data_1VJ5
#
_model_server_result.job_id            A26pyikVRhQ8l1O2Rn1LNw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-29 12:16:30' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1vj5 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":782}' 
#
_entry.id    1VJ5 
#
_exptl.entry_id    1VJ5 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              24.305 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         120 
_cell.entry_id            1VJ5 
_cell.length_a            93.51 
_cell.length_b            93.51 
_cell.length_c            245.7 
_cell.Z_PDB               12 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1VJ5 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        179 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 65 2 2' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1,2 
#
loop_
_pdbx_struct_oper_list.id
_pdbx_struct_oper_list.type
_pdbx_struct_oper_list.name
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]
1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 
2 'crystal symmetry operation' 10_666 -y+1,-x+1,-z+7/6 0.5 -0.866025 0 -0.866025 -0.5 0 0 0 -1 46.755 80.982036 286.65 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      2 
_struct_asym.id                             B 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD2 ASP 9 A ASP 9 1_555 B MG MG . A MG 782 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? 
metalc ? metalc2 A O ASP 11 A ASP 11 1_555 B MG MG . A MG 782 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.397 ? 
metalc ? metalc3 A OD1 ASP 185 A ASP 185 1_555 B MG MG . A MG 782 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? 
metalc ? metalc4 B MG MG . A MG 782 1_555 C O1 PO4 . A PO4 783 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? 
metalc ? metalc5 B MG MG . A MG 782 1_555 F O HOH . A HOH 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? 
metalc ? metalc6 B MG MG . A MG 782 1_555 F O HOH . A HOH 1012 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.359 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     1VJ5 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.010694 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.006174 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.012348 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.00407 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 MG A 1 782 782 MG MG2 . 
C 3 PO4 A 1 783 783 PO4 PO4 . 
D 4 P6G A 1 780 780 P6G 15P . 
E 5 CIU A 1 781 781 CIU CIU . 
F 6 HOH A 1 784 551 HOH WAT . 
F 6 HOH A 2 785 552 HOH WAT . 
F 6 HOH A 3 786 553 HOH WAT . 
F 6 HOH A 4 787 554 HOH WAT . 
F 6 HOH A 5 788 555 HOH WAT . 
F 6 HOH A 6 789 556 HOH WAT . 
F 6 HOH A 7 790 557 HOH WAT . 
F 6 HOH A 8 791 558 HOH WAT . 
F 6 HOH A 9 792 559 HOH WAT . 
F 6 HOH A 10 793 560 HOH WAT . 
F 6 HOH A 11 794 561 HOH WAT . 
F 6 HOH A 12 795 562 HOH WAT . 
F 6 HOH A 13 796 563 HOH WAT . 
F 6 HOH A 14 797 564 HOH WAT . 
F 6 HOH A 15 798 565 HOH WAT . 
F 6 HOH A 16 799 566 HOH WAT . 
F 6 HOH A 17 800 567 HOH WAT . 
F 6 HOH A 18 801 568 HOH WAT . 
F 6 HOH A 19 802 569 HOH WAT . 
F 6 HOH A 20 803 570 HOH WAT . 
F 6 HOH A 21 804 571 HOH WAT . 
F 6 HOH A 22 805 572 HOH WAT . 
F 6 HOH A 23 806 573 HOH WAT . 
F 6 HOH A 24 807 574 HOH WAT . 
F 6 HOH A 25 808 575 HOH WAT . 
F 6 HOH A 26 809 576 HOH WAT . 
F 6 HOH A 27 810 577 HOH WAT . 
F 6 HOH A 28 811 578 HOH WAT . 
F 6 HOH A 29 812 579 HOH WAT . 
F 6 HOH A 30 813 580 HOH WAT . 
F 6 HOH A 31 814 581 HOH WAT . 
F 6 HOH A 32 815 582 HOH WAT . 
F 6 HOH A 33 816 583 HOH WAT . 
F 6 HOH A 34 817 584 HOH WAT . 
F 6 HOH A 35 818 585 HOH WAT . 
F 6 HOH A 36 819 586 HOH WAT . 
F 6 HOH A 37 820 587 HOH WAT . 
F 6 HOH A 38 821 588 HOH WAT . 
F 6 HOH A 39 822 589 HOH WAT . 
F 6 HOH A 40 823 590 HOH WAT . 
F 6 HOH A 41 824 591 HOH WAT . 
F 6 HOH A 42 825 592 HOH WAT . 
F 6 HOH A 43 826 593 HOH WAT . 
F 6 HOH A 44 827 594 HOH WAT . 
F 6 HOH A 45 828 595 HOH WAT . 
F 6 HOH A 46 829 596 HOH WAT . 
F 6 HOH A 47 830 597 HOH WAT . 
F 6 HOH A 48 831 598 HOH WAT . 
F 6 HOH A 49 832 599 HOH WAT . 
F 6 HOH A 50 833 600 HOH WAT . 
F 6 HOH A 51 834 601 HOH WAT . 
F 6 HOH A 52 835 602 HOH WAT . 
F 6 HOH A 53 836 603 HOH WAT . 
F 6 HOH A 54 837 604 HOH WAT . 
F 6 HOH A 55 838 605 HOH WAT . 
F 6 HOH A 56 839 606 HOH WAT . 
F 6 HOH A 57 840 607 HOH WAT . 
F 6 HOH A 58 841 608 HOH WAT . 
F 6 HOH A 59 842 609 HOH WAT . 
F 6 HOH A 60 843 610 HOH WAT . 
F 6 HOH A 61 844 611 HOH WAT . 
F 6 HOH A 62 845 612 HOH WAT . 
F 6 HOH A 63 846 613 HOH WAT . 
F 6 HOH A 64 847 614 HOH WAT . 
F 6 HOH A 65 848 615 HOH WAT . 
F 6 HOH A 66 849 616 HOH WAT . 
F 6 HOH A 67 850 617 HOH WAT . 
F 6 HOH A 68 851 618 HOH WAT . 
F 6 HOH A 69 852 619 HOH WAT . 
F 6 HOH A 70 853 620 HOH WAT . 
F 6 HOH A 71 854 621 HOH WAT . 
F 6 HOH A 72 855 622 HOH WAT . 
F 6 HOH A 73 856 623 HOH WAT . 
F 6 HOH A 74 857 624 HOH WAT . 
F 6 HOH A 75 858 625 HOH WAT . 
F 6 HOH A 76 859 626 HOH WAT . 
F 6 HOH A 77 860 627 HOH WAT . 
F 6 HOH A 78 861 628 HOH WAT . 
F 6 HOH A 79 862 629 HOH WAT . 
F 6 HOH A 80 863 630 HOH WAT . 
F 6 HOH A 81 864 631 HOH WAT . 
F 6 HOH A 82 865 632 HOH WAT . 
F 6 HOH A 83 866 633 HOH WAT . 
F 6 HOH A 84 867 634 HOH WAT . 
F 6 HOH A 85 868 635 HOH WAT . 
F 6 HOH A 86 869 636 HOH WAT . 
F 6 HOH A 87 870 637 HOH WAT . 
F 6 HOH A 88 871 638 HOH WAT . 
F 6 HOH A 89 872 639 HOH WAT . 
F 6 HOH A 90 873 640 HOH WAT . 
F 6 HOH A 91 874 641 HOH WAT . 
F 6 HOH A 92 875 642 HOH WAT . 
F 6 HOH A 93 876 643 HOH WAT . 
F 6 HOH A 94 877 644 HOH WAT . 
F 6 HOH A 95 878 645 HOH WAT . 
F 6 HOH A 96 879 646 HOH WAT . 
F 6 HOH A 97 880 647 HOH WAT . 
F 6 HOH A 98 881 648 HOH WAT . 
F 6 HOH A 99 882 649 HOH WAT . 
F 6 HOH A 100 883 650 HOH WAT . 
F 6 HOH A 101 884 651 HOH WAT . 
F 6 HOH A 102 885 652 HOH WAT . 
F 6 HOH A 103 886 653 HOH WAT . 
F 6 HOH A 104 887 654 HOH WAT . 
F 6 HOH A 105 888 655 HOH WAT . 
F 6 HOH A 106 889 656 HOH WAT . 
F 6 HOH A 107 890 657 HOH WAT . 
F 6 HOH A 108 891 658 HOH WAT . 
F 6 HOH A 109 892 659 HOH WAT . 
F 6 HOH A 110 893 660 HOH WAT . 
F 6 HOH A 111 894 661 HOH WAT . 
F 6 HOH A 112 895 662 HOH WAT . 
F 6 HOH A 113 896 663 HOH WAT . 
F 6 HOH A 114 897 664 HOH WAT . 
F 6 HOH A 115 898 665 HOH WAT . 
F 6 HOH A 116 899 666 HOH WAT . 
F 6 HOH A 117 900 667 HOH WAT . 
F 6 HOH A 118 901 668 HOH WAT . 
F 6 HOH A 119 902 669 HOH WAT . 
F 6 HOH A 120 903 670 HOH WAT . 
F 6 HOH A 121 904 671 HOH WAT . 
F 6 HOH A 122 905 672 HOH WAT . 
F 6 HOH A 123 906 673 HOH WAT . 
F 6 HOH A 124 907 674 HOH WAT . 
F 6 HOH A 125 908 675 HOH WAT . 
F 6 HOH A 126 909 676 HOH WAT . 
F 6 HOH A 127 910 677 HOH WAT . 
F 6 HOH A 128 911 678 HOH WAT . 
F 6 HOH A 129 912 679 HOH WAT . 
F 6 HOH A 130 913 680 HOH WAT . 
F 6 HOH A 131 914 681 HOH WAT . 
F 6 HOH A 132 915 682 HOH WAT . 
F 6 HOH A 133 916 683 HOH WAT . 
F 6 HOH A 134 917 684 HOH WAT . 
F 6 HOH A 135 918 685 HOH WAT . 
F 6 HOH A 136 919 686 HOH WAT . 
F 6 HOH A 137 920 687 HOH WAT . 
F 6 HOH A 138 921 688 HOH WAT . 
F 6 HOH A 139 922 689 HOH WAT . 
F 6 HOH A 140 923 690 HOH WAT . 
F 6 HOH A 141 924 691 HOH WAT . 
F 6 HOH A 142 925 692 HOH WAT . 
F 6 HOH A 143 926 693 HOH WAT . 
F 6 HOH A 144 927 694 HOH WAT . 
F 6 HOH A 145 928 695 HOH WAT . 
F 6 HOH A 146 929 696 HOH WAT . 
F 6 HOH A 147 930 697 HOH WAT . 
F 6 HOH A 148 931 698 HOH WAT . 
F 6 HOH A 149 932 699 HOH WAT . 
F 6 HOH A 150 933 700 HOH WAT . 
F 6 HOH A 151 934 701 HOH WAT . 
F 6 HOH A 152 935 702 HOH WAT . 
F 6 HOH A 153 936 703 HOH WAT . 
F 6 HOH A 154 937 704 HOH WAT . 
F 6 HOH A 155 938 705 HOH WAT . 
F 6 HOH A 156 939 706 HOH WAT . 
F 6 HOH A 157 940 707 HOH WAT . 
F 6 HOH A 158 941 708 HOH WAT . 
F 6 HOH A 159 942 709 HOH WAT . 
F 6 HOH A 160 943 710 HOH WAT . 
F 6 HOH A 161 944 711 HOH WAT . 
F 6 HOH A 162 945 712 HOH WAT . 
F 6 HOH A 163 946 713 HOH WAT . 
F 6 HOH A 164 947 714 HOH WAT . 
F 6 HOH A 165 948 715 HOH WAT . 
F 6 HOH A 166 949 716 HOH WAT . 
F 6 HOH A 167 950 717 HOH WAT . 
F 6 HOH A 168 951 718 HOH WAT . 
F 6 HOH A 169 952 719 HOH WAT . 
F 6 HOH A 170 953 720 HOH WAT . 
F 6 HOH A 171 954 721 HOH WAT . 
F 6 HOH A 172 955 722 HOH WAT . 
F 6 HOH A 173 956 723 HOH WAT . 
F 6 HOH A 174 957 724 HOH WAT . 
F 6 HOH A 175 958 725 HOH WAT . 
F 6 HOH A 176 959 726 HOH WAT . 
F 6 HOH A 177 960 727 HOH WAT . 
F 6 HOH A 178 961 728 HOH WAT . 
F 6 HOH A 179 962 729 HOH WAT . 
F 6 HOH A 180 963 730 HOH WAT . 
F 6 HOH A 181 964 731 HOH WAT . 
F 6 HOH A 182 965 732 HOH WAT . 
F 6 HOH A 183 966 733 HOH WAT . 
F 6 HOH A 184 967 734 HOH WAT . 
F 6 HOH A 185 968 735 HOH WAT . 
F 6 HOH A 186 969 736 HOH WAT . 
F 6 HOH A 187 970 737 HOH WAT . 
F 6 HOH A 188 971 738 HOH WAT . 
F 6 HOH A 189 972 739 HOH WAT . 
F 6 HOH A 190 973 740 HOH WAT . 
F 6 HOH A 191 974 741 HOH WAT . 
F 6 HOH A 192 975 742 HOH WAT . 
F 6 HOH A 193 976 743 HOH WAT . 
F 6 HOH A 194 977 744 HOH WAT . 
F 6 HOH A 195 978 745 HOH WAT . 
F 6 HOH A 196 979 746 HOH WAT . 
F 6 HOH A 197 980 747 HOH WAT . 
F 6 HOH A 198 981 748 HOH WAT . 
F 6 HOH A 199 982 749 HOH WAT . 
F 6 HOH A 200 983 750 HOH WAT . 
F 6 HOH A 201 984 751 HOH WAT . 
F 6 HOH A 202 985 752 HOH WAT . 
F 6 HOH A 203 986 753 HOH WAT . 
F 6 HOH A 204 987 754 HOH WAT . 
F 6 HOH A 205 988 755 HOH WAT . 
F 6 HOH A 206 989 756 HOH WAT . 
F 6 HOH A 207 990 757 HOH WAT . 
F 6 HOH A 208 991 758 HOH WAT . 
F 6 HOH A 209 992 759 HOH WAT . 
F 6 HOH A 210 993 760 HOH WAT . 
F 6 HOH A 211 994 761 HOH WAT . 
F 6 HOH A 212 995 762 HOH WAT . 
F 6 HOH A 213 996 763 HOH WAT . 
F 6 HOH A 214 997 764 HOH WAT . 
F 6 HOH A 215 998 765 HOH WAT . 
F 6 HOH A 216 999 766 HOH WAT . 
F 6 HOH A 217 1000 767 HOH WAT . 
F 6 HOH A 218 1001 768 HOH WAT . 
F 6 HOH A 219 1002 769 HOH WAT . 
F 6 HOH A 220 1003 770 HOH WAT . 
F 6 HOH A 221 1004 771 HOH WAT . 
F 6 HOH A 222 1005 772 HOH WAT . 
F 6 HOH A 223 1006 773 HOH WAT . 
F 6 HOH A 224 1007 774 HOH WAT . 
F 6 HOH A 225 1008 775 HOH WAT . 
F 6 HOH A 226 1009 776 HOH WAT . 
F 6 HOH A 227 1010 777 HOH WAT . 
F 6 HOH A 228 1011 778 HOH WAT . 
F 6 HOH A 229 1012 779 HOH WAT . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MG 
_atom_site.label_atom_id         MG 
_atom_site.label_comp_id         MG 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         B 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               19.521 
_atom_site.Cartn_y               55.999 
_atom_site.Cartn_z               111.729 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        25.75 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MG 
_atom_site.auth_comp_id          MG 
_atom_site.auth_seq_id           782 
_atom_site.auth_asym_id          A 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              9 
_model_server_stats.parse_time_ms           9 
_model_server_stats.create_model_time_ms    7 
_model_server_stats.query_time_ms           291 
_model_server_stats.encode_time_ms          18 
_model_server_stats.element_count           1 
#