data_1SHW # _model_server_result.job_id QkqDbK-8HGxIgHbZQO7T-w _model_server_result.datetime_utc '2024-11-28 05:30:34' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1shw # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":1001}' # _entry.id 1SHW # _exptl.entry_id 1SHW _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1SHW _cell.length_a 37.89 _cell.length_b 88.97 _cell.length_c 122.81 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1SHW _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 4 _struct_asym.id D _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # _pdbx_entity_branch.entity_id 3 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 3 3 2 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 3 n C NAG 1 C 1 NAG ? 401 NAG 3 n C NAG 2 C 2 NAG ? 402 NAG 3 n C NAG 3 C 3 NAG ? 403 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 26 A CYS 57 1_555 A SG CYS 137 A CYS 169 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 35 A CYS 66 1_555 A SG CYS 75 A CYS 106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 63 A CYS 94 1_555 A SG CYS 124 A CYS 156 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf4 B SG CYS 44 B CYS 270 1_555 B SG CYS 166 B CYS 392 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf5 B SG CYS 79 B CYS 305 1_555 B SG CYS 89 B CYS 315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 10 A ASN 41 1_555 C C1 NAG . C NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale2 C O4 NAG . C NAG 1 1_555 C C1 NAG . C NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.39 ? covale ? covale3 C O4 NAG . C NAG 2 1_555 C C1 NAG . C NAG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.396 ? metalc ? metalc1 A NE2 HIS 22 A HIS 53 1_555 D ZN ZN . A ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 24 A ASP 55 1_555 D ZN ZN . A ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.383 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 24 A ASP 55 1_555 D ZN ZN . A ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASP 58 A ASP 89 4_455 D ZN ZN . A ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.773 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1SHW _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.026392 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.01124 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.008143 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 4 ZN A 1 1001 1 ZN ZN2 . E 5 HOH A 1 1002 1 HOH WAT . E 5 HOH A 2 1003 34 HOH WAT . E 5 HOH A 3 1004 6 HOH WAT . E 5 HOH A 4 1005 29 HOH WAT . E 5 HOH A 5 1006 5 HOH WAT . E 5 HOH A 6 1007 22 HOH WAT . E 5 HOH A 7 1008 4 HOH WAT . E 5 HOH A 8 1009 27 HOH WAT . E 5 HOH A 9 1010 11 HOH WAT . E 5 HOH A 10 1011 18 HOH WAT . E 5 HOH A 11 1012 17 HOH WAT . E 5 HOH A 12 1013 8 HOH WAT . E 5 HOH A 13 1014 81 HOH WAT . E 5 HOH A 14 1015 3 HOH WAT . E 5 HOH A 15 1016 67 HOH WAT . E 5 HOH A 16 1017 79 HOH WAT . E 5 HOH A 17 1018 39 HOH WAT . E 5 HOH A 18 1019 10 HOH WAT . E 5 HOH A 19 1020 30 HOH WAT . E 5 HOH A 20 1021 25 HOH WAT . E 5 HOH A 21 1022 12 HOH WAT . E 5 HOH A 22 1023 43 HOH WAT . E 5 HOH A 23 1024 56 HOH WAT . E 5 HOH A 24 1025 38 HOH WAT . E 5 HOH A 25 1026 84 HOH WAT . E 5 HOH A 26 1027 91 HOH WAT . E 5 HOH A 27 1028 19 HOH WAT . E 5 HOH A 28 1029 50 HOH WAT . E 5 HOH A 29 1030 57 HOH WAT . E 5 HOH A 30 1031 16 HOH WAT . E 5 HOH A 31 1032 54 HOH WAT . E 5 HOH A 32 1033 64 HOH WAT . E 5 HOH A 33 1034 21 HOH WAT . E 5 HOH A 34 1035 98 HOH WAT . E 5 HOH A 35 1036 101 HOH WAT . E 5 HOH A 36 1037 105 HOH WAT . E 5 HOH A 37 1038 106 HOH WAT . E 5 HOH A 38 1039 108 HOH WAT . E 5 HOH A 39 1040 109 HOH WAT . E 5 HOH A 40 1041 111 HOH WAT . E 5 HOH A 41 1042 114 HOH WAT . E 5 HOH A 42 1043 117 HOH WAT . E 5 HOH A 43 1044 120 HOH WAT . E 5 HOH A 44 1045 121 HOH WAT . E 5 HOH A 45 1046 122 HOH WAT . E 5 HOH A 46 1047 125 HOH WAT . E 5 HOH A 47 1048 134 HOH WAT . E 5 HOH A 48 1049 138 HOH WAT . E 5 HOH A 49 1050 139 HOH WAT . E 5 HOH A 50 1051 141 HOH WAT . E 5 HOH A 51 1052 142 HOH WAT . E 5 HOH A 52 1053 147 HOH WAT . E 5 HOH A 53 1054 148 HOH WAT . E 5 HOH A 54 1055 150 HOH WAT . E 5 HOH A 55 1056 151 HOH WAT . E 5 HOH A 56 1057 153 HOH WAT . E 5 HOH A 57 1058 154 HOH WAT . E 5 HOH A 58 1059 157 HOH WAT . E 5 HOH A 59 1060 161 HOH WAT . E 5 HOH A 60 1061 165 HOH WAT . E 5 HOH A 61 1062 166 HOH WAT . E 5 HOH A 62 1063 167 HOH WAT . E 5 HOH A 63 1064 168 HOH WAT . E 5 HOH A 64 1065 171 HOH WAT . E 5 HOH A 65 1066 174 HOH WAT . E 5 HOH A 66 1067 175 HOH WAT . E 5 HOH A 67 1068 180 HOH WAT . E 5 HOH A 68 1069 181 HOH WAT . E 5 HOH A 69 1070 184 HOH WAT . E 5 HOH A 70 1071 185 HOH WAT . E 5 HOH A 71 1072 189 HOH WAT . E 5 HOH A 72 1073 191 HOH WAT . E 5 HOH A 73 1074 192 HOH WAT . E 5 HOH A 74 1075 195 HOH WAT . E 5 HOH A 75 1076 196 HOH WAT . E 5 HOH A 76 1077 197 HOH WAT . E 5 HOH A 77 1078 198 HOH WAT . E 5 HOH A 78 1079 199 HOH WAT . E 5 HOH A 79 1080 203 HOH WAT . E 5 HOH A 80 1081 205 HOH WAT . E 5 HOH A 81 1082 206 HOH WAT . E 5 HOH A 82 1083 211 HOH WAT . E 5 HOH A 83 1084 213 HOH WAT . E 5 HOH A 84 1085 215 HOH WAT . E 5 HOH A 85 1086 217 HOH WAT . E 5 HOH A 86 1087 218 HOH WAT . E 5 HOH A 87 1088 220 HOH WAT . E 5 HOH A 88 1089 221 HOH WAT . E 5 HOH A 89 1090 223 HOH WAT . E 5 HOH A 90 1091 224 HOH WAT . E 5 HOH A 91 1092 228 HOH WAT . E 5 HOH A 92 1093 233 HOH WAT . E 5 HOH A 93 1094 235 HOH WAT . E 5 HOH A 94 1095 239 HOH WAT . E 5 HOH A 95 1096 242 HOH WAT . E 5 HOH A 96 1097 243 HOH WAT . E 5 HOH A 97 1098 244 HOH WAT . E 5 HOH A 98 1099 250 HOH WAT . E 5 HOH A 99 1100 253 HOH WAT . E 5 HOH A 100 1101 254 HOH WAT . E 5 HOH A 101 1102 255 HOH WAT . E 5 HOH A 102 1103 256 HOH WAT . E 5 HOH A 103 1104 257 HOH WAT . E 5 HOH A 104 1105 258 HOH WAT . E 5 HOH A 105 1106 261 HOH WAT . E 5 HOH A 106 1107 262 HOH WAT . E 5 HOH A 107 1108 264 HOH WAT . F 5 HOH B 1 408 2 HOH WAT . F 5 HOH B 2 409 9 HOH WAT . F 5 HOH B 3 410 76 HOH WAT . F 5 HOH B 4 411 88 HOH WAT . F 5 HOH B 5 412 31 HOH WAT . F 5 HOH B 6 413 46 HOH WAT . F 5 HOH B 7 414 47 HOH WAT . F 5 HOH B 8 415 86 HOH WAT . F 5 HOH B 9 416 35 HOH WAT . F 5 HOH B 10 417 87 HOH WAT . F 5 HOH B 11 418 36 HOH WAT . F 5 HOH B 12 419 28 HOH WAT . F 5 HOH B 13 420 41 HOH WAT . F 5 HOH B 14 421 51 HOH WAT . F 5 HOH B 15 422 85 HOH WAT . F 5 HOH B 16 423 42 HOH WAT . F 5 HOH B 17 424 15 HOH WAT . F 5 HOH B 18 425 33 HOH WAT . F 5 HOH B 19 426 40 HOH WAT . F 5 HOH B 20 427 77 HOH WAT . F 5 HOH B 21 428 55 HOH WAT . F 5 HOH B 22 429 60 HOH WAT . F 5 HOH B 23 430 59 HOH WAT . F 5 HOH B 24 431 83 HOH WAT . F 5 HOH B 25 432 73 HOH WAT . F 5 HOH B 26 433 61 HOH WAT . F 5 HOH B 27 434 99 HOH WAT . F 5 HOH B 28 435 52 HOH WAT . F 5 HOH B 29 436 71 HOH WAT . F 5 HOH B 30 437 100 HOH WAT . F 5 HOH B 31 438 102 HOH WAT . F 5 HOH B 32 439 103 HOH WAT . F 5 HOH B 33 440 107 HOH WAT . F 5 HOH B 34 441 110 HOH WAT . F 5 HOH B 35 442 112 HOH WAT . F 5 HOH B 36 443 113 HOH WAT . F 5 HOH B 37 444 115 HOH WAT . F 5 HOH B 38 445 116 HOH WAT . F 5 HOH B 39 446 118 HOH WAT . F 5 HOH B 40 447 119 HOH WAT . F 5 HOH B 41 448 123 HOH WAT . F 5 HOH B 42 449 124 HOH WAT . F 5 HOH B 43 450 126 HOH WAT . F 5 HOH B 44 451 127 HOH WAT . F 5 HOH B 45 452 128 HOH WAT . F 5 HOH B 46 453 129 HOH WAT . F 5 HOH B 47 454 130 HOH WAT . F 5 HOH B 48 455 131 HOH WAT . F 5 HOH B 49 456 132 HOH WAT . F 5 HOH B 50 457 133 HOH WAT . F 5 HOH B 51 458 135 HOH WAT . F 5 HOH B 52 459 136 HOH WAT . F 5 HOH B 53 460 137 HOH WAT . F 5 HOH B 54 461 140 HOH WAT . F 5 HOH B 55 462 143 HOH WAT . F 5 HOH B 56 463 145 HOH WAT . F 5 HOH B 57 464 146 HOH WAT . F 5 HOH B 58 465 149 HOH WAT . F 5 HOH B 59 466 152 HOH WAT . F 5 HOH B 60 467 155 HOH WAT . F 5 HOH B 61 468 159 HOH WAT . F 5 HOH B 62 469 160 HOH WAT . F 5 HOH B 63 470 162 HOH WAT . F 5 HOH B 64 471 163 HOH WAT . F 5 HOH B 65 472 164 HOH WAT . F 5 HOH B 66 473 169 HOH WAT . F 5 HOH B 67 474 170 HOH WAT . F 5 HOH B 68 475 172 HOH WAT . F 5 HOH B 69 476 173 HOH WAT . F 5 HOH B 70 477 178 HOH WAT . F 5 HOH B 71 478 179 HOH WAT . F 5 HOH B 72 479 182 HOH WAT . F 5 HOH B 73 480 183 HOH WAT . F 5 HOH B 74 481 186 HOH WAT . F 5 HOH B 75 482 187 HOH WAT . F 5 HOH B 76 483 188 HOH WAT . F 5 HOH B 77 484 190 HOH WAT . F 5 HOH B 78 485 193 HOH WAT . F 5 HOH B 79 486 194 HOH WAT . F 5 HOH B 80 487 200 HOH WAT . F 5 HOH B 81 488 201 HOH WAT . F 5 HOH B 82 489 202 HOH WAT . F 5 HOH B 83 490 204 HOH WAT . F 5 HOH B 84 491 207 HOH WAT . F 5 HOH B 85 492 208 HOH WAT . F 5 HOH B 86 493 209 HOH WAT . F 5 HOH B 87 494 210 HOH WAT . F 5 HOH B 88 495 212 HOH WAT . F 5 HOH B 89 496 214 HOH WAT . F 5 HOH B 90 497 216 HOH WAT . F 5 HOH B 91 498 219 HOH WAT . F 5 HOH B 92 499 222 HOH WAT . F 5 HOH B 93 500 225 HOH WAT . F 5 HOH B 94 501 226 HOH WAT . F 5 HOH B 95 502 227 HOH WAT . F 5 HOH B 96 503 229 HOH WAT . F 5 HOH B 97 504 230 HOH WAT . F 5 HOH B 98 505 231 HOH WAT . F 5 HOH B 99 506 232 HOH WAT . F 5 HOH B 100 507 234 HOH WAT . F 5 HOH B 101 508 236 HOH WAT . F 5 HOH B 102 509 237 HOH WAT . F 5 HOH B 103 510 238 HOH WAT . F 5 HOH B 104 511 240 HOH WAT . F 5 HOH B 105 512 241 HOH WAT . F 5 HOH B 106 513 245 HOH WAT . F 5 HOH B 107 514 246 HOH WAT . F 5 HOH B 108 515 247 HOH WAT . F 5 HOH B 109 516 248 HOH WAT . F 5 HOH B 110 517 249 HOH WAT . F 5 HOH B 111 518 251 HOH WAT . F 5 HOH B 112 519 252 HOH WAT . F 5 HOH B 113 520 259 HOH WAT . F 5 HOH B 114 521 260 HOH WAT . F 5 HOH B 115 522 263 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id D _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x -3.505 _atom_site.Cartn_y 17.516 _atom_site.Cartn_z 1.059 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 38.4 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 1001 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 17 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 5 _model_server_stats.query_time_ms 286 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #