data_1SAC # _model_server_result.job_id FbSgEhw3atz42xdDwavveA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-16 19:00:27' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1sac # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"O","auth_seq_id":206}' # _entry.id 1SAC # _exptl.entry_id 1SAC _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 10 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 95.9 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1SAC _cell.length_a 68.9 _cell.length_b 99.3 _cell.length_c 96.7 _cell.Z_PDB 10 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1SAC _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 5 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 I N N ? 2 J N N ? 2 L N N ? 2 M N N ? 2 N N N ? 2 O N N ? 2 Q N N ? 2 R N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 36 A CYS 36 1_555 A SG CYS 95 A CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 36 B CYS 36 1_555 B SG CYS 95 B CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.648 ? disulf ? disulf3 C SG CYS 36 C CYS 36 1_555 C SG CYS 95 C CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.681 ? disulf ? disulf4 D SG CYS 36 D CYS 36 1_555 D SG CYS 95 D CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.67 ? disulf ? disulf5 E SG CYS 36 E CYS 36 1_555 E SG CYS 95 E CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.68 ? metalc ? metalc1 F CA CA . A CA 205 1_555 A OE1 GLU 136 A GLU 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.79 ? metalc ? metalc2 F CA CA . A CA 205 1_555 A OE2 GLU 136 A GLU 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.59 ? metalc ? metalc3 F CA CA . A CA 205 1_555 H O ACY . A ACY 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.749 ? metalc ? metalc4 F CA CA . A CA 205 1_555 A OD1 ASP 138 A ASP 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? metalc ? metalc5 F CA CA . A CA 205 1_555 A OD1 ASN 59 A ASN 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.513 ? metalc ? metalc6 F CA CA . A CA 205 1_555 A OD1 ASP 58 A ASP 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.682 ? metalc ? metalc7 F CA CA . A CA 205 1_555 A OD2 ASP 58 A ASP 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.755 ? metalc ? metalc8 F CA CA . A CA 205 1_555 A O GLN 137 A GLN 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? metalc ? metalc9 G CA CA . A CA 206 1_555 A OE1 GLU 136 A GLU 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.4 ? metalc ? metalc10 G CA CA . A CA 206 1_555 A OE1 GLN 148 A GLN 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.583 ? metalc ? metalc11 G CA CA . A CA 206 1_555 H OXT ACY . A ACY 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.669 ? metalc ? metalc12 G CA CA . A CA 206 1_555 A OD1 ASP 138 A ASP 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.769 ? metalc ? metalc13 G CA CA . A CA 206 1_555 A OD2 ASP 138 A ASP 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.701 ? metalc ? metalc14 I CA CA . B CA 205 1_555 B OE1 GLU 136 B GLU 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.841 ? metalc ? metalc15 I CA CA . B CA 205 1_555 B OE2 GLU 136 B GLU 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.646 ? metalc ? metalc16 I CA CA . B CA 205 1_555 B OD1 ASP 58 B ASP 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.606 ? metalc ? metalc17 I CA CA . B CA 205 1_555 B O GLN 137 B GLN 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.522 ? metalc ? metalc18 I CA CA . B CA 205 1_555 K O ACY . B ACY 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.681 ? metalc ? metalc19 I CA CA . B CA 205 1_555 B OD2 ASP 58 B ASP 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.793 ? metalc ? metalc20 I CA CA . B CA 205 1_555 B OD1 ASP 138 B ASP 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? metalc ? metalc21 I CA CA . B CA 205 1_555 B OD1 ASN 59 B ASN 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.533 ? metalc ? metalc22 J CA CA . B CA 206 1_555 B OD2 ASP 138 B ASP 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.835 ? metalc ? metalc23 J CA CA . B CA 206 1_555 B OE1 GLU 136 B GLU 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? metalc ? metalc24 J CA CA . B CA 206 1_555 B OE1 GLN 148 B GLN 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.588 ? metalc ? metalc25 J CA CA . B CA 206 1_555 K OXT ACY . B ACY 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.668 ? metalc ? metalc26 J CA CA . B CA 206 1_555 B OD1 ASP 138 B ASP 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.598 ? metalc ? metalc27 L CA CA . C CA 205 1_555 C OE1 GLU 136 C GLU 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.773 ? metalc ? metalc28 L CA CA . C CA 205 1_555 C OE2 GLU 136 C GLU 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.531 ? metalc ? metalc29 L CA CA . C CA 205 1_555 C O GLN 137 C GLN 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? metalc ? metalc30 L CA CA . C CA 205 1_555 C OD1 ASP 138 C ASP 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.539 ? metalc ? metalc31 L CA CA . C CA 205 1_555 C OD1 ASP 58 C ASP 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.704 ? metalc ? metalc32 L CA CA . C CA 205 1_555 C OD2 ASP 58 C ASP 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.693 ? metalc ? metalc33 L CA CA . C CA 205 1_555 C OD1 ASN 59 C ASN 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.641 ? metalc ? metalc34 M CA CA . C CA 206 1_555 C OD1 ASP 138 C ASP 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.572 ? metalc ? metalc35 M CA CA . C CA 206 1_555 C OD2 ASP 138 C ASP 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.721 ? metalc ? metalc36 M CA CA . C CA 206 1_555 C OE1 GLN 148 C GLN 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.462 ? metalc ? metalc37 M CA CA . C CA 206 1_555 C OE1 GLU 136 C GLU 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.468 ? metalc ? metalc38 N CA CA . D CA 205 1_555 D OD1 ASN 59 D ASN 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.728 ? metalc ? metalc39 N CA CA . D CA 205 1_555 D OE2 GLU 136 D GLU 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.589 ? metalc ? metalc40 N CA CA . D CA 205 1_555 D OD2 ASP 58 D ASP 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.774 ? metalc ? metalc41 N CA CA . D CA 205 1_555 D O GLN 137 D GLN 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? metalc ? metalc42 N CA CA . D CA 205 1_555 D OD1 ASP 138 D ASP 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc43 N CA CA . D CA 205 1_555 P O ACY . D ACY 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.7 ? metalc ? metalc44 N CA CA . D CA 205 1_555 D OE1 GLU 136 D GLU 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.698 ? metalc ? metalc45 N CA CA . D CA 205 1_555 D OD1 ASP 58 D ASP 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.512 ? metalc ? metalc46 O CA CA . D CA 206 1_555 D OD2 ASP 138 D ASP 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.573 ? metalc ? metalc47 O CA CA . D CA 206 1_555 P OXT ACY . D ACY 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.685 ? metalc ? metalc48 O CA CA . D CA 206 1_555 D OE1 GLU 136 D GLU 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.563 ? metalc ? metalc49 O CA CA . D CA 206 1_555 D OE1 GLN 148 D GLN 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.526 ? metalc ? metalc50 O CA CA . D CA 206 1_555 D OD1 ASP 138 D ASP 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.872 ? metalc ? metalc51 Q CA CA . E CA 205 1_555 E OD2 ASP 58 E ASP 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.881 ? metalc ? metalc52 Q CA CA . E CA 205 1_555 E OD1 ASN 59 E ASN 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.568 ? metalc ? metalc53 Q CA CA . E CA 205 1_555 E OE1 GLU 136 E GLU 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.875 ? metalc ? metalc54 Q CA CA . E CA 205 1_555 E OE2 GLU 136 E GLU 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.53 ? metalc ? metalc55 Q CA CA . E CA 205 1_555 E O GLN 137 E GLN 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.436 ? metalc ? metalc56 Q CA CA . E CA 205 1_555 E OD1 ASP 138 E ASP 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.529 ? metalc ? metalc57 Q CA CA . E CA 205 1_555 S O ACY . E ACY 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.563 ? metalc ? metalc58 Q CA CA . E CA 205 1_555 E OD1 ASP 58 E ASP 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.503 ? metalc ? metalc59 R CA CA . E CA 206 1_555 E OE1 GLU 136 E GLU 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? metalc ? metalc60 R CA CA . E CA 206 1_555 E OD1 ASP 138 E ASP 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.759 ? metalc ? metalc61 R CA CA . E CA 206 1_555 E OE1 GLN 148 E GLN 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.642 ? metalc ? metalc62 R CA CA . E CA 206 1_555 E OD2 ASP 138 E ASP 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.738 ? metalc ? metalc63 R CA CA . E CA 206 1_555 S OXT ACY . E ACY 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.723 ? metalc ? metalc64 L CA CA . C CA 205 1_555 A OE2 GLU 167 A GLU 167 1_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? metalc ? metalc65 M CA CA . C CA 206 1_555 A OE1 GLU 167 A GLU 167 1_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.489 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1SAC _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.014514 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.0015 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.01007 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.010396 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code F 2 CA A 1 205 1 CA CA . G 2 CA A 1 206 2 CA CA . H 3 ACY A 1 300 300 ACY ACY . I 2 CA B 1 205 1 CA CA . J 2 CA B 1 206 2 CA CA . K 3 ACY B 1 300 300 ACY ACY . L 2 CA C 1 205 1 CA CA . M 2 CA C 1 206 2 CA CA . N 2 CA D 1 205 1 CA CA . O 2 CA D 1 206 2 CA CA . P 3 ACY D 1 300 300 ACY ACY . Q 2 CA E 1 205 1 CA CA . R 2 CA E 1 206 2 CA CA . S 3 ACY E 1 300 300 ACY ACY . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id O _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x -0.627 _atom_site.Cartn_y 42.506 _atom_site.Cartn_z -16.821 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 27.8 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 206 _atom_site.auth_asym_id D _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 8 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 22 _model_server_stats.query_time_ms 259 _model_server_stats.encode_time_ms 9 _model_server_stats.element_count 1 #