data_1WN7 # _model_server_result.job_id ZqUDCKVkwgcLaAo6dzI_Dw _model_server_result.datetime_utc '2024-12-27 02:03:43' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1wn7 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":1001}' # _entry.id 1WN7 # _exptl.entry_id 1WN7 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 58.693 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'NICKEL (II) ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1WN7 _cell.length_a 74.344 _cell.length_b 111.131 _cell.length_c 111.559 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1WN7 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id B _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 428 A CYS 428 1_555 A SG CYS 442 A CYS 442 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 506 A CYS 506 1_555 A SG CYS 509 A CYS 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASP 141 A ASP 141 1_555 B NI NI . A NI 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.954 ? metalc ? metalc2 B NI NI . A NI 1001 1_555 D O HOH . A HOH 2013 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? # _chem_comp.formula 'Ni 2' _chem_comp.formula_weight 58.693 _chem_comp.id NI _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'NICKEL (II) ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1WN7 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.013451 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008998 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.008964 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 NI A 1 1001 1 NI NI2 . C 3 GOL A 1 2001 1 GOL GLL . D 4 HOH A 1 2002 0 HOH WAT . D 4 HOH A 2 2003 1 HOH WAT . D 4 HOH A 3 2004 2 HOH WAT . D 4 HOH A 4 2005 3 HOH WAT . D 4 HOH A 5 2006 4 HOH WAT . D 4 HOH A 6 2007 5 HOH WAT . D 4 HOH A 7 2008 6 HOH WAT . D 4 HOH A 8 2009 7 HOH WAT . D 4 HOH A 9 2010 8 HOH WAT . D 4 HOH A 10 2011 9 HOH WAT . D 4 HOH A 11 2012 10 HOH WAT . D 4 HOH A 12 2013 11 HOH WAT . D 4 HOH A 13 2014 12 HOH WAT . D 4 HOH A 14 2015 13 HOH WAT . D 4 HOH A 15 2016 14 HOH WAT . D 4 HOH A 16 2017 15 HOH WAT . D 4 HOH A 17 2018 16 HOH WAT . D 4 HOH A 18 2019 17 HOH WAT . D 4 HOH A 19 2020 18 HOH WAT . D 4 HOH A 20 2021 19 HOH WAT . D 4 HOH A 21 2022 20 HOH WAT . D 4 HOH A 22 2023 21 HOH WAT . D 4 HOH A 23 2024 22 HOH WAT . D 4 HOH A 24 2025 23 HOH WAT . D 4 HOH A 25 2026 24 HOH WAT . D 4 HOH A 26 2027 25 HOH WAT . D 4 HOH A 27 2028 26 HOH WAT . D 4 HOH A 28 2029 27 HOH WAT . D 4 HOH A 29 2030 28 HOH WAT . D 4 HOH A 30 2031 29 HOH WAT . D 4 HOH A 31 2032 30 HOH WAT . D 4 HOH A 32 2033 31 HOH WAT . D 4 HOH A 33 2034 32 HOH WAT . D 4 HOH A 34 2035 33 HOH WAT . D 4 HOH A 35 2036 34 HOH WAT . D 4 HOH A 36 2037 35 HOH WAT . D 4 HOH A 37 2038 36 HOH WAT . D 4 HOH A 38 2039 37 HOH WAT . D 4 HOH A 39 2040 38 HOH WAT . D 4 HOH A 40 2041 39 HOH WAT . D 4 HOH A 41 2042 40 HOH WAT . D 4 HOH A 42 2043 41 HOH WAT . D 4 HOH A 43 2044 42 HOH WAT . D 4 HOH A 44 2045 43 HOH WAT . D 4 HOH A 45 2046 44 HOH WAT . D 4 HOH A 46 2047 45 HOH WAT . D 4 HOH A 47 2048 46 HOH WAT . D 4 HOH A 48 2049 47 HOH WAT . D 4 HOH A 49 2050 48 HOH WAT . D 4 HOH A 50 2051 49 HOH WAT . D 4 HOH A 51 2052 50 HOH WAT . D 4 HOH A 52 2053 51 HOH WAT . D 4 HOH A 53 2054 52 HOH WAT . D 4 HOH A 54 2055 53 HOH WAT . D 4 HOH A 55 2056 54 HOH WAT . D 4 HOH A 56 2057 55 HOH WAT . D 4 HOH A 57 2058 56 HOH WAT . D 4 HOH A 58 2059 57 HOH WAT . D 4 HOH A 59 2060 58 HOH WAT . D 4 HOH A 60 2061 59 HOH WAT . D 4 HOH A 61 2062 60 HOH WAT . D 4 HOH A 62 2063 61 HOH WAT . D 4 HOH A 63 2064 62 HOH WAT . D 4 HOH A 64 2065 63 HOH WAT . D 4 HOH A 65 2066 64 HOH WAT . D 4 HOH A 66 2067 65 HOH WAT . D 4 HOH A 67 2068 66 HOH WAT . D 4 HOH A 68 2069 67 HOH WAT . D 4 HOH A 69 2070 68 HOH WAT . D 4 HOH A 70 2071 69 HOH WAT . D 4 HOH A 71 2072 70 HOH WAT . D 4 HOH A 72 2073 71 HOH WAT . D 4 HOH A 73 2074 72 HOH WAT . D 4 HOH A 74 2075 73 HOH WAT . D 4 HOH A 75 2076 74 HOH WAT . D 4 HOH A 76 2077 75 HOH WAT . D 4 HOH A 77 2078 76 HOH WAT . D 4 HOH A 78 2079 77 HOH WAT . D 4 HOH A 79 2080 78 HOH WAT . D 4 HOH A 80 2081 79 HOH WAT . D 4 HOH A 81 2082 80 HOH WAT . D 4 HOH A 82 2083 81 HOH WAT . D 4 HOH A 83 2084 82 HOH WAT . D 4 HOH A 84 2085 83 HOH WAT . D 4 HOH A 85 2086 84 HOH WAT . D 4 HOH A 86 2087 85 HOH WAT . D 4 HOH A 87 2088 86 HOH WAT . D 4 HOH A 88 2089 87 HOH WAT . D 4 HOH A 89 2090 88 HOH WAT . D 4 HOH A 90 2091 89 HOH WAT . D 4 HOH A 91 2092 90 HOH WAT . D 4 HOH A 92 2093 91 HOH WAT . D 4 HOH A 93 2094 92 HOH WAT . D 4 HOH A 94 2095 93 HOH WAT . D 4 HOH A 95 2096 94 HOH WAT . D 4 HOH A 96 2097 95 HOH WAT . D 4 HOH A 97 2098 96 HOH WAT . D 4 HOH A 98 2099 97 HOH WAT . D 4 HOH A 99 2100 98 HOH WAT . D 4 HOH A 100 2101 99 HOH WAT . D 4 HOH A 101 2102 100 HOH WAT . D 4 HOH A 102 2103 101 HOH WAT . D 4 HOH A 103 2104 102 HOH WAT . D 4 HOH A 104 2105 103 HOH WAT . D 4 HOH A 105 2106 104 HOH WAT . D 4 HOH A 106 2107 105 HOH WAT . D 4 HOH A 107 2108 106 HOH WAT . D 4 HOH A 108 2109 107 HOH WAT . D 4 HOH A 109 2110 108 HOH WAT . D 4 HOH A 110 2111 109 HOH WAT . D 4 HOH A 111 2112 110 HOH WAT . D 4 HOH A 112 2113 111 HOH WAT . D 4 HOH A 113 2114 112 HOH WAT . D 4 HOH A 114 2115 113 HOH WAT . D 4 HOH A 115 2116 114 HOH WAT . D 4 HOH A 116 2117 115 HOH WAT . D 4 HOH A 117 2118 116 HOH WAT . D 4 HOH A 118 2119 117 HOH WAT . D 4 HOH A 119 2120 118 HOH WAT . D 4 HOH A 120 2121 119 HOH WAT . D 4 HOH A 121 2122 120 HOH WAT . D 4 HOH A 122 2123 121 HOH WAT . D 4 HOH A 123 2124 122 HOH WAT . D 4 HOH A 124 2125 123 HOH WAT . D 4 HOH A 125 2126 124 HOH WAT . D 4 HOH A 126 2127 125 HOH WAT . D 4 HOH A 127 2128 126 HOH WAT . D 4 HOH A 128 2129 127 HOH WAT . D 4 HOH A 129 2130 128 HOH WAT . D 4 HOH A 130 2131 129 HOH WAT . D 4 HOH A 131 2132 130 HOH WAT . D 4 HOH A 132 2133 131 HOH WAT . D 4 HOH A 133 2134 132 HOH WAT . D 4 HOH A 134 2135 133 HOH WAT . D 4 HOH A 135 2136 134 HOH WAT . D 4 HOH A 136 2137 135 HOH WAT . D 4 HOH A 137 2138 136 HOH WAT . D 4 HOH A 138 2139 137 HOH WAT . D 4 HOH A 139 2140 138 HOH WAT . D 4 HOH A 140 2141 139 HOH WAT . D 4 HOH A 141 2142 140 HOH WAT . D 4 HOH A 142 2143 141 HOH WAT . D 4 HOH A 143 2144 142 HOH WAT . D 4 HOH A 144 2145 143 HOH WAT . D 4 HOH A 145 2146 144 HOH WAT . D 4 HOH A 146 2147 145 HOH WAT . D 4 HOH A 147 2148 146 HOH WAT . D 4 HOH A 148 2149 147 HOH WAT . D 4 HOH A 149 2150 148 HOH WAT . D 4 HOH A 150 2151 149 HOH WAT . D 4 HOH A 151 2152 150 HOH WAT . D 4 HOH A 152 2153 151 HOH WAT . D 4 HOH A 153 2154 152 HOH WAT . D 4 HOH A 154 2155 153 HOH WAT . D 4 HOH A 155 2156 154 HOH WAT . D 4 HOH A 156 2157 155 HOH WAT . D 4 HOH A 157 2158 156 HOH WAT . D 4 HOH A 158 2159 157 HOH WAT . D 4 HOH A 159 2160 158 HOH WAT . D 4 HOH A 160 2161 159 HOH WAT . D 4 HOH A 161 2162 160 HOH WAT . D 4 HOH A 162 2163 161 HOH WAT . D 4 HOH A 163 2164 162 HOH WAT . D 4 HOH A 164 2165 163 HOH WAT . D 4 HOH A 165 2166 164 HOH WAT . D 4 HOH A 166 2167 165 HOH WAT . D 4 HOH A 167 2168 166 HOH WAT . D 4 HOH A 168 2169 167 HOH WAT . D 4 HOH A 169 2170 168 HOH WAT . D 4 HOH A 170 2171 169 HOH WAT . D 4 HOH A 171 2172 170 HOH WAT . D 4 HOH A 172 2173 171 HOH WAT . D 4 HOH A 173 2174 172 HOH WAT . D 4 HOH A 174 2175 173 HOH WAT . D 4 HOH A 175 2176 174 HOH WAT . D 4 HOH A 176 2177 175 HOH WAT . D 4 HOH A 177 2178 176 HOH WAT . D 4 HOH A 178 2179 177 HOH WAT . D 4 HOH A 179 2180 178 HOH WAT . D 4 HOH A 180 2181 179 HOH WAT . D 4 HOH A 181 2182 180 HOH WAT . D 4 HOH A 182 2183 181 HOH WAT . D 4 HOH A 183 2184 182 HOH WAT . D 4 HOH A 184 2185 183 HOH WAT . D 4 HOH A 185 2186 184 HOH WAT . D 4 HOH A 186 2187 185 HOH WAT . D 4 HOH A 187 2188 186 HOH WAT . D 4 HOH A 188 2189 187 HOH WAT . D 4 HOH A 189 2190 188 HOH WAT . D 4 HOH A 190 2191 189 HOH WAT . D 4 HOH A 191 2192 190 HOH WAT . D 4 HOH A 192 2193 191 HOH WAT . D 4 HOH A 193 2194 192 HOH WAT . D 4 HOH A 194 2195 193 HOH WAT . D 4 HOH A 195 2196 194 HOH WAT . D 4 HOH A 196 2197 195 HOH WAT . D 4 HOH A 197 2198 196 HOH WAT . D 4 HOH A 198 2199 197 HOH WAT . D 4 HOH A 199 2200 198 HOH WAT . D 4 HOH A 200 2201 199 HOH WAT . D 4 HOH A 201 2202 200 HOH WAT . D 4 HOH A 202 2203 201 HOH WAT . D 4 HOH A 203 2204 202 HOH WAT . D 4 HOH A 204 2205 203 HOH WAT . D 4 HOH A 205 2206 204 HOH WAT . D 4 HOH A 206 2207 205 HOH WAT . D 4 HOH A 207 2208 206 HOH WAT . D 4 HOH A 208 2209 207 HOH WAT . D 4 HOH A 209 2210 208 HOH WAT . D 4 HOH A 210 2211 209 HOH WAT . D 4 HOH A 211 2212 210 HOH WAT . D 4 HOH A 212 2213 211 HOH WAT . D 4 HOH A 213 2214 212 HOH WAT . D 4 HOH A 214 2215 213 HOH WAT . D 4 HOH A 215 2216 214 HOH WAT . D 4 HOH A 216 2217 215 HOH WAT . D 4 HOH A 217 2218 216 HOH WAT . D 4 HOH A 218 2219 217 HOH WAT . D 4 HOH A 219 2220 218 HOH WAT . D 4 HOH A 220 2221 219 HOH WAT . D 4 HOH A 221 2222 220 HOH WAT . D 4 HOH A 222 2223 221 HOH WAT . D 4 HOH A 223 2224 222 HOH WAT . D 4 HOH A 224 2225 223 HOH WAT . D 4 HOH A 225 2226 224 HOH WAT . D 4 HOH A 226 2227 225 HOH WAT . D 4 HOH A 227 2228 226 HOH WAT . D 4 HOH A 228 2229 227 HOH WAT . D 4 HOH A 229 2230 228 HOH WAT . D 4 HOH A 230 2231 229 HOH WAT . D 4 HOH A 231 2232 230 HOH WAT . D 4 HOH A 232 2233 231 HOH WAT . D 4 HOH A 233 2234 232 HOH WAT . D 4 HOH A 234 2235 233 HOH WAT . D 4 HOH A 235 2236 234 HOH WAT . D 4 HOH A 236 2237 235 HOH WAT . D 4 HOH A 237 2238 236 HOH WAT . D 4 HOH A 238 2239 237 HOH WAT . D 4 HOH A 239 2240 238 HOH WAT . D 4 HOH A 240 2241 239 HOH WAT . D 4 HOH A 241 2242 240 HOH WAT . D 4 HOH A 242 2243 241 HOH WAT . D 4 HOH A 243 2244 242 HOH WAT . D 4 HOH A 244 2245 243 HOH WAT . D 4 HOH A 245 2246 244 HOH WAT . D 4 HOH A 246 2247 245 HOH WAT . D 4 HOH A 247 2248 246 HOH WAT . D 4 HOH A 248 2249 247 HOH WAT . D 4 HOH A 249 2250 248 HOH WAT . D 4 HOH A 250 2251 249 HOH WAT . D 4 HOH A 251 2252 250 HOH WAT . D 4 HOH A 252 2253 251 HOH WAT . D 4 HOH A 253 2254 252 HOH WAT . D 4 HOH A 254 2255 253 HOH WAT . D 4 HOH A 255 2256 254 HOH WAT . D 4 HOH A 256 2257 255 HOH WAT . D 4 HOH A 257 2258 256 HOH WAT . D 4 HOH A 258 2259 257 HOH WAT . D 4 HOH A 259 2260 258 HOH WAT . D 4 HOH A 260 2261 259 HOH WAT . D 4 HOH A 261 2262 260 HOH WAT . D 4 HOH A 262 2263 261 HOH WAT . D 4 HOH A 263 2264 262 HOH WAT . D 4 HOH A 264 2265 263 HOH WAT . D 4 HOH A 265 2266 264 HOH WAT . D 4 HOH A 266 2267 265 HOH WAT . D 4 HOH A 267 2268 266 HOH WAT . D 4 HOH A 268 2269 267 HOH WAT . D 4 HOH A 269 2270 268 HOH WAT . D 4 HOH A 270 2271 269 HOH WAT . D 4 HOH A 271 2272 270 HOH WAT . D 4 HOH A 272 2273 271 HOH WAT . D 4 HOH A 273 2274 272 HOH WAT . D 4 HOH A 274 2275 273 HOH WAT . D 4 HOH A 275 2276 274 HOH WAT . D 4 HOH A 276 2277 275 HOH WAT . D 4 HOH A 277 2278 276 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol NI _atom_site.label_atom_id NI _atom_site.label_comp_id NI _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id B _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 25.454 _atom_site.Cartn_y 28.321 _atom_site.Cartn_z 32.842 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 41.61 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id NI _atom_site.auth_comp_id NI _atom_site.auth_seq_id 1001 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 8 _model_server_stats.parse_time_ms 6 _model_server_stats.create_model_time_ms 6 _model_server_stats.query_time_ms 214 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #