data_1WYG # _model_server_result.job_id gx1GR7Vr2V-gAPMdiwVeXg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-07 19:15:10' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1wyg # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":3001}' # _entry.id 1WYG # _exptl.entry_id 1WYG _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 60.052 _entity.id 7 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ACETIC ACID' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1WYG _cell.length_a 134.253 _cell.length_b 134.253 _cell.length_c 523.315 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1WYG _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 98 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'I 41 2 2' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PQS monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 PISA dimeric 2 software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K 1 1 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K 2 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 6_565 x,-y+3/2,-z+1/4 1 0 0 0 -1 0 0 0 -1 0 201.3795 130.82875 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 7 _struct_asym.id J _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A SG CYS 43 A CYS 43 1_555 G FE2 FES . A FES 4003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 48 A CYS 48 1_555 G FE2 FES . A FES 4003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 51 A CYS 51 1_555 G FE1 FES . A FES 4003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.411 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 73 A CYS 73 1_555 G FE1 FES . A FES 4003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? metalc ? metalc5 A SG CYS 112 A CYS 112 1_555 F FE2 FES . A FES 4002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? metalc ? metalc6 A SG CYS 115 A CYS 115 1_555 F FE1 FES . A FES 4002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? metalc ? metalc7 A SG CYS 147 A CYS 147 1_555 F FE1 FES . A FES 4002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.473 ? metalc ? metalc8 A SG CYS 149 A CYS 149 1_555 F FE2 FES . A FES 4002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.423 ? metalc ? metalc9 A O GLY 867 A GLY 867 1_555 E CA CA . A CA 4001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.987 ? metalc ? metalc10 A O THR 870 A THR 870 1_555 E CA CA . A CA 4001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.554 ? metalc ? metalc11 A O GLU 871 A GLU 871 1_555 E CA CA . A CA 4001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.854 ? metalc ? metalc12 A OG SER 874 A SER 874 1_555 E CA CA . A CA 4001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.575 ? metalc ? metalc13 A OG SER 907 A SER 907 1_555 E CA CA . A CA 4001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.691 ? metalc ? metalc14 A O ASN 908 A ASN 908 1_555 E CA CA . A CA 4001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? # _chem_comp.formula 'C2 H4 O2' _chem_comp.formula_weight 60.052 _chem_comp.id ACY _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ACETIC ACID' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C O ACY doub 1 n n C OXT ACY sing 2 n n C CH3 ACY sing 3 n n OXT HXT ACY sing 4 n n CH3 H1 ACY sing 5 n n CH3 H2 ACY sing 6 n n CH3 H3 ACY sing 7 n n # _atom_sites.entry_id 1WYG _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007449 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.007449 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.001911 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 PO4 A 1 2001 2001 PO4 PO4 . C 2 PO4 A 1 2002 2002 PO4 PO4 . D 2 PO4 A 1 2003 2003 PO4 PO4 . E 3 CA A 1 4001 4001 CA CA . F 4 FES A 1 4002 1001 FES FES . G 4 FES A 1 4003 1002 FES FES . H 5 FAD A 1 4004 1003 FAD FAD . I 6 SAL A 1 4005 1001 SAL SAL . J 7 ACY A 1 3001 3001 ACY ACY . K 8 HOH A 1 4006 1 HOH WAT . K 8 HOH A 2 4007 2 HOH WAT . K 8 HOH A 3 4008 3 HOH WAT . K 8 HOH A 4 4009 4 HOH WAT . K 8 HOH A 5 4010 5 HOH WAT . K 8 HOH A 6 4011 6 HOH WAT . K 8 HOH A 7 4012 7 HOH WAT . K 8 HOH A 8 4013 8 HOH WAT . K 8 HOH A 9 4014 9 HOH WAT . K 8 HOH A 10 4015 10 HOH WAT . K 8 HOH A 11 4016 11 HOH WAT . K 8 HOH A 12 4017 12 HOH WAT . K 8 HOH A 13 4018 13 HOH WAT . K 8 HOH A 14 4019 14 HOH WAT . K 8 HOH A 15 4020 15 HOH WAT . K 8 HOH A 16 4021 16 HOH WAT . K 8 HOH A 17 4022 17 HOH WAT . K 8 HOH A 18 4023 18 HOH WAT . K 8 HOH A 19 4024 19 HOH WAT . K 8 HOH A 20 4025 20 HOH WAT . K 8 HOH A 21 4026 21 HOH WAT . K 8 HOH A 22 4027 22 HOH WAT . K 8 HOH A 23 4028 23 HOH WAT . K 8 HOH A 24 4029 24 HOH WAT . K 8 HOH A 25 4030 25 HOH WAT . K 8 HOH A 26 4031 26 HOH WAT . K 8 HOH A 27 4032 27 HOH WAT . K 8 HOH A 28 4033 28 HOH WAT . K 8 HOH A 29 4034 29 HOH WAT . K 8 HOH A 30 4035 30 HOH WAT . K 8 HOH A 31 4036 31 HOH WAT . K 8 HOH A 32 4037 32 HOH WAT . K 8 HOH A 33 4038 33 HOH WAT . K 8 HOH A 34 4039 34 HOH WAT . K 8 HOH A 35 4040 35 HOH WAT . K 8 HOH A 36 4041 36 HOH WAT . K 8 HOH A 37 4042 37 HOH WAT . K 8 HOH A 38 4043 38 HOH WAT . K 8 HOH A 39 4044 39 HOH WAT . K 8 HOH A 40 4045 40 HOH WAT . K 8 HOH A 41 4046 41 HOH WAT . K 8 HOH A 42 4047 42 HOH WAT . K 8 HOH A 43 4048 43 HOH WAT . K 8 HOH A 44 4049 44 HOH WAT . K 8 HOH A 45 4050 45 HOH WAT . K 8 HOH A 46 4051 46 HOH WAT . K 8 HOH A 47 4052 47 HOH WAT . K 8 HOH A 48 4053 48 HOH WAT . K 8 HOH A 49 4054 49 HOH WAT . K 8 HOH A 50 4055 50 HOH WAT . K 8 HOH A 51 4056 51 HOH WAT . K 8 HOH A 52 4057 52 HOH WAT . K 8 HOH A 53 4058 53 HOH WAT . K 8 HOH A 54 4059 54 HOH WAT . K 8 HOH A 55 4060 55 HOH WAT . K 8 HOH A 56 4061 56 HOH WAT . K 8 HOH A 57 4062 57 HOH WAT . K 8 HOH A 58 4063 58 HOH WAT . K 8 HOH A 59 4064 59 HOH WAT . K 8 HOH A 60 4065 60 HOH WAT . K 8 HOH A 61 4066 61 HOH WAT . K 8 HOH A 62 4067 62 HOH WAT . K 8 HOH A 63 4068 63 HOH WAT . K 8 HOH A 64 4069 64 HOH WAT . K 8 HOH A 65 4070 65 HOH WAT . K 8 HOH A 66 4071 66 HOH WAT . K 8 HOH A 67 4072 67 HOH WAT . K 8 HOH A 68 4073 68 HOH WAT . K 8 HOH A 69 4074 69 HOH WAT . K 8 HOH A 70 4075 70 HOH WAT . K 8 HOH A 71 4076 71 HOH WAT . K 8 HOH A 72 4077 72 HOH WAT . K 8 HOH A 73 4078 73 HOH WAT . K 8 HOH A 74 4079 74 HOH WAT . K 8 HOH A 75 4080 75 HOH WAT . K 8 HOH A 76 4081 76 HOH WAT . K 8 HOH A 77 4082 77 HOH WAT . K 8 HOH A 78 4083 78 HOH WAT . K 8 HOH A 79 4084 79 HOH WAT . K 8 HOH A 80 4085 80 HOH WAT . K 8 HOH A 81 4086 81 HOH WAT . K 8 HOH A 82 4087 82 HOH WAT . K 8 HOH A 83 4088 83 HOH WAT . K 8 HOH A 84 4089 84 HOH WAT . K 8 HOH A 85 4090 85 HOH WAT . K 8 HOH A 86 4091 86 HOH WAT . K 8 HOH A 87 4092 87 HOH WAT . K 8 HOH A 88 4093 88 HOH WAT . K 8 HOH A 89 4094 89 HOH WAT . K 8 HOH A 90 4095 90 HOH WAT . K 8 HOH A 91 4096 91 HOH WAT . K 8 HOH A 92 4097 92 HOH WAT . K 8 HOH A 93 4098 93 HOH WAT . K 8 HOH A 94 4099 94 HOH WAT . K 8 HOH A 95 4100 95 HOH WAT . K 8 HOH A 96 4101 96 HOH WAT . K 8 HOH A 97 4102 97 HOH WAT . K 8 HOH A 98 4103 98 HOH WAT . K 8 HOH A 99 4104 99 HOH WAT . K 8 HOH A 100 4105 100 HOH WAT . K 8 HOH A 101 4106 101 HOH WAT . K 8 HOH A 102 4107 102 HOH WAT . K 8 HOH A 103 4108 103 HOH WAT . K 8 HOH A 104 4109 104 HOH WAT . K 8 HOH A 105 4110 105 HOH WAT . K 8 HOH A 106 4111 106 HOH WAT . K 8 HOH A 107 4112 107 HOH WAT . K 8 HOH A 108 4113 108 HOH WAT . K 8 HOH A 109 4114 109 HOH WAT . K 8 HOH A 110 4115 110 HOH WAT . K 8 HOH A 111 4116 111 HOH WAT . K 8 HOH A 112 4117 112 HOH WAT . K 8 HOH A 113 4118 113 HOH WAT . K 8 HOH A 114 4119 114 HOH WAT . K 8 HOH A 115 4120 115 HOH WAT . K 8 HOH A 116 4121 116 HOH WAT . K 8 HOH A 117 4122 117 HOH WAT . K 8 HOH A 118 4123 118 HOH WAT . K 8 HOH A 119 4124 119 HOH WAT . K 8 HOH A 120 4125 120 HOH WAT . K 8 HOH A 121 4126 121 HOH WAT . K 8 HOH A 122 4127 122 HOH WAT . K 8 HOH A 123 4128 123 HOH WAT . K 8 HOH A 124 4129 124 HOH WAT . K 8 HOH A 125 4130 125 HOH WAT . K 8 HOH A 126 4131 126 HOH WAT . K 8 HOH A 127 4132 127 HOH WAT . K 8 HOH A 128 4133 128 HOH WAT . K 8 HOH A 129 4134 129 HOH WAT . K 8 HOH A 130 4135 130 HOH WAT . K 8 HOH A 131 4136 131 HOH WAT . K 8 HOH A 132 4137 132 HOH WAT . K 8 HOH A 133 4138 133 HOH WAT . K 8 HOH A 134 4139 134 HOH WAT . K 8 HOH A 135 4140 135 HOH WAT . K 8 HOH A 136 4141 136 HOH WAT . K 8 HOH A 137 4142 137 HOH WAT . K 8 HOH A 138 4143 138 HOH WAT . K 8 HOH A 139 4144 139 HOH WAT . K 8 HOH A 140 4145 140 HOH WAT . K 8 HOH A 141 4146 141 HOH WAT . K 8 HOH A 142 4147 142 HOH WAT . K 8 HOH A 143 4148 143 HOH WAT . K 8 HOH A 144 4149 144 HOH WAT . K 8 HOH A 145 4150 145 HOH WAT . K 8 HOH A 146 4151 146 HOH WAT . K 8 HOH A 147 4152 147 HOH WAT . K 8 HOH A 148 4153 148 HOH WAT . K 8 HOH A 149 4154 149 HOH WAT . K 8 HOH A 150 4155 150 HOH WAT . K 8 HOH A 151 4156 151 HOH WAT . K 8 HOH A 152 4157 152 HOH WAT . K 8 HOH A 153 4158 153 HOH WAT . K 8 HOH A 154 4159 154 HOH WAT . K 8 HOH A 155 4160 155 HOH WAT . K 8 HOH A 156 4161 156 HOH WAT . K 8 HOH A 157 4162 157 HOH WAT . K 8 HOH A 158 4163 158 HOH WAT . K 8 HOH A 159 4164 159 HOH WAT . K 8 HOH A 160 4165 160 HOH WAT . K 8 HOH A 161 4166 161 HOH WAT . K 8 HOH A 162 4167 162 HOH WAT . K 8 HOH A 163 4168 163 HOH WAT . K 8 HOH A 164 4169 164 HOH WAT . K 8 HOH A 165 4170 165 HOH WAT . K 8 HOH A 166 4171 166 HOH WAT . K 8 HOH A 167 4172 167 HOH WAT . K 8 HOH A 168 4173 168 HOH WAT . K 8 HOH A 169 4174 169 HOH WAT . K 8 HOH A 170 4175 170 HOH WAT . K 8 HOH A 171 4176 171 HOH WAT . K 8 HOH A 172 4177 172 HOH WAT . K 8 HOH A 173 4178 173 HOH WAT . K 8 HOH A 174 4179 174 HOH WAT . K 8 HOH A 175 4180 175 HOH WAT . K 8 HOH A 176 4181 176 HOH WAT . K 8 HOH A 177 4182 177 HOH WAT . K 8 HOH A 178 4183 178 HOH WAT . K 8 HOH A 179 4184 179 HOH WAT . K 8 HOH A 180 4185 180 HOH WAT . K 8 HOH A 181 4186 181 HOH WAT . K 8 HOH A 182 4187 182 HOH WAT . K 8 HOH A 183 4188 183 HOH WAT . K 8 HOH A 184 4189 184 HOH WAT . K 8 HOH A 185 4190 185 HOH WAT . K 8 HOH A 186 4191 186 HOH WAT . K 8 HOH A 187 4192 187 HOH WAT . K 8 HOH A 188 4193 188 HOH WAT . K 8 HOH A 189 4194 189 HOH WAT . K 8 HOH A 190 4195 190 HOH WAT . K 8 HOH A 191 4196 191 HOH WAT . K 8 HOH A 192 4197 192 HOH WAT . K 8 HOH A 193 4198 193 HOH WAT . K 8 HOH A 194 4199 194 HOH WAT . K 8 HOH A 195 4200 195 HOH WAT . K 8 HOH A 196 4201 196 HOH WAT . K 8 HOH A 197 4202 197 HOH WAT . K 8 HOH A 198 4203 198 HOH WAT . K 8 HOH A 199 4204 199 HOH WAT . K 8 HOH A 200 4205 200 HOH WAT . K 8 HOH A 201 4206 201 HOH WAT . K 8 HOH A 202 4207 202 HOH WAT . K 8 HOH A 203 4208 203 HOH WAT . K 8 HOH A 204 4209 204 HOH WAT . K 8 HOH A 205 4210 205 HOH WAT . K 8 HOH A 206 4211 206 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C ACY . . . J 7 28.475 100.552 40.084 1 56.45 ? C ACY 3001 A 1 HETATM 2 O O ACY . . . J 7 29.35 100.968 40.816 1 56.3 ? O ACY 3001 A 1 HETATM 3 O OXT ACY . . . J 7 27.596 101.409 39.533 1 55.26 ? OXT ACY 3001 A 1 HETATM 4 C CH3 ACY . . . J 7 28.376 99.074 39.791 1 55.4 ? CH3 ACY 3001 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 10 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 16 _model_server_stats.query_time_ms 330 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 4 #