data_1WYW # _model_server_result.job_id YoEG2wBNIRHYeZPkKU5uGQ _model_server_result.datetime_utc '2025-03-06 18:51:22' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1wyw # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":207}' # _entry.id 1WYW # _exptl.entry_id 1WYW _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 5 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1WYW _cell.length_a 42.212 _cell.length_b 70.42 _cell.length_c 106.434 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1WYW _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 F N N ? 4 G N N ? 4 I N N ? 4 J N N ? 4 K N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O ILE 27 A ILE 136 1_555 G MG MG . A MG 344 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.903 ? metalc ? metalc2 A OH TYR 43 A TYR 152 1_555 G MG MG . A MG 344 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.81 ? metalc ? metalc3 A O THR 81 A THR 190 1_555 G MG MG . A MG 344 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.823 ? metalc ? metalc4 A O GLN 174 A GLN 283 1_555 F MG MG . A MG 343 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.759 ? metalc ? metalc5 A N HIS 178 A HIS 287 1_555 F MG MG . A MG 343 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.008 ? metalc ? metalc6 F MG MG . A MG 343 1_555 L O HOH . A HOH 348 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.772 ? metalc ? metalc7 F MG MG . A MG 343 1_555 B NH2 ARG 54 B ARG 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.996 ? metalc ? metalc8 G MG MG . A MG 344 1_555 L O HOH . A HOH 349 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.891 ? metalc ? metalc9 B NE2 HIS 43 B HIS 43 1_555 I MG MG . B MG 206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.544 ? metalc ? metalc10 B N ASP 73 B ASP 73 1_555 H NA NA . B NA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.999 ? metalc ? metalc11 B OG1 THR 76 B THR 76 1_555 K MG MG . B MG 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.963 ? metalc ? metalc12 I MG MG . B MG 206 1_555 M O HOH . B HOH 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.38 ? metalc ? metalc13 I MG MG . B MG 206 1_555 M O HOH . B HOH 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.482 ? metalc ? metalc14 I MG MG . B MG 206 1_555 M O HOH . B HOH 240 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.502 ? metalc ? metalc15 I MG MG . B MG 206 1_555 M O HOH . B HOH 241 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.571 ? metalc ? metalc16 J MG MG . B MG 207 1_555 M O HOH . B HOH 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? metalc ? metalc17 J MG MG . B MG 207 1_555 M O HOH . B HOH 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? metalc ? metalc18 J MG MG . B MG 207 1_555 M O HOH . B HOH 225 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.158 ? metalc ? metalc19 J MG MG . B MG 207 1_555 M O HOH . B HOH 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.825 ? metalc ? metalc20 J MG MG . B MG 207 1_555 M O HOH . B HOH 233 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.53 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1WYW _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.02369 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.014201 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.009395 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 3 CL A 1 340 101 CL CL . D 3 CL A 1 341 102 CL CL . E 3 CL A 1 342 103 CL CL . F 4 MG A 1 343 105 MG MG . G 4 MG A 1 344 109 MG MG . H 5 NA B 1 204 104 NA NA . I 4 MG B 1 206 106 MG MG . J 4 MG B 1 207 107 MG MG . K 4 MG B 1 208 108 MG MG . L 6 HOH A 1 345 2 HOH WAT . L 6 HOH A 2 346 3 HOH WAT . L 6 HOH A 3 347 4 HOH WAT . L 6 HOH A 4 348 6 HOH WAT . L 6 HOH A 5 349 7 HOH WAT . L 6 HOH A 6 350 10 HOH WAT . L 6 HOH A 7 351 11 HOH WAT . L 6 HOH A 8 352 12 HOH WAT . L 6 HOH A 9 353 14 HOH WAT . L 6 HOH A 10 354 15 HOH WAT . L 6 HOH A 11 355 16 HOH WAT . L 6 HOH A 12 356 18 HOH WAT . L 6 HOH A 13 357 19 HOH WAT . L 6 HOH A 14 358 20 HOH WAT . L 6 HOH A 15 359 21 HOH WAT . L 6 HOH A 16 360 22 HOH WAT . L 6 HOH A 17 361 23 HOH WAT . L 6 HOH A 18 362 24 HOH WAT . L 6 HOH A 19 363 26 HOH WAT . L 6 HOH A 20 364 27 HOH WAT . L 6 HOH A 21 365 28 HOH WAT . L 6 HOH A 22 366 29 HOH WAT . L 6 HOH A 23 367 31 HOH WAT . L 6 HOH A 24 368 33 HOH WAT . L 6 HOH A 25 369 34 HOH WAT . L 6 HOH A 26 370 35 HOH WAT . L 6 HOH A 27 371 36 HOH WAT . L 6 HOH A 28 372 37 HOH WAT . L 6 HOH A 29 373 38 HOH WAT . L 6 HOH A 30 374 39 HOH WAT . L 6 HOH A 31 375 40 HOH WAT . L 6 HOH A 32 376 41 HOH WAT . L 6 HOH A 33 377 42 HOH WAT . L 6 HOH A 34 378 43 HOH WAT . L 6 HOH A 35 379 44 HOH WAT . L 6 HOH A 36 380 45 HOH WAT . L 6 HOH A 37 381 46 HOH WAT . L 6 HOH A 38 382 47 HOH WAT . L 6 HOH A 39 383 48 HOH WAT . L 6 HOH A 40 384 49 HOH WAT . L 6 HOH A 41 385 50 HOH WAT . L 6 HOH A 42 386 52 HOH WAT . L 6 HOH A 43 387 53 HOH WAT . L 6 HOH A 44 388 54 HOH WAT . L 6 HOH A 45 389 55 HOH WAT . L 6 HOH A 46 390 56 HOH WAT . L 6 HOH A 47 391 58 HOH WAT . L 6 HOH A 48 392 59 HOH WAT . L 6 HOH A 49 393 60 HOH WAT . L 6 HOH A 50 394 61 HOH WAT . L 6 HOH A 51 395 62 HOH WAT . L 6 HOH A 52 396 63 HOH WAT . L 6 HOH A 53 397 64 HOH WAT . L 6 HOH A 54 398 65 HOH WAT . L 6 HOH A 55 399 67 HOH WAT . L 6 HOH A 56 400 68 HOH WAT . L 6 HOH A 57 401 71 HOH WAT . L 6 HOH A 58 402 72 HOH WAT . L 6 HOH A 59 403 74 HOH WAT . L 6 HOH A 60 404 75 HOH WAT . L 6 HOH A 61 405 77 HOH WAT . L 6 HOH A 62 406 79 HOH WAT . L 6 HOH A 63 407 80 HOH WAT . L 6 HOH A 64 408 81 HOH WAT . L 6 HOH A 65 409 83 HOH WAT . L 6 HOH A 66 410 84 HOH WAT . L 6 HOH A 67 411 85 HOH WAT . L 6 HOH A 68 412 87 HOH WAT . L 6 HOH A 69 413 89 HOH WAT . L 6 HOH A 70 414 92 HOH WAT . L 6 HOH A 71 415 93 HOH WAT . L 6 HOH A 72 416 94 HOH WAT . L 6 HOH A 73 417 95 HOH WAT . L 6 HOH A 74 418 96 HOH WAT . L 6 HOH A 75 419 97 HOH WAT . L 6 HOH A 76 420 99 HOH WAT . L 6 HOH A 77 421 100 HOH WAT . L 6 HOH A 78 422 101 HOH WAT . L 6 HOH A 79 423 102 HOH WAT . L 6 HOH A 80 424 103 HOH WAT . L 6 HOH A 81 425 104 HOH WAT . L 6 HOH A 82 426 106 HOH WAT . L 6 HOH A 83 427 107 HOH WAT . L 6 HOH A 84 428 108 HOH WAT . L 6 HOH A 85 429 109 HOH WAT . L 6 HOH A 86 430 110 HOH WAT . L 6 HOH A 87 431 111 HOH WAT . L 6 HOH A 88 432 112 HOH WAT . L 6 HOH A 89 433 114 HOH WAT . L 6 HOH A 90 434 115 HOH WAT . L 6 HOH A 91 435 117 HOH WAT . L 6 HOH A 92 436 118 HOH WAT . L 6 HOH A 93 437 119 HOH WAT . L 6 HOH A 94 438 120 HOH WAT . L 6 HOH A 95 439 121 HOH WAT . L 6 HOH A 96 440 122 HOH WAT . L 6 HOH A 97 441 123 HOH WAT . L 6 HOH A 98 442 124 HOH WAT . L 6 HOH A 99 443 125 HOH WAT . L 6 HOH A 100 444 126 HOH WAT . L 6 HOH A 101 445 127 HOH WAT . L 6 HOH A 102 446 128 HOH WAT . L 6 HOH A 103 447 130 HOH WAT . L 6 HOH A 104 448 134 HOH WAT . L 6 HOH A 105 449 135 HOH WAT . L 6 HOH A 106 450 136 HOH WAT . L 6 HOH A 107 451 137 HOH WAT . L 6 HOH A 108 452 138 HOH WAT . L 6 HOH A 109 453 139 HOH WAT . L 6 HOH A 110 454 140 HOH WAT . L 6 HOH A 111 455 141 HOH WAT . L 6 HOH A 112 456 142 HOH WAT . L 6 HOH A 113 457 143 HOH WAT . L 6 HOH A 114 458 144 HOH WAT . L 6 HOH A 115 459 145 HOH WAT . L 6 HOH A 116 460 146 HOH WAT . L 6 HOH A 117 461 147 HOH WAT . L 6 HOH A 118 462 150 HOH WAT . L 6 HOH A 119 463 151 HOH WAT . L 6 HOH A 120 464 152 HOH WAT . L 6 HOH A 121 465 153 HOH WAT . L 6 HOH A 122 466 154 HOH WAT . L 6 HOH A 123 467 155 HOH WAT . L 6 HOH A 124 468 157 HOH WAT . L 6 HOH A 125 469 158 HOH WAT . L 6 HOH A 126 470 159 HOH WAT . L 6 HOH A 127 471 160 HOH WAT . L 6 HOH A 128 472 161 HOH WAT . L 6 HOH A 129 473 162 HOH WAT . L 6 HOH A 130 474 163 HOH WAT . L 6 HOH A 131 475 164 HOH WAT . L 6 HOH A 132 476 165 HOH WAT . L 6 HOH A 133 477 167 HOH WAT . L 6 HOH A 134 478 168 HOH WAT . M 6 HOH B 1 209 1 HOH WAT . M 6 HOH B 2 210 5 HOH WAT . M 6 HOH B 3 211 8 HOH WAT . M 6 HOH B 4 212 9 HOH WAT . M 6 HOH B 5 213 13 HOH WAT . M 6 HOH B 6 214 17 HOH WAT . M 6 HOH B 7 215 25 HOH WAT . M 6 HOH B 8 216 30 HOH WAT . M 6 HOH B 9 217 32 HOH WAT . M 6 HOH B 10 218 51 HOH WAT . M 6 HOH B 11 219 57 HOH WAT . M 6 HOH B 12 220 66 HOH WAT . M 6 HOH B 13 221 69 HOH WAT . M 6 HOH B 14 222 70 HOH WAT . M 6 HOH B 15 223 73 HOH WAT . M 6 HOH B 16 224 76 HOH WAT . M 6 HOH B 17 225 78 HOH WAT . M 6 HOH B 18 226 82 HOH WAT . M 6 HOH B 19 227 86 HOH WAT . M 6 HOH B 20 228 88 HOH WAT . M 6 HOH B 21 229 90 HOH WAT . M 6 HOH B 22 230 91 HOH WAT . M 6 HOH B 23 231 98 HOH WAT . M 6 HOH B 24 232 105 HOH WAT . M 6 HOH B 25 233 113 HOH WAT . M 6 HOH B 26 234 116 HOH WAT . M 6 HOH B 27 235 129 HOH WAT . M 6 HOH B 28 236 131 HOH WAT . M 6 HOH B 29 237 132 HOH WAT . M 6 HOH B 30 238 133 HOH WAT . M 6 HOH B 31 239 148 HOH WAT . M 6 HOH B 32 240 149 HOH WAT . M 6 HOH B 33 241 156 HOH WAT . M 6 HOH B 34 242 166 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id J _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 30.66 _atom_site.Cartn_y 80.44 _atom_site.Cartn_z 50.554 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 46.4 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 207 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 8 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 270 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #