data_1ULT # _model_server_result.job_id RHJkOmu7fpymFnF_zRyCBg _model_server_result.datetime_utc '2025-03-06 09:40:16' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1ult # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":1001}' # _entry.id 1ULT # _exptl.entry_id 1ULT _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 192.124 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CITRIC ACID' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1ULT _cell.length_a 55.952 _cell.length_b 124.687 _cell.length_c 212.471 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1ULT _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id C _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # _chem_comp.formula 'C6 H8 O7' _chem_comp.formula_weight 192.124 _chem_comp.id CIT _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CITRIC ACID' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 O1 CIT doub 70 n n C1 O2 CIT sing 71 n n C1 C2 CIT sing 72 n n O2 HO2 CIT sing 73 n n C2 C3 CIT sing 74 n n C2 H21 CIT sing 75 n n C2 H22 CIT sing 76 n n C3 O7 CIT sing 77 n n C3 C4 CIT sing 78 n n C3 C6 CIT sing 79 n n O7 HO7 CIT sing 80 n n C4 C5 CIT sing 81 n n C4 H41 CIT sing 82 n n C4 H42 CIT sing 83 n n C5 O3 CIT doub 84 n n C5 O4 CIT sing 85 n n O4 HO4 CIT sing 86 n n C6 O5 CIT doub 87 n n C6 O6 CIT sing 88 n n O6 HO6 CIT sing 89 n n # _atom_sites.entry_id 1ULT _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.017872 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.00802 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.004707 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 CIT A 1 1001 1 CIT CIT . D 3 HOH A 1 1002 2 HOH WAT . D 3 HOH A 2 1003 5 HOH WAT . D 3 HOH A 3 1004 7 HOH WAT . D 3 HOH A 4 1005 9 HOH WAT . D 3 HOH A 5 1006 10 HOH WAT . D 3 HOH A 6 1007 14 HOH WAT . D 3 HOH A 7 1008 16 HOH WAT . D 3 HOH A 8 1009 18 HOH WAT . D 3 HOH A 9 1010 20 HOH WAT . D 3 HOH A 10 1011 21 HOH WAT . D 3 HOH A 11 1012 24 HOH WAT . D 3 HOH A 12 1013 25 HOH WAT . D 3 HOH A 13 1014 26 HOH WAT . D 3 HOH A 14 1015 29 HOH WAT . D 3 HOH A 15 1016 30 HOH WAT . D 3 HOH A 16 1017 31 HOH WAT . D 3 HOH A 17 1018 33 HOH WAT . D 3 HOH A 18 1019 37 HOH WAT . D 3 HOH A 19 1020 38 HOH WAT . D 3 HOH A 20 1021 40 HOH WAT . D 3 HOH A 21 1022 41 HOH WAT . D 3 HOH A 22 1023 42 HOH WAT . D 3 HOH A 23 1024 44 HOH WAT . D 3 HOH A 24 1025 45 HOH WAT . D 3 HOH A 25 1026 46 HOH WAT . D 3 HOH A 26 1027 47 HOH WAT . D 3 HOH A 27 1028 48 HOH WAT . D 3 HOH A 28 1029 49 HOH WAT . D 3 HOH A 29 1030 50 HOH WAT . D 3 HOH A 30 1031 52 HOH WAT . D 3 HOH A 31 1032 53 HOH WAT . D 3 HOH A 32 1033 55 HOH WAT . D 3 HOH A 33 1034 57 HOH WAT . D 3 HOH A 34 1035 61 HOH WAT . D 3 HOH A 35 1036 65 HOH WAT . D 3 HOH A 36 1037 68 HOH WAT . D 3 HOH A 37 1038 69 HOH WAT . D 3 HOH A 38 1039 70 HOH WAT . D 3 HOH A 39 1040 72 HOH WAT . D 3 HOH A 40 1041 73 HOH WAT . D 3 HOH A 41 1042 74 HOH WAT . D 3 HOH A 42 1043 76 HOH WAT . D 3 HOH A 43 1044 77 HOH WAT . D 3 HOH A 44 1045 79 HOH WAT . D 3 HOH A 45 1046 80 HOH WAT . D 3 HOH A 46 1047 83 HOH WAT . D 3 HOH A 47 1048 85 HOH WAT . D 3 HOH A 48 1049 88 HOH WAT . D 3 HOH A 49 1050 89 HOH WAT . D 3 HOH A 50 1051 90 HOH WAT . D 3 HOH A 51 1052 91 HOH WAT . D 3 HOH A 52 1053 94 HOH WAT . D 3 HOH A 53 1054 100 HOH WAT . D 3 HOH A 54 1055 103 HOH WAT . D 3 HOH A 55 1056 104 HOH WAT . D 3 HOH A 56 1057 109 HOH WAT . D 3 HOH A 57 1058 110 HOH WAT . D 3 HOH A 58 1059 114 HOH WAT . D 3 HOH A 59 1060 117 HOH WAT . D 3 HOH A 60 1061 118 HOH WAT . D 3 HOH A 61 1062 119 HOH WAT . D 3 HOH A 62 1063 123 HOH WAT . D 3 HOH A 63 1064 124 HOH WAT . D 3 HOH A 64 1065 125 HOH WAT . D 3 HOH A 65 1066 126 HOH WAT . D 3 HOH A 66 1067 132 HOH WAT . D 3 HOH A 67 1068 133 HOH WAT . D 3 HOH A 68 1069 134 HOH WAT . D 3 HOH A 69 1070 136 HOH WAT . D 3 HOH A 70 1071 137 HOH WAT . D 3 HOH A 71 1072 138 HOH WAT . D 3 HOH A 72 1073 140 HOH WAT . D 3 HOH A 73 1074 148 HOH WAT . D 3 HOH A 74 1075 150 HOH WAT . D 3 HOH A 75 1076 152 HOH WAT . D 3 HOH A 76 1077 153 HOH WAT . D 3 HOH A 77 1078 154 HOH WAT . D 3 HOH A 78 1079 155 HOH WAT . D 3 HOH A 79 1080 156 HOH WAT . D 3 HOH A 80 1081 157 HOH WAT . D 3 HOH A 81 1082 158 HOH WAT . D 3 HOH A 82 1083 159 HOH WAT . D 3 HOH A 83 1084 161 HOH WAT . D 3 HOH A 84 1085 163 HOH WAT . D 3 HOH A 85 1086 165 HOH WAT . D 3 HOH A 86 1087 169 HOH WAT . D 3 HOH A 87 1088 172 HOH WAT . D 3 HOH A 88 1089 173 HOH WAT . D 3 HOH A 89 1090 180 HOH WAT . D 3 HOH A 90 1091 183 HOH WAT . D 3 HOH A 91 1092 186 HOH WAT . D 3 HOH A 92 1093 187 HOH WAT . D 3 HOH A 93 1094 188 HOH WAT . D 3 HOH A 94 1095 189 HOH WAT . D 3 HOH A 95 1096 192 HOH WAT . D 3 HOH A 96 1097 194 HOH WAT . D 3 HOH A 97 1098 195 HOH WAT . D 3 HOH A 98 1099 196 HOH WAT . D 3 HOH A 99 1100 197 HOH WAT . D 3 HOH A 100 1101 198 HOH WAT . D 3 HOH A 101 1102 201 HOH WAT . D 3 HOH A 102 1103 202 HOH WAT . D 3 HOH A 103 1104 203 HOH WAT . D 3 HOH A 104 1105 204 HOH WAT . D 3 HOH A 105 1106 206 HOH WAT . D 3 HOH A 106 1107 207 HOH WAT . D 3 HOH A 107 1108 210 HOH WAT . D 3 HOH A 108 1109 215 HOH WAT . D 3 HOH A 109 1110 216 HOH WAT . D 3 HOH A 110 1111 217 HOH WAT . D 3 HOH A 111 1112 218 HOH WAT . D 3 HOH A 112 1113 219 HOH WAT . D 3 HOH A 113 1114 221 HOH WAT . D 3 HOH A 114 1115 223 HOH WAT . D 3 HOH A 115 1116 226 HOH WAT . D 3 HOH A 116 1117 227 HOH WAT . D 3 HOH A 117 1118 232 HOH WAT . D 3 HOH A 118 1119 233 HOH WAT . D 3 HOH A 119 1120 234 HOH WAT . D 3 HOH A 120 1121 236 HOH WAT . D 3 HOH A 121 1122 242 HOH WAT . D 3 HOH A 122 1123 243 HOH WAT . D 3 HOH A 123 1124 244 HOH WAT . D 3 HOH A 124 1125 245 HOH WAT . D 3 HOH A 125 1126 246 HOH WAT . D 3 HOH A 126 1127 249 HOH WAT . D 3 HOH A 127 1128 250 HOH WAT . D 3 HOH A 128 1129 253 HOH WAT . D 3 HOH A 129 1130 256 HOH WAT . D 3 HOH A 130 1131 257 HOH WAT . D 3 HOH A 131 1132 258 HOH WAT . D 3 HOH A 132 1133 261 HOH WAT . D 3 HOH A 133 1134 263 HOH WAT . D 3 HOH A 134 1135 264 HOH WAT . D 3 HOH A 135 1136 266 HOH WAT . D 3 HOH A 136 1137 275 HOH WAT . D 3 HOH A 137 1138 277 HOH WAT . D 3 HOH A 138 1139 278 HOH WAT . D 3 HOH A 139 1140 281 HOH WAT . D 3 HOH A 140 1141 282 HOH WAT . D 3 HOH A 141 1142 284 HOH WAT . D 3 HOH A 142 1143 286 HOH WAT . D 3 HOH A 143 1144 287 HOH WAT . D 3 HOH A 144 1145 288 HOH WAT . D 3 HOH A 145 1146 289 HOH WAT . D 3 HOH A 146 1147 290 HOH WAT . D 3 HOH A 147 1148 292 HOH WAT . D 3 HOH A 148 1149 293 HOH WAT . D 3 HOH A 149 1150 294 HOH WAT . D 3 HOH A 150 1151 295 HOH WAT . D 3 HOH A 151 1152 296 HOH WAT . D 3 HOH A 152 1153 297 HOH WAT . D 3 HOH A 153 1154 298 HOH WAT . E 3 HOH B 1 542 1 HOH WAT . E 3 HOH B 2 543 3 HOH WAT . E 3 HOH B 3 544 6 HOH WAT . E 3 HOH B 4 545 8 HOH WAT . E 3 HOH B 5 546 12 HOH WAT . E 3 HOH B 6 547 13 HOH WAT . E 3 HOH B 7 548 15 HOH WAT . E 3 HOH B 8 549 17 HOH WAT . E 3 HOH B 9 550 19 HOH WAT . E 3 HOH B 10 551 22 HOH WAT . E 3 HOH B 11 552 27 HOH WAT . E 3 HOH B 12 553 28 HOH WAT . E 3 HOH B 13 554 32 HOH WAT . E 3 HOH B 14 555 34 HOH WAT . E 3 HOH B 15 556 35 HOH WAT . E 3 HOH B 16 557 36 HOH WAT . E 3 HOH B 17 558 51 HOH WAT . E 3 HOH B 18 559 54 HOH WAT . E 3 HOH B 19 560 56 HOH WAT . E 3 HOH B 20 561 58 HOH WAT . E 3 HOH B 21 562 60 HOH WAT . E 3 HOH B 22 563 62 HOH WAT . E 3 HOH B 23 564 63 HOH WAT . E 3 HOH B 24 565 64 HOH WAT . E 3 HOH B 25 566 66 HOH WAT . E 3 HOH B 26 567 67 HOH WAT . E 3 HOH B 27 568 71 HOH WAT . E 3 HOH B 28 569 78 HOH WAT . E 3 HOH B 29 570 81 HOH WAT . E 3 HOH B 30 571 82 HOH WAT . E 3 HOH B 31 572 84 HOH WAT . E 3 HOH B 32 573 86 HOH WAT . E 3 HOH B 33 574 87 HOH WAT . E 3 HOH B 34 575 92 HOH WAT . E 3 HOH B 35 576 93 HOH WAT . E 3 HOH B 36 577 95 HOH WAT . E 3 HOH B 37 578 96 HOH WAT . E 3 HOH B 38 579 97 HOH WAT . E 3 HOH B 39 580 98 HOH WAT . E 3 HOH B 40 581 99 HOH WAT . E 3 HOH B 41 582 101 HOH WAT . E 3 HOH B 42 583 102 HOH WAT . E 3 HOH B 43 584 106 HOH WAT . E 3 HOH B 44 585 107 HOH WAT . E 3 HOH B 45 586 108 HOH WAT . E 3 HOH B 46 587 111 HOH WAT . E 3 HOH B 47 588 112 HOH WAT . E 3 HOH B 48 589 113 HOH WAT . E 3 HOH B 49 590 115 HOH WAT . E 3 HOH B 50 591 116 HOH WAT . E 3 HOH B 51 592 120 HOH WAT . E 3 HOH B 52 593 121 HOH WAT . E 3 HOH B 53 594 122 HOH WAT . E 3 HOH B 54 595 127 HOH WAT . E 3 HOH B 55 596 128 HOH WAT . E 3 HOH B 56 597 129 HOH WAT . E 3 HOH B 57 598 130 HOH WAT . E 3 HOH B 58 599 131 HOH WAT . E 3 HOH B 59 600 135 HOH WAT . E 3 HOH B 60 601 139 HOH WAT . E 3 HOH B 61 602 141 HOH WAT . E 3 HOH B 62 603 142 HOH WAT . E 3 HOH B 63 604 143 HOH WAT . E 3 HOH B 64 605 144 HOH WAT . E 3 HOH B 65 606 145 HOH WAT . E 3 HOH B 66 607 146 HOH WAT . E 3 HOH B 67 608 147 HOH WAT . E 3 HOH B 68 609 149 HOH WAT . E 3 HOH B 69 610 151 HOH WAT . E 3 HOH B 70 611 160 HOH WAT . E 3 HOH B 71 612 162 HOH WAT . E 3 HOH B 72 613 164 HOH WAT . E 3 HOH B 73 614 166 HOH WAT . E 3 HOH B 74 615 167 HOH WAT . E 3 HOH B 75 616 170 HOH WAT . E 3 HOH B 76 617 174 HOH WAT . E 3 HOH B 77 618 176 HOH WAT . E 3 HOH B 78 619 177 HOH WAT . E 3 HOH B 79 620 179 HOH WAT . E 3 HOH B 80 621 181 HOH WAT . E 3 HOH B 81 622 182 HOH WAT . E 3 HOH B 82 623 184 HOH WAT . E 3 HOH B 83 624 185 HOH WAT . E 3 HOH B 84 625 190 HOH WAT . E 3 HOH B 85 626 191 HOH WAT . E 3 HOH B 86 627 193 HOH WAT . E 3 HOH B 87 628 199 HOH WAT . E 3 HOH B 88 629 200 HOH WAT . E 3 HOH B 89 630 205 HOH WAT . E 3 HOH B 90 631 208 HOH WAT . E 3 HOH B 91 632 209 HOH WAT . E 3 HOH B 92 633 211 HOH WAT . E 3 HOH B 93 634 212 HOH WAT . E 3 HOH B 94 635 213 HOH WAT . E 3 HOH B 95 636 214 HOH WAT . E 3 HOH B 96 637 220 HOH WAT . E 3 HOH B 97 638 222 HOH WAT . E 3 HOH B 98 639 224 HOH WAT . E 3 HOH B 99 640 225 HOH WAT . E 3 HOH B 100 641 228 HOH WAT . E 3 HOH B 101 642 229 HOH WAT . E 3 HOH B 102 643 230 HOH WAT . E 3 HOH B 103 644 231 HOH WAT . E 3 HOH B 104 645 235 HOH WAT . E 3 HOH B 105 646 237 HOH WAT . E 3 HOH B 106 647 238 HOH WAT . E 3 HOH B 107 648 239 HOH WAT . E 3 HOH B 108 649 240 HOH WAT . E 3 HOH B 109 650 247 HOH WAT . E 3 HOH B 110 651 248 HOH WAT . E 3 HOH B 111 652 251 HOH WAT . E 3 HOH B 112 653 252 HOH WAT . E 3 HOH B 113 654 254 HOH WAT . E 3 HOH B 114 655 255 HOH WAT . E 3 HOH B 115 656 259 HOH WAT . E 3 HOH B 116 657 260 HOH WAT . E 3 HOH B 117 658 262 HOH WAT . E 3 HOH B 118 659 265 HOH WAT . E 3 HOH B 119 660 267 HOH WAT . E 3 HOH B 120 661 268 HOH WAT . E 3 HOH B 121 662 269 HOH WAT . E 3 HOH B 122 663 270 HOH WAT . E 3 HOH B 123 664 271 HOH WAT . E 3 HOH B 124 665 272 HOH WAT . E 3 HOH B 125 666 273 HOH WAT . E 3 HOH B 126 667 274 HOH WAT . E 3 HOH B 127 668 276 HOH WAT . E 3 HOH B 128 669 279 HOH WAT . E 3 HOH B 129 670 280 HOH WAT . E 3 HOH B 130 671 283 HOH WAT . E 3 HOH B 131 672 285 HOH WAT . E 3 HOH B 132 673 291 HOH WAT . E 3 HOH B 133 674 299 HOH WAT . E 3 HOH B 134 675 300 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 CIT . . . C 2 -5.907 30.792 99.703 1 82.53 ? C1 CIT 1001 A 1 HETATM 2 O O1 CIT . . . C 2 -6.459 29.659 99.986 1 81.86 ? O1 CIT 1001 A 1 HETATM 3 O O2 CIT . . . C 2 -4.895 31.206 100.394 1 81.12 ? O2 CIT 1001 A 1 HETATM 4 C C2 CIT . . . C 2 -6.531 31.541 98.507 1 84.23 ? C2 CIT 1001 A 1 HETATM 5 C C3 CIT . . . C 2 -6.549 33.084 98.427 1 85.41 ? C3 CIT 1001 A 1 HETATM 6 O O7 CIT . . . C 2 -7.956 33.569 98.564 1 86.15 ? O7 CIT 1001 A 1 HETATM 7 C C4 CIT . . . C 2 -5.95 33.513 97.099 1 86.41 ? C4 CIT 1001 A 1 HETATM 8 C C5 CIT . . . C 2 -5.841 34.955 96.763 1 87.19 ? C5 CIT 1001 A 1 HETATM 9 O O3 CIT . . . C 2 -6.682 35.668 96.227 1 86.82 ? O3 CIT 1001 A 1 HETATM 10 O O4 CIT . . . C 2 -4.761 35.507 97.053 1 87.99 ? O4 CIT 1001 A 1 HETATM 11 C C6 CIT . . . C 2 -5.927 33.892 99.623 1 85.22 ? C6 CIT 1001 A 1 HETATM 12 O O5 CIT . . . C 2 -4.656 34.102 99.503 1 84.64 ? O5 CIT 1001 A 1 HETATM 13 O O6 CIT . . . C 2 -6.781 34.159 100.512 1 83.94 ? O6 CIT 1001 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 10 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 8 _model_server_stats.query_time_ms 312 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 13 #