data_1S26 # _model_server_result.job_id Am4Nlge6wCpmmuUBaVyHFw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-04 22:17:10' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1s26 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"R","auth_seq_id":805}' # _entry.id 1S26 # _exptl.entry_id 1S26 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1S26 _cell.length_a 117.555 _cell.length_b 167.605 _cell.length_c 345.346 _cell.Z_PDB 24 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1S26 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 23 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'I 2 2 2' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 3 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,D,G,H,M,N 1 1 B,E,I,J,O,P 2 1 C,F,K,L,Q,R 3 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 M N N ? 5 N N N ? 5 O N N ? 5 P N N ? 5 Q N N ? 5 R N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASP 201 A ASP 491 1_555 G YB YB . A YB 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.281 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 201 A ASP 491 1_555 G YB YB . A YB 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.916 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 203 A ASP 493 1_555 G YB YB . A YB 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.162 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 203 A ASP 493 1_555 G YB YB . A YB 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.876 ? metalc ? metalc5 A NE2 HIS 287 A HIS 577 1_555 G YB YB . A YB 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.025 ? metalc ? metalc6 G YB YB . A YB 901 1_555 H O1A APC . A APC 1139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.424 ? metalc ? metalc7 G YB YB . A YB 901 1_555 H O2B APC . A APC 1139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.228 ? metalc ? metalc8 B OD1 ASP 201 B ASP 491 1_555 I YB YB . B YB 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.611 ? metalc ? metalc9 B OD2 ASP 201 B ASP 491 1_555 I YB YB . B YB 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.443 ? metalc ? metalc10 B OD1 ASP 203 B ASP 493 1_555 I YB YB . B YB 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.608 ? metalc ? metalc11 B OD2 ASP 203 B ASP 493 1_555 I YB YB . B YB 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc12 C OD1 ASP 201 C ASP 491 1_555 K YB YB . C YB 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.046 ? metalc ? metalc13 C OD2 ASP 201 C ASP 491 1_555 K YB YB . C YB 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.805 ? metalc ? metalc14 C OD1 ASP 203 C ASP 493 1_555 K YB YB . C YB 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc15 C OD2 ASP 203 C ASP 493 1_555 K YB YB . C YB 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.014 ? metalc ? metalc16 C NE2 HIS 287 C HIS 577 1_555 K YB YB . C YB 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.091 ? metalc ? metalc17 D OD1 ASP 93 D ASP 93 1_555 N CA CA . D CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.621 ? metalc ? metalc18 D OD1 ASP 95 D ASP 95 1_555 N CA CA . D CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? metalc ? metalc19 D OD1 ASN 97 D ASN 97 1_555 N CA CA . D CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? metalc ? metalc20 D O TYR 99 D TYR 99 1_555 N CA CA . D CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? metalc ? metalc21 D OE1 GLU 104 D GLU 104 1_555 N CA CA . D CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? metalc ? metalc22 D OE2 GLU 104 D GLU 104 1_555 N CA CA . D CA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.65 ? metalc ? metalc23 D OD1 ASP 131 D ASP 131 1_555 M CA CA . D CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? metalc ? metalc24 D OD1 ASP 133 D ASP 133 1_555 M CA CA . D CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.856 ? metalc ? metalc25 D O GLN 135 D GLN 135 1_555 M CA CA . D CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? metalc ? metalc26 D OE1 GLU 140 D GLU 140 1_555 M CA CA . D CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.682 ? metalc ? metalc27 D OE2 GLU 140 D GLU 140 1_555 M CA CA . D CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? metalc ? metalc28 E OD1 ASP 93 E ASP 93 1_555 P CA CA . E CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.636 ? metalc ? metalc29 E OD1 ASP 95 E ASP 95 1_555 P CA CA . E CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? metalc ? metalc30 E OD1 ASN 97 E ASN 97 1_555 P CA CA . E CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.122 ? metalc ? metalc31 E O TYR 99 E TYR 99 1_555 P CA CA . E CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? metalc ? metalc32 E OE1 GLU 104 E GLU 104 1_555 P CA CA . E CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? metalc ? metalc33 E OE2 GLU 104 E GLU 104 1_555 P CA CA . E CA 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.586 ? metalc ? metalc34 E OD1 ASP 131 E ASP 131 1_555 O CA CA . E CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.631 ? metalc ? metalc35 E OD1 ASP 133 E ASP 133 1_555 O CA CA . E CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.089 ? metalc ? metalc36 E O GLN 135 E GLN 135 1_555 O CA CA . E CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.909 ? metalc ? metalc37 E OE1 GLU 140 E GLU 140 1_555 O CA CA . E CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? metalc ? metalc38 E OE2 GLU 140 E GLU 140 1_555 O CA CA . E CA 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.49 ? metalc ? metalc39 F OD1 ASP 93 F ASP 93 1_555 R CA CA . F CA 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? metalc ? metalc40 F OD1 ASP 95 F ASP 95 1_555 R CA CA . F CA 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? metalc ? metalc41 F OD1 ASN 97 F ASN 97 1_555 R CA CA . F CA 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.99 ? metalc ? metalc42 F O TYR 99 F TYR 99 1_555 R CA CA . F CA 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.079 ? metalc ? metalc43 F OE1 GLU 104 F GLU 104 1_555 R CA CA . F CA 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? metalc ? metalc44 F OE2 GLU 104 F GLU 104 1_555 R CA CA . F CA 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.777 ? metalc ? metalc45 F OD1 ASP 131 F ASP 131 1_555 Q CA CA . F CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.446 ? metalc ? metalc46 F OD1 ASP 133 F ASP 133 1_555 Q CA CA . F CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? metalc ? metalc47 F O GLN 135 F GLN 135 1_555 Q CA CA . F CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? metalc ? metalc48 F OE1 GLU 140 F GLU 140 1_555 Q CA CA . F CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc49 F OE2 GLU 140 F GLU 140 1_555 Q CA CA . F CA 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1S26 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.008507 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005966 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.002896 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 3 YB A 1 901 901 YB YB . H 4 APC A 1 1139 1139 APC APC . I 3 YB B 1 902 902 YB YB . J 4 APC B 1 2139 2139 APC APC . K 3 YB C 1 903 903 YB YB . L 4 APC C 1 3139 3139 APC APC . M 5 CA D 1 800 800 CA CA . N 5 CA D 1 801 801 CA CA . O 5 CA E 1 802 802 CA CA . P 5 CA E 1 803 803 CA CA . Q 5 CA F 1 804 804 CA CA . R 5 CA F 1 805 805 CA CA . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id R _atom_site.label_entity_id 5 _atom_site.Cartn_x 32.029 _atom_site.Cartn_y 58.343 _atom_site.Cartn_z 86.94 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 66.84 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 805 _atom_site.auth_asym_id F _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 13 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 25 _model_server_stats.query_time_ms 304 _model_server_stats.encode_time_ms 7 _model_server_stats.element_count 1 #