data_1SA5 # _model_server_result.job_id w3q0nxguXNez02dEsrHdDw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-26 05:48:55' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1sa5 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":441}' # _entry.id 1SA5 # _exptl.entry_id 1SA5 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 60.052 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ACETIC ACID' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 1SA5 _cell.length_a 170.469 _cell.length_b 170.469 _cell.length_c 69.028 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1SA5 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 169 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 61' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 6 _struct_asym.id F _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 B OD1 ASP 297 B ASP 297 1_555 C ZN ZN . B ZN 438 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.431 ? metalc ? metalc2 B OD2 ASP 297 B ASP 297 1_555 C ZN ZN . B ZN 438 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.169 ? metalc ? metalc3 B SG CYS 299 B CYS 299 1_555 C ZN ZN . B ZN 438 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.418 ? metalc ? metalc4 B NE2 HIS 362 B HIS 362 1_555 C ZN ZN . B ZN 438 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? metalc ? metalc5 C ZN ZN . B ZN 438 1_555 E NAV BMV . B BMV 440 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? # _chem_comp.formula 'C2 H4 O2' _chem_comp.formula_weight 60.052 _chem_comp.id ACY _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ACETIC ACID' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C O ACY doub 1 n n C OXT ACY sing 2 n n C CH3 ACY sing 3 n n OXT HXT ACY sing 4 n n CH3 H1 ACY sing 5 n n CH3 H2 ACY sing 6 n n CH3 H3 ACY sing 7 n n # _atom_sites.entry_id 1SA5 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.005866 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.003387 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006774 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.014487 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 3 ZN B 1 438 3 ZN ZN . D 4 FPP B 1 439 1 FPP FPP . E 5 BMV B 1 440 2 BMV BMS . F 6 ACY B 1 441 4 ACY ACY . G 7 HOH A 1 378 6 HOH WAT . G 7 HOH A 2 379 9 HOH WAT . G 7 HOH A 3 380 10 HOH WAT . G 7 HOH A 4 381 12 HOH WAT . G 7 HOH A 5 382 13 HOH WAT . G 7 HOH A 6 383 17 HOH WAT . G 7 HOH A 7 384 20 HOH WAT . G 7 HOH A 8 385 21 HOH WAT . G 7 HOH A 9 386 22 HOH WAT . G 7 HOH A 10 387 26 HOH WAT . G 7 HOH A 11 388 27 HOH WAT . G 7 HOH A 12 389 29 HOH WAT . G 7 HOH A 13 390 30 HOH WAT . G 7 HOH A 14 391 31 HOH WAT . G 7 HOH A 15 392 32 HOH WAT . G 7 HOH A 16 393 33 HOH WAT . G 7 HOH A 17 394 34 HOH WAT . G 7 HOH A 18 395 35 HOH WAT . G 7 HOH A 19 396 36 HOH WAT . G 7 HOH A 20 397 37 HOH WAT . G 7 HOH A 21 398 38 HOH WAT . G 7 HOH A 22 399 39 HOH WAT . G 7 HOH A 23 400 42 HOH WAT . G 7 HOH A 24 401 43 HOH WAT . G 7 HOH A 25 402 44 HOH WAT . G 7 HOH A 26 403 45 HOH WAT . G 7 HOH A 27 404 46 HOH WAT . G 7 HOH A 28 405 49 HOH WAT . G 7 HOH A 29 406 53 HOH WAT . G 7 HOH A 30 407 54 HOH WAT . G 7 HOH A 31 408 55 HOH WAT . G 7 HOH A 32 409 56 HOH WAT . G 7 HOH A 33 410 60 HOH WAT . G 7 HOH A 34 411 62 HOH WAT . G 7 HOH A 35 412 63 HOH WAT . G 7 HOH A 36 413 66 HOH WAT . G 7 HOH A 37 414 67 HOH WAT . G 7 HOH A 38 415 69 HOH WAT . G 7 HOH A 39 416 70 HOH WAT . G 7 HOH A 40 417 71 HOH WAT . G 7 HOH A 41 418 73 HOH WAT . G 7 HOH A 42 419 76 HOH WAT . G 7 HOH A 43 420 77 HOH WAT . G 7 HOH A 44 421 79 HOH WAT . G 7 HOH A 45 422 80 HOH WAT . G 7 HOH A 46 423 82 HOH WAT . G 7 HOH A 47 424 83 HOH WAT . G 7 HOH A 48 425 84 HOH WAT . G 7 HOH A 49 426 87 HOH WAT . G 7 HOH A 50 427 89 HOH WAT . G 7 HOH A 51 428 90 HOH WAT . G 7 HOH A 52 429 92 HOH WAT . G 7 HOH A 53 430 93 HOH WAT . G 7 HOH A 54 431 96 HOH WAT . G 7 HOH A 55 432 100 HOH WAT . G 7 HOH A 56 433 104 HOH WAT . G 7 HOH A 57 434 106 HOH WAT . G 7 HOH A 58 435 109 HOH WAT . G 7 HOH A 59 436 111 HOH WAT . G 7 HOH A 60 437 116 HOH WAT . G 7 HOH A 61 438 117 HOH WAT . G 7 HOH A 62 439 118 HOH WAT . G 7 HOH A 63 440 120 HOH WAT . G 7 HOH A 64 441 121 HOH WAT . G 7 HOH A 65 442 123 HOH WAT . G 7 HOH A 66 443 124 HOH WAT . G 7 HOH A 67 444 126 HOH WAT . G 7 HOH A 68 445 128 HOH WAT . G 7 HOH A 69 446 131 HOH WAT . G 7 HOH A 70 447 134 HOH WAT . G 7 HOH A 71 448 135 HOH WAT . G 7 HOH A 72 449 137 HOH WAT . G 7 HOH A 73 450 140 HOH WAT . G 7 HOH A 74 451 141 HOH WAT . G 7 HOH A 75 452 143 HOH WAT . G 7 HOH A 76 453 145 HOH WAT . G 7 HOH A 77 454 146 HOH WAT . G 7 HOH A 78 455 148 HOH WAT . G 7 HOH A 79 456 152 HOH WAT . G 7 HOH A 80 457 153 HOH WAT . G 7 HOH A 81 458 155 HOH WAT . G 7 HOH A 82 459 156 HOH WAT . G 7 HOH A 83 460 157 HOH WAT . G 7 HOH A 84 461 158 HOH WAT . G 7 HOH A 85 462 160 HOH WAT . G 7 HOH A 86 463 161 HOH WAT . G 7 HOH A 87 464 162 HOH WAT . G 7 HOH A 88 465 163 HOH WAT . G 7 HOH A 89 466 164 HOH WAT . G 7 HOH A 90 467 166 HOH WAT . G 7 HOH A 91 468 167 HOH WAT . G 7 HOH A 92 469 169 HOH WAT . G 7 HOH A 93 470 173 HOH WAT . G 7 HOH A 94 471 174 HOH WAT . G 7 HOH A 95 472 175 HOH WAT . G 7 HOH A 96 473 176 HOH WAT . G 7 HOH A 97 474 178 HOH WAT . G 7 HOH A 98 475 184 HOH WAT . G 7 HOH A 99 476 189 HOH WAT . G 7 HOH A 100 477 190 HOH WAT . G 7 HOH A 101 478 196 HOH WAT . G 7 HOH A 102 479 197 HOH WAT . G 7 HOH A 103 480 199 HOH WAT . G 7 HOH A 104 481 200 HOH WAT . G 7 HOH A 105 482 201 HOH WAT . G 7 HOH A 106 483 203 HOH WAT . G 7 HOH A 107 484 207 HOH WAT . G 7 HOH A 108 485 210 HOH WAT . G 7 HOH A 109 486 214 HOH WAT . G 7 HOH A 110 487 216 HOH WAT . G 7 HOH A 111 488 217 HOH WAT . G 7 HOH A 112 489 218 HOH WAT . G 7 HOH A 113 490 220 HOH WAT . G 7 HOH A 114 491 222 HOH WAT . G 7 HOH A 115 492 223 HOH WAT . G 7 HOH A 116 493 225 HOH WAT . G 7 HOH A 117 494 226 HOH WAT . G 7 HOH A 118 495 227 HOH WAT . G 7 HOH A 119 496 228 HOH WAT . G 7 HOH A 120 497 232 HOH WAT . G 7 HOH A 121 498 235 HOH WAT . G 7 HOH A 122 499 237 HOH WAT . G 7 HOH A 123 500 238 HOH WAT . G 7 HOH A 124 501 239 HOH WAT . G 7 HOH A 125 502 240 HOH WAT . G 7 HOH A 126 503 242 HOH WAT . G 7 HOH A 127 504 243 HOH WAT . G 7 HOH A 128 505 245 HOH WAT . G 7 HOH A 129 506 246 HOH WAT . G 7 HOH A 130 507 248 HOH WAT . G 7 HOH A 131 508 250 HOH WAT . G 7 HOH A 132 509 251 HOH WAT . G 7 HOH A 133 510 252 HOH WAT . G 7 HOH A 134 511 257 HOH WAT . G 7 HOH A 135 512 258 HOH WAT . G 7 HOH A 136 513 261 HOH WAT . G 7 HOH A 137 514 263 HOH WAT . G 7 HOH A 138 515 265 HOH WAT . G 7 HOH A 139 516 267 HOH WAT . G 7 HOH A 140 517 269 HOH WAT . G 7 HOH A 141 518 272 HOH WAT . G 7 HOH A 142 519 274 HOH WAT . G 7 HOH A 143 520 275 HOH WAT . G 7 HOH A 144 521 276 HOH WAT . G 7 HOH A 145 522 279 HOH WAT . G 7 HOH A 146 523 281 HOH WAT . G 7 HOH A 147 524 282 HOH WAT . H 7 HOH B 1 442 5 HOH WAT . H 7 HOH B 2 443 7 HOH WAT . H 7 HOH B 3 444 8 HOH WAT . H 7 HOH B 4 445 11 HOH WAT . H 7 HOH B 5 446 14 HOH WAT . H 7 HOH B 6 447 15 HOH WAT . H 7 HOH B 7 448 16 HOH WAT . H 7 HOH B 8 449 18 HOH WAT . H 7 HOH B 9 450 19 HOH WAT . H 7 HOH B 10 451 23 HOH WAT . H 7 HOH B 11 452 24 HOH WAT . H 7 HOH B 12 453 25 HOH WAT . H 7 HOH B 13 454 28 HOH WAT . H 7 HOH B 14 455 40 HOH WAT . H 7 HOH B 15 456 41 HOH WAT . H 7 HOH B 16 457 47 HOH WAT . H 7 HOH B 17 458 48 HOH WAT . H 7 HOH B 18 459 50 HOH WAT . H 7 HOH B 19 460 51 HOH WAT . H 7 HOH B 20 461 52 HOH WAT . H 7 HOH B 21 462 57 HOH WAT . H 7 HOH B 22 463 58 HOH WAT . H 7 HOH B 23 464 59 HOH WAT . H 7 HOH B 24 465 61 HOH WAT . H 7 HOH B 25 466 64 HOH WAT . H 7 HOH B 26 467 65 HOH WAT . H 7 HOH B 27 468 68 HOH WAT . H 7 HOH B 28 469 72 HOH WAT . H 7 HOH B 29 470 74 HOH WAT . H 7 HOH B 30 471 75 HOH WAT . H 7 HOH B 31 472 78 HOH WAT . H 7 HOH B 32 473 81 HOH WAT . H 7 HOH B 33 474 85 HOH WAT . H 7 HOH B 34 475 86 HOH WAT . H 7 HOH B 35 476 88 HOH WAT . H 7 HOH B 36 477 91 HOH WAT . H 7 HOH B 37 478 94 HOH WAT . H 7 HOH B 38 479 95 HOH WAT . H 7 HOH B 39 480 97 HOH WAT . H 7 HOH B 40 481 98 HOH WAT . H 7 HOH B 41 482 99 HOH WAT . H 7 HOH B 42 483 101 HOH WAT . H 7 HOH B 43 484 102 HOH WAT . H 7 HOH B 44 485 103 HOH WAT . H 7 HOH B 45 486 105 HOH WAT . H 7 HOH B 46 487 107 HOH WAT . H 7 HOH B 47 488 108 HOH WAT . H 7 HOH B 48 489 110 HOH WAT . H 7 HOH B 49 490 112 HOH WAT . H 7 HOH B 50 491 113 HOH WAT . H 7 HOH B 51 492 114 HOH WAT . H 7 HOH B 52 493 115 HOH WAT . H 7 HOH B 53 494 119 HOH WAT . H 7 HOH B 54 495 122 HOH WAT . H 7 HOH B 55 496 125 HOH WAT . H 7 HOH B 56 497 127 HOH WAT . H 7 HOH B 57 498 129 HOH WAT . H 7 HOH B 58 499 130 HOH WAT . H 7 HOH B 59 500 132 HOH WAT . H 7 HOH B 60 501 133 HOH WAT . H 7 HOH B 61 502 136 HOH WAT . H 7 HOH B 62 503 138 HOH WAT . H 7 HOH B 63 504 139 HOH WAT . H 7 HOH B 64 505 142 HOH WAT . H 7 HOH B 65 506 144 HOH WAT . H 7 HOH B 66 507 147 HOH WAT . H 7 HOH B 67 508 149 HOH WAT . H 7 HOH B 68 509 150 HOH WAT . H 7 HOH B 69 510 151 HOH WAT . H 7 HOH B 70 511 154 HOH WAT . H 7 HOH B 71 512 159 HOH WAT . H 7 HOH B 72 513 165 HOH WAT . H 7 HOH B 73 514 168 HOH WAT . H 7 HOH B 74 515 170 HOH WAT . H 7 HOH B 75 516 171 HOH WAT . H 7 HOH B 76 517 172 HOH WAT . H 7 HOH B 77 518 177 HOH WAT . H 7 HOH B 78 519 179 HOH WAT . H 7 HOH B 79 520 180 HOH WAT . H 7 HOH B 80 521 181 HOH WAT . H 7 HOH B 81 522 182 HOH WAT . H 7 HOH B 82 523 183 HOH WAT . H 7 HOH B 83 524 185 HOH WAT . H 7 HOH B 84 525 186 HOH WAT . H 7 HOH B 85 526 187 HOH WAT . H 7 HOH B 86 527 188 HOH WAT . H 7 HOH B 87 528 191 HOH WAT . H 7 HOH B 88 529 192 HOH WAT . H 7 HOH B 89 530 193 HOH WAT . H 7 HOH B 90 531 194 HOH WAT . H 7 HOH B 91 532 195 HOH WAT . H 7 HOH B 92 533 198 HOH WAT . H 7 HOH B 93 534 202 HOH WAT . H 7 HOH B 94 535 204 HOH WAT . H 7 HOH B 95 536 205 HOH WAT . H 7 HOH B 96 537 206 HOH WAT . H 7 HOH B 97 538 208 HOH WAT . H 7 HOH B 98 539 209 HOH WAT . H 7 HOH B 99 540 211 HOH WAT . H 7 HOH B 100 541 212 HOH WAT . H 7 HOH B 101 542 213 HOH WAT . H 7 HOH B 102 543 215 HOH WAT . H 7 HOH B 103 544 219 HOH WAT . H 7 HOH B 104 545 221 HOH WAT . H 7 HOH B 105 546 224 HOH WAT . H 7 HOH B 106 547 229 HOH WAT . H 7 HOH B 107 548 230 HOH WAT . H 7 HOH B 108 549 231 HOH WAT . H 7 HOH B 109 550 233 HOH WAT . H 7 HOH B 110 551 234 HOH WAT . H 7 HOH B 111 552 236 HOH WAT . H 7 HOH B 112 553 241 HOH WAT . H 7 HOH B 113 554 244 HOH WAT . H 7 HOH B 114 555 247 HOH WAT . H 7 HOH B 115 556 249 HOH WAT . H 7 HOH B 116 557 253 HOH WAT . H 7 HOH B 117 558 254 HOH WAT . H 7 HOH B 118 559 255 HOH WAT . H 7 HOH B 119 560 256 HOH WAT . H 7 HOH B 120 561 259 HOH WAT . H 7 HOH B 121 562 260 HOH WAT . H 7 HOH B 122 563 262 HOH WAT . H 7 HOH B 123 564 264 HOH WAT . H 7 HOH B 124 565 266 HOH WAT . H 7 HOH B 125 566 268 HOH WAT . H 7 HOH B 126 567 270 HOH WAT . H 7 HOH B 127 568 271 HOH WAT . H 7 HOH B 128 569 273 HOH WAT . H 7 HOH B 129 570 277 HOH WAT . H 7 HOH B 130 571 278 HOH WAT . H 7 HOH B 131 572 280 HOH WAT . H 7 HOH B 132 573 283 HOH WAT . H 7 HOH B 133 574 284 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C ACY . . . F 6 94.141 7.642 24.786 1 27.3 ? C ACY 441 B 1 HETATM 2 O O ACY . . . F 6 95.299 7.17 25.168 1 26.76 ? O ACY 441 B 1 HETATM 3 O OXT ACY . . . F 6 92.987 7.391 25.286 1 25.81 ? OXT ACY 441 B 1 HETATM 4 C CH3 ACY . . . F 6 94.243 8.596 23.609 1 28.19 ? CH3 ACY 441 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 7 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 19 _model_server_stats.query_time_ms 270 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 4 #