data_1WPL
#
_model_server_result.job_id            9b9jLVsquxnm93tV4PE0lw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-05 21:03:55' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1wpl 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"OA","auth_seq_id":1006}' 
#
_entry.id    1WPL 
#
_exptl.entry_id    1WPL 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              239.231 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            7,8-DIHYDROBIOPTERIN 
_entity.pdbx_number_of_molecules    10 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          97.85 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            1WPL 
_cell.length_a            121.72 
_cell.length_b            109.67 
_cell.length_c            130.27 
_cell.Z_PDB               20 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1WPL 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    eicosameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      20 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 V N N 
? 4 W N N 
? 4 Z N N 
? 4 CA N N 
? 4 FA N N 
? 4 KA N N 
? 4 LA N N 
? 4 OA N N 
? 4 RA N N 
? 4 UA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A SG CYS 121 A CYS 132 1_555 U ZN ZN . A ZN 1110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? 
metalc ? metalc2 A ND1 HIS 124 A HIS 135 1_555 U ZN ZN . A ZN 1110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 192 A CYS 203 1_555 U ZN ZN . A ZN 1110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? 
metalc ? metalc4 B SG CYS 121 B CYS 132 1_555 Y ZN ZN . B ZN 1108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? 
metalc ? metalc5 B ND1 HIS 124 B HIS 135 1_555 Y ZN ZN . B ZN 1108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.25 ? 
metalc ? metalc6 B SG CYS 192 B CYS 203 1_555 Y ZN ZN . B ZN 1108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? 
metalc ? metalc7 C SG CYS 121 C CYS 132 1_555 BA ZN ZN . C ZN 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? 
metalc ? metalc8 C ND1 HIS 124 C HIS 135 1_555 BA ZN ZN . C ZN 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? 
metalc ? metalc9 C SG CYS 192 C CYS 203 1_555 BA ZN ZN . C ZN 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.599 ? 
metalc ? metalc10 D SG CYS 121 D CYS 132 1_555 EA ZN ZN . D ZN 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? 
metalc ? metalc11 D ND1 HIS 124 D HIS 135 1_555 EA ZN ZN . D ZN 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? 
metalc ? metalc12 D SG CYS 192 D CYS 203 1_555 EA ZN ZN . D ZN 1104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.444 ? 
metalc ? metalc13 E SG CYS 121 E CYS 132 1_555 HA ZN ZN . E ZN 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? 
metalc ? metalc14 E ND1 HIS 124 E HIS 135 1_555 HA ZN ZN . E ZN 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? 
metalc ? metalc15 E SG CYS 192 E CYS 203 1_555 HA ZN ZN . E ZN 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.341 ? 
metalc ? metalc16 F SG CYS 121 F CYS 132 1_555 JA ZN ZN . F ZN 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? 
metalc ? metalc17 F ND1 HIS 124 F HIS 135 1_555 JA ZN ZN . F ZN 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.204 ? 
metalc ? metalc18 F SG CYS 192 F CYS 203 1_555 JA ZN ZN . F ZN 1105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? 
metalc ? metalc19 G SG CYS 121 G CYS 132 1_555 NA ZN ZN . G ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? 
metalc ? metalc20 G ND1 HIS 124 G HIS 135 1_555 NA ZN ZN . G ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? 
metalc ? metalc21 G SG CYS 192 G CYS 203 1_555 NA ZN ZN . G ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.645 ? 
metalc ? metalc22 H SG CYS 121 H CYS 132 1_555 QA ZN ZN . H ZN 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? 
metalc ? metalc23 H ND1 HIS 124 H HIS 135 1_555 QA ZN ZN . H ZN 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? 
metalc ? metalc24 H SG CYS 192 H CYS 203 1_555 QA ZN ZN . H ZN 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? 
metalc ? metalc25 I SG CYS 121 I CYS 132 1_555 TA ZN ZN . I ZN 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? 
metalc ? metalc26 I ND1 HIS 124 I HIS 135 1_555 TA ZN ZN . I ZN 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? 
metalc ? metalc27 I SG CYS 192 I CYS 203 1_555 TA ZN ZN . I ZN 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.411 ? 
metalc ? metalc28 J SG CYS 121 J CYS 132 1_555 WA ZN ZN . J ZN 1106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? 
metalc ? metalc29 J ND1 HIS 124 J HIS 135 1_555 WA ZN ZN . J ZN 1106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? 
metalc ? metalc30 J SG CYS 192 J CYS 203 1_555 WA ZN ZN . J ZN 1106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? 
metalc ? metalc31 K OG1 THR 8 K THR 8 1_555 YA NA NA . K NA 1015 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.917 ? 
metalc ? metalc32 K O GLN 9 K GLN 9 1_555 YA NA NA . K NA 1015 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.74 ? 
metalc ? metalc33 K O ARG 11 K ARG 11 1_555 YA NA NA . K NA 1015 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.446 ? 
metalc ? metalc34 K O VAL 14 K VAL 14 1_555 YA NA NA . K NA 1015 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.843 ? 
metalc ? metalc35 L OG1 THR 8 L THR 8 1_555 ZA NA NA . L NA 1011 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.852 ? 
metalc ? metalc36 L O ARG 11 L ARG 11 1_555 ZA NA NA . L NA 1011 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.806 ? 
metalc ? metalc37 L O VAL 14 L VAL 14 1_555 ZA NA NA . L NA 1011 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? 
metalc ? metalc38 M OG1 THR 8 M THR 8 1_555 AB NA NA . M NA 1012 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.993 ? 
metalc ? metalc39 M O GLN 9 M GLN 9 1_555 AB NA NA . M NA 1012 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.873 ? 
metalc ? metalc40 M O VAL 14 M VAL 14 1_555 AB NA NA . M NA 1012 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.984 ? 
metalc ? metalc41 N OG1 THR 8 N THR 8 1_555 BB NA NA . N NA 1013 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.474 ? 
metalc ? metalc42 N O ARG 11 N ARG 11 1_555 BB NA NA . N NA 1013 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.875 ? 
metalc ? metalc43 N O VAL 14 N VAL 14 1_555 BB NA NA . N NA 1013 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.624 ? 
metalc ? metalc44 O OG1 THR 8 O THR 8 1_555 CB NA NA . O NA 1014 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.801 ? 
metalc ? metalc45 O O ARG 11 O ARG 11 1_555 CB NA NA . O NA 1014 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? 
metalc ? metalc46 O O VAL 14 O VAL 14 1_555 CB NA NA . O NA 1014 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.529 ? 
metalc ? metalc47 P OG1 THR 8 P THR 8 1_555 DB NA NA . P NA 1017 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.731 ? 
metalc ? metalc48 P O GLN 9 P GLN 9 1_555 DB NA NA . P NA 1017 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.799 ? 
metalc ? metalc49 Q OG1 THR 8 Q THR 8 1_555 EB NA NA . Q NA 1018 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.863 ? 
metalc ? metalc50 Q O GLN 9 Q GLN 9 1_555 EB NA NA . Q NA 1018 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? 
metalc ? metalc51 Q O ARG 11 Q ARG 11 1_555 EB NA NA . Q NA 1018 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? 
metalc ? metalc52 Q O VAL 14 Q VAL 14 1_555 EB NA NA . Q NA 1018 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.916 ? 
metalc ? metalc53 R O GLN 9 R GLN 9 1_555 FB NA NA . R NA 1019 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.977 ? 
metalc ? metalc54 R O VAL 14 R VAL 14 1_555 FB NA NA . R NA 1019 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.871 ? 
metalc ? metalc55 S O VAL 14 S VAL 14 1_555 GB NA NA . S NA 1020 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.666 ? 
metalc ? metalc56 S O GLY 15 S GLY 15 1_555 GB NA NA . S NA 1020 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.894 ? 
metalc ? metalc57 T O ARG 11 T ARG 11 1_555 HB NA NA . T NA 1016 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.468 ? 
metalc ? metalc58 T O VAL 14 T VAL 14 1_555 HB NA NA . T NA 1016 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? 
#
_chem_comp.formula           'C9 H13 N5 O3' 
_chem_comp.formula_weight    239.231 
_chem_comp.id                HBI 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              7,8-DIHYDROBIOPTERIN 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
N1 C2 HBI doub 146 n y 
N1 C8A HBI sing 147 n y 
N2 C2 HBI sing 148 n n 
N2 HN21 HBI sing 149 n n 
N2 HN22 HBI sing 150 n n 
C2 N3 HBI sing 151 n y 
N3 C4 HBI sing 152 n y 
N3 H3 HBI sing 153 n n 
C4 O4 HBI doub 154 n n 
C4 C4A HBI sing 155 n y 
C4A C8A HBI doub 156 n y 
C4A N5 HBI sing 157 n n 
C8A N8 HBI sing 158 n n 
N8 C7 HBI sing 159 n n 
N8 H8 HBI sing 160 n n 
C7 C6 HBI sing 161 n n 
C7 H71 HBI sing 162 n n 
C7 H72 HBI sing 163 n n 
C6 N5 HBI doub 164 n n 
C6 C9 HBI sing 165 n n 
C9 O9 HBI sing 166 n n 
C9 C10 HBI sing 167 n n 
C9 H9 HBI sing 168 n n 
O9 HO9 HBI sing 169 n n 
C10 O10 HBI sing 170 n n 
C10 C11 HBI sing 171 n n 
C10 H10 HBI sing 172 n n 
O10 HO1 HBI sing 173 n n 
C11 H111 HBI sing 174 n n 
C11 H112 HBI sing 175 n n 
C11 H113 HBI sing 176 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     1WPL 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.008216 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.001133 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.009118 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.007749 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
U 3 ZN A 1 1110 110 ZN ZN2 . 
V 4 HBI A 1 1003 3 HBI HBI . 
W 4 HBI A 1 1004 4 HBI HBI . 
X 5 3PO A 1 2005 5 3PO 3PO . 
Y 3 ZN B 1 1108 108 ZN ZN2 . 
Z 4 HBI B 1 1005 5 HBI HBI . 
AA 5 3PO B 1 2001 1 3PO 3PO . 
BA 3 ZN C 1 1103 103 ZN ZN2 . 
CA 4 HBI C 1 1001 1 HBI HBI . 
DA 5 3PO C 1 2002 2 3PO 3PO . 
EA 3 ZN D 1 1104 104 ZN ZN2 . 
FA 4 HBI D 1 1002 2 HBI HBI . 
GA 5 3PO D 1 2003 3 3PO 3PO . 
HA 3 ZN E 1 1102 102 ZN ZN2 . 
IA 5 3PO E 1 2004 4 3PO 3PO . 
JA 3 ZN F 1 1105 105 ZN ZN2 . 
KA 4 HBI F 1 1009 9 HBI HBI . 
LA 4 HBI F 1 1010 10 HBI HBI . 
MA 5 3PO F 1 2010 10 3PO 3PO . 
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