data_1S6C # _model_server_result.job_id P93B766KjQmcL04sXj8bSw _model_server_result.datetime_utc '2025-09-08 19:37:46' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1s6c # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":217}' # _entry.id 1S6C # _exptl.entry_id 1S6C _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1S6C _cell.length_a 74.744 _cell.length_b 74.487 _cell.length_c 85.41 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1S6C _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 23 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'I 2 2 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA,PQS _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 3_556 -x,y,-z+1 -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 0 0 85.41 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 C N N ? 3 D N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C GLU 30 A GLU 63 1_555 A N CAS 31 A CAS 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale2 A C CAS 31 A CAS 64 1_555 A N PRO 32 A PRO 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.356 ? covale ? covale3 A C SER 165 A SER 198 1_555 A N CAS 166 A CAS 199 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale4 A C CAS 166 A CAS 199 1_555 A N GLN 167 A GLN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale5 A C MET 183 A MET 216 1_555 B N MET 1 B MET 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASP 102 A ASP 135 1_555 C CA CA . A CA 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASN 104 A ASN 137 1_555 C CA CA . A CA 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 106 A ASP 139 1_555 C CA CA . A CA 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? metalc ? metalc4 A O TYR 108 A TYR 141 1_555 C CA CA . A CA 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.228 ? metalc ? metalc5 A OE1 GLU 113 A GLU 146 1_555 C CA CA . A CA 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? metalc ? metalc6 A OE2 GLU 113 A GLU 146 1_555 C CA CA . A CA 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.761 ? metalc ? metalc7 A OD1 ASP 150 A ASP 183 1_555 D CA CA . A CA 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.118 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASN 152 A ASN 185 1_555 D CA CA . A CA 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.34 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 154 A ASP 187 1_555 D CA CA . A CA 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? metalc ? metalc10 A O ILE 156 A ILE 189 1_555 D CA CA . A CA 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.206 ? metalc ? metalc11 A OE1 GLU 161 A GLU 194 1_555 D CA CA . A CA 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.445 ? metalc ? metalc12 A OE2 GLU 161 A GLU 194 1_555 D CA CA . A CA 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.555 ? metalc ? metalc13 C CA CA . A CA 217 1_555 E O HOH . A HOH 298 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.544 ? metalc ? metalc14 D CA CA . A CA 218 1_555 E O HOH . A HOH 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.24 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1S6C _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.013379 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.013425 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.011708 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 3 CA A 1 217 1 CA CA2 . D 3 CA A 1 218 2 CA CA2 . E 4 HOH A 1 219 1 HOH WAT . E 4 HOH A 2 220 2 HOH WAT . E 4 HOH A 3 221 3 HOH WAT . E 4 HOH A 4 222 4 HOH WAT . E 4 HOH A 5 223 5 HOH WAT . E 4 HOH A 6 224 7 HOH WAT . E 4 HOH A 7 225 8 HOH WAT . E 4 HOH A 8 226 9 HOH WAT . E 4 HOH A 9 227 10 HOH WAT . E 4 HOH A 10 228 11 HOH WAT . E 4 HOH A 11 229 12 HOH WAT . E 4 HOH A 12 230 13 HOH WAT . E 4 HOH A 13 231 14 HOH WAT . E 4 HOH A 14 232 15 HOH WAT . E 4 HOH A 15 233 16 HOH WAT . E 4 HOH A 16 234 17 HOH WAT . E 4 HOH A 17 235 18 HOH WAT . E 4 HOH A 18 236 19 HOH WAT . E 4 HOH A 19 237 20 HOH WAT . E 4 HOH A 20 238 21 HOH WAT . E 4 HOH A 21 239 22 HOH WAT . E 4 HOH A 22 240 23 HOH WAT . E 4 HOH A 23 241 24 HOH WAT . E 4 HOH A 24 242 25 HOH WAT . E 4 HOH A 25 243 26 HOH WAT . E 4 HOH A 26 244 27 HOH WAT . E 4 HOH A 27 245 30 HOH WAT . E 4 HOH A 28 246 31 HOH WAT . E 4 HOH A 29 247 32 HOH WAT . E 4 HOH A 30 248 33 HOH WAT . E 4 HOH A 31 249 34 HOH WAT . E 4 HOH A 32 250 35 HOH WAT . E 4 HOH A 33 251 36 HOH WAT . E 4 HOH A 34 252 37 HOH WAT . E 4 HOH A 35 253 38 HOH WAT . E 4 HOH A 36 254 39 HOH WAT . E 4 HOH A 37 255 40 HOH WAT . E 4 HOH A 38 256 41 HOH WAT . E 4 HOH A 39 257 42 HOH WAT . E 4 HOH A 40 258 43 HOH WAT . E 4 HOH A 41 259 44 HOH WAT . E 4 HOH A 42 260 45 HOH WAT . E 4 HOH A 43 261 47 HOH WAT . E 4 HOH A 44 262 48 HOH WAT . E 4 HOH A 45 263 49 HOH WAT . E 4 HOH A 46 264 50 HOH WAT . E 4 HOH A 47 265 51 HOH WAT . E 4 HOH A 48 266 52 HOH WAT . E 4 HOH A 49 267 53 HOH WAT . E 4 HOH A 50 268 54 HOH WAT . E 4 HOH A 51 269 55 HOH WAT . E 4 HOH A 52 270 56 HOH WAT . E 4 HOH A 53 271 57 HOH WAT . E 4 HOH A 54 272 58 HOH WAT . E 4 HOH A 55 273 59 HOH WAT . E 4 HOH A 56 274 60 HOH WAT . E 4 HOH A 57 275 61 HOH WAT . E 4 HOH A 58 276 62 HOH WAT . E 4 HOH A 59 277 63 HOH WAT . E 4 HOH A 60 278 64 HOH WAT . E 4 HOH A 61 279 65 HOH WAT . E 4 HOH A 62 280 67 HOH WAT . E 4 HOH A 63 281 68 HOH WAT . E 4 HOH A 64 282 69 HOH WAT . E 4 HOH A 65 283 70 HOH WAT . E 4 HOH A 66 284 71 HOH WAT . E 4 HOH A 67 285 73 HOH WAT . E 4 HOH A 68 286 74 HOH WAT . E 4 HOH A 69 287 75 HOH WAT . E 4 HOH A 70 288 76 HOH WAT . E 4 HOH A 71 289 77 HOH WAT . E 4 HOH A 72 290 78 HOH WAT . E 4 HOH A 73 291 80 HOH WAT . E 4 HOH A 74 292 81 HOH WAT . E 4 HOH A 75 293 82 HOH WAT . E 4 HOH A 76 294 83 HOH WAT . E 4 HOH A 77 295 84 HOH WAT . E 4 HOH A 78 296 85 HOH WAT . E 4 HOH A 79 297 87 HOH WAT . E 4 HOH A 80 298 88 HOH WAT . E 4 HOH A 81 299 89 HOH WAT . E 4 HOH A 82 300 90 HOH WAT . E 4 HOH A 83 301 91 HOH WAT . E 4 HOH A 84 302 92 HOH WAT . E 4 HOH A 85 303 93 HOH WAT . E 4 HOH A 86 304 94 HOH WAT . E 4 HOH A 87 305 95 HOH WAT . E 4 HOH A 88 306 96 HOH WAT . E 4 HOH A 89 307 97 HOH WAT . E 4 HOH A 90 308 98 HOH WAT . E 4 HOH A 91 309 99 HOH WAT . E 4 HOH A 92 310 100 HOH WAT . E 4 HOH A 93 311 101 HOH WAT . E 4 HOH A 94 312 102 HOH WAT . E 4 HOH A 95 313 103 HOH WAT . E 4 HOH A 96 314 104 HOH WAT . E 4 HOH A 97 315 105 HOH WAT . E 4 HOH A 98 316 106 HOH WAT . E 4 HOH A 99 317 107 HOH WAT . E 4 HOH A 100 318 108 HOH WAT . E 4 HOH A 101 319 109 HOH WAT . E 4 HOH A 102 320 110 HOH WAT . E 4 HOH A 103 321 111 HOH WAT . E 4 HOH A 104 322 112 HOH WAT . E 4 HOH A 105 323 113 HOH WAT . E 4 HOH A 106 324 114 HOH WAT . E 4 HOH A 107 325 116 HOH WAT . E 4 HOH A 108 326 117 HOH WAT . E 4 HOH A 109 327 118 HOH WAT . E 4 HOH A 110 328 119 HOH WAT . E 4 HOH A 111 329 120 HOH WAT . E 4 HOH A 112 330 121 HOH WAT . E 4 HOH A 113 331 122 HOH WAT . E 4 HOH A 114 332 123 HOH WAT . E 4 HOH A 115 333 124 HOH WAT . E 4 HOH A 116 334 125 HOH WAT . E 4 HOH A 117 335 126 HOH WAT . E 4 HOH A 118 336 127 HOH WAT . E 4 HOH A 119 337 128 HOH WAT . E 4 HOH A 120 338 129 HOH WAT . E 4 HOH A 121 339 130 HOH WAT . E 4 HOH A 122 340 131 HOH WAT . E 4 HOH A 123 341 132 HOH WAT . E 4 HOH A 124 342 133 HOH WAT . E 4 HOH A 125 343 134 HOH WAT . E 4 HOH A 126 344 135 HOH WAT . E 4 HOH A 127 345 136 HOH WAT . E 4 HOH A 128 346 137 HOH WAT . E 4 HOH A 129 347 138 HOH WAT . E 4 HOH A 130 348 139 HOH WAT . E 4 HOH A 131 349 140 HOH WAT . E 4 HOH A 132 350 142 HOH WAT . E 4 HOH A 133 351 143 HOH WAT . E 4 HOH A 134 352 145 HOH WAT . E 4 HOH A 135 353 146 HOH WAT . E 4 HOH A 136 354 147 HOH WAT . E 4 HOH A 137 355 148 HOH WAT . E 4 HOH A 138 356 149 HOH WAT . E 4 HOH A 139 357 150 HOH WAT . E 4 HOH A 140 358 151 HOH WAT . E 4 HOH A 141 359 152 HOH WAT . E 4 HOH A 142 360 153 HOH WAT . E 4 HOH A 143 361 154 HOH WAT . E 4 HOH A 144 362 155 HOH WAT . E 4 HOH A 145 363 156 HOH WAT . E 4 HOH A 146 364 157 HOH WAT . E 4 HOH A 147 365 158 HOH WAT . F 4 HOH B 1 6 6 HOH WAT . F 4 HOH B 2 28 28 HOH WAT . F 4 HOH B 3 46 46 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id C _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x -16.976 _atom_site.Cartn_y 23.368 _atom_site.Cartn_z 23.185 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 35.76 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 217 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 9 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 2 _model_server_stats.query_time_ms 353 _model_server_stats.encode_time_ms 1 _model_server_stats.element_count 1 #