data_1WXI # _model_server_result.job_id swSWTxWjU7BSe-2jmFUBUQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-05 00:40:38' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1wxi # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":700}' # _entry.id 1WXI # _exptl.entry_id 1WXI _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 104.24 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1WXI _cell.length_a 92.444 _cell.length_b 67.922 _cell.length_c 48.394 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1WXI _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 2_656 -x+1,y,-z+1 -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 80.539844 0 46.907039 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD2 ASP 52 A ASP 52 1_555 B MG MG . A MG 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.419 ? metalc ? metalc2 A OE1 GLU 165 A GLU 165 1_555 B MG MG . A MG 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.491 ? metalc ? metalc3 E O2P AMP . A AMP 400 1_555 B MG MG . A MG 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.612 ? metalc ? metalc4 E O1P AMP . A AMP 400 1_555 C MG MG . A MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.6 ? metalc ? metalc5 F O7 DPO . A DPO 500 1_555 B MG MG . A MG 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.672 ? metalc ? metalc6 F O1 DPO . A DPO 500 1_555 B MG MG . A MG 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.599 ? metalc ? metalc7 F O3 DPO . A DPO 500 1_555 C MG MG . A MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.806 ? metalc ? metalc8 F O5 DPO . A DPO 500 1_555 C MG MG . A MG 700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.858 ? metalc ? metalc9 B MG MG . A MG 600 1_555 G O HOH . A HOH 880 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.444 ? metalc ? metalc10 C MG MG . A MG 700 1_555 G O HOH . A HOH 729 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.669 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1WXI _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.010817 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.002745 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.014723 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.021319 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 MG A 1 600 600 MG MG . C 2 MG A 1 700 700 MG MG . D 3 AMP A 1 300 300 AMP AMP . E 3 AMP A 1 400 400 AMP ATS . F 4 DPO A 1 500 500 DPO PO2 . G 5 HOH A 1 701 1 HOH WAT . G 5 HOH A 2 702 2 HOH WAT . G 5 HOH A 3 703 3 HOH WAT . G 5 HOH A 4 704 4 HOH WAT . G 5 HOH A 5 705 5 HOH WAT . G 5 HOH A 6 706 6 HOH WAT . G 5 HOH A 7 707 7 HOH WAT . G 5 HOH A 8 708 8 HOH WAT . G 5 HOH A 9 709 9 HOH WAT . G 5 HOH A 10 710 10 HOH WAT . G 5 HOH A 11 711 11 HOH WAT . G 5 HOH A 12 712 12 HOH WAT . G 5 HOH A 13 713 13 HOH WAT . G 5 HOH A 14 714 14 HOH WAT . G 5 HOH A 15 715 15 HOH WAT . G 5 HOH A 16 716 16 HOH WAT . G 5 HOH A 17 717 17 HOH WAT . G 5 HOH A 18 718 18 HOH WAT . G 5 HOH A 19 719 19 HOH WAT . G 5 HOH A 20 720 20 HOH WAT . G 5 HOH A 21 721 21 HOH WAT . G 5 HOH A 22 722 22 HOH WAT . G 5 HOH A 23 723 23 HOH WAT . G 5 HOH A 24 724 24 HOH WAT . G 5 HOH A 25 725 25 HOH WAT . G 5 HOH A 26 726 26 HOH WAT . G 5 HOH A 27 727 27 HOH WAT . G 5 HOH A 28 728 28 HOH WAT . G 5 HOH A 29 729 29 HOH WAT . G 5 HOH A 30 730 30 HOH WAT . G 5 HOH A 31 731 31 HOH WAT . G 5 HOH A 32 732 32 HOH WAT . G 5 HOH A 33 733 33 HOH WAT . G 5 HOH A 34 734 34 HOH WAT . G 5 HOH A 35 735 35 HOH WAT . G 5 HOH A 36 736 36 HOH WAT . G 5 HOH A 37 737 37 HOH WAT . G 5 HOH A 38 738 38 HOH WAT . G 5 HOH A 39 739 39 HOH WAT . G 5 HOH A 40 740 40 HOH WAT . G 5 HOH A 41 741 41 HOH WAT . G 5 HOH A 42 742 42 HOH WAT . G 5 HOH A 43 743 43 HOH WAT . G 5 HOH A 44 744 44 HOH WAT . G 5 HOH A 45 745 45 HOH WAT . G 5 HOH A 46 746 46 HOH WAT . G 5 HOH A 47 747 47 HOH WAT . G 5 HOH A 48 748 48 HOH WAT . G 5 HOH A 49 749 49 HOH WAT . G 5 HOH A 50 750 50 HOH WAT . G 5 HOH A 51 751 51 HOH WAT . G 5 HOH A 52 752 52 HOH WAT . G 5 HOH A 53 753 53 HOH WAT . G 5 HOH A 54 754 54 HOH WAT . G 5 HOH A 55 755 55 HOH WAT . G 5 HOH A 56 756 56 HOH WAT . G 5 HOH A 57 757 57 HOH WAT . G 5 HOH A 58 758 58 HOH WAT . G 5 HOH A 59 759 59 HOH WAT . G 5 HOH A 60 760 60 HOH WAT . G 5 HOH A 61 761 61 HOH WAT . G 5 HOH A 62 762 62 HOH WAT . G 5 HOH A 63 763 63 HOH WAT . G 5 HOH A 64 764 64 HOH WAT . G 5 HOH A 65 765 65 HOH WAT . G 5 HOH A 66 766 66 HOH WAT . G 5 HOH A 67 767 67 HOH WAT . G 5 HOH A 68 768 68 HOH WAT . G 5 HOH A 69 769 69 HOH WAT . G 5 HOH A 70 770 70 HOH WAT . G 5 HOH A 71 771 71 HOH WAT . G 5 HOH A 72 772 72 HOH WAT . G 5 HOH A 73 773 73 HOH WAT . G 5 HOH A 74 774 74 HOH WAT . G 5 HOH A 75 775 75 HOH WAT . G 5 HOH A 76 776 76 HOH WAT . G 5 HOH A 77 777 77 HOH WAT . G 5 HOH A 78 778 78 HOH WAT . G 5 HOH A 79 779 79 HOH WAT . G 5 HOH A 80 780 80 HOH WAT . G 5 HOH A 81 781 81 HOH WAT . G 5 HOH A 82 782 82 HOH WAT . G 5 HOH A 83 783 83 HOH WAT . G 5 HOH A 84 784 84 HOH WAT . G 5 HOH A 85 785 85 HOH WAT . G 5 HOH A 86 786 86 HOH WAT . G 5 HOH A 87 787 87 HOH WAT . G 5 HOH A 88 788 88 HOH WAT . G 5 HOH A 89 789 89 HOH WAT . G 5 HOH A 90 790 90 HOH WAT . G 5 HOH A 91 791 91 HOH WAT . G 5 HOH A 92 792 92 HOH WAT . G 5 HOH A 93 793 93 HOH WAT . G 5 HOH A 94 794 94 HOH WAT . G 5 HOH A 95 795 95 HOH WAT . G 5 HOH A 96 796 96 HOH WAT . G 5 HOH A 97 797 97 HOH WAT . G 5 HOH A 98 798 98 HOH WAT . G 5 HOH A 99 799 99 HOH WAT . G 5 HOH A 100 800 100 HOH WAT . G 5 HOH A 101 801 101 HOH WAT . G 5 HOH A 102 802 102 HOH WAT . G 5 HOH A 103 803 103 HOH WAT . G 5 HOH A 104 804 104 HOH WAT . G 5 HOH A 105 805 105 HOH WAT . G 5 HOH A 106 806 106 HOH WAT . G 5 HOH A 107 807 107 HOH WAT . G 5 HOH A 108 808 108 HOH WAT . G 5 HOH A 109 809 109 HOH WAT . G 5 HOH A 110 810 110 HOH WAT . G 5 HOH A 111 811 111 HOH WAT . G 5 HOH A 112 812 112 HOH WAT . G 5 HOH A 113 813 113 HOH WAT . G 5 HOH A 114 814 114 HOH WAT . G 5 HOH A 115 815 115 HOH WAT . G 5 HOH A 116 816 116 HOH WAT . G 5 HOH A 117 817 117 HOH WAT . G 5 HOH A 118 818 118 HOH WAT . G 5 HOH A 119 819 119 HOH WAT . G 5 HOH A 120 820 120 HOH WAT . G 5 HOH A 121 821 121 HOH WAT . G 5 HOH A 122 822 122 HOH WAT . G 5 HOH A 123 823 123 HOH WAT . G 5 HOH A 124 824 124 HOH WAT . G 5 HOH A 125 825 125 HOH WAT . G 5 HOH A 126 826 126 HOH WAT . G 5 HOH A 127 827 127 HOH WAT . G 5 HOH A 128 828 128 HOH WAT . G 5 HOH A 129 829 129 HOH WAT . G 5 HOH A 130 830 130 HOH WAT . G 5 HOH A 131 831 131 HOH WAT . G 5 HOH A 132 832 132 HOH WAT . G 5 HOH A 133 833 133 HOH WAT . G 5 HOH A 134 834 134 HOH WAT . G 5 HOH A 135 835 135 HOH WAT . G 5 HOH A 136 836 136 HOH WAT . G 5 HOH A 137 837 137 HOH WAT . G 5 HOH A 138 838 138 HOH WAT . G 5 HOH A 139 839 139 HOH WAT . G 5 HOH A 140 840 140 HOH WAT . G 5 HOH A 141 841 141 HOH WAT . G 5 HOH A 142 842 142 HOH WAT . G 5 HOH A 143 843 143 HOH WAT . G 5 HOH A 144 844 144 HOH WAT . G 5 HOH A 145 845 145 HOH WAT . G 5 HOH A 146 846 146 HOH WAT . G 5 HOH A 147 847 147 HOH WAT . G 5 HOH A 148 848 148 HOH WAT . G 5 HOH A 149 849 149 HOH WAT . G 5 HOH A 150 850 150 HOH WAT . G 5 HOH A 151 851 151 HOH WAT . G 5 HOH A 152 852 152 HOH WAT . G 5 HOH A 153 853 153 HOH WAT . G 5 HOH A 154 854 154 HOH WAT . G 5 HOH A 155 855 155 HOH WAT . G 5 HOH A 156 856 156 HOH WAT . G 5 HOH A 157 857 157 HOH WAT . G 5 HOH A 158 858 158 HOH WAT . G 5 HOH A 159 859 159 HOH WAT . G 5 HOH A 160 860 160 HOH WAT . G 5 HOH A 161 861 161 HOH WAT . G 5 HOH A 162 862 162 HOH WAT . G 5 HOH A 163 863 163 HOH WAT . G 5 HOH A 164 864 164 HOH WAT . G 5 HOH A 165 865 165 HOH WAT . G 5 HOH A 166 866 166 HOH WAT . G 5 HOH A 167 867 167 HOH WAT . G 5 HOH A 168 868 168 HOH WAT . G 5 HOH A 169 869 169 HOH WAT . G 5 HOH A 170 870 170 HOH WAT . G 5 HOH A 171 871 171 HOH WAT . G 5 HOH A 172 872 172 HOH WAT . G 5 HOH A 173 873 173 HOH WAT . G 5 HOH A 174 874 174 HOH WAT . G 5 HOH A 175 875 175 HOH WAT . G 5 HOH A 176 876 176 HOH WAT . G 5 HOH A 177 877 177 HOH WAT . G 5 HOH A 178 878 178 HOH WAT . G 5 HOH A 179 879 179 HOH WAT . G 5 HOH A 180 880 180 HOH WAT . G 5 HOH A 181 881 181 HOH WAT . G 5 HOH A 182 882 182 HOH WAT . G 5 HOH A 183 883 183 HOH WAT . G 5 HOH A 184 884 184 HOH WAT . G 5 HOH A 185 885 185 HOH WAT . G 5 HOH A 186 886 186 HOH WAT . G 5 HOH A 187 887 187 HOH WAT . G 5 HOH A 188 888 188 HOH WAT . G 5 HOH A 189 889 189 HOH WAT . G 5 HOH A 190 890 190 HOH WAT . G 5 HOH A 191 891 191 HOH WAT . G 5 HOH A 192 892 192 HOH WAT . G 5 HOH A 193 893 193 HOH WAT . G 5 HOH A 194 894 194 HOH WAT . G 5 HOH A 195 895 195 HOH WAT . G 5 HOH A 196 896 196 HOH WAT . G 5 HOH A 197 897 197 HOH WAT . G 5 HOH A 198 898 198 HOH WAT . G 5 HOH A 199 899 199 HOH WAT . G 5 HOH A 200 900 200 HOH WAT . G 5 HOH A 201 901 201 HOH WAT . G 5 HOH A 202 902 202 HOH WAT . G 5 HOH A 203 903 203 HOH WAT . G 5 HOH A 204 904 204 HOH WAT . G 5 HOH A 205 905 205 HOH WAT . G 5 HOH A 206 906 206 HOH WAT . G 5 HOH A 207 907 207 HOH WAT . G 5 HOH A 208 908 208 HOH WAT . G 5 HOH A 209 909 209 HOH WAT . G 5 HOH A 210 910 210 HOH WAT . G 5 HOH A 211 911 211 HOH WAT . G 5 HOH A 212 912 212 HOH WAT . G 5 HOH A 213 913 213 HOH WAT . G 5 HOH A 214 914 214 HOH WAT . G 5 HOH A 215 915 215 HOH WAT . G 5 HOH A 216 916 216 HOH WAT . G 5 HOH A 217 917 217 HOH WAT . G 5 HOH A 218 918 218 HOH WAT . G 5 HOH A 219 919 219 HOH WAT . G 5 HOH A 220 920 220 HOH WAT . G 5 HOH A 221 921 221 HOH WAT . G 5 HOH A 222 922 222 HOH WAT . G 5 HOH A 223 923 223 HOH WAT . G 5 HOH A 224 924 224 HOH WAT . G 5 HOH A 225 925 225 HOH WAT . G 5 HOH A 226 926 226 HOH WAT . G 5 HOH A 227 927 227 HOH WAT . G 5 HOH A 228 928 228 HOH WAT . G 5 HOH A 229 929 229 HOH WAT . G 5 HOH A 230 930 230 HOH WAT . G 5 HOH A 231 931 231 HOH WAT . G 5 HOH A 232 932 232 HOH WAT . G 5 HOH A 233 933 233 HOH WAT . G 5 HOH A 234 934 234 HOH WAT . G 5 HOH A 235 935 235 HOH WAT . G 5 HOH A 236 936 236 HOH WAT . G 5 HOH A 237 937 237 HOH WAT . G 5 HOH A 238 938 238 HOH WAT . G 5 HOH A 239 939 239 HOH WAT . G 5 HOH A 240 940 240 HOH WAT . G 5 HOH A 241 941 241 HOH WAT . G 5 HOH A 242 942 242 HOH WAT . G 5 HOH A 243 943 243 HOH WAT . G 5 HOH A 244 944 244 HOH WAT . G 5 HOH A 245 945 245 HOH WAT . G 5 HOH A 246 946 246 HOH WAT . G 5 HOH A 247 947 247 HOH WAT . G 5 HOH A 248 948 248 HOH WAT . G 5 HOH A 249 949 249 HOH WAT . G 5 HOH A 250 950 250 HOH WAT . G 5 HOH A 251 951 251 HOH WAT . G 5 HOH A 252 952 252 HOH WAT . G 5 HOH A 253 953 253 HOH WAT . G 5 HOH A 254 954 254 HOH WAT . G 5 HOH A 255 955 255 HOH WAT . G 5 HOH A 256 956 256 HOH WAT . G 5 HOH A 257 957 257 HOH WAT . G 5 HOH A 258 958 258 HOH WAT . G 5 HOH A 259 959 259 HOH WAT . G 5 HOH A 260 960 260 HOH WAT . G 5 HOH A 261 961 261 HOH WAT . G 5 HOH A 262 962 262 HOH WAT . G 5 HOH A 263 963 263 HOH WAT . G 5 HOH A 264 964 264 HOH WAT . G 5 HOH A 265 965 265 HOH WAT . G 5 HOH A 266 966 266 HOH WAT . G 5 HOH A 267 967 267 HOH WAT . G 5 HOH A 268 968 268 HOH WAT . G 5 HOH A 269 969 269 HOH WAT . G 5 HOH A 270 970 270 HOH WAT . G 5 HOH A 271 971 271 HOH WAT . G 5 HOH A 272 972 272 HOH WAT . G 5 HOH A 273 973 273 HOH WAT . G 5 HOH A 274 974 274 HOH WAT . G 5 HOH A 275 975 275 HOH WAT . G 5 HOH A 276 976 276 HOH WAT . G 5 HOH A 277 977 277 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id C _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 52.298 _atom_site.Cartn_y 50.244 _atom_site.Cartn_z 37.316 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 69.56 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 700 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 7 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 272 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #