data_1T5A # _model_server_result.job_id S6WTZk7bvPe4w0-ZvCys1w _model_server_result.datetime_utc '2024-11-15 01:57:48' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1t5a # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"MA","auth_seq_id":704}' # _entry.id 1T5A # _exptl.entry_id 1T5A _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 39.098 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'POTASSIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1T5A _cell.length_a 108.209 _cell.length_b 145.006 _cell.length_c 159.26 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1T5A _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA tetrameric 4 author_and_software_defined_assembly 1 PISA tetrameric 4 software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA 1 1 A,C,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,SA,UA 2 1 B,D,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,TA,VA 2 2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 2_554 -x+1/2,-y,z-1/2 -1 0 0 0 -1 0 0 0 1 54.1045 0 -79.63 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 I N N ? 6 S N N ? 6 BA N N ? 6 MA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASN 111 A ASN 75 1_555 I K K . A K 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.465 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 149 A ASP 113 1_555 I K K . A K 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.054 ? metalc ? metalc3 A O THR 150 A THR 114 1_555 I K K . A K 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.2 ? metalc ? metalc4 A OG SER 279 A SER 243 1_555 I K K . A K 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.626 ? metalc ? metalc5 A OE2 GLU 308 A GLU 272 1_555 H MG MG . A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.412 ? metalc ? metalc6 A OD2 ASP 332 A ASP 296 1_555 H MG MG . A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? metalc ? metalc7 F O1 OXL . A OXL 533 1_555 H MG MG . A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.591 ? metalc ? metalc8 F O4 OXL . A OXL 533 1_555 H MG MG . A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? metalc ? metalc9 H MG MG . A MG 601 1_555 SA O HOH . A HOH 729 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? metalc ? metalc10 I K K . A K 701 1_555 SA O HOH . A HOH 729 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.644 ? metalc ? metalc11 B OD1 ASN 111 B ASN 75 1_555 S K K . B K 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.041 ? metalc ? metalc12 B OG SER 113 B SER 77 1_555 S K K . B K 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.436 ? metalc ? metalc13 B OD2 ASP 149 B ASP 113 1_555 S K K . B K 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.017 ? metalc ? metalc14 B O THR 150 B THR 114 1_555 S K K . B K 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.227 ? metalc ? metalc15 B OE2 GLU 308 B GLU 272 1_555 R MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? metalc ? metalc16 B OD2 ASP 332 B ASP 296 1_555 R MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? metalc ? metalc17 P O1 OXL . B OXL 533 1_555 R MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.558 ? metalc ? metalc18 P O4 OXL . B OXL 533 1_555 R MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.461 ? metalc ? metalc19 S K K . B K 702 1_555 TA O HOH . B HOH 723 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.01 ? metalc ? metalc20 C OD1 ASN 111 C ASN 75 1_555 BA K K . C K 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.019 ? metalc ? metalc21 C OG SER 113 C SER 77 1_555 BA K K . C K 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.483 ? metalc ? metalc22 C OD2 ASP 149 C ASP 113 1_555 BA K K . C K 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.904 ? metalc ? metalc23 C O THR 150 C THR 114 1_555 BA K K . C K 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.041 ? metalc ? metalc24 C OE2 GLU 308 C GLU 272 1_555 AA MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? metalc ? metalc25 C OD2 ASP 332 C ASP 296 1_555 AA MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? metalc ? metalc26 Y O3 OXL . C OXL 533 1_555 AA MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.742 ? metalc ? metalc27 Y O2 OXL . C OXL 533 1_555 AA MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.472 ? metalc ? metalc28 BA K K . C K 703 1_555 UA O HOH . C HOH 725 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.431 ? metalc ? metalc29 D OD1 ASN 111 D ASN 75 1_555 MA K K . D K 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.385 ? metalc ? metalc30 D OG SER 113 D SER 77 1_555 MA K K . D K 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.52 ? metalc ? metalc31 D OD2 ASP 149 D ASP 113 1_555 MA K K . D K 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.175 ? metalc ? metalc32 D O THR 150 D THR 114 1_555 MA K K . D K 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.282 ? metalc ? metalc33 D OE2 GLU 308 D GLU 272 1_555 LA MG MG . D MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.873 ? metalc ? metalc34 D OD2 ASP 332 D ASP 296 1_555 LA MG MG . D MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.598 ? metalc ? metalc35 JA O4 OXL . D OXL 533 1_555 LA MG MG . D MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.644 ? metalc ? metalc36 JA O1 OXL . D OXL 533 1_555 LA MG MG . D MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.513 ? # _chem_comp.formula 'K 1' _chem_comp.formula_weight 39.098 _chem_comp.id K _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'POTASSIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1T5A _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.009241 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006896 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006279 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 2 FBP A 1 532 201 FBP FBP . F 3 OXL A 1 533 301 OXL OXL . G 4 PO4 A 1 534 401 PO4 PO4 . H 5 MG A 1 601 601 MG MG . I 6 K A 1 701 701 K K . J 7 GOL A 1 702 501 GOL GOL . K 7 GOL A 1 703 505 GOL GOL . L 7 GOL A 1 704 512 GOL GOL . M 7 GOL A 1 705 513 GOL GOL . N 7 GOL A 1 706 517 GOL GOL . O 2 FBP B 1 532 202 FBP FBP . P 3 OXL B 1 533 302 OXL OXL . Q 4 PO4 B 1 534 402 PO4 PO4 . R 5 MG B 1 602 602 MG MG . S 6 K B 1 702 702 K K . T 7 GOL B 1 703 502 GOL GOL . U 7 GOL B 1 704 506 GOL GOL . V 7 GOL B 1 705 514 GOL GOL . W 7 GOL B 1 706 518 GOL GOL . X 2 FBP C 1 532 203 FBP FBP . Y 3 OXL C 1 533 303 OXL OXL . Z 4 PO4 C 1 534 403 PO4 PO4 . AA 5 MG C 1 603 603 MG MG . BA 6 K C 1 703 703 K K . CA 7 GOL C 1 704 503 GOL GOL . DA 7 GOL C 1 705 507 GOL GOL . EA 7 GOL C 1 706 510 GOL GOL . FA 7 GOL C 1 707 511 GOL GOL . GA 7 GOL C 1 708 515 GOL GOL . HA 7 GOL C 1 709 519 GOL GOL . IA 2 FBP D 1 532 204 FBP FBP . JA 3 OXL D 1 533 304 OXL OXL . KA 4 PO4 D 1 534 404 PO4 PO4 . LA 5 MG D 1 604 604 MG MG . MA 6 K D 1 704 704 K K . NA 7 GOL D 1 705 504 GOL GOL . OA 7 GOL D 1 706 508 GOL GOL . PA 7 GOL D 1 707 509 GOL GOL . QA 7 GOL D 1 708 516 GOL GOL . RA 7 GOL D 1 709 520 GOL GOL . SA 8 HOH A 1 707 7 HOH HOH . SA 8 HOH A 2 708 10 HOH HOH . SA 8 HOH A 3 709 11 HOH HOH . SA 8 HOH A 4 710 13 HOH HOH . SA 8 HOH A 5 711 14 HOH HOH . SA 8 HOH A 6 712 19 HOH HOH . SA 8 HOH A 7 713 21 HOH HOH . SA 8 HOH A 8 714 25 HOH HOH . SA 8 HOH A 9 715 26 HOH HOH . SA 8 HOH A 10 716 27 HOH HOH . SA 8 HOH A 11 717 31 HOH HOH . SA 8 HOH A 12 718 33 HOH HOH . SA 8 HOH A 13 719 35 HOH HOH . SA 8 HOH A 14 720 38 HOH HOH . SA 8 HOH A 15 721 43 HOH HOH . SA 8 HOH A 16 722 46 HOH HOH . SA 8 HOH A 17 723 47 HOH HOH . SA 8 HOH A 18 724 48 HOH HOH . SA 8 HOH A 19 725 49 HOH HOH . SA 8 HOH A 20 726 50 HOH HOH . SA 8 HOH A 21 727 51 HOH HOH . SA 8 HOH A 22 728 55 HOH HOH . SA 8 HOH A 23 729 56 HOH HOH . SA 8 HOH A 24 730 61 HOH HOH . SA 8 HOH A 25 731 62 HOH HOH . SA 8 HOH A 26 732 67 HOH HOH . SA 8 HOH A 27 733 69 HOH HOH . SA 8 HOH A 28 734 71 HOH HOH . SA 8 HOH A 29 735 79 HOH HOH . SA 8 HOH A 30 736 81 HOH HOH . SA 8 HOH A 31 737 82 HOH HOH . SA 8 HOH A 32 738 86 HOH HOH . SA 8 HOH A 33 739 92 HOH HOH . SA 8 HOH A 34 740 97 HOH HOH . SA 8 HOH A 35 741 102 HOH HOH . SA 8 HOH A 36 742 104 HOH HOH . SA 8 HOH A 37 743 106 HOH HOH . SA 8 HOH A 38 744 107 HOH HOH . SA 8 HOH A 39 745 108 HOH HOH . SA 8 HOH A 40 746 113 HOH HOH . SA 8 HOH A 41 747 114 HOH HOH . SA 8 HOH A 42 748 119 HOH HOH . SA 8 HOH A 43 749 124 HOH HOH . SA 8 HOH A 44 750 125 HOH HOH . SA 8 HOH A 45 751 127 HOH HOH . SA 8 HOH A 46 752 132 HOH HOH . SA 8 HOH A 47 753 135 HOH HOH . TA 8 HOH B 1 707 2 HOH HOH . TA 8 HOH B 2 708 3 HOH HOH . TA 8 HOH B 3 709 6 HOH HOH . TA 8 HOH B 4 710 20 HOH HOH . TA 8 HOH B 5 711 22 HOH HOH . TA 8 HOH B 6 712 24 HOH HOH . TA 8 HOH B 7 713 30 HOH HOH . TA 8 HOH B 8 714 32 HOH HOH . TA 8 HOH B 9 715 34 HOH HOH . TA 8 HOH B 10 716 40 HOH HOH . TA 8 HOH B 11 717 42 HOH HOH . TA 8 HOH B 12 718 53 HOH HOH . TA 8 HOH B 13 719 57 HOH HOH . TA 8 HOH B 14 720 60 HOH HOH . TA 8 HOH B 15 721 63 HOH HOH . TA 8 HOH B 16 722 70 HOH HOH . TA 8 HOH B 17 723 72 HOH HOH . TA 8 HOH B 18 724 80 HOH HOH . TA 8 HOH B 19 725 88 HOH HOH . TA 8 HOH B 20 726 93 HOH HOH . TA 8 HOH B 21 727 94 HOH HOH . TA 8 HOH B 22 728 95 HOH HOH . TA 8 HOH B 23 729 111 HOH HOH . TA 8 HOH B 24 730 117 HOH HOH . TA 8 HOH B 25 731 118 HOH HOH . TA 8 HOH B 26 732 123 HOH HOH . TA 8 HOH B 27 733 128 HOH HOH . TA 8 HOH B 28 734 136 HOH HOH . UA 8 HOH C 1 710 5 HOH HOH . UA 8 HOH C 2 711 8 HOH HOH . UA 8 HOH C 3 712 9 HOH HOH . UA 8 HOH C 4 713 15 HOH HOH . UA 8 HOH C 5 714 23 HOH HOH . UA 8 HOH C 6 715 28 HOH HOH . UA 8 HOH C 7 716 29 HOH HOH . UA 8 HOH C 8 717 36 HOH HOH . UA 8 HOH C 9 718 41 HOH HOH . UA 8 HOH C 10 719 44 HOH HOH . UA 8 HOH C 11 720 45 HOH HOH . UA 8 HOH C 12 721 54 HOH HOH . UA 8 HOH C 13 722 58 HOH HOH . UA 8 HOH C 14 723 64 HOH HOH . UA 8 HOH C 15 724 68 HOH HOH . UA 8 HOH C 16 725 73 HOH HOH . UA 8 HOH C 17 726 77 HOH HOH . UA 8 HOH C 18 727 85 HOH HOH . UA 8 HOH C 19 728 89 HOH HOH . UA 8 HOH C 20 729 90 HOH HOH . UA 8 HOH C 21 730 98 HOH HOH . UA 8 HOH C 22 731 99 HOH HOH . UA 8 HOH C 23 732 103 HOH HOH . UA 8 HOH C 24 733 105 HOH HOH . UA 8 HOH C 25 734 110 HOH HOH . UA 8 HOH C 26 735 115 HOH HOH . UA 8 HOH C 27 736 116 HOH HOH . UA 8 HOH C 28 737 120 HOH HOH . UA 8 HOH C 29 738 129 HOH HOH . UA 8 HOH C 30 739 134 HOH HOH . VA 8 HOH D 1 710 1 HOH HOH . VA 8 HOH D 2 711 4 HOH HOH . VA 8 HOH D 3 712 12 HOH HOH . VA 8 HOH D 4 713 16 HOH HOH . VA 8 HOH D 5 714 17 HOH HOH . VA 8 HOH D 6 715 18 HOH HOH . VA 8 HOH D 7 716 37 HOH HOH . VA 8 HOH D 8 717 39 HOH HOH . VA 8 HOH D 9 718 52 HOH HOH . VA 8 HOH D 10 719 59 HOH HOH . VA 8 HOH D 11 720 65 HOH HOH . VA 8 HOH D 12 721 66 HOH HOH . VA 8 HOH D 13 722 74 HOH HOH . VA 8 HOH D 14 723 75 HOH HOH . VA 8 HOH D 15 724 76 HOH HOH . VA 8 HOH D 16 725 83 HOH HOH . VA 8 HOH D 17 726 84 HOH HOH . VA 8 HOH D 18 727 87 HOH HOH . VA 8 HOH D 19 728 91 HOH HOH . VA 8 HOH D 20 729 96 HOH HOH . VA 8 HOH D 21 730 100 HOH HOH . VA 8 HOH D 22 731 101 HOH HOH . VA 8 HOH D 23 732 109 HOH HOH . VA 8 HOH D 24 733 112 HOH HOH . VA 8 HOH D 25 734 121 HOH HOH . VA 8 HOH D 26 735 122 HOH HOH . VA 8 HOH D 27 736 126 HOH HOH . VA 8 HOH D 28 737 130 HOH HOH . VA 8 HOH D 29 738 131 HOH HOH . VA 8 HOH D 30 739 133 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol K _atom_site.label_atom_id K _atom_site.label_comp_id K _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id MA _atom_site.label_entity_id 6 _atom_site.Cartn_x 26.405 _atom_site.Cartn_y 27.577 _atom_site.Cartn_z 126.601 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 66.36 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id K _atom_site.auth_comp_id K _atom_site.auth_seq_id 704 _atom_site.auth_asym_id D _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 15 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 27 _model_server_stats.query_time_ms 296 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #