_555 B O2 DC 18 T DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O6 DG 1 P DG 1 1_555 B N4 DC 18 T DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N1 DG 2 P DG 2 1_555 B N3 DC 17 T DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N2 DG 2 P DG 2 1_555 B O2 DC 17 T DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A O6 DG 2 P DG 2 1_555 B N4 DC 17 T DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N3 DC 3 P DC 3 1_555 B N1 DG 16 T DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A N4 DC 3 P DC 3 1_555 B O6 DG 16 T DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A O2 DC 3 P DC 3 1_555 B N2 DG 16 T DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A N1 DA 4 P DA 4 1_555 B N3 DT 15 T DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A N6 DA 4 P DA 4 1_555 B O4 DT 15 T DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A N3 DC 5 P DC 5 1_555 B N1 DG 14 T DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A N4 DC 5 P DC 5 1_555 B O6 DG 14 T DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A O2 DC 5 P DC 5 1_555 B N2 DG 14 T DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A N3 DT 6 P DT 6 1_555 B N1 DA 13 T DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A O4 DT 6 P DT 6 1_555 B N6 DA 13 T DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A N1 DG 7 P DG 7 1_555 B N3 DC 12 T DC 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A N2 DG 7 P DG 7 1_555 B O2 DC 12 T DC 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 A O6 DG 7 P DG 7 1_555 B N4 DC 12 T DC 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 A N1 DA 8 P DA 8 1_555 B N3 DT 11 T DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 A N6 DA 8 P DA 8 1_555 B O4 DT 11 T DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 A N3 DT 9 P DT 9 1_555 B N1 DA 10 T DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 A O4 DT 9 P DT 9 1_555 B N6 DA 10 T DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 A N3 DC 10 P DC 10 1_555 B N1 DG 9 T DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 A N4 DC 10 P DC 10 1_555 B O6 DG 9 T DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 A O2 DC 10 P DC 10 1_555 B N2 DG 9 T DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 A N1 DA 11 P DA 11 1_555 B N3 DT 8 T DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 A N6 DA 11 P DA 11 1_555 B O4 DT 8 T DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 A N3 DC 12 P DC 12 1_555 B N1 DG 7 T DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 A N4 DC 12 P DC 12 1_555 B O6 DG 7 T DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 A O2 DC 12 P DC 12 1_555 B N2 DG 7 T DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 A N1 DG 13 P DG 13 1_555 B N3 DC 6 T DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 A N2 DG 13 P DG 13 1_555 B O2 DC 6 T DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 A O6 DG 13 P DG 13 1_555 B N4 DC 6 T DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1S0N _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.01009 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009741 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.018805 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 4 CA A 1 403 403 CA CA2 . E 4 CA A 1 404 404 CA CA2 . F 4 CA A 1 405 405 CA CA2 . G 5 DCP A 1 804 804 DCP DCP . H 6 HOH P 1 14 4 HOH TIP . H 6 HOH P 2 15 5 HOH TIP . H 6 HOH P 3 16 12 HOH TIP . H 6 HOH P 4 17 16 HOH TIP . H 6 HOH P 5 18 18 HOH TIP . H 6 HOH P 6 19 19 HOH TIP . I 6 HOH T 1 19 6 HOH TIP . I 6 HOH T 2 20 7 HOH TIP . I 6 HOH T 3 21 10 HOH TIP . I 6 HOH T 4 22 24 HOH TIP . J 6 HOH A 1 805 1 HOH TIP . J 6 HOH A 2 806 2 HOH TIP . J 6 HOH A 3 807 3 HOH TIP . J 6 HOH A 4 808 8 HOH TIP . J 6 HOH A 5 809 11 HOH TIP . J 6 HOH A 6 810 13 HOH TIP . J 6 HOH A 7 811 15 HOH TIP . J 6 HOH A 8 812 17 HOH TIP . J 6 HOH A 9 813 20 HOH TIP . J 6 HOH A 10 814 21 HOH TIP . J 6 HOH A 11 815 22 HOH TIP . J 6 HOH A 12 816 23 HOH TIP . J 6 HOH A 13 817 25 HOH TIP . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id D _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 26.509 _atom_site.Cartn_y 13.707 _atom_site.Cartn_z 8.54 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 90.65 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 403 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 11 _model_server_stats.parse_time_ms 15 _model_server_stats.create_model_time_ms 18 _model_server_stats.query_time_ms 337 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #